MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 5353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	CCAA	2	8	676	683	50 %	0 %	0 %	50 %	170717207
2	NC_010519	ATGC	2	8	843	850	25 %	25 %	25 %	25 %	170717207
3	NC_010519	TGAT	2	8	940	947	25 %	50 %	25 %	0 %	170717207
4	NC_010519	AATT	2	8	2361	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	170718298
5	NC_010519	TTGC	2	8	3704	3711	0 %	50 %	25 %	25 %	170718431
6	NC_010519	AATT	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	170718540
7	NC_010519	ATGA	2	8	4432	4439	50 %	25 %	25 %	0 %	170718540
8	NC_010519	TAAA	2	8	4647	4654	75 %	25 %	0 %	0 %	170718646
9	NC_010519	TAAA	2	8	5194	5201	75 %	25 %	0 %	0 %	170718753
10	NC_010519	CTGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	50 %	25 %	170718862
11	NC_010519	CAAC	2	8	5817	5824	50 %	0 %	0 %	50 %	170718862
12	NC_010519	ACCG	2	8	6840	6847	25 %	0 %	25 %	50 %	170718971
13	NC_010519	AATT	2	8	7068	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	170718971
14	NC_010519	ATTA	2	8	7491	7498	50 %	50 %	0 %	0 %	170719078
15	NC_010519	GTAT	2	8	7643	7650	25 %	50 %	25 %	0 %	170719078
16	NC_010519	CAGA	2	8	7868	7875	50 %	0 %	25 %	25 %	170719078
17	NC_010519	CGCA	2	8	8265	8272	25 %	0 %	25 %	50 %	170717208
18	NC_010519	AAGT	2	8	8840	8847	50 %	25 %	25 %	0 %	170717422
19	NC_010519	AATG	2	8	9637	9644	50 %	25 %	25 %	0 %	170717531
20	NC_010519	CAAA	2	8	11346	11353	75 %	0 %	0 %	25 %	170717640
21	NC_010519	GAGC	2	8	11471	11478	25 %	0 %	50 %	25 %	170717640
22	NC_010519	GGAA	2	8	11730	11737	50 %	0 %	50 %	0 %	170717751
23	NC_010519	CTAT	2	8	11858	11865	25 %	50 %	0 %	25 %	170717751
24	NC_010519	ATGT	2	8	11903	11910	25 %	50 %	25 %	0 %	170717751
25	NC_010519	ACAA	2	8	12909	12916	75 %	0 %	0 %	25 %	170717973
26	NC_010519	AAAG	2	8	13153	13160	75 %	0 %	25 %	0 %	170717973
27	NC_010519	GAAG	2	8	13242	13249	50 %	0 %	50 %	0 %	170717973
28	NC_010519	GTTG	2	8	13553	13560	0 %	50 %	50 %	0 %	170717973
29	NC_010519	TACG	2	8	13851	13858	25 %	25 %	25 %	25 %	170717973
30	NC_010519	AATT	2	8	14536	14543	50 %	50 %	0 %	0 %	170717973
31	NC_010519	TTAT	2	8	14934	14941	25 %	75 %	0 %	0 %	170717973
32	NC_010519	CAGT	2	8	15073	15080	25 %	25 %	25 %	25 %	170717973
33	NC_010519	AGCG	2	8	15157	15164	25 %	0 %	50 %	25 %	170717973
34	NC_010519	TGAA	2	8	15550	15557	50 %	25 %	25 %	0 %	170718084
35	NC_010519	GGAT	2	8	16933	16940	25 %	25 %	50 %	0 %	170718299
36	NC_010519	ATAA	2	8	17009	17016	75 %	25 %	0 %	0 %	170718299
37	NC_010519	GAAA	2	8	17276	17283	75 %	0 %	25 %	0 %	170718299
38	NC_010519	TAAT	2	8	17709	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	170718332
39	NC_010519	TTCT	2	8	17853	17860	0 %	75 %	0 %	25 %	170718332
40	NC_010519	AGGT	2	8	17940	17947	25 %	25 %	50 %	0 %	170718332
41	NC_010519	TCAT	2	8	18365	18372	25 %	50 %	0 %	25 %	170718332
42	NC_010519	AATT	2	8	18581	18588	50 %	50 %	0 %	0 %	170718343
43	NC_010519	TGCC	2	8	18676	18683	0 %	25 %	25 %	50 %	170718343
44	NC_010519	TTAT	2	8	18963	18970	25 %	75 %	0 %	0 %	170718354
45	NC_010519	GCAG	2	8	19843	19850	25 %	0 %	50 %	25 %	170718365
46	NC_010519	AAGT	2	8	20004	20011	50 %	25 %	25 %	0 %	170718365
47	NC_010519	CTTG	2	8	20195	20202	0 %	50 %	25 %	25 %	170718365
48	NC_010519	GTAA	2	8	20294	20301	50 %	25 %	25 %	0 %	170718365
49	NC_010519	TGCG	2	8	20541	20548	0 %	25 %	50 %	25 %	170718365
50	NC_010519	TTGG	2	8	20572	20579	0 %	50 %	50 %	0 %	170718365
51	NC_010519	AAAG	2	8	20615	20622	75 %	0 %	25 %	0 %	170718365
52	NC_010519	ATAA	2	8	21202	21209	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
53	NC_010519	AATA	2	8	21377	21384	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
54	NC_010519	ATAA	2	8	21503	21510	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
55	NC_010519	ATAA	2	8	21597	21604	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
56	NC_010519	TAAA	2	8	22354	22361	75 %	25 %	0 %	0 %	170718387
57	NC_010519	CATC	2	8	22542	22549	25 %	25 %	0 %	50 %	170718398
58	NC_010519	TCGG	2	8	22854	22861	0 %	25 %	50 %	25 %	170718409
59	NC_010519	TTTA	2	8	23067	23074	25 %	75 %	0 %	0 %	170718409
60	NC_010519	TATT	2	8	23408	23415	25 %	75 %	0 %	0 %	170718409
61	NC_010519	AATA	2	8	24522	24529	75 %	25 %	0 %	0 %	170718432
62	NC_010519	AAAG	2	8	24917	24924	75 %	0 %	25 %	0 %	170718443
63	NC_010519	TTTC	2	8	25292	25299	0 %	75 %	0 %	25 %	170718452
64	NC_010519	TTGG	2	8	25695	25702	0 %	50 %	50 %	0 %	170718452
65	NC_010519	GCTG	2	8	26029	26036	0 %	25 %	50 %	25 %	170718463
66	NC_010519	GGAA	2	8	26356	26363	50 %	0 %	50 %	0 %	170718463
67	NC_010519	TCTA	2	8	27298	27305	25 %	50 %	0 %	25 %	170718474
68	NC_010519	ACTA	2	8	27403	27410	50 %	25 %	0 %	25 %	170718474
69	NC_010519	AAGT	2	8	29391	29398	50 %	25 %	25 %	0 %	170718507
70	NC_010519	TAAT	2	8	29447	29454	50 %	50 %	0 %	0 %	170718507
71	NC_010519	ACAA	2	8	29752	29759	75 %	0 %	0 %	25 %	170718518
72	NC_010519	GGCA	2	8	30164	30171	25 %	0 %	50 %	25 %	170718518
73	NC_010519	TTAA	2	8	30221	30228	50 %	50 %	0 %	0 %	170718518
74	NC_010519	TAAC	2	8	30283	30290	50 %	25 %	0 %	25 %	170718529
75	NC_010519	AATT	2	8	30340	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	170718529
76	NC_010519	AAGA	2	8	30600	30607	75 %	0 %	25 %	0 %	170718529
77	NC_010519	AATT	2	8	31529	31536	50 %	50 %	0 %	0 %	170718541
78	NC_010519	TAAG	2	8	31925	31932	50 %	25 %	25 %	0 %	170718541
79	NC_010519	TTAT	2	8	32874	32881	25 %	75 %	0 %	0 %	170718552
80	NC_010519	ATGA	2	8	32971	32978	50 %	25 %	25 %	0 %	170718552
81	NC_010519	CTGC	2	8	33436	33443	0 %	25 %	25 %	50 %	170718552
82	NC_010519	GTCA	2	8	33475	33482	25 %	25 %	25 %	25 %	170718552
83	NC_010519	ATCG	2	8	34008	34015	25 %	25 %	25 %	25 %	170718563
84	NC_010519	AATT	2	8	34410	34417	50 %	50 %	0 %	0 %	170718574
85	NC_010519	GAAA	2	8	34696	34703	75 %	0 %	25 %	0 %	170718574
86	NC_010519	GATC	2	8	34795	34802	25 %	25 %	25 %	25 %	170718574
87	NC_010519	TTTA	2	8	35277	35284	25 %	75 %	0 %	0 %	170718585
88	NC_010519	ACTT	2	8	35375	35382	25 %	50 %	0 %	25 %	170718585
89	NC_010519	TTTA	2	8	35452	35459	25 %	75 %	0 %	0 %	170718585
90	NC_010519	AATA	2	8	36341	36348	75 %	25 %	0 %	0 %	170718593
91	NC_010519	ATGA	2	8	36528	36535	50 %	25 %	25 %	0 %	170718593
92	NC_010519	ATGG	2	8	36844	36851	25 %	25 %	50 %	0 %	170718604
93	NC_010519	TGGA	2	8	36923	36930	25 %	25 %	50 %	0 %	170718604
94	NC_010519	CAAG	2	8	37388	37395	50 %	0 %	25 %	25 %	170718604
95	NC_010519	GTTG	2	8	37966	37973	0 %	50 %	50 %	0 %	170718615
96	NC_010519	TAAG	2	8	38041	38048	50 %	25 %	25 %	0 %	170718615
97	NC_010519	AACC	2	8	38356	38363	50 %	0 %	0 %	50 %	170718615
98	NC_010519	TTTG	2	8	38556	38563	0 %	75 %	25 %	0 %	170718615
99	NC_010519	ATCT	2	8	39086	39093	25 %	50 %	0 %	25 %	170718615
100	NC_010519	TATT	2	8	39361	39368	25 %	75 %	0 %	0 %	170718615
101	NC_010519	CATA	2	8	39902	39909	50 %	25 %	0 %	25 %	170718615
102	NC_010519	GCCA	2	8	40844	40851	25 %	0 %	25 %	50 %	170718626
103	NC_010519	TTTG	2	8	40957	40964	0 %	75 %	25 %	0 %	170718626
104	NC_010519	AAGT	2	8	41098	41105	50 %	25 %	25 %	0 %	170718626
105	NC_010519	TAAT	2	8	41172	41179	50 %	50 %	0 %	0 %	170718626
106	NC_010519	AAAT	2	8	41284	41291	75 %	25 %	0 %	0 %	170718626
107	NC_010519	ATTG	2	8	41929	41936	25 %	50 %	25 %	0 %	170718637
108	NC_010519	TTAA	2	8	42209	42216	50 %	50 %	0 %	0 %	170718637
109	NC_010519	CCAA	2	8	43376	43383	50 %	0 %	0 %	50 %	170718647
110	NC_010519	AATT	2	8	43410	43417	50 %	50 %	0 %	0 %	170718647
111	NC_010519	TAAA	2	8	43716	43723	75 %	25 %	0 %	0 %	170718647
112	NC_010519	CAAC	2	8	45191	45198	50 %	0 %	0 %	50 %	170718669
113	NC_010519	GTTT	2	8	45212	45219	0 %	75 %	25 %	0 %	170718669
114	NC_010519	ACCG	2	8	46202	46209	25 %	0 %	25 %	50 %	170718680
115	NC_010519	GTAG	2	8	46343	46350	25 %	25 %	50 %	0 %	170718680
116	NC_010519	ATCA	2	8	46365	46372	50 %	25 %	0 %	25 %	170718680
117	NC_010519	ATCA	2	8	46562	46569	50 %	25 %	0 %	25 %	170718689
118	NC_010519	AATT	2	8	46879	46886	50 %	50 %	0 %	0 %	170718689
119	NC_010519	AGTA	2	8	46950	46957	50 %	25 %	25 %	0 %	170718689
120	NC_010519	CAAA	2	8	46986	46993	75 %	0 %	0 %	25 %	170718689
121	NC_010519	TTTC	2	8	48213	48220	0 %	75 %	0 %	25 %	170718689
122	NC_010519	TACC	2	8	49047	49054	25 %	25 %	0 %	50 %	170718689
123	NC_010519	TAAA	2	8	49749	49756	75 %	25 %	0 %	0 %	170718700
124	NC_010519	TAAA	2	8	50345	50352	75 %	25 %	0 %	0 %	170718711
125	NC_010519	AAAT	2	8	50662	50669	75 %	25 %	0 %	0 %	170718711
126	NC_010519	GAAA	2	8	51179	51186	75 %	0 %	25 %	0 %	170718722
127	NC_010519	ATTT	2	8	51227	51234	25 %	75 %	0 %	0 %	170718722
128	NC_010519	CAAG	2	8	51469	51476	50 %	0 %	25 %	25 %	170718722
129	NC_010519	AGCA	2	8	52463	52470	50 %	0 %	25 %	25 %	170718742
130	NC_010519	CTAT	2	8	52717	52724	25 %	50 %	0 %	25 %	170718742
131	NC_010519	CAAT	2	8	52760	52767	50 %	25 %	0 %	25 %	170718742
132	NC_010519	TAAT	2	8	53429	53436	50 %	50 %	0 %	0 %	170718754
133	NC_010519	CAGA	2	8	53806	53813	50 %	0 %	25 %	25 %	170718754
134	NC_010519	AACT	2	8	54602	54609	50 %	25 %	0 %	25 %	170718763
135	NC_010519	TCAT	2	8	54621	54628	25 %	50 %	0 %	25 %	170718763
136	NC_010519	TAAT	2	8	54881	54888	50 %	50 %	0 %	0 %	170718774
137	NC_010519	TTAC	2	8	55144	55151	25 %	50 %	0 %	25 %	170718774
138	NC_010519	ACCT	2	8	56242	56249	25 %	25 %	0 %	50 %	170718785
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