MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	CG	3	6	1244	1249	0 %	0 %	50 %	50 %	159901511
2	NC_009973	CG	3	6	5037	5042	0 %	0 %	50 %	50 %	159901515
3	NC_009973	GA	3	6	6091	6096	50 %	0 %	50 %	0 %	159901515
4	NC_009973	AC	3	6	12132	12137	50 %	0 %	0 %	50 %	159901517
5	NC_009973	CA	3	6	13064	13069	50 %	0 %	0 %	50 %	159901518
6	NC_009973	TG	3	6	14639	14644	0 %	50 %	50 %	0 %	159901519
7	NC_009973	AG	3	6	16740	16745	50 %	0 %	50 %	0 %	159901521
8	NC_009973	CA	4	8	21344	21351	50 %	0 %	0 %	50 %	159901524
9	NC_009973	CA	3	6	21595	21600	50 %	0 %	0 %	50 %	159901524
10	NC_009973	TA	3	6	22878	22883	50 %	50 %	0 %	0 %	159901526
11	NC_009973	CA	3	6	25049	25054	50 %	0 %	0 %	50 %	159901529
12	NC_009973	GT	3	6	25735	25740	0 %	50 %	50 %	0 %	159901530
13	NC_009973	GA	3	6	28201	28206	50 %	0 %	50 %	0 %	159901533
14	NC_009973	TC	3	6	28494	28499	0 %	50 %	0 %	50 %	159901533
15	NC_009973	AC	3	6	28572	28577	50 %	0 %	0 %	50 %	159901533
16	NC_009973	GT	3	6	28813	28818	0 %	50 %	50 %	0 %	159901533
17	NC_009973	AT	3	6	28885	28890	50 %	50 %	0 %	0 %	159901533
18	NC_009973	GT	3	6	29822	29827	0 %	50 %	50 %	0 %	159901534
19	NC_009973	CA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	0 %	50 %	159901534
20	NC_009973	GT	3	6	32716	32721	0 %	50 %	50 %	0 %	159901536
21	NC_009973	CG	3	6	35056	35061	0 %	0 %	50 %	50 %	159901538
22	NC_009973	CA	3	6	35102	35107	50 %	0 %	0 %	50 %	159901538
23	NC_009973	GT	3	6	36952	36957	0 %	50 %	50 %	0 %	159901539
24	NC_009973	CG	3	6	39141	39146	0 %	0 %	50 %	50 %	159901541
25	NC_009973	CA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	0 %	50 %	159901541
26	NC_009973	TC	3	6	39790	39795	0 %	50 %	0 %	50 %	159901541
27	NC_009973	GT	3	6	41170	41175	0 %	50 %	50 %	0 %	159901542
28	NC_009973	AG	3	6	41411	41416	50 %	0 %	50 %	0 %	159901542
29	NC_009973	TG	3	6	42211	42216	0 %	50 %	50 %	0 %	159901542
30	NC_009973	CG	3	6	42220	42225	0 %	0 %	50 %	50 %	159901542
31	NC_009973	CG	3	6	43748	43753	0 %	0 %	50 %	50 %	159901542
32	NC_009973	AC	3	6	45050	45055	50 %	0 %	0 %	50 %	159901544
33	NC_009973	GT	3	6	46799	46804	0 %	50 %	50 %	0 %	159901545
34	NC_009973	CG	3	6	48764	48769	0 %	0 %	50 %	50 %	159901547
35	NC_009973	AT	6	12	52768	52779	50 %	50 %	0 %	0 %	159901549
36	NC_009973	CG	3	6	54724	54729	0 %	0 %	50 %	50 %	159901553
37	NC_009973	GC	3	6	54957	54962	0 %	0 %	50 %	50 %	159901553
38	NC_009973	AG	3	6	55355	55360	50 %	0 %	50 %	0 %	159901553
39	NC_009973	CG	3	6	57580	57585	0 %	0 %	50 %	50 %	159901554
40	NC_009973	CT	3	6	58105	58110	0 %	50 %	0 %	50 %	159901555
41	NC_009973	TG	3	6	58322	58327	0 %	50 %	50 %	0 %	159901555
42	NC_009973	GA	3	6	60527	60532	50 %	0 %	50 %	0 %	159901557
43	NC_009973	CG	3	6	60622	60627	0 %	0 %	50 %	50 %	159901557
44	NC_009973	CG	3	6	63822	63827	0 %	0 %	50 %	50 %	159901558
45	NC_009973	TG	3	6	66080	66085	0 %	50 %	50 %	0 %	159901559
46	NC_009973	CG	3	6	67217	67222	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
47	NC_009973	GT	3	6	67404	67409	0 %	50 %	50 %	0 %	159901560
48	NC_009973	CG	3	6	67790	67795	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
49	NC_009973	CG	3	6	67821	67826	0 %	0 %	50 %	50 %	159901560
50	NC_009973	TG	3	6	67894	67899	0 %	50 %	50 %	0 %	159901560
51	NC_009973	GT	3	6	70420	70425	0 %	50 %	50 %	0 %	159901565
52	NC_009973	CG	3	6	70567	70572	0 %	0 %	50 %	50 %	159901565
53	NC_009973	CG	3	6	73296	73301	0 %	0 %	50 %	50 %	159901568
54	NC_009973	CA	3	6	73309	73314	50 %	0 %	0 %	50 %	159901568
55	NC_009973	TG	3	6	74127	74132	0 %	50 %	50 %	0 %	159901569
56	NC_009973	CA	3	6	77292	77297	50 %	0 %	0 %	50 %	159901573
57	NC_009973	CG	3	6	78015	78020	0 %	0 %	50 %	50 %	159901574
58	NC_009973	CA	3	6	81154	81159	50 %	0 %	0 %	50 %	159901576
59	NC_009973	GC	3	6	82425	82430	0 %	0 %	50 %	50 %	159901578
60	NC_009973	AT	3	6	84811	84816	50 %	50 %	0 %	0 %	159901579
61	NC_009973	AT	3	6	84983	84988	50 %	50 %	0 %	0 %	159901579
62	NC_009973	AT	3	6	86199	86204	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
63	NC_009973	AT	3	6	86262	86267	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
64	NC_009973	AT	3	6	86359	86364	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
65	NC_009973	TA	3	6	86503	86508	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
66	NC_009973	AT	3	6	86595	86600	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
67	NC_009973	TA	3	6	86644	86649	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
68	NC_009973	TA	3	6	86682	86687	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
69	NC_009973	AT	3	6	86711	86716	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
70	NC_009973	AT	3	6	86775	86780	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
71	NC_009973	AT	5	10	87030	87039	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
72	NC_009973	TA	4	8	87480	87487	50 %	50 %	0 %	0 %	159901580
73	NC_009973	AT	3	6	87780	87785	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
74	NC_009973	AT	5	10	87789	87798	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
75	NC_009973	AT	3	6	87915	87920	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
76	NC_009973	AT	3	6	87945	87950	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
77	NC_009973	TA	3	6	88151	88156	50 %	50 %	0 %	0 %	159901581
78	NC_009973	CA	3	6	89493	89498	50 %	0 %	0 %	50 %	159901582
79	NC_009973	GA	3	6	90182	90187	50 %	0 %	50 %	0 %	159901583
80	NC_009973	AT	3	6	90594	90599	50 %	50 %	0 %	0 %	159901583
81	NC_009973	TA	3	6	90669	90674	50 %	50 %	0 %	0 %	159901583
82	NC_009973	CA	3	6	91358	91363	50 %	0 %	0 %	50 %	159901584
83	NC_009973	CG	3	6	91524	91529	0 %	0 %	50 %	50 %	159901584
84	NC_009973	TG	3	6	92961	92966	0 %	50 %	50 %	0 %	159901585
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90	NC_009973	GT	3	6	113251	113256	0 %	50 %	50 %	0 %	159901598
91	NC_009973	CG	3	6	113260	113265	0 %	0 %	50 %	50 %	159901598
92	NC_009973	AT	3	6	113678	113683	50 %	50 %	0 %	0 %	159901598
93	NC_009973	CG	3	6	113805	113810	0 %	0 %	50 %	50 %	159901598
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100	NC_009973	CG	3	6	132517	132522	0 %	0 %	50 %	50 %	159901612
101	NC_009973	GC	3	6	133314	133319	0 %	0 %	50 %	50 %	159901612
102	NC_009973	TG	3	6	136205	136210	0 %	50 %	50 %	0 %	159901613
103	NC_009973	GC	3	6	136235	136240	0 %	0 %	50 %	50 %	159901613
104	NC_009973	CT	3	6	137736	137741	0 %	50 %	0 %	50 %	159901614
105	NC_009973	GT	3	6	137907	137912	0 %	50 %	50 %	0 %	159901614
106	NC_009973	GT	3	6	137999	138004	0 %	50 %	50 %	0 %	159901614
107	NC_009973	TG	3	6	139218	139223	0 %	50 %	50 %	0 %	159901615
108	NC_009973	CG	3	6	143098	143103	0 %	0 %	50 %	50 %	159901617
109	NC_009973	CA	3	6	148653	148658	50 %	0 %	0 %	50 %	159901619
110	NC_009973	GT	3	6	148747	148752	0 %	50 %	50 %	0 %	159901619
111	NC_009973	CG	3	6	150160	150165	0 %	0 %	50 %	50 %	159901622
112	NC_009973	CG	3	6	150245	150250	0 %	0 %	50 %	50 %	159901622
113	NC_009973	AC	3	6	151348	151353	50 %	0 %	0 %	50 %	159901623
114	NC_009973	CA	3	6	152398	152403	50 %	0 %	0 %	50 %	159901623
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117	NC_009973	CG	3	6	158149	158154	0 %	0 %	50 %	50 %	159901628
118	NC_009973	CG	3	6	159954	159959	0 %	0 %	50 %	50 %	159901629
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120	NC_009973	CG	3	6	161679	161684	0 %	0 %	50 %	50 %	159901631
121	NC_009973	CG	3	6	164818	164823	0 %	0 %	50 %	50 %	159901632
122	NC_009973	CA	3	6	164857	164862	50 %	0 %	0 %	50 %	159901632
123	NC_009973	GT	3	6	164890	164895	0 %	50 %	50 %	0 %	159901632
124	NC_009973	CA	3	6	165085	165090	50 %	0 %	0 %	50 %	159901632
125	NC_009973	CG	3	6	165927	165932	0 %	0 %	50 %	50 %	159901633
126	NC_009973	CG	3	6	166536	166541	0 %	0 %	50 %	50 %	159901633
127	NC_009973	AC	3	6	167409	167414	50 %	0 %	0 %	50 %	159901633
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131	NC_009973	CA	3	6	170798	170803	50 %	0 %	0 %	50 %	159901634
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140	NC_009973	AC	3	6	176906	176911	50 %	0 %	0 %	50 %	159901636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.