MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	TG	3	6	1308	1313	0 %	50 %	50 %	0 %	169237355
2	NC_010368	TC	3	6	1358	1363	0 %	50 %	0 %	50 %	169237355
3	NC_010368	CA	3	6	3084	3089	50 %	0 %	0 %	50 %	169237355
4	NC_010368	GA	3	6	3146	3151	50 %	0 %	50 %	0 %	169237355
5	NC_010368	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	169237356
6	NC_010368	GC	3	6	6387	6392	0 %	0 %	50 %	50 %	169237356
7	NC_010368	GA	3	6	6549	6554	50 %	0 %	50 %	0 %	169237356
8	NC_010368	TG	3	6	6670	6675	0 %	50 %	50 %	0 %	169237356
9	NC_010368	GC	3	6	7600	7605	0 %	0 %	50 %	50 %	169237357
10	NC_010368	GC	3	6	10295	10300	0 %	0 %	50 %	50 %	169237359
11	NC_010368	GA	3	6	10344	10349	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
12	NC_010368	AG	3	6	10840	10845	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
13	NC_010368	TC	3	6	10948	10953	0 %	50 %	0 %	50 %	169237359
14	NC_010368	GA	3	6	10975	10980	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
15	NC_010368	GC	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	169237359
16	NC_010368	TC	3	6	11459	11464	0 %	50 %	0 %	50 %	169237360
17	NC_010368	GA	3	6	11570	11575	50 %	0 %	50 %	0 %	169237360
18	NC_010368	AG	3	6	12985	12990	50 %	0 %	50 %	0 %	169237360
19	NC_010368	CG	3	6	13069	13074	0 %	0 %	50 %	50 %	169237360
20	NC_010368	TC	3	6	14648	14653	0 %	50 %	0 %	50 %	169237361
21	NC_010368	GC	3	6	14855	14860	0 %	0 %	50 %	50 %	169237361
22	NC_010368	AC	4	8	15452	15459	50 %	0 %	0 %	50 %	169237362
23	NC_010368	TG	3	6	15819	15824	0 %	50 %	50 %	0 %	169237363
24	NC_010368	CG	3	6	19144	19149	0 %	0 %	50 %	50 %	169237365
25	NC_010368	GA	3	6	19497	19502	50 %	0 %	50 %	0 %	169237365
26	NC_010368	AC	3	6	19583	19588	50 %	0 %	0 %	50 %	169237365
27	NC_010368	CT	3	6	19849	19854	0 %	50 %	0 %	50 %	169237366
28	NC_010368	TC	3	6	20359	20364	0 %	50 %	0 %	50 %	169237367
29	NC_010368	AC	3	6	20663	20668	50 %	0 %	0 %	50 %	169237367
30	NC_010368	CG	3	6	21652	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	169237370
31	NC_010368	GA	3	6	22187	22192	50 %	0 %	50 %	0 %	169237370
32	NC_010368	CG	3	6	22251	22256	0 %	0 %	50 %	50 %	169237370
33	NC_010368	CT	3	6	22257	22262	0 %	50 %	0 %	50 %	169237370
34	NC_010368	GA	3	6	24686	24691	50 %	0 %	50 %	0 %	169237371
35	NC_010368	GC	3	6	25657	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	169237372
36	NC_010368	GA	3	6	26087	26092	50 %	0 %	50 %	0 %	169237374
37	NC_010368	TC	3	6	27251	27256	0 %	50 %	0 %	50 %	169237375
38	NC_010368	TC	3	6	27261	27266	0 %	50 %	0 %	50 %	169237375
39	NC_010368	AC	3	6	28465	28470	50 %	0 %	0 %	50 %	169237376
40	NC_010368	CT	3	6	28614	28619	0 %	50 %	0 %	50 %	169237376
41	NC_010368	CT	3	6	29004	29009	0 %	50 %	0 %	50 %	169237376
42	NC_010368	TG	3	6	29889	29894	0 %	50 %	50 %	0 %	169237377
43	NC_010368	GT	3	6	31083	31088	0 %	50 %	50 %	0 %	169237379
44	NC_010368	GC	3	6	32065	32070	0 %	0 %	50 %	50 %	169237379
45	NC_010368	TC	3	6	32439	32444	0 %	50 %	0 %	50 %	169237379
46	NC_010368	GC	3	6	32500	32505	0 %	0 %	50 %	50 %	169237379
47	NC_010368	CG	3	6	32747	32752	0 %	0 %	50 %	50 %	169237380
48	NC_010368	AC	3	6	35584	35589	50 %	0 %	0 %	50 %	169237382
49	NC_010368	TC	3	6	37392	37397	0 %	50 %	0 %	50 %	169237384
50	NC_010368	GA	3	6	37618	37623	50 %	0 %	50 %	0 %	169237384
51	NC_010368	GT	3	6	37816	37821	0 %	50 %	50 %	0 %	169237385
52	NC_010368	CT	3	6	37834	37839	0 %	50 %	0 %	50 %	169237385
53	NC_010368	CG	3	6	38261	38266	0 %	0 %	50 %	50 %	169237385
54	NC_010368	AC	3	6	38376	38381	50 %	0 %	0 %	50 %	169237385
55	NC_010368	GC	3	6	39680	39685	0 %	0 %	50 %	50 %	169237387
56	NC_010368	GA	3	6	39990	39995	50 %	0 %	50 %	0 %	169237387
57	NC_010368	CA	3	6	40122	40127	50 %	0 %	0 %	50 %	169237387
58	NC_010368	AG	3	6	40419	40424	50 %	0 %	50 %	0 %	169237387
59	NC_010368	GC	3	6	40930	40935	0 %	0 %	50 %	50 %	169237388
60	NC_010368	GA	3	6	41031	41036	50 %	0 %	50 %	0 %	169237388
61	NC_010368	GT	3	6	41442	41447	0 %	50 %	50 %	0 %	169237388
62	NC_010368	CT	3	6	43595	43600	0 %	50 %	0 %	50 %	169237391
63	NC_010368	AC	3	6	44261	44266	50 %	0 %	0 %	50 %	169237392
64	NC_010368	CT	3	6	45151	45156	0 %	50 %	0 %	50 %	169237394
65	NC_010368	CT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	0 %	50 %	169237400
66	NC_010368	CG	3	6	48623	48628	0 %	0 %	50 %	50 %	169237400
67	NC_010368	AT	3	6	50346	50351	50 %	50 %	0 %	0 %	169237402
68	NC_010368	CT	3	6	50811	50816	0 %	50 %	0 %	50 %	169237403
69	NC_010368	GC	3	6	53050	53055	0 %	0 %	50 %	50 %	169237406
70	NC_010368	AC	3	6	54200	54205	50 %	0 %	0 %	50 %	169237408
71	NC_010368	GC	3	6	54558	54563	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
72	NC_010368	GC	3	6	55140	55145	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
73	NC_010368	CG	3	6	55342	55347	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
74	NC_010368	CG	4	8	55989	55996	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
75	NC_010368	CG	3	6	56404	56409	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
76	NC_010368	CG	3	6	56856	56861	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
77	NC_010368	CG	3	6	56878	56883	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
78	NC_010368	GC	3	6	57363	57368	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
79	NC_010368	GC	3	6	57831	57836	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
80	NC_010368	GC	3	6	57990	57995	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
81	NC_010368	GC	3	6	58505	58510	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
82	NC_010368	GC	3	6	58622	58627	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
83	NC_010368	AC	3	6	58837	58842	50 %	0 %	0 %	50 %	169237410
84	NC_010368	GC	3	6	59236	59241	0 %	0 %	50 %	50 %	169237411
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86	NC_010368	GT	3	6	60151	60156	0 %	50 %	50 %	0 %	169237412
87	NC_010368	GC	3	6	60776	60781	0 %	0 %	50 %	50 %	169237412
88	NC_010368	AC	3	6	61026	61031	50 %	0 %	0 %	50 %	169237413
89	NC_010368	CG	3	6	61271	61276	0 %	0 %	50 %	50 %	169237413
90	NC_010368	GC	3	6	61431	61436	0 %	0 %	50 %	50 %	169237413
91	NC_010368	AC	3	6	61728	61733	50 %	0 %	0 %	50 %	169237413
92	NC_010368	GC	3	6	63013	63018	0 %	0 %	50 %	50 %	169237414
93	NC_010368	GC	3	6	63185	63190	0 %	0 %	50 %	50 %	169237414
94	NC_010368	GT	3	6	63496	63501	0 %	50 %	50 %	0 %	169237415
95	NC_010368	GC	3	6	64625	64630	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
96	NC_010368	CA	3	6	66324	66329	50 %	0 %	0 %	50 %	169237416
97	NC_010368	AT	3	6	66970	66975	50 %	50 %	0 %	0 %	169237417
98	NC_010368	CG	3	6	67277	67282	0 %	0 %	50 %	50 %	169237417
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100	NC_010368	GA	3	6	68759	68764	50 %	0 %	50 %	0 %	169237419
101	NC_010368	AC	3	6	69200	69205	50 %	0 %	0 %	50 %	169237420
102	NC_010368	CG	3	6	69812	69817	0 %	0 %	50 %	50 %	169237422
103	NC_010368	GC	3	6	70018	70023	0 %	0 %	50 %	50 %	169237422
104	NC_010368	TG	3	6	70570	70575	0 %	50 %	50 %	0 %	169237423
105	NC_010368	GC	3	6	71355	71360	0 %	0 %	50 %	50 %	169237425
106	NC_010368	CG	3	6	71404	71409	0 %	0 %	50 %	50 %	169237425
107	NC_010368	GT	3	6	71464	71469	0 %	50 %	50 %	0 %	169237425
108	NC_010368	CG	3	6	71717	71722	0 %	0 %	50 %	50 %	169237426
109	NC_010368	GC	3	6	72612	72617	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
110	NC_010368	GC	3	6	72655	72660	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
111	NC_010368	CG	3	6	72789	72794	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
112	NC_010368	CG	3	6	74734	74739	0 %	0 %	50 %	50 %	169237430
113	NC_010368	AC	3	6	76130	76135	50 %	0 %	0 %	50 %	169237432
114	NC_010368	CG	3	6	76498	76503	0 %	0 %	50 %	50 %	169237433
115	NC_010368	GT	3	6	77312	77317	0 %	50 %	50 %	0 %	169237433
116	NC_010368	CG	3	6	77970	77975	0 %	0 %	50 %	50 %	169237435
117	NC_010368	GT	3	6	78111	78116	0 %	50 %	50 %	0 %	169237435
118	NC_010368	CG	3	6	78437	78442	0 %	0 %	50 %	50 %	169237435
119	NC_010368	GC	3	6	79220	79225	0 %	0 %	50 %	50 %	169237436
120	NC_010368	CG	3	6	79248	79253	0 %	0 %	50 %	50 %	169237436
121	NC_010368	AC	3	6	79973	79978	50 %	0 %	0 %	50 %	169237437
122	NC_010368	CG	4	8	80574	80581	0 %	0 %	50 %	50 %	169237438
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124	NC_010368	GC	3	6	80869	80874	0 %	0 %	50 %	50 %	169237439
125	NC_010368	GC	3	6	80960	80965	0 %	0 %	50 %	50 %	169237439
126	NC_010368	GC	3	6	81213	81218	0 %	0 %	50 %	50 %	169237440
127	NC_010368	GC	3	6	81688	81693	0 %	0 %	50 %	50 %	169237440
128	NC_010368	CG	3	6	81792	81797	0 %	0 %	50 %	50 %	169237441
129	NC_010368	TG	3	6	81839	81844	0 %	50 %	50 %	0 %	169237441
130	NC_010368	CG	3	6	83347	83352	0 %	0 %	50 %	50 %	169237442
131	NC_010368	GC	3	6	84279	84284	0 %	0 %	50 %	50 %	169237443
132	NC_010368	AC	3	6	84396	84401	50 %	0 %	0 %	50 %	169237443
133	NC_010368	CG	3	6	86344	86349	0 %	0 %	50 %	50 %	169237444
134	NC_010368	CG	3	6	86526	86531	0 %	0 %	50 %	50 %	169237445
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138	NC_010368	GT	3	6	87742	87747	0 %	50 %	50 %	0 %	169237446
139	NC_010368	CG	3	6	88125	88130	0 %	0 %	50 %	50 %	169237446
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.