MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008818	GCAA	2	8	286366	286373	50 %	0 %	25 %	25 %	124027197
5002	NC_008818	GGA	2	6	286393	286398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027197
5003	NC_008818	TGG	2	6	287023	287028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027198
5004	NC_008818	TGC	2	6	287041	287046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027198
5005	NC_008818	TAT	2	6	287093	287098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027198
5006	NC_008818	CTC	2	6	287108	287113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027198
5007	NC_008818	CAGC	2	8	287114	287121	25 %	0 %	25 %	50 %	124027198
5008	NC_008818	ATGA	2	8	287196	287203	50 %	25 %	25 %	0 %	124027198
5009	NC_008818	CAC	2	6	287608	287613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027199
5010	NC_008818	GGC	2	6	287637	287642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027199
5011	NC_008818	AGG	2	6	287684	287689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027199
5012	NC_008818	CAGCGG	2	12	287728	287739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124027199
5013	NC_008818	TCA	2	6	287796	287801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027199
5014	NC_008818	GCT	2	6	287824	287829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5015	NC_008818	TGC	2	6	287862	287867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5016	NC_008818	CAGC	2	8	287899	287906	25 %	0 %	25 %	50 %	124027199
5017	NC_008818	GCT	2	6	287942	287947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5018	NC_008818	CTC	2	6	287960	287965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5019	NC_008818	CAC	2	6	288035	288040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027199
5020	NC_008818	CAG	2	6	288052	288057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5021	NC_008818	TGC	2	6	288106	288111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5022	NC_008818	GC	3	6	288122	288127	0 %	0 %	50 %	50 %	124027199
5023	NC_008818	CTTG	2	8	288148	288155	0 %	50 %	25 %	25 %	124027199
5024	NC_008818	ATC	2	6	288284	288289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027199
5025	NC_008818	CAGG	2	8	288306	288313	25 %	0 %	50 %	25 %	124027199
5026	NC_008818	CGC	2	6	288342	288347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027199
5027	NC_008818	GCG	2	6	288394	288399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027199
5028	NC_008818	CTC	2	6	288511	288516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5029	NC_008818	CCT	2	6	288609	288614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5030	NC_008818	GCT	2	6	288626	288631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5031	NC_008818	GCT	2	6	288642	288647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5032	NC_008818	CTC	2	6	288658	288663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5033	NC_008818	GAG	2	6	288664	288669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027199
5034	NC_008818	GAG	2	6	288724	288729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027199
5035	NC_008818	CGC	2	6	288735	288740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027199
5036	NC_008818	CTC	2	6	288742	288747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5037	NC_008818	GCC	2	6	288778	288783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027199
5038	NC_008818	CTC	2	6	288850	288855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5039	NC_008818	ACC	2	6	288920	288925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027199
5040	NC_008818	GGC	2	6	288936	288941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027199
5041	NC_008818	GC	3	6	288940	288945	0 %	0 %	50 %	50 %	124027199
5042	NC_008818	TAC	2	6	288961	288966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027199
5043	NC_008818	GTT	2	6	289040	289045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027199
5044	NC_008818	GTG	2	6	289190	289195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027199
5045	NC_008818	TCG	2	6	289217	289222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5046	NC_008818	AGCA	2	8	289246	289253	50 %	0 %	25 %	25 %	124027199
5047	NC_008818	CGC	2	6	289286	289291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027199
5048	NC_008818	CCT	2	6	289449	289454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5049	NC_008818	CTC	2	6	289468	289473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5050	NC_008818	CGA	2	6	289488	289493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5051	NC_008818	ACG	2	6	289652	289657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5052	NC_008818	TAG	2	6	289708	289713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027199
5053	NC_008818	TCG	2	6	289715	289720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5054	NC_008818	GCA	2	6	289745	289750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5055	NC_008818	GCT	2	6	289792	289797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5056	NC_008818	GCA	2	6	289923	289928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5057	NC_008818	AGT	2	6	290079	290084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027199
5058	NC_008818	CGA	2	6	290097	290102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027199
5059	NC_008818	CTC	2	6	290155	290160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5060	NC_008818	CTA	2	6	290172	290177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027199
5061	NC_008818	CCG	2	6	290189	290194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027199
5062	NC_008818	CCT	2	6	290253	290258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5063	NC_008818	TCA	2	6	290304	290309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027199
5064	NC_008818	CG	3	6	290328	290333	0 %	0 %	50 %	50 %	124027199
5065	NC_008818	AG	3	6	290334	290339	50 %	0 %	50 %	0 %	124027199
5066	NC_008818	CGG	2	6	290402	290407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027199
5067	NC_008818	CTC	2	6	290596	290601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5068	NC_008818	TCC	2	6	290703	290708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027199
5069	NC_008818	GCCCG	2	10	290824	290833	0 %	0 %	40 %	60 %	124027200
5070	NC_008818	ATAGC	2	10	290957	290966	40 %	20 %	20 %	20 %	124027200
5071	NC_008818	CGA	2	6	291009	291014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027200
5072	NC_008818	TAG	2	6	291079	291084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027200
5073	NC_008818	GCT	2	6	291137	291142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027200
5074	NC_008818	GGA	2	6	291159	291164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027200
5075	NC_008818	CGT	2	6	291201	291206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027200
5076	NC_008818	CAGG	2	8	291224	291231	25 %	0 %	50 %	25 %	124027200
5077	NC_008818	AGG	2	6	291272	291277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027200
5078	NC_008818	CGC	2	6	291278	291283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027200
5079	NC_008818	TCG	2	6	291395	291400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027200
5080	NC_008818	GAT	2	6	291410	291415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027200
5081	NC_008818	CTC	2	6	291451	291456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027200
5082	NC_008818	CTC	2	6	291560	291565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027200
5083	NC_008818	ATC	2	6	291716	291721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027200
5084	NC_008818	GT	3	6	291724	291729	0 %	50 %	50 %	0 %	124027200
5085	NC_008818	CGT	2	6	291793	291798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027200
5086	NC_008818	TAG	2	6	291868	291873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027200
5087	NC_008818	AGG	2	6	291905	291910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027200
5088	NC_008818	CT	3	6	291957	291962	0 %	50 %	0 %	50 %	124027201
5089	NC_008818	GGA	2	6	292016	292021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027201
5090	NC_008818	TCATG	2	10	292025	292034	20 %	40 %	20 %	20 %	124027201
5091	NC_008818	GAG	2	6	292218	292223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027201
5092	NC_008818	TC	3	6	292275	292280	0 %	50 %	0 %	50 %	124027201
5093	NC_008818	CCT	2	6	292370	292375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027201
5094	NC_008818	AGG	2	6	292420	292425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027201
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5096	NC_008818	ATA	2	6	292501	292506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027201
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5098	NC_008818	CT	3	6	292525	292530	0 %	50 %	0 %	50 %	124027201
5099	NC_008818	TACG	2	8	292548	292555	25 %	25 %	25 %	25 %	124027201
5100	NC_008818	TGC	2	6	292614	292619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027201
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5102	NC_008818	CTG	2	6	292645	292650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027201
5103	NC_008818	GGCG	2	8	292697	292704	0 %	0 %	75 %	25 %	124027201
5104	NC_008818	CTC	2	6	292707	292712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027201
5105	NC_008818	CGA	2	6	292769	292774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027201
5106	NC_008818	AGT	2	6	292792	292797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027201
5107	NC_008818	CCT	2	6	292817	292822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027201
5108	NC_008818	GCT	2	6	292865	292870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027201
5109	NC_008818	CTT	2	6	293124	293129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027201
5110	NC_008818	AGG	2	6	293143	293148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027201
5111	NC_008818	CGG	2	6	293191	293196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027201
5112	NC_008818	TAC	2	6	293229	293234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027201
5113	NC_008818	TC	3	6	293315	293320	0 %	50 %	0 %	50 %	124027201
5114	NC_008818	GC	3	6	293429	293434	0 %	0 %	50 %	50 %	124027202
5115	NC_008818	GCA	2	6	293442	293447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027202
5116	NC_008818	CCT	2	6	293485	293490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027202
5117	NC_008818	ACCA	2	8	293503	293510	50 %	0 %	0 %	50 %	124027202
5118	NC_008818	CCAC	2	8	293665	293672	25 %	0 %	0 %	75 %	124027202
5119	NC_008818	TCT	2	6	293749	293754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027202
5120	NC_008818	GCCGTA	2	12	293855	293866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124027202
5121	NC_008818	GAG	2	6	293885	293890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027202
5122	NC_008818	TCC	2	6	294018	294023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027202
5123	NC_008818	GTC	2	6	294041	294046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027202
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5125	NC_008818	TCG	2	6	294084	294089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027202
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5130	NC_008818	TCCT	2	8	294291	294298	0 %	50 %	0 %	50 %	124027202
5131	NC_008818	GTGCC	2	10	294340	294349	0 %	20 %	40 %	40 %	124027202
5132	NC_008818	CT	3	6	294466	294471	0 %	50 %	0 %	50 %	124027202
5133	NC_008818	CCT	2	6	294478	294483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027202
5134	NC_008818	TCC	3	9	294489	294497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027202
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5142	NC_008818	TCG	2	6	295064	295069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027203
5143	NC_008818	GCT	2	6	295101	295106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027203
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5154	NC_008818	CTAT	2	8	295734	295741	25 %	50 %	0 %	25 %	124027204
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5228	NC_008818	CCTTG	2	10	300703	300712	0 %	40 %	20 %	40 %	124027207
5229	NC_008818	TAT	2	6	300757	300762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027207
5230	NC_008818	TGC	2	6	300775	300780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027207
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5232	NC_008818	CAAA	2	8	300885	300892	75 %	0 %	0 %	25 %	124027207
5233	NC_008818	ATG	2	6	300899	300904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027207
5234	NC_008818	TGC	2	6	300907	300912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027207
5235	NC_008818	GTAGC	2	10	300946	300955	20 %	20 %	40 %	20 %	124027207
5236	NC_008818	ATC	2	6	301010	301015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027207
5237	NC_008818	AAC	2	6	301085	301090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027207
5238	NC_008818	CCAA	2	8	301108	301115	50 %	0 %	0 %	50 %	124027207
5239	NC_008818	GAA	2	6	301233	301238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027207
5240	NC_008818	AT	3	6	301246	301251	50 %	50 %	0 %	0 %	124027207
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5242	NC_008818	AGC	2	6	301301	301306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027207
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5487	NC_008818	GGC	2	6	316343	316348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027222
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