MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009972	AGC	2	6	227726	227731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
4003	NC_009972	AAT	2	6	227759	227764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896727
4004	NC_009972	CCT	2	6	227840	227845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159896727
4005	NC_009972	CAG	2	6	227863	227868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
4006	NC_009972	GCA	2	6	227899	227904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
4007	NC_009972	TGG	2	6	227994	227999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896727
4008	NC_009972	CGC	2	6	228017	228022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896727
4009	NC_009972	CGG	2	6	228061	228066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896727
4010	NC_009972	CTA	3	9	228133	228141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896727
4011	NC_009972	CGC	2	6	228170	228175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896727
4012	NC_009972	GAT	2	6	228191	228196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896727
4013	NC_009972	GAGC	2	8	228217	228224	25 %	0 %	50 %	25 %	159896727
4014	NC_009972	GCC	2	6	228269	228274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896727
4015	NC_009972	GCCA	2	8	228284	228291	25 %	0 %	25 %	50 %	159896727
4016	NC_009972	GCA	2	6	228297	228302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
4017	NC_009972	GCG	2	6	228347	228352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896728
4018	NC_009972	T	6	6	228353	228358	0 %	100 %	0 %	0 %	159896728
4019	NC_009972	AC	3	6	228443	228448	50 %	0 %	0 %	50 %	159896728
4020	NC_009972	AGC	2	6	228474	228479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896728
4021	NC_009972	CTGG	2	8	228584	228591	0 %	25 %	50 %	25 %	159896728
4022	NC_009972	CGC	2	6	228602	228607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896728
4023	NC_009972	TGC	2	6	228614	228619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896728
4024	NC_009972	CAA	2	6	228621	228626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896728
4025	NC_009972	CAA	2	6	228654	228659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896728
4026	NC_009972	CCAA	2	8	228694	228701	50 %	0 %	0 %	50 %	159896728
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4031	NC_009972	GCTTG	2	10	228890	228899	0 %	40 %	40 %	20 %	159896728
4032	NC_009972	GGC	2	6	228999	229004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896728
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4045	NC_009972	TGC	2	6	229942	229947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896728
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4057	NC_009972	GCG	2	6	230475	230480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896728
4058	NC_009972	TGGCCT	2	12	230485	230496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896728
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4062	NC_009972	ATG	2	6	230770	230775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896728
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4122	NC_009972	ATG	2	6	234030	234035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896732
4123	NC_009972	GAT	2	6	234258	234263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896732
4124	NC_009972	GAT	2	6	234279	234284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896732
4125	NC_009972	ACCA	2	8	234297	234304	50 %	0 %	0 %	50 %	159896732
4126	NC_009972	AAC	2	6	234352	234357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896732
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4242	NC_009972	GCC	2	6	241752	241757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896740
4243	NC_009972	GCT	2	6	241783	241788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896740
4244	NC_009972	GCA	2	6	241822	241827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896740
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4246	NC_009972	ATT	2	6	241952	241957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896740
4247	NC_009972	TTG	2	6	241970	241975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896740
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4251	NC_009972	AGT	2	6	242135	242140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896740
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4262	NC_009972	TCG	2	6	242924	242929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896741
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4273	NC_009972	TGC	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896741
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4275	NC_009972	TTG	2	6	243587	243592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896741
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4278	NC_009972	TCG	2	6	243759	243764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896742
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4333	NC_009972	TTGAT	2	10	246947	246956	20 %	60 %	20 %	0 %	159896744
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4352	NC_009972	TGA	2	6	247656	247661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896745
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4354	NC_009972	TGC	2	6	247751	247756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896745
4355	NC_009972	TGA	2	6	247758	247763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896745
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4358	NC_009972	CCG	2	6	247868	247873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896746
4359	NC_009972	CAA	2	6	247891	247896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896746
4360	NC_009972	CGATGG	2	12	247920	247931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159896746
4361	NC_009972	TCAA	2	8	247946	247953	50 %	25 %	0 %	25 %	159896746
4362	NC_009972	TCAATC	2	12	247973	247984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896746
4363	NC_009972	CAG	2	6	247987	247992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896746
4364	NC_009972	CAAG	2	8	248025	248032	50 %	0 %	25 %	25 %	159896746
4365	NC_009972	TGTT	2	8	248033	248040	0 %	75 %	25 %	0 %	159896746
4366	NC_009972	ATGGCA	2	12	248048	248059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159896746
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4368	NC_009972	CTG	2	6	248153	248158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896746
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4382	NC_009972	GTT	2	6	249012	249017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896747
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4393	NC_009972	TGC	2	6	249690	249695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896748
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4471	NC_009972	CTT	2	6	254756	254761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896752
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4475	NC_009972	CAAC	2	8	254918	254925	50 %	0 %	0 %	50 %	159896752
4476	NC_009972	GGCGA	2	10	254938	254947	20 %	0 %	60 %	20 %	159896752
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4479	NC_009972	CATCA	2	10	255045	255054	40 %	20 %	0 %	40 %	159896752
4480	NC_009972	GTTG	2	8	255058	255065	0 %	50 %	50 %	0 %	159896752
4481	NC_009972	GAG	2	6	255154	255159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159896752
4482	NC_009972	CAA	2	6	255203	255208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896752
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4484	NC_009972	GAC	2	6	255276	255281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896752
4485	NC_009972	GCG	2	6	255292	255297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896752
4486	NC_009972	AAT	2	6	255298	255303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896752
4487	NC_009972	AATA	2	8	255321	255328	75 %	25 %	0 %	0 %	159896752
4488	NC_009972	AAT	2	6	255333	255338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896752
4489	NC_009972	CCA	2	6	255339	255344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896752
4490	NC_009972	T	6	6	256076	256081	0 %	100 %	0 %	0 %	159896753
4491	NC_009972	TCT	2	6	256172	256177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896753
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4493	NC_009972	TGA	2	6	256430	256435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896753
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