MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 75646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008358	CAT	2	6	241109	241114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799551
5002	NC_008358	GGTC	2	8	241150	241157	0 %	25 %	50 %	25 %	114799551
5003	NC_008358	AGG	2	6	241164	241169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799551
5004	NC_008358	GCA	2	6	241227	241232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799551
5005	NC_008358	CGC	2	6	241258	241263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799551
5006	NC_008358	GCA	2	6	241266	241271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799551
5007	NC_008358	CTG	2	6	241286	241291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799551
5008	NC_008358	TGT	2	6	241354	241359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114799551
5009	NC_008358	TGG	2	6	241366	241371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799551
5010	NC_008358	GGA	2	6	241418	241423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799551
5011	NC_008358	GGC	2	6	241593	241598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797285
5012	NC_008358	GTC	2	6	241605	241610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797285
5013	NC_008358	GC	3	6	241675	241680	0 %	0 %	50 %	50 %	114797285
5014	NC_008358	GGC	2	6	241688	241693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797285
5015	NC_008358	CAA	2	6	241775	241780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114797285
5016	NC_008358	GCTC	2	8	241853	241860	0 %	25 %	25 %	50 %	114797285
5017	NC_008358	G	6	6	241877	241882	0 %	0 %	100 %	0 %	114797285
5018	NC_008358	ATC	2	6	241933	241938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797285
5019	NC_008358	GGC	2	6	241955	241960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797285
5020	NC_008358	GA	3	6	241971	241976	50 %	0 %	50 %	0 %	114797285
5021	NC_008358	AGA	2	6	242153	242158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797285
5022	NC_008358	CTC	2	6	242250	242255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797285
5023	NC_008358	AGC	2	6	242269	242274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797285
5024	NC_008358	AAG	2	6	242280	242285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797285
5025	NC_008358	CAT	2	6	242295	242300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797285
5026	NC_008358	GCC	2	6	242337	242342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797285
5027	NC_008358	ATG	2	6	242343	242348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797285
5028	NC_008358	CTT	2	6	242367	242372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797285
5029	NC_008358	TAA	2	6	242378	242383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114797285
5030	NC_008358	GGTC	2	8	242385	242392	0 %	25 %	50 %	25 %	114797285
5031	NC_008358	GAG	2	6	242401	242406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114797285
5032	NC_008358	GCG	2	6	242754	242759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797535
5033	NC_008358	GAC	2	6	242780	242785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797535
5034	NC_008358	TG	3	6	242818	242823	0 %	50 %	50 %	0 %	114797535
5035	NC_008358	GCG	2	6	242847	242852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797535
5036	NC_008358	TTG	2	6	242857	242862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114797535
5037	NC_008358	GAAG	2	8	242894	242901	50 %	0 %	50 %	0 %	114797535
5038	NC_008358	GCCG	2	8	242936	242943	0 %	0 %	50 %	50 %	114797535
5039	NC_008358	GC	3	6	242954	242959	0 %	0 %	50 %	50 %	114797535
5040	NC_008358	CGCT	2	8	242995	243002	0 %	25 %	25 %	50 %	114797535
5041	NC_008358	GGC	2	6	243026	243031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797535
5042	NC_008358	CTGG	2	8	243107	243114	0 %	25 %	50 %	25 %	114797535
5043	NC_008358	CGG	2	6	243159	243164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797535
5044	NC_008358	GCC	2	6	243165	243170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797535
5045	NC_008358	TGA	2	6	243214	243219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797535
5046	NC_008358	AGCG	2	8	243406	243413	25 %	0 %	50 %	25 %	114797535
5047	NC_008358	AAC	2	6	243424	243429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114797535
5048	NC_008358	GGC	2	6	243586	243591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797426
5049	NC_008358	TAT	2	6	243618	243623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114797426
5050	NC_008358	GAT	4	12	243645	243656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797426
5051	NC_008358	GAA	2	6	243756	243761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797426
5052	NC_008358	CTG	2	6	243781	243786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797426
5053	NC_008358	CATG	2	8	243789	243796	25 %	25 %	25 %	25 %	114797426
5054	NC_008358	GCT	2	6	243798	243803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797426
5055	NC_008358	GAT	2	6	243915	243920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797426
5056	NC_008358	CCA	2	6	243963	243968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797426
5057	NC_008358	GAA	2	6	243973	243978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797426
5058	NC_008358	CAG	2	6	244039	244044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797426
5059	NC_008358	GGC	2	6	244077	244082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797426
5060	NC_008358	CATC	2	8	244109	244116	25 %	25 %	0 %	50 %	114797426
5061	NC_008358	ACC	2	6	244122	244127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797426
5062	NC_008358	CGG	2	6	244149	244154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797426
5063	NC_008358	GAA	2	6	244240	244245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797426
5064	NC_008358	TCT	2	6	244250	244255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797426
5065	NC_008358	GAT	2	6	244260	244265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797426
5066	NC_008358	CCG	2	6	244326	244331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797426
5067	NC_008358	GTCC	3	12	244348	244359	0 %	25 %	25 %	50 %	114797426
5068	NC_008358	TGA	2	6	244362	244367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797426
5069	NC_008358	GCAG	2	8	244395	244402	25 %	0 %	50 %	25 %	114797426
5070	NC_008358	GC	3	6	244435	244440	0 %	0 %	50 %	50 %	114798160
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5074	NC_008358	GCG	2	6	244633	244638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798160
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5078	NC_008358	TCCG	2	8	244933	244940	0 %	25 %	25 %	50 %	114798160
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5089	NC_008358	GAC	2	6	245568	245573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798160
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5091	NC_008358	TCT	2	6	245621	245626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798160
5092	NC_008358	ATC	2	6	245629	245634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798160
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5099	NC_008358	CGA	2	6	245920	245925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798160
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5101	NC_008358	CAGC	2	8	246061	246068	25 %	0 %	25 %	50 %	114798160
5102	NC_008358	TGA	2	6	246118	246123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798160
5103	NC_008358	TC	3	6	246144	246149	0 %	50 %	0 %	50 %	114798160
5104	NC_008358	GAGG	2	8	246150	246157	25 %	0 %	75 %	0 %	114798160
5105	NC_008358	CGCC	2	8	246193	246200	0 %	0 %	25 %	75 %	114799934
5106	NC_008358	GTC	2	6	246227	246232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799934
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5108	NC_008358	TGG	2	6	246438	246443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799934
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5110	NC_008358	GCGG	2	8	246539	246546	0 %	0 %	75 %	25 %	114799934
5111	NC_008358	CGA	2	6	246565	246570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799934
5112	NC_008358	CAT	2	6	246640	246645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799934
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5122	NC_008358	GGT	2	6	247091	247096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799186
5123	NC_008358	CA	3	6	247154	247159	50 %	0 %	0 %	50 %	114799186
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5141	NC_008358	TTC	2	6	248162	248167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800335
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5232	NC_008358	GAAGA	2	10	252723	252732	60 %	0 %	40 %	0 %	114799536
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5244	NC_008358	CGG	2	6	253310	253315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799536
5245	NC_008358	GC	3	6	253321	253326	0 %	0 %	50 %	50 %	114799536
5246	NC_008358	TGA	2	6	253390	253395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799536
5247	NC_008358	GCT	2	6	253416	253421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799536
5248	NC_008358	TTC	2	6	253427	253432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799536
5249	NC_008358	CT	3	6	253481	253486	0 %	50 %	0 %	50 %	114799536
5250	NC_008358	CACCGA	2	12	253508	253519	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114799536
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5262	NC_008358	GCGAT	2	10	254259	254268	20 %	20 %	40 %	20 %	114797786
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5266	NC_008358	TGA	2	6	254368	254373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797786
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5308	NC_008358	CAGG	2	8	256193	256200	25 %	0 %	50 %	25 %	114799102
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5323	NC_008358	GGCG	2	8	257060	257067	0 %	0 %	75 %	25 %	114798179
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5359	NC_008358	GC	4	8	258693	258700	0 %	0 %	50 %	50 %	114797604
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