MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 2254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	AGCGC	2	10	3770	3779	20 %	0 %	40 %	40 %	134093298
2	NC_009138	ATTGA	2	10	5920	5929	40 %	40 %	20 %	0 %	134093298
3	NC_009138	AATGG	2	10	6636	6645	40 %	20 %	40 %	0 %	134093299
4	NC_009138	GCTTT	2	10	9913	9922	0 %	60 %	20 %	20 %	134093302
5	NC_009138	GTACG	2	10	10637	10646	20 %	20 %	40 %	20 %	134093304
6	NC_009138	CTGCG	2	10	13556	13565	0 %	20 %	40 %	40 %	134093308
7	NC_009138	GCATT	2	10	15838	15847	20 %	40 %	20 %	20 %	134093309
8	NC_009138	GACCG	2	10	20642	20651	20 %	0 %	40 %	40 %	134093314
9	NC_009138	CCAGC	2	10	21791	21800	20 %	0 %	20 %	60 %	134093314
10	NC_009138	AGTGA	2	10	25721	25730	40 %	20 %	40 %	0 %	134093318
11	NC_009138	TGGGT	2	10	26411	26420	0 %	40 %	60 %	0 %	134093319
12	NC_009138	TTTGC	2	10	26438	26447	0 %	60 %	20 %	20 %	134093319
13	NC_009138	GCGCG	2	10	29459	29468	0 %	0 %	60 %	40 %	134093323
14	NC_009138	CGCAA	2	10	29490	29499	40 %	0 %	20 %	40 %	134093323
15	NC_009138	GAAAT	2	10	30629	30638	60 %	20 %	20 %	0 %	134093325
16	NC_009138	GATGG	2	10	31414	31423	20 %	20 %	60 %	0 %	134093326
17	NC_009138	CGAAT	2	10	36231	36240	40 %	20 %	20 %	20 %	134093331
18	NC_009138	TACCG	2	10	36900	36909	20 %	20 %	20 %	40 %	134093331
19	NC_009138	TCGCG	2	10	37934	37943	0 %	20 %	40 %	40 %	134093332
20	NC_009138	CGATA	2	10	37952	37961	40 %	20 %	20 %	20 %	134093332
21	NC_009138	TGCCA	2	10	44481	44490	20 %	20 %	20 %	40 %	134093338
22	NC_009138	CAGAA	2	10	45573	45582	60 %	0 %	20 %	20 %	134093338
23	NC_009138	CCAGC	2	10	45932	45941	20 %	0 %	20 %	60 %	134093338
24	NC_009138	TGCAG	2	10	46326	46335	20 %	20 %	40 %	20 %	134093338
25	NC_009138	GCCAG	2	10	46399	46408	20 %	0 %	40 %	40 %	134093338
26	NC_009138	CAGTC	2	10	46432	46441	20 %	20 %	20 %	40 %	134093338
27	NC_009138	TCGAT	2	10	46921	46930	20 %	40 %	20 %	20 %	134093339
28	NC_009138	ATGGA	2	10	46947	46956	40 %	20 %	40 %	0 %	134093339
29	NC_009138	TGAAA	2	10	49621	49630	60 %	20 %	20 %	0 %	134093340
30	NC_009138	TCGGA	2	10	50823	50832	20 %	20 %	40 %	20 %	134093342
31	NC_009138	TTGCC	2	10	51443	51452	0 %	40 %	20 %	40 %	134093344
32	NC_009138	TGCTC	2	10	52769	52778	0 %	40 %	20 %	40 %	134093345
33	NC_009138	TGCAA	2	10	54819	54828	40 %	20 %	20 %	20 %	134093347
34	NC_009138	GTACA	2	10	57603	57612	40 %	20 %	20 %	20 %	134093348
35	NC_009138	AGGGA	2	10	58997	59006	40 %	0 %	60 %	0 %	134093351
36	NC_009138	CTTGC	2	10	62910	62919	0 %	40 %	20 %	40 %	134093358
37	NC_009138	GCAAC	2	10	64973	64982	40 %	0 %	20 %	40 %	134093360
38	NC_009138	TCCCA	2	10	65231	65240	20 %	20 %	0 %	60 %	134093360
39	NC_009138	GCCGC	2	10	67518	67527	0 %	0 %	40 %	60 %	134093363
40	NC_009138	GTTCG	2	10	67670	67679	0 %	40 %	40 %	20 %	134093363
41	NC_009138	GGTTT	2	10	68314	68323	0 %	60 %	40 %	0 %	134093365
42	NC_009138	TTCGC	2	10	69460	69469	0 %	40 %	20 %	40 %	134093365
43	NC_009138	TGCGT	2	10	70742	70751	0 %	40 %	40 %	20 %	134093367
44	NC_009138	CGTCA	2	10	71214	71223	20 %	20 %	20 %	40 %	134093368
45	NC_009138	TCGGT	2	10	78207	78216	0 %	40 %	40 %	20 %	134093373
46	NC_009138	TTTCC	2	10	82864	82873	0 %	60 %	0 %	40 %	134093378
47	NC_009138	TTGCC	2	10	83323	83332	0 %	40 %	20 %	40 %	134093379
48	NC_009138	GATGC	2	10	83838	83847	20 %	20 %	40 %	20 %	134093379
49	NC_009138	CTGCG	2	10	86340	86349	0 %	20 %	40 %	40 %	134093381
50	NC_009138	TGATC	2	10	87299	87308	20 %	40 %	20 %	20 %	134093383
51	NC_009138	GCGAT	2	10	87514	87523	20 %	20 %	40 %	20 %	134093383
52	NC_009138	ATCGA	2	10	87777	87786	40 %	20 %	20 %	20 %	134093383
53	NC_009138	TGATT	2	10	88274	88283	20 %	60 %	20 %	0 %	134093383
54	NC_009138	CGCGC	2	10	89940	89949	0 %	0 %	40 %	60 %	134093385
55	NC_009138	GAGCG	2	10	90220	90229	20 %	0 %	60 %	20 %	134093386
56	NC_009138	GATTC	2	10	92659	92668	20 %	40 %	20 %	20 %	134093388
57	NC_009138	CAAAA	2	10	93540	93549	80 %	0 %	0 %	20 %	134093389
58	NC_009138	CGTGC	2	10	95002	95011	0 %	20 %	40 %	40 %	134093390
59	NC_009138	ACATG	2	10	95462	95471	40 %	20 %	20 %	20 %	134093391
60	NC_009138	CCAGC	2	10	98637	98646	20 %	0 %	20 %	60 %	134093394
61	NC_009138	CCAAA	2	10	100246	100255	60 %	0 %	0 %	40 %	134093394
62	NC_009138	ATGCC	2	10	101734	101743	20 %	20 %	20 %	40 %	134093396
63	NC_009138	GTCAT	2	10	101933	101942	20 %	40 %	20 %	20 %	134093396
64	NC_009138	GGTGC	2	10	102110	102119	0 %	20 %	60 %	20 %	134093396
65	NC_009138	GAATT	2	10	103724	103733	40 %	40 %	20 %	0 %	134093399
66	NC_009138	ATGGC	2	10	104834	104843	20 %	20 %	40 %	20 %	134093400
67	NC_009138	AGTGA	2	10	106305	106314	40 %	20 %	40 %	0 %	134093401
68	NC_009138	CCAGC	2	10	107019	107028	20 %	0 %	20 %	60 %	134093403
69	NC_009138	TTTTC	2	10	107239	107248	0 %	80 %	0 %	20 %	134093403
70	NC_009138	CATCG	2	10	107363	107372	20 %	20 %	20 %	40 %	134093403
71	NC_009138	TGGCC	2	10	114000	114009	0 %	20 %	40 %	40 %	134093408
72	NC_009138	AGCGC	2	10	115426	115435	20 %	0 %	40 %	40 %	134093409
73	NC_009138	GGCGC	2	10	117318	117327	0 %	0 %	60 %	40 %	134093412
74	NC_009138	CGGCA	2	10	117446	117455	20 %	0 %	40 %	40 %	134093412
75	NC_009138	ATGAA	2	10	119111	119120	60 %	20 %	20 %	0 %	134093414
76	NC_009138	ATTCG	2	10	119501	119510	20 %	40 %	20 %	20 %	134093414
77	NC_009138	TGCAA	2	10	121145	121154	40 %	20 %	20 %	20 %	134093414
78	NC_009138	ATTGC	2	10	121846	121855	20 %	40 %	20 %	20 %	134093414
79	NC_009138	GCGAT	2	10	123226	123235	20 %	20 %	40 %	20 %	134093415
80	NC_009138	AATGT	2	10	123767	123776	40 %	40 %	20 %	0 %	134093416
81	NC_009138	TGCTG	2	10	124024	124033	0 %	40 %	40 %	20 %	134093416
82	NC_009138	AGCGC	2	10	124461	124470	20 %	0 %	40 %	40 %	134093417
83	NC_009138	GCGTC	2	10	126216	126225	0 %	20 %	40 %	40 %	134093420
84	NC_009138	CGCTG	2	10	126572	126581	0 %	20 %	40 %	40 %	134093420
85	NC_009138	CGGTT	2	10	129866	129875	0 %	40 %	40 %	20 %	134093422
86	NC_009138	CACAT	2	10	130425	130434	40 %	20 %	0 %	40 %	134093423
87	NC_009138	TTGAA	2	10	132317	132326	40 %	40 %	20 %	0 %	134093425
88	NC_009138	CCGGG	2	10	133617	133626	0 %	0 %	60 %	40 %	134093428
89	NC_009138	CGCGG	2	10	136476	136485	0 %	0 %	60 %	40 %	134093432
90	NC_009138	ATGAG	2	10	136682	136691	40 %	20 %	40 %	0 %	134093433
91	NC_009138	GGCCT	2	10	137551	137560	0 %	20 %	40 %	40 %	134093433
92	NC_009138	AAGGC	2	10	137627	137636	40 %	0 %	40 %	20 %	134093433
93	NC_009138	GGCTG	2	10	138894	138903	0 %	20 %	60 %	20 %	134093434
94	NC_009138	TGGTG	2	10	139508	139517	0 %	40 %	60 %	0 %	134093434
95	NC_009138	GCCAT	2	10	139815	139824	20 %	20 %	20 %	40 %	134093435
96	NC_009138	CGCTG	2	10	142879	142888	0 %	20 %	40 %	40 %	134093438
97	NC_009138	CCATC	2	10	143684	143693	20 %	20 %	0 %	60 %	134093439
98	NC_009138	TGGTG	2	10	145542	145551	0 %	40 %	60 %	0 %	134093441
99	NC_009138	TTTCC	2	10	146416	146425	0 %	60 %	0 %	40 %	134093442
100	NC_009138	ATGCC	2	10	147676	147685	20 %	20 %	20 %	40 %	134093443
101	NC_009138	GCCGC	2	10	150164	150173	0 %	0 %	40 %	60 %	134093446
102	NC_009138	TGGCG	2	10	150246	150255	0 %	20 %	60 %	20 %	134093446
103	NC_009138	ATTTT	2	10	152027	152036	20 %	80 %	0 %	0 %	134093447
104	NC_009138	GAAGC	2	10	152424	152433	40 %	0 %	40 %	20 %	134093448
105	NC_009138	GCGCC	2	10	154405	154414	0 %	0 %	40 %	60 %	134093449
106	NC_009138	TGAAA	2	10	157282	157291	60 %	20 %	20 %	0 %	134093452
107	NC_009138	GGCTT	2	10	159024	159033	0 %	40 %	40 %	20 %	134093454
108	NC_009138	CTGAT	2	10	159786	159795	20 %	40 %	20 %	20 %	134093454
109	NC_009138	CTGCG	2	10	159898	159907	0 %	20 %	40 %	40 %	134093454
110	NC_009138	GCGCC	2	10	159967	159976	0 %	0 %	40 %	60 %	134093454
111	NC_009138	CACGC	2	10	160378	160387	20 %	0 %	20 %	60 %	134093455
112	NC_009138	ATTTA	2	10	161872	161881	40 %	60 %	0 %	0 %	134093456
113	NC_009138	GCATG	2	10	166102	166111	20 %	20 %	40 %	20 %	134093460
114	NC_009138	TGGTG	2	10	166417	166426	0 %	40 %	60 %	0 %	134093460
115	NC_009138	TGCGG	2	10	169526	169535	0 %	20 %	60 %	20 %	134093463
116	NC_009138	GGCAA	2	10	170775	170784	40 %	0 %	40 %	20 %	134093464
117	NC_009138	CGCTG	2	10	170921	170930	0 %	20 %	40 %	40 %	134093464
118	NC_009138	GTACG	2	10	172396	172405	20 %	20 %	40 %	20 %	134093466
119	NC_009138	AAGAC	2	10	172652	172661	60 %	0 %	20 %	20 %	134093467
120	NC_009138	ATTCA	2	10	174698	174707	40 %	40 %	0 %	20 %	134093469
121	NC_009138	CGTGA	2	10	177271	177280	20 %	20 %	40 %	20 %	134093471
122	NC_009138	ACCAG	2	10	177448	177457	40 %	0 %	20 %	40 %	134093472
123	NC_009138	GGGCA	2	10	177768	177777	20 %	0 %	60 %	20 %	134093472
124	NC_009138	ATCGA	2	10	180080	180089	40 %	20 %	20 %	20 %	134093474
125	NC_009138	GCGCG	2	10	181904	181913	0 %	0 %	60 %	40 %	134093475
126	NC_009138	CAGTG	2	10	182104	182113	20 %	20 %	40 %	20 %	134093475
127	NC_009138	CAGTG	2	10	183207	183216	20 %	20 %	40 %	20 %	134093476
128	NC_009138	AGCAA	2	10	184575	184584	60 %	0 %	20 %	20 %	134093477
129	NC_009138	GGCGC	2	10	184703	184712	0 %	0 %	60 %	40 %	134093477
130	NC_009138	GCGCC	2	10	188679	188688	0 %	0 %	40 %	60 %	134093481
131	NC_009138	GGCGT	2	10	193369	193378	0 %	20 %	60 %	20 %	134093484
132	NC_009138	GCAGC	2	10	195792	195801	20 %	0 %	40 %	40 %	134093486
133	NC_009138	GCATC	2	10	198873	198882	20 %	20 %	20 %	40 %	134093490
134	NC_009138	GCGAT	2	10	199496	199505	20 %	20 %	40 %	20 %	134093490
135	NC_009138	ATCCG	2	10	199748	199757	20 %	20 %	20 %	40 %	134093492
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148	NC_009138	GCTGG	2	10	229904	229913	0 %	20 %	60 %	20 %	134093514
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251	NC_009138	CATTG	2	10	398107	398116	20 %	40 %	20 %	20 %	134093675
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255	NC_009138	TCGGG	2	10	405938	405947	0 %	20 %	60 %	20 %	134093682
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260	NC_009138	CTTGT	2	10	421356	421365	0 %	60 %	20 %	20 %	134093698
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