MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010366	CG	3	6	602	607	0 %	0 %	50 %	50 %	169237161
2	NC_010366	CG	3	6	3405	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	169237163
3	NC_010366	GC	3	6	3533	3538	0 %	0 %	50 %	50 %	169237163
4	NC_010366	AG	3	6	4718	4723	50 %	0 %	50 %	0 %	169237166
5	NC_010366	AT	3	6	4761	4766	50 %	50 %	0 %	0 %	169237166
6	NC_010366	TG	3	6	5723	5728	0 %	50 %	50 %	0 %	169237167
7	NC_010366	CT	3	6	7848	7853	0 %	50 %	0 %	50 %	169237167
8	NC_010366	TC	3	6	8174	8179	0 %	50 %	0 %	50 %	169237168
9	NC_010366	CT	3	6	9456	9461	0 %	50 %	0 %	50 %	169237169
10	NC_010366	CG	3	6	10529	10534	0 %	0 %	50 %	50 %	169237169
11	NC_010366	AG	3	6	13105	13110	50 %	0 %	50 %	0 %	169237170
12	NC_010366	TG	3	6	13395	13400	0 %	50 %	50 %	0 %	169237170
13	NC_010366	CG	3	6	13571	13576	0 %	0 %	50 %	50 %	169237170
14	NC_010366	AC	3	6	14010	14015	50 %	0 %	0 %	50 %	169237170
15	NC_010366	TC	3	6	14501	14506	0 %	50 %	0 %	50 %	169237171
16	NC_010366	TC	3	6	14673	14678	0 %	50 %	0 %	50 %	169237171
17	NC_010366	CA	3	6	15797	15802	50 %	0 %	0 %	50 %	169237172
18	NC_010366	GT	3	6	16679	16684	0 %	50 %	50 %	0 %	169237173
19	NC_010366	GC	3	6	19839	19844	0 %	0 %	50 %	50 %	169237180
20	NC_010366	TC	3	6	20106	20111	0 %	50 %	0 %	50 %	169237181
21	NC_010366	GA	3	6	21356	21361	50 %	0 %	50 %	0 %	169237182
22	NC_010366	GT	3	6	22499	22504	0 %	50 %	50 %	0 %	169237183
23	NC_010366	TC	3	6	22585	22590	0 %	50 %	0 %	50 %	169237183
24	NC_010366	CG	3	6	22938	22943	0 %	0 %	50 %	50 %	169237183
25	NC_010366	GT	3	6	23960	23965	0 %	50 %	50 %	0 %	169237184
26	NC_010366	CA	3	6	24387	24392	50 %	0 %	0 %	50 %	169237185
27	NC_010366	AT	3	6	24643	24648	50 %	50 %	0 %	0 %	169237185
28	NC_010366	TC	3	6	25039	25044	0 %	50 %	0 %	50 %	169237185
29	NC_010366	CG	4	8	25654	25661	0 %	0 %	50 %	50 %	169237186
30	NC_010366	CT	3	6	26517	26522	0 %	50 %	0 %	50 %	169237187
31	NC_010366	CG	3	6	26535	26540	0 %	0 %	50 %	50 %	169237187
32	NC_010366	CG	3	6	28111	28116	0 %	0 %	50 %	50 %	169237189
33	NC_010366	GC	3	6	29672	29677	0 %	0 %	50 %	50 %	169237189
34	NC_010366	AT	3	6	30015	30020	50 %	50 %	0 %	0 %	169237189
35	NC_010366	TC	3	6	31509	31514	0 %	50 %	0 %	50 %	169237191
36	NC_010366	GA	3	6	32920	32925	50 %	0 %	50 %	0 %	169237192
37	NC_010366	GT	3	6	33482	33487	0 %	50 %	50 %	0 %	169237193
38	NC_010366	TC	3	6	33568	33573	0 %	50 %	0 %	50 %	169237193
39	NC_010366	CG	3	6	33921	33926	0 %	0 %	50 %	50 %	169237193
40	NC_010366	CA	3	6	36118	36123	50 %	0 %	0 %	50 %	169237194
41	NC_010366	AC	3	6	36418	36423	50 %	0 %	0 %	50 %	169237194
42	NC_010366	CG	3	6	36584	36589	0 %	0 %	50 %	50 %	169237194
43	NC_010366	TG	3	6	36622	36627	0 %	50 %	50 %	0 %	169237194
44	NC_010366	GT	3	6	37196	37201	0 %	50 %	50 %	0 %	169237195
45	NC_010366	GC	3	6	37269	37274	0 %	0 %	50 %	50 %	169237195
46	NC_010366	AC	3	6	37331	37336	50 %	0 %	0 %	50 %	169237195
47	NC_010366	CT	3	6	37368	37373	0 %	50 %	0 %	50 %	169237195
48	NC_010366	CT	3	6	37420	37425	0 %	50 %	0 %	50 %	169237195
49	NC_010366	GA	3	6	37475	37480	50 %	0 %	50 %	0 %	169237195
50	NC_010366	GC	3	6	38099	38104	0 %	0 %	50 %	50 %	169237195
51	NC_010366	GC	3	6	38128	38133	0 %	0 %	50 %	50 %	169237195
52	NC_010366	GA	3	6	39201	39206	50 %	0 %	50 %	0 %	169237197
53	NC_010366	CA	3	6	40031	40036	50 %	0 %	0 %	50 %	169237199
54	NC_010366	GA	3	6	40048	40053	50 %	0 %	50 %	0 %	169237199
55	NC_010366	GA	3	6	41786	41791	50 %	0 %	50 %	0 %	169237202
56	NC_010366	TG	3	6	41941	41946	0 %	50 %	50 %	0 %	169237202
57	NC_010366	TC	3	6	41947	41952	0 %	50 %	0 %	50 %	169237202
58	NC_010366	CT	3	6	43157	43162	0 %	50 %	0 %	50 %	169237204
59	NC_010366	TC	4	8	43223	43230	0 %	50 %	0 %	50 %	169237204
60	NC_010366	AG	3	6	44224	44229	50 %	0 %	50 %	0 %	169237204
61	NC_010366	CG	3	6	44797	44802	0 %	0 %	50 %	50 %	169237205
62	NC_010366	CT	3	6	45246	45251	0 %	50 %	0 %	50 %	169237205
63	NC_010366	GC	3	6	45316	45321	0 %	0 %	50 %	50 %	169237205
64	NC_010366	GA	3	6	45401	45406	50 %	0 %	50 %	0 %	169237205
65	NC_010366	CG	4	8	46167	46174	0 %	0 %	50 %	50 %	169237206
66	NC_010366	GT	3	6	46218	46223	0 %	50 %	50 %	0 %	169237206
67	NC_010366	GC	3	6	47076	47081	0 %	0 %	50 %	50 %	169237208
68	NC_010366	AC	3	6	47462	47467	50 %	0 %	0 %	50 %	169237208
69	NC_010366	GC	3	6	47572	47577	0 %	0 %	50 %	50 %	169237208
70	NC_010366	GC	3	6	47586	47591	0 %	0 %	50 %	50 %	169237208
71	NC_010366	GC	3	6	47653	47658	0 %	0 %	50 %	50 %	169237208
72	NC_010366	CT	3	6	47906	47911	0 %	50 %	0 %	50 %	169237208
73	NC_010366	CG	3	6	48279	48284	0 %	0 %	50 %	50 %	169237209
74	NC_010366	CG	3	6	48628	48633	0 %	0 %	50 %	50 %	169237210
75	NC_010366	TC	3	6	50423	50428	0 %	50 %	0 %	50 %	169237212
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81	NC_010366	GC	4	8	56053	56060	0 %	0 %	50 %	50 %	169237219
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84	NC_010366	GC	3	6	57677	57682	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
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87	NC_010366	TC	3	6	59454	59459	0 %	50 %	0 %	50 %	169237223
88	NC_010366	CG	3	6	59726	59731	0 %	0 %	50 %	50 %	169237224
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90	NC_010366	AG	3	6	60591	60596	50 %	0 %	50 %	0 %	169237224
91	NC_010366	CA	3	6	61519	61524	50 %	0 %	0 %	50 %	169237225
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93	NC_010366	AC	3	6	61654	61659	50 %	0 %	0 %	50 %	169237225
94	NC_010366	AG	3	6	62283	62288	50 %	0 %	50 %	0 %	169237226
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98	NC_010366	GA	3	6	63364	63369	50 %	0 %	50 %	0 %	169237227
99	NC_010366	GA	4	8	63476	63483	50 %	0 %	50 %	0 %	169237227
100	NC_010366	GA	3	6	63723	63728	50 %	0 %	50 %	0 %	169237227
101	NC_010366	AG	3	6	63753	63758	50 %	0 %	50 %	0 %	169237227
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103	NC_010366	CG	3	6	64660	64665	0 %	0 %	50 %	50 %	169237228
104	NC_010366	CG	3	6	65533	65538	0 %	0 %	50 %	50 %	169237229
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110	NC_010366	AG	3	6	70644	70649	50 %	0 %	50 %	0 %	169237234
111	NC_010366	GA	3	6	71635	71640	50 %	0 %	50 %	0 %	169237235
112	NC_010366	CA	3	6	71918	71923	50 %	0 %	0 %	50 %	169237235
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119	NC_010366	CA	3	6	77108	77113	50 %	0 %	0 %	50 %	169237239
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124	NC_010366	AC	3	6	81425	81430	50 %	0 %	0 %	50 %	169237242
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.