MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_009972	GGC	2	6	203577	203582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896707
3503	NC_009972	TTTG	2	8	203681	203688	0 %	75 %	25 %	0 %	159896707
3504	NC_009972	ACGC	2	8	203711	203718	25 %	0 %	25 %	50 %	159896707
3505	NC_009972	GGC	2	6	203724	203729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896707
3506	NC_009972	ATCA	2	8	203769	203776	50 %	25 %	0 %	25 %	159896707
3507	NC_009972	TGA	2	6	203779	203784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896707
3508	NC_009972	CGC	2	6	203807	203812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896707
3509	NC_009972	GCA	2	6	203819	203824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896707
3510	NC_009972	GCG	2	6	203852	203857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896707
3511	NC_009972	CGC	2	6	203879	203884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896707
3512	NC_009972	GCC	2	6	203939	203944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896707
3513	NC_009972	ATA	2	6	203971	203976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896707
3514	NC_009972	CGA	2	6	204008	204013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896707
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3517	NC_009972	CAT	2	6	204264	204269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896707
3518	NC_009972	GCG	2	6	204307	204312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896707
3519	NC_009972	ATT	2	6	204317	204322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896707
3520	NC_009972	CGG	2	6	204390	204395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896707
3521	NC_009972	GCC	2	6	204457	204462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896707
3522	NC_009972	CCG	2	6	204466	204471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896707
3523	NC_009972	TCGA	2	8	204507	204514	25 %	25 %	25 %	25 %	159896707
3524	NC_009972	TTTG	2	8	204533	204540	0 %	75 %	25 %	0 %	159896707
3525	NC_009972	GAT	2	6	204543	204548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896707
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3531	NC_009972	CTG	2	6	205040	205045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896708
3532	NC_009972	GCGA	2	8	205077	205084	25 %	0 %	50 %	25 %	159896708
3533	NC_009972	TTA	2	6	205127	205132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896708
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3536	NC_009972	TGG	2	6	205395	205400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896708
3537	NC_009972	CGA	2	6	205419	205424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896708
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3545	NC_009972	TTGG	2	8	205690	205697	0 %	50 %	50 %	0 %	159896708
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3555	NC_009972	GGC	2	6	205930	205935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896708
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3557	NC_009972	GGCG	2	8	206169	206176	0 %	0 %	75 %	25 %	159896708
3558	NC_009972	TGA	2	6	206266	206271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896708
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3561	NC_009972	TGG	2	6	206378	206383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896708
3562	NC_009972	GCG	2	6	206456	206461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896708
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3565	NC_009972	TGC	2	6	206506	206511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896708
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3593	NC_009972	TGGT	2	8	208563	208570	0 %	50 %	50 %	0 %	159896711
3594	NC_009972	TGG	2	6	208599	208604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896711
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3602	NC_009972	TTC	2	6	209011	209016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896712
3603	NC_009972	TTCT	2	8	209031	209038	0 %	75 %	0 %	25 %	159896712
3604	NC_009972	TGGCTT	2	12	209039	209050	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	159896712
3605	NC_009972	TTG	2	6	209109	209114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896712
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3607	NC_009972	T	6	6	209144	209149	0 %	100 %	0 %	0 %	159896712
3608	NC_009972	TGT	2	6	209264	209269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896712
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3610	NC_009972	T	6	6	209360	209365	0 %	100 %	0 %	0 %	159896712
3611	NC_009972	CAA	2	6	209430	209435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896712
3612	NC_009972	CGTG	2	8	209570	209577	0 %	25 %	50 %	25 %	159896713
3613	NC_009972	ACA	2	6	209613	209618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896713
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3616	NC_009972	CTT	2	6	209936	209941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896713
3617	NC_009972	TCGAT	2	10	209947	209956	20 %	40 %	20 %	20 %	159896713
3618	NC_009972	GTC	2	6	210057	210062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896713
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3622	NC_009972	CGAT	2	8	210240	210247	25 %	25 %	25 %	25 %	159896713
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3861	NC_009972	TTG	2	6	221189	221194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896723
3862	NC_009972	GTT	2	6	221255	221260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896723
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3865	NC_009972	TTG	2	6	221426	221431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896723
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3972	NC_009972	TGGCT	2	10	226505	226514	0 %	40 %	40 %	20 %	159896726
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3981	NC_009972	CAA	2	6	226682	226687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896727
3982	NC_009972	CAG	2	6	226702	226707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
3983	NC_009972	TGG	2	6	226764	226769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896727
3984	NC_009972	GCAG	2	8	226825	226832	25 %	0 %	50 %	25 %	159896727
3985	NC_009972	AGC	2	6	226836	226841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
3986	NC_009972	ATC	2	6	226874	226879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896727
3987	NC_009972	TGA	2	6	227029	227034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896727
3988	NC_009972	CTG	3	9	227136	227144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896727
3989	NC_009972	ACA	2	6	227173	227178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896727
3990	NC_009972	CAAAAT	2	12	227183	227194	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159896727
3991	NC_009972	CAC	2	6	227292	227297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896727
3992	NC_009972	TTTGG	2	10	227348	227357	0 %	60 %	40 %	0 %	159896727
3993	NC_009972	TTG	2	6	227360	227365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896727
3994	NC_009972	TGA	2	6	227377	227382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896727
3995	NC_009972	CAAG	2	8	227446	227453	50 %	0 %	25 %	25 %	159896727
3996	NC_009972	ATTG	2	8	227581	227588	25 %	50 %	25 %	0 %	159896727
3997	NC_009972	CAG	2	6	227593	227598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896727
3998	NC_009972	GAA	2	6	227606	227611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896727
3999	NC_009972	GCT	2	6	227627	227632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896727
4000	NC_009972	GTC	2	6	227669	227674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896727

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