MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 64444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009138	CAC	2	6	148328	148333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093444
3002	NC_009138	TCT	2	6	148366	148371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093444
3003	NC_009138	TCA	2	6	148513	148518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093444
3004	NC_009138	GCC	2	6	148547	148552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093444
3005	NC_009138	TCG	2	6	148578	148583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093444
3006	NC_009138	GGC	2	6	148605	148610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093444
3007	NC_009138	CCG	2	6	148648	148653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093444
3008	NC_009138	GCG	2	6	148770	148775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093444
3009	NC_009138	CGG	2	6	148780	148785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093444
3010	NC_009138	CCT	2	6	148825	148830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134093444
3011	NC_009138	GCG	2	6	148972	148977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093444
3012	NC_009138	CCG	2	6	148999	149004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093444
3013	NC_009138	TGT	2	6	149107	149112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134093444
3014	NC_009138	CGTT	2	8	149130	149137	0 %	50 %	25 %	25 %	134093444
3015	NC_009138	TG	3	6	149146	149151	0 %	50 %	50 %	0 %	134093444
3016	NC_009138	CATC	2	8	149155	149162	25 %	25 %	0 %	50 %	134093444
3017	NC_009138	CTT	2	6	149302	149307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093445
3018	NC_009138	AAC	2	6	149321	149326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093445
3019	NC_009138	ATC	2	6	149340	149345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093445
3020	NC_009138	A	6	6	149365	149370	100 %	0 %	0 %	0 %	134093445
3021	NC_009138	GC	4	8	149493	149500	0 %	0 %	50 %	50 %	134093445
3022	NC_009138	GCG	2	6	149582	149587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093445
3023	NC_009138	CCG	2	6	149596	149601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093445
3024	NC_009138	TGC	2	6	149615	149620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093445
3025	NC_009138	GCC	2	6	149643	149648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093445
3026	NC_009138	CGA	2	6	149672	149677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093445
3027	NC_009138	TGG	2	6	149695	149700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093445
3028	NC_009138	GCC	2	6	149894	149899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093445
3029	NC_009138	GAC	2	6	149901	149906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093445
3030	NC_009138	TGC	2	6	149908	149913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093445
3031	NC_009138	A	6	6	149961	149966	100 %	0 %	0 %	0 %	134093445
3032	NC_009138	AAT	2	6	149989	149994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093446
3033	NC_009138	CGA	2	6	150043	150048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3034	NC_009138	CTG	2	6	150059	150064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3035	NC_009138	TGG	2	6	150089	150094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093446
3036	NC_009138	GCCGC	2	10	150164	150173	0 %	0 %	40 %	60 %	134093446
3037	NC_009138	TGC	2	6	150199	150204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3038	NC_009138	GC	3	6	150221	150226	0 %	0 %	50 %	50 %	134093446
3039	NC_009138	TGGCG	2	10	150246	150255	0 %	20 %	60 %	20 %	134093446
3040	NC_009138	CTG	2	6	150263	150268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3041	NC_009138	AGC	2	6	150286	150291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3042	NC_009138	AT	3	6	150300	150305	50 %	50 %	0 %	0 %	134093446
3043	NC_009138	GCC	2	6	150328	150333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093446
3044	NC_009138	GAT	2	6	150358	150363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093446
3045	NC_009138	GAA	2	6	150389	150394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093446
3046	NC_009138	GC	3	6	150406	150411	0 %	0 %	50 %	50 %	134093446
3047	NC_009138	ATT	2	6	150418	150423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093446
3048	NC_009138	GCG	2	6	150476	150481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093446
3049	NC_009138	CTG	2	6	150530	150535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3050	NC_009138	CGT	2	6	150557	150562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093446
3051	NC_009138	GATC	2	8	150577	150584	25 %	25 %	25 %	25 %	134093446
3052	NC_009138	GC	3	6	150608	150613	0 %	0 %	50 %	50 %	134093446
3053	NC_009138	TCA	2	6	150633	150638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093446
3054	NC_009138	CG	3	6	150653	150658	0 %	0 %	50 %	50 %	134093446
3055	NC_009138	GAA	2	6	150833	150838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093446
3056	NC_009138	CGC	2	6	150845	150850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093446
3057	NC_009138	TAT	2	6	150978	150983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093446
3058	NC_009138	CGC	2	6	151068	151073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093447
3059	NC_009138	TCG	2	6	151140	151145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3060	NC_009138	GT	3	6	151200	151205	0 %	50 %	50 %	0 %	134093447
3061	NC_009138	CGC	2	6	151276	151281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093447
3062	NC_009138	GCAG	2	8	151285	151292	25 %	0 %	50 %	25 %	134093447
3063	NC_009138	GTC	2	6	151304	151309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3064	NC_009138	GCC	2	6	151405	151410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093447
3065	NC_009138	GTC	2	6	151415	151420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3066	NC_009138	TGC	2	6	151455	151460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3067	NC_009138	GAT	2	6	151471	151476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093447
3068	NC_009138	GGC	2	6	151505	151510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093447
3069	NC_009138	TAA	2	6	151534	151539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093447
3070	NC_009138	A	6	6	151538	151543	100 %	0 %	0 %	0 %	134093447
3071	NC_009138	TGC	2	6	151560	151565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3072	NC_009138	GCG	2	6	151629	151634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093447
3073	NC_009138	T	6	6	151685	151690	0 %	100 %	0 %	0 %	134093447
3074	NC_009138	GAA	2	6	151760	151765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093447
3075	NC_009138	AAT	2	6	151766	151771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093447
3076	NC_009138	GGC	2	6	151802	151807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093447
3077	NC_009138	CAT	2	6	151825	151830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093447
3078	NC_009138	GCGG	2	8	151877	151884	0 %	0 %	75 %	25 %	134093447
3079	NC_009138	CGG	2	6	151918	151923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093447
3080	NC_009138	GGT	2	6	151927	151932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093447
3081	NC_009138	TGCTGG	2	12	151950	151961	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134093447
3082	NC_009138	TTC	2	6	151967	151972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093447
3083	NC_009138	CGG	2	6	152010	152015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093447
3084	NC_009138	ATTTT	2	10	152027	152036	20 %	80 %	0 %	0 %	134093447
3085	NC_009138	GCA	2	6	152061	152066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3086	NC_009138	CTG	2	6	152076	152081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3087	NC_009138	GTG	3	9	152096	152104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093447
3088	NC_009138	TGTCGG	2	12	152134	152145	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134093447
3089	NC_009138	CAT	2	6	152168	152173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093447
3090	NC_009138	GCA	2	6	152176	152181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093447
3091	NC_009138	GCT	2	6	152208	152213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093448
3092	NC_009138	CCAG	2	8	152218	152225	25 %	0 %	25 %	50 %	134093448
3093	NC_009138	GCAATC	2	12	152247	152258	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134093448
3094	NC_009138	GGC	2	6	152325	152330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3095	NC_009138	CCG	2	6	152340	152345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3096	NC_009138	CCG	2	6	152365	152370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3097	NC_009138	GAC	2	6	152389	152394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093448
3098	NC_009138	GAAGC	2	10	152424	152433	40 %	0 %	40 %	20 %	134093448
3099	NC_009138	GCG	2	6	152481	152486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3100	NC_009138	CAGC	2	8	152509	152516	25 %	0 %	25 %	50 %	134093448
3101	NC_009138	ACG	2	6	152532	152537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093448
3102	NC_009138	CGC	2	6	152538	152543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3103	NC_009138	CAA	2	6	152585	152590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093448
3104	NC_009138	GCG	2	6	152620	152625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3105	NC_009138	CGC	2	6	152665	152670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3106	NC_009138	GAT	2	6	152714	152719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093448
3107	NC_009138	TTGC	2	8	152759	152766	0 %	50 %	25 %	25 %	134093448
3108	NC_009138	GGC	2	6	152790	152795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3109	NC_009138	GGC	2	6	152820	152825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3110	NC_009138	CATG	2	8	152928	152935	25 %	25 %	25 %	25 %	134093448
3111	NC_009138	AG	3	6	152938	152943	50 %	0 %	50 %	0 %	134093448
3112	NC_009138	TGG	2	6	152947	152952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093448
3113	NC_009138	AGC	2	6	153007	153012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093448
3114	NC_009138	GCG	2	6	153018	153023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3115	NC_009138	GCCAGC	2	12	153066	153077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134093448
3116	NC_009138	GGC	2	6	153116	153121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093448
3117	NC_009138	GCC	2	6	153185	153190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3118	NC_009138	CGC	2	6	153257	153262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093448
3119	NC_009138	ATG	2	6	153265	153270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093448
3120	NC_009138	CAG	2	6	153284	153289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093448
3121	NC_009138	ACA	2	6	153346	153351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093448
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3126	NC_009138	ATG	2	6	153744	153749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093449
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3202	NC_009138	CGAT	2	8	157765	157772	25 %	25 %	25 %	25 %	134093452
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3229	NC_009138	GAC	2	6	159206	159211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093454
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3232	NC_009138	TTTC	2	8	159283	159290	0 %	75 %	0 %	25 %	134093454
3233	NC_009138	CAC	2	6	159320	159325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093454
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3236	NC_009138	GGAA	2	8	159478	159485	50 %	0 %	50 %	0 %	134093454
3237	NC_009138	CAG	2	6	159562	159567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093454
3238	NC_009138	TCT	2	6	159675	159680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093454
3239	NC_009138	GC	4	8	159688	159695	0 %	0 %	50 %	50 %	134093454
3240	NC_009138	GCC	2	6	159755	159760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093454
3241	NC_009138	CTGAT	2	10	159786	159795	20 %	40 %	20 %	20 %	134093454
3242	NC_009138	TGCG	2	8	159829	159836	0 %	25 %	50 %	25 %	134093454
3243	NC_009138	CG	3	6	159887	159892	0 %	0 %	50 %	50 %	134093454
3244	NC_009138	CTGCG	2	10	159898	159907	0 %	20 %	40 %	40 %	134093454
3245	NC_009138	TCA	2	6	159910	159915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093454
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3247	NC_009138	GTC	2	6	160014	160019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093454
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3250	NC_009138	CTG	2	6	160167	160172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093455
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3253	NC_009138	GAT	2	6	160221	160226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093455
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3355	NC_009138	CGCCTG	2	12	165035	165046	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134093460
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3363	NC_009138	GAA	2	6	165356	165361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093460
3364	NC_009138	GC	3	6	165416	165421	0 %	0 %	50 %	50 %	134093460
3365	NC_009138	CG	3	6	165537	165542	0 %	0 %	50 %	50 %	134093460
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3380	NC_009138	ATCG	2	8	166126	166133	25 %	25 %	25 %	25 %	134093460
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3480	NC_009138	A	6	6	170940	170945	100 %	0 %	0 %	0 %	134093464
3481	NC_009138	CGCTGG	2	12	171064	171075	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134093464
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3483	NC_009138	AGC	2	6	171199	171204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093464
3484	NC_009138	TCG	2	6	171703	171708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093465
3485	NC_009138	GCC	2	6	171740	171745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093465
3486	NC_009138	CGAT	2	8	171769	171776	25 %	25 %	25 %	25 %	134093465
3487	NC_009138	ATCA	2	8	171897	171904	50 %	25 %	0 %	25 %	134093466
3488	NC_009138	GCC	2	6	171951	171956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093466
3489	NC_009138	GCT	2	6	171959	171964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093466
3490	NC_009138	GCAG	2	8	171980	171987	25 %	0 %	50 %	25 %	134093466
3491	NC_009138	CAA	2	6	172019	172024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093466
3492	NC_009138	GGC	2	6	172044	172049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093466
3493	NC_009138	CTG	2	6	172051	172056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093466
3494	NC_009138	AG	3	6	172101	172106	50 %	0 %	50 %	0 %	134093466
3495	NC_009138	GAC	2	6	172133	172138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093466
3496	NC_009138	CGT	2	6	172310	172315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093466
3497	NC_009138	TGA	2	6	172318	172323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093466
3498	NC_009138	GTACG	2	10	172396	172405	20 %	20 %	40 %	20 %	134093466
3499	NC_009138	TTA	2	6	172422	172427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093466
3500	NC_009138	ATT	2	6	172463	172468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093466

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