MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 4002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	TCG	2	6	15	20	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237354
2	NC_010368	CCG	2	6	122	127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237354
3	NC_010368	ACG	2	6	141	146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237354
4	NC_010368	GAG	3	9	173	181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237354
5	NC_010368	AGG	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237354
6	NC_010368	CGG	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237354
7	NC_010368	AAG	2	6	407	412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237354
8	NC_010368	TCA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237354
9	NC_010368	TCG	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237354
10	NC_010368	CGT	2	6	436	441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237354
11	NC_010368	CGA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237354
12	NC_010368	GGA	2	6	499	504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237354
13	NC_010368	GTA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237354
14	NC_010368	GCT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237354
15	NC_010368	ACG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237354
16	NC_010368	CGT	2	6	674	679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237354
17	NC_010368	CCG	2	6	713	718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237354
18	NC_010368	TGA	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237354
19	NC_010368	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237354
20	NC_010368	CTC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237354
21	NC_010368	GTA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237354
22	NC_010368	GGT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237355
23	NC_010368	GCA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
24	NC_010368	GCC	2	6	995	1000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237355
25	NC_010368	TTG	2	6	1073	1078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237355
26	NC_010368	CCG	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237355
27	NC_010368	TTA	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237355
28	NC_010368	TCG	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
29	NC_010368	GTC	3	9	1222	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
30	NC_010368	GTA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
31	NC_010368	ACG	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
32	NC_010368	GCT	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
33	NC_010368	GAG	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
34	NC_010368	AGG	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
35	NC_010368	GGA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
36	NC_010368	CTG	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
37	NC_010368	CAG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
38	NC_010368	TCG	2	6	1514	1519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
39	NC_010368	TCT	2	6	1520	1525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237355
40	NC_010368	CAC	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237355
41	NC_010368	CGT	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
42	NC_010368	GCT	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
43	NC_010368	GCT	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
44	NC_010368	GGT	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237355
45	NC_010368	GTC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
46	NC_010368	TGA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
47	NC_010368	TGC	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
48	NC_010368	TCC	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237355
49	NC_010368	CGG	3	9	2050	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237355
50	NC_010368	ACG	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
51	NC_010368	TGT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237355
52	NC_010368	TCG	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
53	NC_010368	TCG	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
54	NC_010368	CCT	2	6	2367	2372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237355
55	NC_010368	GAT	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
56	NC_010368	GAT	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
57	NC_010368	CGT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
58	NC_010368	CCG	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237355
59	NC_010368	TGG	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237355
60	NC_010368	GCG	3	9	2774	2782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237355
61	NC_010368	GTC	2	6	2788	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
62	NC_010368	CTC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237355
63	NC_010368	AAC	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237355
64	NC_010368	CGA	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
65	NC_010368	ATC	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237355
66	NC_010368	GGA	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
67	NC_010368	GAA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237355
68	NC_010368	CGT	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
69	NC_010368	CGA	2	6	3108	3113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
70	NC_010368	GAC	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
71	NC_010368	CCA	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237355
72	NC_010368	CGT	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
73	NC_010368	TGA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
74	NC_010368	CAC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237355
75	NC_010368	CGG	2	6	3226	3231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237355
76	NC_010368	TCG	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
77	NC_010368	CCT	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237355
78	NC_010368	CTG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
79	NC_010368	CTG	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
80	NC_010368	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
81	NC_010368	GTC	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
82	NC_010368	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237355
83	NC_010368	CTT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237355
84	NC_010368	GTC	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
85	NC_010368	TCG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
86	NC_010368	TTC	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237355
87	NC_010368	GTC	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
88	NC_010368	GCT	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
89	NC_010368	CGA	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
90	NC_010368	CGA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
91	NC_010368	CGC	2	6	3881	3886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237355
92	NC_010368	GAC	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
93	NC_010368	TCG	2	6	3965	3970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
94	NC_010368	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237355
95	NC_010368	GCG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237355
96	NC_010368	GTC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
97	NC_010368	GCG	2	6	4179	4184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237355
98	NC_010368	TGA	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237355
99	NC_010368	CGA	2	6	4254	4259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
100	NC_010368	CGA	2	6	4365	4370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237355
101	NC_010368	GTC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237355
102	NC_010368	GTG	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237355
103	NC_010368	CCG	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237356
104	NC_010368	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237356
105	NC_010368	CCA	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237356
106	NC_010368	TCG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
107	NC_010368	CTC	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
108	NC_010368	GAA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237356
109	NC_010368	GGT	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237356
110	NC_010368	ATG	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237356
111	NC_010368	TCG	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
112	NC_010368	CCT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
113	NC_010368	TGC	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
114	NC_010368	CTG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
115	NC_010368	AGC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237356
116	NC_010368	TCC	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
117	NC_010368	CCT	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
118	NC_010368	CTC	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
119	NC_010368	GTT	2	6	5546	5551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237356
120	NC_010368	CAT	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237356
121	NC_010368	TCG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
122	NC_010368	GTC	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
123	NC_010368	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
124	NC_010368	CGG	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237356
125	NC_010368	GAA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237356
126	NC_010368	CGT	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
127	NC_010368	CCG	2	6	5835	5840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237356
128	NC_010368	GTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237356
129	NC_010368	GAT	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237356
130	NC_010368	ACC	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237356
131	NC_010368	CGC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237356
132	NC_010368	CCT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237356
133	NC_010368	TCG	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
134	NC_010368	GCG	2	6	6106	6111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237356
135	NC_010368	GCC	2	6	6134	6139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237356
136	NC_010368	GCG	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237356
137	NC_010368	GTC	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
138	NC_010368	GTC	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
139	NC_010368	TCG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
140	NC_010368	TGA	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237356
141	NC_010368	GTC	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
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144	NC_010368	CGT	3	9	6596	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
145	NC_010368	CGC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237356
146	NC_010368	GTC	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
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149	NC_010368	TCG	2	6	6765	6770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237356
150	NC_010368	GGA	2	6	6910	6915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237356
151	NC_010368	TCC	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237357
152	NC_010368	GAT	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237357
153	NC_010368	GTT	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237357
154	NC_010368	ACG	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237357
155	NC_010368	TCG	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237357
156	NC_010368	CGG	2	6	7060	7065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237357
157	NC_010368	ACC	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237357
158	NC_010368	CTG	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237357
159	NC_010368	CGT	2	6	7106	7111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237357
160	NC_010368	CGG	2	6	7174	7179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237357
161	NC_010368	TCG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237357
162	NC_010368	GTA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237357
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164	NC_010368	GAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237357
165	NC_010368	CTC	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237357
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168	NC_010368	GTC	2	6	7533	7538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237357
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172	NC_010368	GGT	2	6	7814	7819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237357
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247	NC_010368	GAC	2	6	13408	13413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237360
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252	NC_010368	ATC	2	6	13939	13944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237360
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255	NC_010368	GTG	2	6	14355	14360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237361
256	NC_010368	GTC	2	6	14363	14368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237361
257	NC_010368	CTG	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237361
258	NC_010368	CCT	2	6	14431	14436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237361
259	NC_010368	CGA	2	6	14515	14520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237361
260	NC_010368	CGT	2	6	14530	14535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237361
261	NC_010368	GGA	2	6	14560	14565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237361
262	NC_010368	CTG	2	6	14573	14578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237361
263	NC_010368	GAT	2	6	14608	14613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237361
264	NC_010368	GCC	2	6	14670	14675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237361
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268	NC_010368	CGG	2	6	14812	14817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237361
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270	NC_010368	TCC	2	6	14841	14846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237361
271	NC_010368	GAG	2	6	14906	14911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237361
272	NC_010368	AAC	2	6	14940	14945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237361
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276	NC_010368	TCA	2	6	15114	15119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237362
277	NC_010368	CCG	2	6	15120	15125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237362
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280	NC_010368	TAC	2	6	15414	15419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237362
281	NC_010368	AGA	2	6	15505	15510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237362
282	NC_010368	CTC	2	6	15513	15518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237362
283	NC_010368	AGT	2	6	15574	15579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237362
284	NC_010368	ACC	2	6	15855	15860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237363
285	NC_010368	CGA	2	6	15920	15925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237363
286	NC_010368	GGC	2	6	16059	16064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237363
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288	NC_010368	ACA	2	6	16303	16308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237363
289	NC_010368	CGT	2	6	16364	16369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237363
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