MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 40736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	CGG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
2	NC_010364	CCG	2	6	342	347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235050
3	NC_010364	CAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235050
4	NC_010364	GCG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
5	NC_010364	ACC	2	6	591	596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235050
6	NC_010364	TCT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235050
7	NC_010364	TCG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235050
8	NC_010364	GCG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
9	NC_010364	CGA	3	9	925	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235050
10	NC_010364	GCG	2	6	1044	1049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
11	NC_010364	CGC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235050
12	NC_010364	CGG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
13	NC_010364	CGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235050
14	NC_010364	ACT	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235050
15	NC_010364	CCG	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235050
16	NC_010364	CGT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235050
17	NC_010364	GCG	2	6	1275	1280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235050
18	NC_010364	CAG	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235050
19	NC_010364	TCG	4	12	1416	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235050
20	NC_010364	CAT	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235051
21	NC_010364	CGG	2	6	1535	1540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235051
22	NC_010364	CGT	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235051
23	NC_010364	CGG	2	6	1628	1633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235051
24	NC_010364	GAG	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235051
25	NC_010364	CGC	2	6	1696	1701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235051
26	NC_010364	CCT	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235051
27	NC_010364	CGG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235051
28	NC_010364	CAG	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235051
29	NC_010364	CTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235051
30	NC_010364	CGA	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235051
31	NC_010364	GAG	3	9	2014	2022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235051
32	NC_010364	GAG	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235051
33	NC_010364	TCG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235051
34	NC_010364	CAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235052
35	NC_010364	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235052
36	NC_010364	CGT	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235052
37	NC_010364	TTC	2	6	2420	2425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235052
38	NC_010364	ACA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235052
39	NC_010364	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235052
40	NC_010364	ACG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235052
41	NC_010364	ATC	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235052
42	NC_010364	ACC	3	9	2625	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235052
43	NC_010364	CGG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235052
44	NC_010364	TCG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235052
45	NC_010364	GAG	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235052
46	NC_010364	AAC	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235052
47	NC_010364	TGG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235052
48	NC_010364	TGA	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235052
49	NC_010364	TGC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235052
50	NC_010364	AGC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235052
51	NC_010364	ACC	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235053
52	NC_010364	CTC	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235053
53	NC_010364	TCG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
54	NC_010364	CGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
55	NC_010364	TCG	3	9	3485	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
56	NC_010364	GCG	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
57	NC_010364	CGC	2	6	3648	3653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
58	NC_010364	TTG	2	6	3658	3663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235053
59	NC_010364	GTC	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
60	NC_010364	CGT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
61	NC_010364	TAC	3	9	3742	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235053
62	NC_010364	GCA	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
63	NC_010364	GCT	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
64	NC_010364	CTG	2	6	3829	3834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
65	NC_010364	GTG	3	9	3835	3843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235053
66	NC_010364	GCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
67	NC_010364	CGG	2	6	3867	3872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
68	NC_010364	CGC	3	9	3882	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
69	NC_010364	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235053
70	NC_010364	CGG	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
71	NC_010364	CTG	2	6	3949	3954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
72	NC_010364	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
73	NC_010364	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235053
74	NC_010364	CGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
75	NC_010364	CGC	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
76	NC_010364	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
77	NC_010364	GCT	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
78	NC_010364	CGC	2	6	4295	4300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
79	NC_010364	CGC	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
80	NC_010364	CCG	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
81	NC_010364	GCG	2	6	4337	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
82	NC_010364	GCT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
83	NC_010364	TGC	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
84	NC_010364	CAC	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235053
85	NC_010364	GCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
86	NC_010364	CGC	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
87	NC_010364	CGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
88	NC_010364	CGA	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
89	NC_010364	AGG	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235053
90	NC_010364	TCG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
91	NC_010364	ACG	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
92	NC_010364	TCT	3	9	4661	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235053
93	NC_010364	GCT	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
94	NC_010364	GTT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235053
95	NC_010364	TCG	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
96	NC_010364	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235053
97	NC_010364	CCG	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
98	NC_010364	TCG	2	6	4915	4920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
99	NC_010364	TCG	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
100	NC_010364	CGC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
101	NC_010364	CGA	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
102	NC_010364	GCG	2	6	5086	5091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
103	NC_010364	CGA	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
104	NC_010364	CAC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235053
105	NC_010364	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235053
106	NC_010364	ACG	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235053
107	NC_010364	TCC	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235053
108	NC_010364	CGC	2	6	5271	5276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
109	NC_010364	TCG	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
110	NC_010364	CGT	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235053
111	NC_010364	CCG	2	6	5438	5443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
112	NC_010364	CCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
113	NC_010364	CGG	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
114	NC_010364	CGG	2	6	5603	5608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235053
115	NC_010364	CCG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235053
116	NC_010364	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235054
117	NC_010364	GTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235054
118	NC_010364	CCA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235054
119	NC_010364	CCG	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235054
120	NC_010364	AGA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235054
121	NC_010364	CTG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
122	NC_010364	GCG	3	9	6169	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235054
123	NC_010364	CAG	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235054
124	NC_010364	GCG	2	6	6229	6234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235054
125	NC_010364	CGT	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
126	NC_010364	TGC	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
127	NC_010364	CCA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235054
128	NC_010364	GCC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235054
129	NC_010364	ACG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235054
130	NC_010364	GCT	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
131	NC_010364	CGC	2	6	6735	6740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235054
132	NC_010364	CGT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
133	NC_010364	CGA	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235054
134	NC_010364	CCA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235054
135	NC_010364	CGT	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
136	NC_010364	CGG	3	9	6968	6976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235054
137	NC_010364	CAG	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235054
138	NC_010364	GAC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235054
139	NC_010364	TCG	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235054
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141	NC_010364	GAT	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235054
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143	NC_010364	CGC	2	6	7304	7309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235054
144	NC_010364	GCC	3	9	7332	7340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235054
145	NC_010364	CGG	2	6	7355	7360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235054
146	NC_010364	GTC	2	6	7478	7483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
147	NC_010364	GAC	2	6	7496	7501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235055
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149	NC_010364	CGA	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235055
150	NC_010364	CCA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235055
151	NC_010364	TGG	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235055
152	NC_010364	CAC	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235055
153	NC_010364	CGA	2	6	7690	7695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235055
154	NC_010364	ACT	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235055
155	NC_010364	CTG	2	6	7874	7879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
156	NC_010364	TCG	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
157	NC_010364	CGG	2	6	7922	7927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235055
158	NC_010364	TGA	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235055
159	NC_010364	CGT	2	6	8005	8010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
160	NC_010364	TCG	2	6	8046	8051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
161	NC_010364	CCG	2	6	8090	8095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235055
162	NC_010364	CGC	2	6	8099	8104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235055
163	NC_010364	CCA	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235055
164	NC_010364	GCT	2	6	8173	8178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235055
165	NC_010364	CCG	2	6	8199	8204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235055
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169	NC_010364	GTT	2	6	8695	8700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235056
170	NC_010364	GTC	2	6	8760	8765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235056
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173	NC_010364	CGT	3	9	8837	8845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235056
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239	NC_010364	ATC	2	6	13756	13761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235059
240	NC_010364	GAC	2	6	13768	13773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235059
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243	NC_010364	CGT	2	6	13946	13951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235060
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245	NC_010364	TTG	2	6	14083	14088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235060
246	NC_010364	GCG	2	6	14089	14094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235060
247	NC_010364	TAG	2	6	14587	14592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235061
248	NC_010364	GCA	2	6	14658	14663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235061
249	NC_010364	CGG	2	6	14710	14715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235061
250	NC_010364	ATG	2	6	14868	14873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235062
251	NC_010364	GCT	2	6	14976	14981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235062
252	NC_010364	CTG	2	6	15015	15020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235062
253	NC_010364	CCA	2	6	15117	15122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235062
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