MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_009972	GCC	2	6	28543	28548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896555
503	NC_009972	TGA	2	6	28955	28960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
504	NC_009972	AAC	2	6	28972	28977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
505	NC_009972	GTG	2	6	29011	29016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
506	NC_009972	GGC	2	6	29152	29157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896556
507	NC_009972	CTA	2	6	29177	29182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896556
508	NC_009972	CGA	2	6	29186	29191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
509	NC_009972	TAT	2	6	29205	29210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896556
510	NC_009972	AT	3	6	29222	29227	50 %	50 %	0 %	0 %	159896556
511	NC_009972	TC	3	6	29240	29245	0 %	50 %	0 %	50 %	159896556
512	NC_009972	TGG	2	6	29389	29394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
513	NC_009972	TTGGC	2	10	29425	29434	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
514	NC_009972	AGCA	2	8	29497	29504	50 %	0 %	25 %	25 %	159896556
515	NC_009972	TGT	2	6	29557	29562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
516	NC_009972	TTG	2	6	29568	29573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
517	NC_009972	GAT	2	6	29592	29597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
518	NC_009972	GCC	3	9	29636	29644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
519	NC_009972	AAT	2	6	29673	29678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896556
520	NC_009972	CAG	3	9	29683	29691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
521	NC_009972	TCA	2	6	29789	29794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896556
522	NC_009972	GCCAAT	2	12	29802	29813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159896556
523	NC_009972	ACC	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896556
524	NC_009972	GTG	2	6	29935	29940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
525	NC_009972	TGT	2	6	30127	30132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
526	NC_009972	TGC	2	6	30248	30253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896556
527	NC_009972	CAA	2	6	30317	30322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
528	NC_009972	TGGCT	2	10	30350	30359	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
529	NC_009972	CAC	2	6	30400	30405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896556
530	NC_009972	TTC	2	6	30431	30436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896556
531	NC_009972	GAC	2	6	30516	30521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
532	NC_009972	AGC	2	6	30689	30694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
533	NC_009972	ACTGGC	2	12	30711	30722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159896556
534	NC_009972	CGC	2	6	30802	30807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
535	NC_009972	GCCA	2	8	30861	30868	25 %	0 %	25 %	50 %	159896556
536	NC_009972	CGC	2	6	30907	30912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
537	NC_009972	TCT	2	6	30942	30947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896556
538	NC_009972	CGG	2	6	30960	30965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896556
539	NC_009972	GCC	2	6	30977	30982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
540	NC_009972	GCC	2	6	30990	30995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
541	NC_009972	CCATGC	2	12	31030	31041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159896556
542	NC_009972	CCG	2	6	31045	31050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
543	NC_009972	CAA	2	6	31098	31103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
544	NC_009972	CTG	2	6	31113	31118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896556
545	NC_009972	TGA	2	6	31174	31179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
546	NC_009972	GCG	2	6	31350	31355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896557
547	NC_009972	AAC	2	6	31406	31411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896557
548	NC_009972	ACC	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896557
549	NC_009972	CAG	2	6	31479	31484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896557
550	NC_009972	GGCG	2	8	31491	31498	0 %	0 %	75 %	25 %	159896557
551	NC_009972	GCC	2	6	31555	31560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896557
552	NC_009972	GCG	2	6	31660	31665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896557
553	NC_009972	T	6	6	31731	31736	0 %	100 %	0 %	0 %	159896557
554	NC_009972	CAA	2	6	31738	31743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896557
555	NC_009972	CCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896557
556	NC_009972	C	6	6	31781	31786	0 %	0 %	0 %	100 %	159896557
557	NC_009972	CAT	2	6	32109	32114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896557
558	NC_009972	GCTA	2	8	32147	32154	25 %	25 %	25 %	25 %	159896557
559	NC_009972	AGC	2	6	32470	32475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896558
560	NC_009972	GAA	2	6	32569	32574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896558
561	NC_009972	CAG	3	9	32762	32770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896558
562	NC_009972	GGC	2	6	32779	32784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896558
563	NC_009972	CTGA	2	8	32800	32807	25 %	25 %	25 %	25 %	159896558
564	NC_009972	GGC	2	6	32862	32867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896558
565	NC_009972	TCGA	2	8	32899	32906	25 %	25 %	25 %	25 %	159896558
566	NC_009972	TGA	2	6	32958	32963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896558
567	NC_009972	TTG	2	6	33010	33015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896558
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571	NC_009972	A	7	7	33454	33460	100 %	0 %	0 %	0 %	159896559
572	NC_009972	GAA	2	6	33463	33468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896559
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575	NC_009972	CAC	2	6	33719	33724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896560
576	NC_009972	CAG	2	6	33768	33773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896560
577	NC_009972	CAC	2	6	33805	33810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896560
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581	NC_009972	CAGC	2	8	33936	33943	25 %	0 %	25 %	50 %	159896560
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592	NC_009972	TTG	2	6	34534	34539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896561
593	NC_009972	AAT	2	6	34542	34547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896561
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595	NC_009972	GCG	2	6	34647	34652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896561
596	NC_009972	CTT	2	6	34685	34690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896561
597	NC_009972	CAA	2	6	34695	34700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896561
598	NC_009972	AAT	2	6	34821	34826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896561
599	NC_009972	CGG	2	6	34921	34926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896561
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604	NC_009972	GCG	2	6	35115	35120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896561
605	NC_009972	TCG	2	6	35149	35154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896561
606	NC_009972	CCAA	2	8	35179	35186	50 %	0 %	0 %	50 %	159896561
607	NC_009972	TCG	3	9	35245	35253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896561
608	NC_009972	AAG	2	6	35257	35262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896561
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610	NC_009972	CGG	2	6	35384	35389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896561
611	NC_009972	CAA	2	6	35408	35413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896561
612	NC_009972	TTC	2	6	35430	35435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896561
613	NC_009972	TCT	2	6	35518	35523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896561
614	NC_009972	CAT	2	6	35534	35539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896561
615	NC_009972	CCAAGG	2	12	35591	35602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896561
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619	NC_009972	TCG	2	6	35749	35754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896561
620	NC_009972	GGC	3	9	35814	35822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896561
621	NC_009972	AGC	2	6	35829	35834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896561
622	NC_009972	TTC	2	6	35859	35864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896561
623	NC_009972	GCA	2	6	35885	35890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896561
624	NC_009972	TCG	2	6	35983	35988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896561
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