MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 1090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	188526815
2	NC_010698	TTTCT	2	10	8138	8147	0 %	80 %	0 %	20 %	188526820
3	NC_010698	TTGAA	2	10	11649	11658	40 %	40 %	20 %	0 %	188526823
4	NC_010698	TTTTG	2	10	11665	11674	0 %	80 %	20 %	0 %	188526823
5	NC_010698	TGGTG	2	10	12503	12512	0 %	40 %	60 %	0 %	188526825
6	NC_010698	CAAAA	2	10	18379	18388	80 %	0 %	0 %	20 %	188526830
7	NC_010698	CATCA	2	10	19755	19764	40 %	20 %	0 %	40 %	188526831
8	NC_010698	TGAAA	2	10	20723	20732	60 %	20 %	20 %	0 %	188526832
9	NC_010698	CCATG	2	10	22914	22923	20 %	20 %	20 %	40 %	188526834
10	NC_010698	CTCTT	2	10	22944	22953	0 %	60 %	0 %	40 %	188526834
11	NC_010698	CAAGC	2	10	27546	27555	40 %	0 %	20 %	40 %	188526837
12	NC_010698	TTTTA	2	10	28476	28485	20 %	80 %	0 %	0 %	188526838
13	NC_010698	GATAA	2	10	30556	30565	60 %	20 %	20 %	0 %	188526842
14	NC_010698	GTGGG	2	10	32015	32024	0 %	20 %	80 %	0 %	188526843
15	NC_010698	TGGGG	2	10	33266	33275	0 %	20 %	80 %	0 %	188526845
16	NC_010698	TGTGT	2	10	35177	35186	0 %	60 %	40 %	0 %	188526847
17	NC_010698	AAGCC	2	10	39028	39037	40 %	0 %	20 %	40 %	188526852
18	NC_010698	AGAAA	2	10	40341	40350	80 %	0 %	20 %	0 %	188526853
19	NC_010698	TAAAA	2	10	43042	43051	80 %	20 %	0 %	0 %	188526856
20	NC_010698	TCCCA	2	10	44054	44063	20 %	20 %	0 %	60 %	188526857
21	NC_010698	GCTCC	2	10	44375	44384	0 %	20 %	20 %	60 %	188526857
22	NC_010698	TCGCA	2	10	44912	44921	20 %	20 %	20 %	40 %	188526857
23	NC_010698	AGGCT	2	10	46799	46808	20 %	20 %	40 %	20 %	188526859
24	NC_010698	TGCCT	2	10	47174	47183	0 %	40 %	20 %	40 %	188526859
25	NC_010698	TAAAA	2	10	49363	49372	80 %	20 %	0 %	0 %	188526862
26	NC_010698	TGAAA	2	10	50166	50175	60 %	20 %	20 %	0 %	188526864
27	NC_010698	TCGCC	2	10	53163	53172	0 %	20 %	20 %	60 %	188526865
28	NC_010698	TAAAA	2	10	53459	53468	80 %	20 %	0 %	0 %	188526865
29	NC_010698	TCAAA	2	10	54175	54184	60 %	20 %	0 %	20 %	188526865
30	NC_010698	GCGTT	2	10	60645	60654	0 %	40 %	40 %	20 %	188526873
31	NC_010698	TCAAT	2	10	61499	61508	40 %	40 %	0 %	20 %	188526874
32	NC_010698	TGCCT	2	10	62415	62424	0 %	40 %	20 %	40 %	188526875
33	NC_010698	TCCAA	2	10	62827	62836	40 %	20 %	0 %	40 %	188526876
34	NC_010698	TTTTG	2	10	66126	66135	0 %	80 %	20 %	0 %	188526880
35	NC_010698	ACGCC	2	10	66432	66441	20 %	0 %	20 %	60 %	188526880
36	NC_010698	AAAGC	2	10	67198	67207	60 %	0 %	20 %	20 %	188526881
37	NC_010698	ATCTT	2	10	75246	75255	20 %	60 %	0 %	20 %	188526888
38	NC_010698	TGGCT	2	10	75787	75796	0 %	40 %	40 %	20 %	188526888
39	NC_010698	ATGCC	2	10	76203	76212	20 %	20 %	20 %	40 %	188526889
40	NC_010698	TTGAT	2	10	77127	77136	20 %	60 %	20 %	0 %	188526892
41	NC_010698	GGCGT	2	10	78941	78950	0 %	20 %	60 %	20 %	188526894
42	NC_010698	ATTTT	2	10	81969	81978	20 %	80 %	0 %	0 %	188526895
43	NC_010698	CTTTC	2	10	82442	82451	0 %	60 %	0 %	40 %	188526896
44	NC_010698	TTTGA	2	10	85233	85242	20 %	60 %	20 %	0 %	188526898
45	NC_010698	TCTTT	2	10	85444	85453	0 %	80 %	0 %	20 %	188526898
46	NC_010698	GGCTT	2	10	86548	86557	0 %	40 %	40 %	20 %	188526899
47	NC_010698	CGGCA	2	10	89191	89200	20 %	0 %	40 %	40 %	188526902
48	NC_010698	ACGAT	2	10	91670	91679	40 %	20 %	20 %	20 %	188526904
49	NC_010698	TTTTC	2	10	91865	91874	0 %	80 %	0 %	20 %	188526904
50	NC_010698	AATTG	2	10	93521	93530	40 %	40 %	20 %	0 %	188526905
51	NC_010698	TCGTT	2	10	95321	95330	0 %	60 %	20 %	20 %	188526906
52	NC_010698	TCTTT	2	10	98631	98640	0 %	80 %	0 %	20 %	188526909
53	NC_010698	AAAGC	2	10	101402	101411	60 %	0 %	20 %	20 %	188526911
54	NC_010698	TGTCT	2	10	103433	103442	0 %	60 %	20 %	20 %	188526913
55	NC_010698	CAAAT	2	10	103826	103835	60 %	20 %	0 %	20 %	188526913
56	NC_010698	ACCCT	2	10	105255	105264	20 %	20 %	0 %	60 %	188526914
57	NC_010698	ATGCC	2	10	105387	105396	20 %	20 %	20 %	40 %	188526914
58	NC_010698	TGATT	2	10	107391	107400	20 %	60 %	20 %	0 %	188526916
59	NC_010698	GAATT	2	10	108026	108035	40 %	40 %	20 %	0 %	188526918
60	NC_010698	GGATC	2	10	111902	111911	20 %	20 %	40 %	20 %	188526920
61	NC_010698	GCAAT	2	10	113772	113781	40 %	20 %	20 %	20 %	188526921
62	NC_010698	AAGCC	2	10	113810	113819	40 %	0 %	20 %	40 %	188526921
63	NC_010698	GTTTG	2	10	115168	115177	0 %	60 %	40 %	0 %	188526922
64	NC_010698	GTTTG	2	10	116690	116699	0 %	60 %	40 %	0 %	188526923
65	NC_010698	TGATC	2	10	117169	117178	20 %	40 %	20 %	20 %	188526923
66	NC_010698	TTTGA	2	10	118240	118249	20 %	60 %	20 %	0 %	188526924
67	NC_010698	GACTT	2	10	118774	118783	20 %	40 %	20 %	20 %	188526924
68	NC_010698	ATCTC	2	10	119525	119534	20 %	40 %	0 %	40 %	188526924
69	NC_010698	CGCTT	2	10	119683	119692	0 %	40 %	20 %	40 %	188526924
70	NC_010698	TTTGT	2	10	120040	120049	0 %	80 %	20 %	0 %	188526925
71	NC_010698	TGCGT	2	10	122073	122082	0 %	40 %	40 %	20 %	188526927
72	NC_010698	GAAAA	2	10	122234	122243	80 %	0 %	20 %	0 %	188526927
73	NC_010698	GAAAA	2	10	122552	122561	80 %	0 %	20 %	0 %	188526927
74	NC_010698	ATTTT	2	10	125522	125531	20 %	80 %	0 %	0 %	188526933
75	NC_010698	ATGTT	2	10	125604	125613	20 %	60 %	20 %	0 %	188526933
76	NC_010698	AAAAG	2	10	126016	126025	80 %	0 %	20 %	0 %	188526933
77	NC_010698	TAGGG	2	10	127010	127019	20 %	20 %	60 %	0 %	188526934
78	NC_010698	AAATC	2	10	128276	128285	60 %	20 %	0 %	20 %	188526935
79	NC_010698	AAAAT	2	10	129748	129757	80 %	20 %	0 %	0 %	188526936
80	NC_010698	TTTTC	2	10	132098	132107	0 %	80 %	0 %	20 %	188526940
81	NC_010698	GTAAA	2	10	132650	132659	60 %	20 %	20 %	0 %	188526941
82	NC_010698	TTCTT	2	10	134054	134063	0 %	80 %	0 %	20 %	188526942
83	NC_010698	TCTTT	2	10	134548	134557	0 %	80 %	0 %	20 %	188526943
84	NC_010698	ACTTG	2	10	134761	134770	20 %	40 %	20 %	20 %	188526943
85	NC_010698	TTTTG	2	10	135711	135720	0 %	80 %	20 %	0 %	188526944
86	NC_010698	AATTC	2	10	136345	136354	40 %	40 %	0 %	20 %	188526944
87	NC_010698	GCGAT	2	10	136504	136513	20 %	20 %	40 %	20 %	188526944
88	NC_010698	GCTTG	2	10	136760	136769	0 %	40 %	40 %	20 %	188526944
89	NC_010698	TTTTG	2	10	137412	137421	0 %	80 %	20 %	0 %	188526945
90	NC_010698	CCAAA	2	10	139252	139261	60 %	0 %	0 %	40 %	188526946
91	NC_010698	ACGCC	2	10	142774	142783	20 %	0 %	20 %	60 %	188526948
92	NC_010698	TGATT	2	10	143679	143688	20 %	60 %	20 %	0 %	188526950
93	NC_010698	TTATT	2	10	144670	144679	20 %	80 %	0 %	0 %	188526952
94	NC_010698	GCGTT	2	10	145028	145037	0 %	40 %	40 %	20 %	188526954
95	NC_010698	CCCAG	2	10	145948	145957	20 %	0 %	20 %	60 %	188526955
96	NC_010698	AAAAC	2	10	148627	148636	80 %	0 %	0 %	20 %	188526958
97	NC_010698	AAGCC	2	10	151862	151871	40 %	0 %	20 %	40 %	188526963
98	NC_010698	GGGTG	2	10	154263	154272	0 %	20 %	80 %	0 %	188526965
99	NC_010698	ATTCA	2	10	155637	155646	40 %	40 %	0 %	20 %	188526967
100	NC_010698	AAAAC	2	10	157974	157983	80 %	0 %	0 %	20 %	188526969
101	NC_010698	ATCTT	2	10	159039	159048	20 %	60 %	0 %	20 %	188526970
102	NC_010698	TATCA	2	10	167404	167413	40 %	40 %	0 %	20 %	188526979
103	NC_010698	AGCAG	2	10	168061	168070	40 %	0 %	40 %	20 %	188526980
104	NC_010698	ATTTG	2	10	168412	168421	20 %	60 %	20 %	0 %	188526980
105	NC_010698	AATTG	2	10	168568	168577	40 %	40 %	20 %	0 %	188526981
106	NC_010698	AAATG	2	10	169977	169986	60 %	20 %	20 %	0 %	188526983
107	NC_010698	TGTAA	2	10	170767	170776	40 %	40 %	20 %	0 %	188526984
108	NC_010698	ATAAA	2	10	172263	172272	80 %	20 %	0 %	0 %	188526985
109	NC_010698	GAATA	2	10	172560	172569	60 %	20 %	20 %	0 %	188526985
110	NC_010698	AAAAG	2	10	173432	173441	80 %	0 %	20 %	0 %	188526987
111	NC_010698	ACCCC	2	10	173497	173506	20 %	0 %	0 %	80 %	188526987
112	NC_010698	ATTCA	2	10	180944	180953	40 %	40 %	0 %	20 %	188526995
113	NC_010698	GCGAA	2	10	183518	183527	40 %	0 %	40 %	20 %	188526997
114	NC_010698	TAAAA	2	10	185385	185394	80 %	20 %	0 %	0 %	188526998
115	NC_010698	TCATT	2	10	186556	186565	20 %	60 %	0 %	20 %	188526999
116	NC_010698	CATAA	2	10	187116	187125	60 %	20 %	0 %	20 %	188527000
117	NC_010698	CTATT	2	10	187445	187454	20 %	60 %	0 %	20 %	188527001
118	NC_010698	TTTTC	2	10	188505	188514	0 %	80 %	0 %	20 %	188527002
119	NC_010698	ATTAG	2	10	190483	190492	40 %	40 %	20 %	0 %	188527004
120	NC_010698	TATTT	2	10	192255	192264	20 %	80 %	0 %	0 %	188527007
121	NC_010698	TTTTA	2	10	192916	192925	20 %	80 %	0 %	0 %	188527008
122	NC_010698	TGGGG	2	10	199724	199733	0 %	20 %	80 %	0 %	188527013
123	NC_010698	GATCA	2	10	201630	201639	40 %	20 %	20 %	20 %	188527014
124	NC_010698	ATTCT	2	10	202157	202166	20 %	60 %	0 %	20 %	188527014
125	NC_010698	GCAAA	2	10	204972	204981	60 %	0 %	20 %	20 %	188527016
126	NC_010698	TCGGC	2	10	205786	205795	0 %	20 %	40 %	40 %	188527017
127	NC_010698	ATCTT	2	10	206236	206245	20 %	60 %	0 %	20 %	188527017
128	NC_010698	TAAAA	2	10	207164	207173	80 %	20 %	0 %	0 %	188527018
129	NC_010698	CCACC	2	10	208689	208698	20 %	0 %	0 %	80 %	188527018
130	NC_010698	GAAAA	2	10	211890	211899	80 %	0 %	20 %	0 %	188527022
131	NC_010698	GTGGG	2	10	213944	213953	0 %	20 %	80 %	0 %	188527025
132	NC_010698	TGATG	2	10	214134	214143	20 %	40 %	40 %	0 %	188527025
133	NC_010698	GATTT	2	10	215445	215454	20 %	60 %	20 %	0 %	188527026
134	NC_010698	TGGGG	2	10	216265	216274	0 %	20 %	80 %	0 %	188527028
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251	NC_010698	TGATT	2	10	379402	379411	20 %	60 %	20 %	0 %	188527189
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255	NC_010698	AACTT	2	10	388873	388882	40 %	40 %	0 %	20 %	188527202
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260	NC_010698	AAATC	2	10	393828	393837	60 %	20 %	0 %	20 %	188527208
261	NC_010698	AGCAT	2	10	393982	393991	40 %	20 %	20 %	20 %	188527208
262	NC_010698	AAAGA	2	10	394317	394326	80 %	0 %	20 %	0 %	188527209
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