MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 5313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010368	TGCT	2	8	142213	142220	0 %	50 %	25 %	25 %	169237493
3002	NC_010368	AC	3	6	142230	142235	50 %	0 %	0 %	50 %	169237493
3003	NC_010368	ACT	2	6	143436	143441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237494
3004	NC_010368	CGA	2	6	143479	143484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3005	NC_010368	CCA	2	6	143562	143567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3006	NC_010368	ACC	2	6	143655	143660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3007	NC_010368	ACA	2	6	143688	143693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3008	NC_010368	CAG	2	6	143702	143707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3009	NC_010368	CAA	2	6	143716	143721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3010	NC_010368	ACC	2	6	143748	143753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3011	NC_010368	GTC	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3012	NC_010368	CAGA	2	8	143902	143909	50 %	0 %	25 %	25 %	169237494
3013	NC_010368	GCG	2	6	143949	143954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3014	NC_010368	CGA	2	6	144292	144297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3015	NC_010368	ACC	2	6	144298	144303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3016	NC_010368	ACT	2	6	144312	144317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237494
3017	NC_010368	GCG	2	6	144433	144438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3018	NC_010368	ACA	2	6	144474	144479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3019	NC_010368	GCG	2	6	144489	144494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3020	NC_010368	GGA	2	6	144589	144594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237494
3021	NC_010368	GC	3	6	144652	144657	0 %	0 %	50 %	50 %	169237494
3022	NC_010368	CGT	2	6	144662	144667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3023	NC_010368	GAAA	2	8	144726	144733	75 %	0 %	25 %	0 %	169237494
3024	NC_010368	TGA	2	6	144736	144741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237494
3025	NC_010368	CTG	2	6	144751	144756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3026	NC_010368	GCC	2	6	144830	144835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237494
3027	NC_010368	AG	3	6	144842	144847	50 %	0 %	50 %	0 %	169237494
3028	NC_010368	TAC	2	6	145225	145230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237495
3029	NC_010368	TAG	2	6	145570	145575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3030	NC_010368	TGA	2	6	145586	145591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3031	NC_010368	CCG	2	6	145594	145599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237496
3032	NC_010368	CGA	2	6	145643	145648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237496
3033	NC_010368	GAT	2	6	145669	145674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3034	NC_010368	AAT	2	6	145683	145688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237496
3035	NC_010368	GCT	2	6	145693	145698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237496
3036	NC_010368	GCT	2	6	146004	146009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3037	NC_010368	ACC	2	6	146021	146026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237497
3038	NC_010368	TGA	2	6	146069	146074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3039	NC_010368	GC	3	6	146084	146089	0 %	0 %	50 %	50 %	169237497
3040	NC_010368	GTT	2	6	146138	146143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3041	NC_010368	GCT	2	6	146166	146171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3042	NC_010368	CGTT	2	8	146272	146279	0 %	50 %	25 %	25 %	169237497
3043	NC_010368	GA	3	6	146290	146295	50 %	0 %	50 %	0 %	169237497
3044	NC_010368	GAT	2	6	146301	146306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3045	NC_010368	TTG	2	6	146377	146382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3046	NC_010368	GTT	2	6	146606	146611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3047	NC_010368	ACG	2	6	146629	146634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3048	NC_010368	TCG	2	6	146677	146682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3049	NC_010368	CGA	2	6	146747	146752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3050	NC_010368	TCG	2	6	146842	146847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3051	NC_010368	GC	3	6	146943	146948	0 %	0 %	50 %	50 %	169237497
3052	NC_010368	GCT	2	6	146960	146965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3053	NC_010368	TGA	2	6	146996	147001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3054	NC_010368	CAT	2	6	147023	147028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237497
3055	NC_010368	ATC	2	6	147039	147044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237497
3056	NC_010368	GCG	2	6	147048	147053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237497
3057	NC_010368	GCT	2	6	147059	147064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3058	NC_010368	CGA	3	9	147122	147130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3059	NC_010368	CGT	2	6	147139	147144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3060	NC_010368	CGA	2	6	147248	147253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3061	NC_010368	TGT	2	6	147259	147264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3062	NC_010368	GTC	2	6	147266	147271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3063	NC_010368	GAC	2	6	148455	148460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237498
3064	NC_010368	TGG	2	6	148524	148529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237498
3065	NC_010368	GGT	2	6	148563	148568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237498
3066	NC_010368	CTC	2	6	148627	148632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237498
3067	NC_010368	AAG	2	6	148664	148669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237498
3068	NC_010368	CAGATG	2	12	149351	149362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237499
3069	NC_010368	GCA	2	6	149401	149406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3070	NC_010368	AG	3	6	149445	149450	50 %	0 %	50 %	0 %	169237499
3071	NC_010368	TGC	2	6	149482	149487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3072	NC_010368	GAA	2	6	149508	149513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237499
3073	NC_010368	CGT	2	6	149585	149590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3074	NC_010368	CAA	2	6	149605	149610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237499
3075	NC_010368	CGA	2	6	149663	149668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3076	NC_010368	ACG	2	6	149680	149685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3077	NC_010368	GCG	2	6	149717	149722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237499
3078	NC_010368	ACC	2	6	149725	149730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237499
3079	NC_010368	CTT	2	6	149756	149761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237499
3080	NC_010368	GCA	2	6	149771	149776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3081	NC_010368	GGT	2	6	149784	149789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237499
3082	NC_010368	TCG	2	6	149857	149862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3083	NC_010368	GCC	2	6	149884	149889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237499
3084	NC_010368	GT	3	6	149972	149977	0 %	50 %	50 %	0 %	169237499
3085	NC_010368	CCG	2	6	150016	150021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237499
3086	NC_010368	GCGA	2	8	150051	150058	25 %	0 %	50 %	25 %	169237499
3087	NC_010368	CGA	2	6	150083	150088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3088	NC_010368	CAT	2	6	150188	150193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237499
3089	NC_010368	CA	3	6	150229	150234	50 %	0 %	0 %	50 %	169237499
3090	NC_010368	TCT	2	6	150265	150270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237499
3091	NC_010368	GAC	2	6	151321	151326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3092	NC_010368	GGT	2	6	151327	151332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237500
3093	NC_010368	TCA	2	6	151418	151423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237500
3094	NC_010368	CCG	2	6	151424	151429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237500
3095	NC_010368	AC	3	6	151444	151449	50 %	0 %	0 %	50 %	169237500
3096	NC_010368	GGA	2	6	151533	151538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237500
3097	NC_010368	ACG	2	6	151601	151606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3098	NC_010368	ACTC	2	8	151616	151623	25 %	25 %	0 %	50 %	169237500
3099	NC_010368	CAG	2	6	151749	151754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3100	NC_010368	TC	3	6	151770	151775	0 %	50 %	0 %	50 %	169237500
3101	NC_010368	CGA	2	6	151794	151799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3102	NC_010368	GGTCG	2	10	151800	151809	0 %	20 %	60 %	20 %	169237500
3103	NC_010368	GAG	2	6	151816	151821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237500
3104	NC_010368	CGA	2	6	151869	151874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3105	NC_010368	GCCA	2	8	151936	151943	25 %	0 %	25 %	50 %	169237500
3106	NC_010368	CCAG	2	8	152057	152064	25 %	0 %	25 %	50 %	169237500
3107	NC_010368	CGA	2	6	152067	152072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3108	NC_010368	TGAG	2	8	152075	152082	25 %	25 %	50 %	0 %	169237500
3109	NC_010368	ATC	2	6	152083	152088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237500
3110	NC_010368	GGT	2	6	152184	152189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237500
3111	NC_010368	GCTG	2	8	152208	152215	0 %	25 %	50 %	25 %	169237500
3112	NC_010368	GAGC	2	8	152227	152234	25 %	0 %	50 %	25 %	169237500
3113	NC_010368	CGA	2	6	152235	152240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3114	NC_010368	GAT	2	6	152250	152255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237500
3115	NC_010368	ACG	2	6	152308	152313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3116	NC_010368	GAG	2	6	152320	152325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237500
3117	NC_010368	AG	3	6	152341	152346	50 %	0 %	50 %	0 %	169237500
3118	NC_010368	CGA	2	6	152382	152387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237500
3119	NC_010368	CGAC	2	8	152420	152427	25 %	0 %	25 %	50 %	169237500
3120	NC_010368	CGC	2	6	152433	152438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237500
3121	NC_010368	TGA	2	6	152466	152471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237500
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3123	NC_010368	TCA	2	6	152862	152867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237501
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3131	NC_010368	CTG	2	6	153388	153393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237501
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3235	NC_010368	TGAC	2	8	159328	159335	25 %	25 %	25 %	25 %	169237504
3236	NC_010368	GGGCC	2	10	159367	159376	0 %	0 %	60 %	40 %	169237504
3237	NC_010368	CGA	2	6	159395	159400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237504
3238	NC_010368	AG	3	6	159411	159416	50 %	0 %	50 %	0 %	169237504
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3240	NC_010368	CGC	2	6	159467	159472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237504
3241	NC_010368	CG	3	6	159479	159484	0 %	0 %	50 %	50 %	169237504
3242	NC_010368	CGA	2	6	159512	159517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237504
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3480	NC_010368	CCGAG	2	10	170645	170654	20 %	0 %	40 %	40 %	169237514
3481	NC_010368	ATG	2	6	170695	170700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237514
3482	NC_010368	GTCCG	2	10	170723	170732	0 %	20 %	40 %	40 %	169237514
3483	NC_010368	GATC	2	8	170846	170853	25 %	25 %	25 %	25 %	169237514
3484	NC_010368	ATC	2	6	170893	170898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237514
3485	NC_010368	GATC	2	8	170948	170955	25 %	25 %	25 %	25 %	169237514
3486	NC_010368	GTT	2	6	171000	171005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237514
3487	NC_010368	CGC	2	6	171030	171035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237514
3488	NC_010368	CGT	2	6	171153	171158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237514
3489	NC_010368	GAC	2	6	171282	171287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237514
3490	NC_010368	AGC	2	6	171319	171324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237514
3491	NC_010368	CA	3	6	171338	171343	50 %	0 %	0 %	50 %	169237514
3492	NC_010368	CGG	2	6	171355	171360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237514
3493	NC_010368	AGT	2	6	171378	171383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237514
3494	NC_010368	GCCG	2	8	171423	171430	0 %	0 %	50 %	50 %	169237514
3495	NC_010368	TGG	2	6	171431	171436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237514
3496	NC_010368	GCC	2	6	171451	171456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237514
3497	NC_010368	GAT	2	6	171488	171493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237515
3498	NC_010368	TGC	2	6	171501	171506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3499	NC_010368	CGA	2	6	171508	171513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237515
3500	NC_010368	CTC	2	6	171551	171556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237515

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