MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	GAA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237314
2	NC_010367	ATA	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237314
3	NC_010367	GTT	2	6	292	297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237314
4	NC_010367	GAC	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237314
5	NC_010367	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237314
6	NC_010367	GAC	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237314
7	NC_010367	TCT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237314
8	NC_010367	AGC	2	6	445	450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237314
9	NC_010367	ACG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237314
10	NC_010367	TAA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237314
11	NC_010367	TCG	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237315
12	NC_010367	GCG	2	6	1096	1101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237315
13	NC_010367	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237315
14	NC_010367	TCC	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237315
15	NC_010367	GGC	2	6	1248	1253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237315
16	NC_010367	GGC	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237315
17	NC_010367	AGC	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237315
18	NC_010367	GAC	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237315
19	NC_010367	CCG	2	6	1354	1359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237315
20	NC_010367	CTG	2	6	1453	1458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237315
21	NC_010367	GAC	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237315
22	NC_010367	TCG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237315
23	NC_010367	TCG	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237315
24	NC_010367	GAG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237315
25	NC_010367	GAT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237315
26	NC_010367	CGA	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237315
27	NC_010367	CCG	2	6	1640	1645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237315
28	NC_010367	CGA	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237316
29	NC_010367	CGT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237316
30	NC_010367	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237316
31	NC_010367	GAA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237316
32	NC_010367	TTC	2	6	2082	2087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237316
33	NC_010367	GTC	2	6	2094	2099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237316
34	NC_010367	ACT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237317
35	NC_010367	CGC	2	6	2366	2371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237317
36	NC_010367	CGC	2	6	2387	2392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237317
37	NC_010367	GTC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237317
38	NC_010367	CGC	2	6	2441	2446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237317
39	NC_010367	TCC	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237317
40	NC_010367	GCT	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237317
41	NC_010367	CTC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237317
42	NC_010367	TTC	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237318
43	NC_010367	CGT	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237318
44	NC_010367	GAC	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237318
45	NC_010367	GGA	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237319
46	NC_010367	TAC	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237319
47	NC_010367	CAC	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237319
48	NC_010367	TGC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237319
49	NC_010367	CGC	2	6	3144	3149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237319
50	NC_010367	CGA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237319
51	NC_010367	GCT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237319
52	NC_010367	TTG	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237320
53	NC_010367	CGT	3	9	3598	3606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237320
54	NC_010367	AGG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237320
55	NC_010367	CGT	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237320
56	NC_010367	GAG	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237321
57	NC_010367	TCA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237321
58	NC_010367	CAA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237321
59	NC_010367	TCA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237321
60	NC_010367	GAG	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237321
61	NC_010367	ACC	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237321
62	NC_010367	CCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237321
63	NC_010367	CGA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237321
64	NC_010367	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237321
65	NC_010367	CTC	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237321
66	NC_010367	GTT	2	6	4345	4350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237321
67	NC_010367	CAC	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237321
68	NC_010367	GAC	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237321
69	NC_010367	GCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237321
70	NC_010367	CGA	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237321
71	NC_010367	GCC	2	6	4646	4651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237321
72	NC_010367	CGA	2	6	4660	4665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237321
73	NC_010367	ACC	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237321
74	NC_010367	CAT	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237322
75	NC_010367	CGA	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237322
76	NC_010367	ACC	2	6	4886	4891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237322
77	NC_010367	ACT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237322
78	NC_010367	ATC	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237322
79	NC_010367	GAG	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237322
80	NC_010367	GAC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237322
81	NC_010367	TCG	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237322
82	NC_010367	TGA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237322
83	NC_010367	CGA	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237323
84	NC_010367	CAT	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237323
85	NC_010367	CAG	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237323
86	NC_010367	GTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
87	NC_010367	CTT	2	6	5427	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237323
88	NC_010367	TCG	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
89	NC_010367	ATC	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237323
90	NC_010367	CGT	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
91	NC_010367	TCG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
92	NC_010367	CGG	2	6	5846	5851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237323
93	NC_010367	CGT	2	6	5978	5983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
94	NC_010367	GAG	2	6	6021	6026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237323
95	NC_010367	CGT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
96	NC_010367	GTC	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
97	NC_010367	TGG	2	6	6184	6189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237323
98	NC_010367	CAG	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237323
99	NC_010367	CTG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
100	NC_010367	GCG	2	6	6340	6345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237323
101	NC_010367	TCG	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
102	NC_010367	GCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237323
103	NC_010367	GCG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237323
104	NC_010367	GGC	3	9	6609	6617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237324
105	NC_010367	GTC	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
106	NC_010367	TGA	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237324
107	NC_010367	TCT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237324
108	NC_010367	AAT	2	6	6751	6756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237324
109	NC_010367	GTT	2	6	6928	6933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237324
110	NC_010367	GAT	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237324
111	NC_010367	GTC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
112	NC_010367	TCT	2	6	6999	7004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237324
113	NC_010367	CGG	2	6	7005	7010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237324
114	NC_010367	CGA	2	6	7052	7057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
115	NC_010367	CGT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
116	NC_010367	TCG	3	9	7160	7168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
117	NC_010367	TTC	2	6	7180	7185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237324
118	NC_010367	TCG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
119	NC_010367	GAC	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
120	NC_010367	TCG	2	6	7406	7411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237324
121	NC_010367	ACG	2	6	7412	7417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
122	NC_010367	GTT	2	6	7472	7477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237324
123	NC_010367	GCC	3	9	7504	7512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237324
124	NC_010367	CAG	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
125	NC_010367	TTG	2	6	7590	7595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237324
126	NC_010367	GAC	2	6	7597	7602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
127	NC_010367	GGA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237324
128	NC_010367	CGG	2	6	7688	7693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237324
129	NC_010367	AGC	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237324
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254	NC_010367	GAC	2	6	14739	14744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237329
255	NC_010367	GGA	2	6	14798	14803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237329
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258	NC_010367	TTG	2	6	15364	15369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237329
259	NC_010367	CCG	2	6	15379	15384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237329
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261	NC_010367	CTT	2	6	15518	15523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237329
262	NC_010367	ACG	2	6	15556	15561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237329
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280	NC_010367	GCT	2	6	16904	16909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237329
281	NC_010367	GTG	2	6	16963	16968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237329
282	NC_010367	TGA	3	9	17012	17020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237329
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285	NC_010367	ATT	2	6	17385	17390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237329
286	NC_010367	CTC	2	6	17498	17503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237330
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371	NC_010367	TGA	2	6	23638	23643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237334
372	NC_010367	CGA	2	6	23659	23664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237334
373	NC_010367	CTT	2	6	23807	23812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237334
374	NC_010367	AGT	2	6	23820	23825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237334
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499	NC_010367	CCG	2	6	32202	32207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237338
500	NC_010367	AGA	2	6	32236	32241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237338

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