MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009972	TTG	3	9	174846	174854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896675
3003	NC_009972	CCG	2	6	174899	174904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896675
3004	NC_009972	CTCC	2	8	174947	174954	0 %	25 %	0 %	75 %	159896675
3005	NC_009972	TGC	2	6	174978	174983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896675
3006	NC_009972	AACA	2	8	175134	175141	75 %	0 %	0 %	25 %	159896675
3007	NC_009972	CAA	2	6	175146	175151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896675
3008	NC_009972	CTGG	2	8	175388	175395	0 %	25 %	50 %	25 %	159896676
3009	NC_009972	GGT	2	6	175402	175407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896676
3010	NC_009972	G	6	6	175442	175447	0 %	0 %	100 %	0 %	159896676
3011	NC_009972	ATC	2	6	175459	175464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896676
3012	NC_009972	CGCA	2	8	175573	175580	25 %	0 %	25 %	50 %	159896676
3013	NC_009972	ATTGG	2	10	175605	175614	20 %	40 %	40 %	0 %	159896676
3014	NC_009972	CAA	2	6	175636	175641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896676
3015	NC_009972	CCG	2	6	175690	175695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896676
3016	NC_009972	CCAA	2	8	175773	175780	50 %	0 %	0 %	50 %	159896676
3017	NC_009972	CAAC	2	8	175789	175796	50 %	0 %	0 %	50 %	159896676
3018	NC_009972	TGG	2	6	175826	175831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896676
3019	NC_009972	TG	3	6	176004	176009	0 %	50 %	50 %	0 %	159896676
3020	NC_009972	GGC	2	6	176010	176015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896676
3021	NC_009972	CAG	2	6	176035	176040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896676
3022	NC_009972	CAA	2	6	176077	176082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896676
3023	NC_009972	GCA	2	6	176424	176429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896677
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3025	NC_009972	CGG	2	6	176535	176540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896677
3026	NC_009972	CGG	2	6	176639	176644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896677
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3032	NC_009972	CGG	2	6	176997	177002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896678
3033	NC_009972	GCGT	2	8	177027	177034	0 %	25 %	50 %	25 %	159896678
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3035	NC_009972	GATC	2	8	177075	177082	25 %	25 %	25 %	25 %	159896678
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3037	NC_009972	TCG	2	6	177185	177190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896678
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3039	NC_009972	CCAG	2	8	177287	177294	25 %	0 %	25 %	50 %	159896679
3040	NC_009972	TGGCT	2	10	177301	177310	0 %	40 %	40 %	20 %	159896679
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3044	NC_009972	TTTGA	2	10	177383	177392	20 %	60 %	20 %	0 %	159896679
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3054	NC_009972	CGA	2	6	177877	177882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896679
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3057	NC_009972	CCA	2	6	178089	178094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896679
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3059	NC_009972	TCAA	2	8	178260	178267	50 %	25 %	0 %	25 %	159896679
3060	NC_009972	CCG	2	6	178365	178370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896679
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3065	NC_009972	GTC	2	6	179020	179025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896680
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3092	NC_009972	TAACGA	2	12	180188	180199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159896681
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3097	NC_009972	ATCGC	2	10	180431	180440	20 %	20 %	20 %	40 %	159896681
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3099	NC_009972	GGTTG	2	10	180641	180650	0 %	40 %	60 %	0 %	159896682
3100	NC_009972	TGC	2	6	180661	180666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896682
3101	NC_009972	AACC	2	8	180715	180722	50 %	0 %	0 %	50 %	159896682
3102	NC_009972	CCA	2	6	180757	180762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896682
3103	NC_009972	CA	3	6	180773	180778	50 %	0 %	0 %	50 %	159896682
3104	NC_009972	TTC	2	6	180855	180860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896682
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3106	NC_009972	GCC	2	6	180912	180917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896682
3107	NC_009972	GCG	2	6	180939	180944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896682
3108	NC_009972	AAT	3	9	180958	180966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896682
3109	NC_009972	TCG	2	6	180979	180984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896682
3110	NC_009972	TGCC	2	8	180992	180999	0 %	25 %	25 %	50 %	159896682
3111	NC_009972	CAG	2	6	181005	181010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896682
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3119	NC_009972	AT	3	6	181403	181408	50 %	50 %	0 %	0 %	159896683
3120	NC_009972	AACT	2	8	181419	181426	50 %	25 %	0 %	25 %	159896683
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3122	NC_009972	ACTTA	2	10	181540	181549	40 %	40 %	0 %	20 %	159896683
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