MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 5313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010368	TCG	2	6	171570	171575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3502	NC_010368	CGA	2	6	171590	171595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3503	NC_010368	TGC	2	6	171630	171635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3504	NC_010368	CAG	2	6	171698	171703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3505	NC_010368	TCC	2	6	171774	171779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237515
3506	NC_010368	GTT	2	6	171794	171799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237515
3507	NC_010368	AGT	2	6	171820	171825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237515
3508	NC_010368	CCGCC	2	10	171889	171898	0 %	0 %	20 %	80 %	169237515
3509	NC_010368	GTA	2	6	171914	171919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237515
3510	NC_010368	CTGG	2	8	171928	171935	0 %	25 %	50 %	25 %	169237515
3511	NC_010368	GTC	2	6	171938	171943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3512	NC_010368	CCG	2	6	171951	171956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237515
3513	NC_010368	GTT	2	6	171962	171967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237515
3514	NC_010368	TGC	2	6	171977	171982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3515	NC_010368	GGA	2	6	172042	172047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237515
3516	NC_010368	TGAG	2	8	172159	172166	25 %	25 %	50 %	0 %	169237515
3517	NC_010368	CGT	2	6	172213	172218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3518	NC_010368	CCG	2	6	172245	172250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237515
3519	NC_010368	GAGT	2	8	172260	172267	25 %	25 %	50 %	0 %	169237515
3520	NC_010368	TGC	2	6	172293	172298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3521	NC_010368	CGA	2	6	172310	172315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3522	NC_010368	GTC	3	9	172319	172327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3523	NC_010368	TCGAC	2	10	172348	172357	20 %	20 %	20 %	40 %	169237515
3524	NC_010368	AGTAGA	2	12	172402	172413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169237515
3525	NC_010368	GTC	2	6	172454	172459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3526	NC_010368	CGC	2	6	172510	172515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237515
3527	NC_010368	GAG	2	6	172541	172546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237515
3528	NC_010368	AGT	2	6	172580	172585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237515
3529	NC_010368	TTG	2	6	172813	172818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237516
3530	NC_010368	GGA	2	6	172906	172911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237516
3531	NC_010368	TCC	2	6	173000	173005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237516
3532	NC_010368	GAT	2	6	173049	173054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237516
3533	NC_010368	GCA	2	6	173059	173064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237516
3534	NC_010368	CG	3	6	173102	173107	0 %	0 %	50 %	50 %	169237516
3535	NC_010368	GTT	2	6	173111	173116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237516
3536	NC_010368	GAC	2	6	173137	173142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237516
3537	NC_010368	CGA	2	6	173563	173568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3538	NC_010368	TGA	2	6	173569	173574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237517
3539	NC_010368	CTC	2	6	173599	173604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237517
3540	NC_010368	GAC	2	6	173608	173613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3541	NC_010368	ACG	2	6	173672	173677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3542	NC_010368	ACG	2	6	173681	173686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3543	NC_010368	ACC	2	6	173703	173708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237517
3544	NC_010368	ACGGAG	2	12	173744	173755	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	169237517
3545	NC_010368	CTC	2	6	173758	173763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237517
3546	NC_010368	TG	4	8	173778	173785	0 %	50 %	50 %	0 %	169237517
3547	NC_010368	CGA	2	6	173827	173832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3548	NC_010368	CAC	2	6	173965	173970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237517
3549	NC_010368	AATC	2	8	174058	174065	50 %	25 %	0 %	25 %	169237517
3550	NC_010368	TGA	2	6	174087	174092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237517
3551	NC_010368	GTC	2	6	174095	174100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3552	NC_010368	CCG	2	6	174147	174152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237517
3553	NC_010368	TCG	2	6	174249	174254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3554	NC_010368	ACGT	2	8	174455	174462	25 %	25 %	25 %	25 %	169237517
3555	NC_010368	ACGA	2	8	174504	174511	50 %	0 %	25 %	25 %	169237517
3556	NC_010368	CCGAA	2	10	174538	174547	40 %	0 %	20 %	40 %	169237517
3557	NC_010368	GTG	2	6	174588	174593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237517
3558	NC_010368	ACG	2	6	174686	174691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3559	NC_010368	CGA	2	6	174706	174711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237517
3560	NC_010368	ACC	2	6	175115	175120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237518
3561	NC_010368	GCC	2	6	175180	175185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237518
3562	NC_010368	CTGG	2	8	175204	175211	0 %	25 %	50 %	25 %	169237518
3563	NC_010368	GCA	2	6	175226	175231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237518
3564	NC_010368	CAT	2	6	175255	175260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237518
3565	NC_010368	GTC	2	6	175309	175314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237518
3566	NC_010368	ATC	2	6	175412	175417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237518
3567	NC_010368	CGG	2	6	175419	175424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237518
3568	NC_010368	AC	3	6	175434	175439	50 %	0 %	0 %	50 %	169237518
3569	NC_010368	GAC	2	6	175593	175598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3570	NC_010368	CAT	2	6	175629	175634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237519
3571	NC_010368	GAG	2	6	175638	175643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237519
3572	NC_010368	GCC	2	6	175680	175685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237519
3573	NC_010368	GTC	2	6	175707	175712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3574	NC_010368	CGT	2	6	175721	175726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3575	NC_010368	GTC	2	6	175743	175748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3576	NC_010368	GTG	3	9	175768	175776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237519
3577	NC_010368	GGT	2	6	175809	175814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237519
3578	NC_010368	CGT	2	6	175905	175910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3579	NC_010368	CG	3	6	175923	175928	0 %	0 %	50 %	50 %	169237519
3580	NC_010368	TGA	2	6	175994	175999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237519
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3582	NC_010368	CGA	2	6	176057	176062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237519
3583	NC_010368	TG	3	6	176098	176103	0 %	50 %	50 %	0 %	169237519
3584	NC_010368	GAG	2	6	176106	176111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237519
3585	NC_010368	CGAT	2	8	176131	176138	25 %	25 %	25 %	25 %	169237519
3586	NC_010368	AGG	2	6	176179	176184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237519
3587	NC_010368	GCG	2	6	176188	176193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237519
3588	NC_010368	ATA	2	6	176250	176255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237519
3589	NC_010368	TTA	2	6	176276	176281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237519
3590	NC_010368	CGGC	2	8	176284	176291	0 %	0 %	50 %	50 %	169237519
3591	NC_010368	AGT	2	6	176293	176298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237519
3592	NC_010368	AGTG	2	8	176343	176350	25 %	25 %	50 %	0 %	169237519
3593	NC_010368	ACG	2	6	176459	176464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3594	NC_010368	CTC	2	6	176465	176470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237520
3595	NC_010368	CCA	2	6	176473	176478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237520
3596	NC_010368	TCG	2	6	176490	176495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3597	NC_010368	CAAC	2	8	176497	176504	50 %	0 %	0 %	50 %	169237520
3598	NC_010368	CCACG	2	10	176541	176550	20 %	0 %	20 %	60 %	169237520
3599	NC_010368	GCT	2	6	176571	176576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3600	NC_010368	ACTG	2	8	176593	176600	25 %	25 %	25 %	25 %	169237520
3601	NC_010368	CCA	2	6	176603	176608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237520
3602	NC_010368	ACA	2	6	176649	176654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237520
3603	NC_010368	GACA	2	8	176797	176804	50 %	0 %	25 %	25 %	169237520
3604	NC_010368	ACG	2	6	176842	176847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3605	NC_010368	GC	3	6	176860	176865	0 %	0 %	50 %	50 %	169237520
3606	NC_010368	TCA	2	6	176868	176873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237520
3607	NC_010368	ATC	2	6	176876	176881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237520
3608	NC_010368	GA	3	6	176908	176913	50 %	0 %	50 %	0 %	169237520
3609	NC_010368	AGT	2	6	176917	176922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237520
3610	NC_010368	CGGAAT	2	12	176950	176961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237520
3611	NC_010368	ACG	2	6	176962	176967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3612	NC_010368	CA	3	6	176983	176988	50 %	0 %	0 %	50 %	169237520
3613	NC_010368	CGA	2	6	177061	177066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3614	NC_010368	ACG	2	6	177196	177201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237520
3615	NC_010368	CAA	2	6	177260	177265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237520
3616	NC_010368	GA	3	6	177283	177288	50 %	0 %	50 %	0 %	169237520
3617	NC_010368	CCAT	2	8	177306	177313	25 %	25 %	0 %	50 %	169237520
3618	NC_010368	GTA	3	9	177565	177573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237521
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3620	NC_010368	TCG	2	6	177611	177616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237521
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3742	NC_010368	ACT	2	6	184111	184116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237526
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3863	NC_010368	CGTA	2	8	191052	191059	25 %	25 %	25 %	25 %	169237533
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3979	NC_010368	TGTGG	2	10	201403	201412	0 %	40 %	60 %	0 %	169237542
3980	NC_010368	CGT	2	6	201452	201457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237542
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3982	NC_010368	GCG	2	6	201487	201492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237542
3983	NC_010368	CCCG	2	8	201546	201553	0 %	0 %	25 %	75 %	169237542
3984	NC_010368	CGT	2	6	201609	201614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237542
3985	NC_010368	ATG	2	6	201980	201985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237543
3986	NC_010368	CTTG	2	8	202003	202010	0 %	50 %	25 %	25 %	169237543
3987	NC_010368	GTCG	2	8	202075	202082	0 %	25 %	50 %	25 %	169237543
3988	NC_010368	TGA	2	6	202158	202163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237543
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3990	NC_010368	AAG	2	6	202254	202259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237543
3991	NC_010368	ACG	2	6	202431	202436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237543
3992	NC_010368	TTG	2	6	202458	202463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237543
3993	NC_010368	CCG	2	6	202494	202499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237543
3994	NC_010368	CTC	2	6	202500	202505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237543
3995	NC_010368	CAAAT	2	10	202541	202550	60 %	20 %	0 %	20 %	169237543
3996	NC_010368	CT	3	6	202910	202915	0 %	50 %	0 %	50 %	169237544
3997	NC_010368	CGA	2	6	202930	202935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237544
3998	NC_010368	TCG	2	6	202938	202943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237544
3999	NC_010368	CGA	2	6	202975	202980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237544
4000	NC_010368	TCG	2	6	202998	203003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237544

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