MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 41066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_010519	GGC	2	6	25305	25310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170718452
503	NC_010519	GTAAA	2	10	25367	25376	60 %	20 %	20 %	0 %	170718452
504	NC_010519	A	7	7	25374	25380	100 %	0 %	0 %	0 %	170718452
505	NC_010519	TTATT	2	10	25442	25451	20 %	80 %	0 %	0 %	170718452
506	NC_010519	AGC	2	6	25483	25488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718452
507	NC_010519	ATT	2	6	25501	25506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718452
508	NC_010519	CTT	2	6	25523	25528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718452
509	NC_010519	TTC	2	6	25550	25555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718452
510	NC_010519	GTA	2	6	25645	25650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718452
511	NC_010519	GAA	2	6	25651	25656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718452
512	NC_010519	TTGG	2	8	25695	25702	0 %	50 %	50 %	0 %	170718452
513	NC_010519	TCA	2	6	25707	25712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718452
514	NC_010519	TAT	2	6	25725	25730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718452
515	NC_010519	CTG	2	6	25739	25744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718452
516	NC_010519	GCG	2	6	25807	25812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170718452
517	NC_010519	ATT	4	12	25869	25880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718452
518	NC_010519	TGG	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170718452
519	NC_010519	A	6	6	25979	25984	100 %	0 %	0 %	0 %	170718463
520	NC_010519	GCTG	2	8	26029	26036	0 %	25 %	50 %	25 %	170718463
521	NC_010519	TTG	2	6	26058	26063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718463
522	NC_010519	TCC	2	6	26084	26089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170718463
523	NC_010519	CAA	2	6	26120	26125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718463
524	NC_010519	AGA	2	6	26134	26139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718463
525	NC_010519	GCT	2	6	26177	26182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718463
526	NC_010519	CAA	2	6	26207	26212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718463
527	NC_010519	CAA	2	6	26342	26347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718463
528	NC_010519	GGAA	2	8	26356	26363	50 %	0 %	50 %	0 %	170718463
529	NC_010519	GTG	2	6	26477	26482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170718463
530	NC_010519	TGC	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718463
531	NC_010519	CAG	3	9	26598	26606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718463
532	NC_010519	A	6	6	26628	26633	100 %	0 %	0 %	0 %	170718463
533	NC_010519	TTA	2	6	26661	26666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718463
534	NC_010519	AG	3	6	26774	26779	50 %	0 %	50 %	0 %	170718463
535	NC_010519	TAA	2	6	26809	26814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718463
536	NC_010519	GAA	2	6	26897	26902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718463
537	NC_010519	GAT	2	6	26964	26969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718474
538	NC_010519	AGA	2	6	27027	27032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718474
539	NC_010519	CAA	2	6	27068	27073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718474
540	NC_010519	AAT	2	6	27214	27219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718474
541	NC_010519	TTA	2	6	27241	27246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718474
542	NC_010519	GAT	2	6	27259	27264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718474
543	NC_010519	TCTA	2	8	27298	27305	25 %	50 %	0 %	25 %	170718474
544	NC_010519	GAT	2	6	27333	27338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718474
545	NC_010519	A	6	6	27340	27345	100 %	0 %	0 %	0 %	170718474
546	NC_010519	ATT	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718474
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548	NC_010519	ACTA	2	8	27403	27410	50 %	25 %	0 %	25 %	170718474
549	NC_010519	GCA	2	6	27466	27471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718474
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551	NC_010519	GGA	2	6	27630	27635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170718474
552	NC_010519	AT	3	6	27642	27647	50 %	50 %	0 %	0 %	170718474
553	NC_010519	TAC	2	6	27654	27659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718474
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556	NC_010519	A	8	8	27968	27975	100 %	0 %	0 %	0 %	170718485
557	NC_010519	TTG	2	6	27979	27984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718485
558	NC_010519	AGA	2	6	28001	28006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718485
559	NC_010519	GAA	2	6	28089	28094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718485
560	NC_010519	GAA	2	6	28116	28121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718485
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562	NC_010519	AAT	2	6	28167	28172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718485
563	NC_010519	A	7	7	28332	28338	100 %	0 %	0 %	0 %	170718496
564	NC_010519	GCA	2	6	28366	28371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718496
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571	NC_010519	A	6	6	28567	28572	100 %	0 %	0 %	0 %	170718496
572	NC_010519	GCT	2	6	28573	28578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718496
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577	NC_010519	CAA	2	6	28863	28868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718507
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584	NC_010519	TAC	2	6	29275	29280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718507
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602	NC_010519	TAAC	2	8	30283	30290	50 %	25 %	0 %	25 %	170718529
603	NC_010519	AATT	2	8	30340	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	170718529
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609	NC_010519	A	6	6	30430	30435	100 %	0 %	0 %	0 %	170718529
610	NC_010519	TAA	2	6	30470	30475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718529
611	NC_010519	GTG	2	6	30499	30504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170718529
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613	NC_010519	TAG	2	6	30538	30543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718529
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615	NC_010519	AAGA	2	8	30600	30607	75 %	0 %	25 %	0 %	170718529
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621	NC_010519	T	6	6	31006	31011	0 %	100 %	0 %	0 %	170718541
622	NC_010519	AGA	2	6	31032	31037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718541
623	NC_010519	TCT	2	6	31038	31043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718541
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626	NC_010519	CTT	2	6	31216	31221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718541
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