MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 32875

< Previous12...678910111213141516...6566Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011126	GAA	2	6	241513	241518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952643
5002	NC_011126	GAT	2	6	241611	241616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952644
5003	NC_011126	AAG	2	6	241679	241684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952644
5004	NC_011126	AAG	3	9	241731	241739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952644
5005	NC_011126	AT	3	6	241792	241797	50 %	50 %	0 %	0 %	195952644
5006	NC_011126	TTG	2	6	241798	241803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952644
5007	NC_011126	AAC	2	6	241908	241913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952644
5008	NC_011126	TCT	2	6	241941	241946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952644
5009	NC_011126	TTG	2	6	242133	242138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952644
5010	NC_011126	A	6	6	242158	242163	100 %	0 %	0 %	0 %	195952644
5011	NC_011126	TTA	2	6	242202	242207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952645
5012	NC_011126	GTAT	2	8	242260	242267	25 %	50 %	25 %	0 %	195952645
5013	NC_011126	AACA	2	8	242288	242295	75 %	0 %	0 %	25 %	195952645
5014	NC_011126	AAG	2	6	242389	242394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952645
5015	NC_011126	AAG	2	6	242426	242431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952645
5016	NC_011126	ATT	2	6	242435	242440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952645
5017	NC_011126	TA	4	8	242486	242493	50 %	50 %	0 %	0 %	195952646
5018	NC_011126	ATT	2	6	242551	242556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952646
5019	NC_011126	GA	3	6	242570	242575	50 %	0 %	50 %	0 %	195952646
5020	NC_011126	A	6	6	242581	242586	100 %	0 %	0 %	0 %	195952646
5021	NC_011126	CTTA	2	8	242589	242596	25 %	50 %	0 %	25 %	195952646
5022	NC_011126	AG	3	6	242698	242703	50 %	0 %	50 %	0 %	195952646
5023	NC_011126	A	7	7	242794	242800	100 %	0 %	0 %	0 %	195952646
5024	NC_011126	GGT	2	6	242840	242845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952646
5025	NC_011126	AAAGG	2	10	242871	242880	60 %	0 %	40 %	0 %	195952646
5026	NC_011126	GCC	2	6	242991	242996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195952646
5027	NC_011126	TGG	3	9	243218	243226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952646
5028	NC_011126	AG	3	6	243295	243300	50 %	0 %	50 %	0 %	195952646
5029	NC_011126	ATA	2	6	243324	243329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952646
5030	NC_011126	AGGTA	2	10	243347	243356	40 %	20 %	40 %	0 %	195952646
5031	NC_011126	A	6	6	243431	243436	100 %	0 %	0 %	0 %	195952647
5032	NC_011126	AAC	2	6	243479	243484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952647
5033	NC_011126	A	7	7	243506	243512	100 %	0 %	0 %	0 %	195952647
5034	NC_011126	A	6	6	243554	243559	100 %	0 %	0 %	0 %	195952647
5035	NC_011126	CGA	2	6	243585	243590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952647
5036	NC_011126	AGT	2	6	243622	243627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952647
5037	NC_011126	AT	4	8	243713	243720	50 %	50 %	0 %	0 %	195952647
5038	NC_011126	CTA	2	6	243762	243767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952647
5039	NC_011126	AGT	2	6	243802	243807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952647
5040	NC_011126	AGA	2	6	243810	243815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952647
5041	NC_011126	AGT	2	6	243841	243846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952648
5042	NC_011126	A	6	6	243962	243967	100 %	0 %	0 %	0 %	195952648
5043	NC_011126	GCT	2	6	243968	243973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952648
5044	NC_011126	A	6	6	243982	243987	100 %	0 %	0 %	0 %	195952648
5045	NC_011126	TAT	2	6	244075	244080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952648
5046	NC_011126	ATG	2	6	244121	244126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952648
5047	NC_011126	A	6	6	244129	244134	100 %	0 %	0 %	0 %	195952648
5048	NC_011126	AAG	2	6	244170	244175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952648
5049	NC_011126	GAG	2	6	244181	244186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952648
5050	NC_011126	A	6	6	244202	244207	100 %	0 %	0 %	0 %	195952649
5051	NC_011126	A	6	6	244270	244275	100 %	0 %	0 %	0 %	195952649
5052	NC_011126	TTA	2	6	244307	244312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952649
5053	NC_011126	AT	3	6	244317	244322	50 %	50 %	0 %	0 %	195952649
5054	NC_011126	AAAG	2	8	244324	244331	75 %	0 %	25 %	0 %	195952649
5055	NC_011126	GA	3	6	244376	244381	50 %	0 %	50 %	0 %	195952649
5056	NC_011126	TCT	2	6	244402	244407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952649
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5058	NC_011126	GAA	2	6	244455	244460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952649
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5060	NC_011126	GGT	2	6	244669	244674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952649
5061	NC_011126	TGG	2	6	244703	244708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952649
5062	NC_011126	AGA	2	6	244833	244838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952649
5063	NC_011126	AGA	3	9	244854	244862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952649
5064	NC_011126	AGG	2	6	244880	244885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952649
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5066	NC_011126	TAG	2	6	244912	244917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952650
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5068	NC_011126	GGT	4	12	245147	245158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952650
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5070	NC_011126	GAA	2	6	245243	245248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952650
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5075	NC_011126	TAA	2	6	245483	245488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952651
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5079	NC_011126	CAA	2	6	245570	245575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952652
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5081	NC_011126	TGCT	2	8	245681	245688	0 %	50 %	25 %	25 %	195952652
5082	NC_011126	TGT	2	6	245699	245704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952652
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5084	NC_011126	CAAAA	2	10	245732	245741	80 %	0 %	0 %	20 %	195952652
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5091	NC_011126	AAG	2	6	246051	246056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952653
5092	NC_011126	TA	3	6	246067	246072	50 %	50 %	0 %	0 %	195952653
5093	NC_011126	TGA	2	6	246078	246083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952653
5094	NC_011126	CTT	2	6	246185	246190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952653
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5097	NC_011126	TA	3	6	246380	246385	50 %	50 %	0 %	0 %	195952654
5098	NC_011126	TAGAA	2	10	246464	246473	60 %	20 %	20 %	0 %	195952654
5099	NC_011126	AG	3	6	246607	246612	50 %	0 %	50 %	0 %	195952655
5100	NC_011126	ATA	2	6	246683	246688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952655
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5102	NC_011126	TAGA	2	8	246741	246748	50 %	25 %	25 %	0 %	195952655
5103	NC_011126	A	6	6	246803	246808	100 %	0 %	0 %	0 %	195952655
5104	NC_011126	CTT	2	6	246816	246821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952655
5105	NC_011126	TTAAG	2	10	246822	246831	40 %	40 %	20 %	0 %	195952655
5106	NC_011126	AGAT	2	8	247011	247018	50 %	25 %	25 %	0 %	195952655
5107	NC_011126	TTA	2	6	247056	247061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952655
5108	NC_011126	TGA	2	6	247078	247083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952655
5109	NC_011126	TTA	2	6	247129	247134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952655
5110	NC_011126	AGG	2	6	247135	247140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952655
5111	NC_011126	A	7	7	247206	247212	100 %	0 %	0 %	0 %	195952656
5112	NC_011126	AG	3	6	247280	247285	50 %	0 %	50 %	0 %	195952656
5113	NC_011126	AAC	2	6	247433	247438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952657
5114	NC_011126	AAG	2	6	247460	247465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952657
5115	NC_011126	TA	3	6	247468	247473	50 %	50 %	0 %	0 %	195952657
5116	NC_011126	AGA	2	6	247491	247496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952657
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5118	NC_011126	ATTT	2	8	247534	247541	25 %	75 %	0 %	0 %	195952657
5119	NC_011126	AGA	2	6	247609	247614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952657
5120	NC_011126	AGA	2	6	247631	247636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952657
5121	NC_011126	AAG	2	6	247647	247652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952657
5122	NC_011126	GCG	2	6	247727	247732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195952657
5123	NC_011126	TTA	2	6	247749	247754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952657
5124	NC_011126	A	6	6	247783	247788	100 %	0 %	0 %	0 %	195952658
5125	NC_011126	AAC	2	6	247804	247809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952658
5126	NC_011126	ACA	2	6	247904	247909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952658
5127	NC_011126	A	6	6	247926	247931	100 %	0 %	0 %	0 %	195952658
5128	NC_011126	A	6	6	247983	247988	100 %	0 %	0 %	0 %	195952658
5129	NC_011126	GGT	2	6	248031	248036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952658
5130	NC_011126	CTG	2	6	248120	248125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952658
5131	NC_011126	GCT	2	6	248197	248202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952658
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5133	NC_011126	AGGTAA	2	12	248295	248306	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	195952658
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5144	NC_011126	AGA	2	6	248942	248947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952660
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5149	NC_011126	GTA	2	6	249156	249161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952660
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5154	NC_011126	AAAG	2	8	249356	249363	75 %	0 %	25 %	0 %	195952661
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5162	NC_011126	AAG	2	6	249665	249670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952662
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5239	NC_011126	TAAGCA	2	12	252943	252954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	195952667
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5245	NC_011126	GAGAA	2	10	253191	253200	60 %	0 %	40 %	0 %	195952668
5246	NC_011126	CAAA	2	8	253285	253292	75 %	0 %	0 %	25 %	195952668
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5497	NC_011126	ACT	2	6	264204	264209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952682
5498	NC_011126	CAAA	2	8	264245	264252	75 %	0 %	0 %	25 %	195952682
5499	NC_011126	AG	3	6	264263	264268	50 %	0 %	50 %	0 %	195952682
5500	NC_011126	TA	3	6	264269	264274	50 %	50 %	0 %	0 %	195952682

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