MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 75646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008358	ATGC	2	8	216992	216999	25 %	25 %	25 %	25 %	114799501
4502	NC_008358	GCG	2	6	217317	217322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797391
4503	NC_008358	CT	3	6	217323	217328	0 %	50 %	0 %	50 %	114797391
4504	NC_008358	TGG	2	6	217430	217435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797391
4505	NC_008358	TGA	2	6	217455	217460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797391
4506	NC_008358	TGC	2	6	217506	217511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797391
4507	NC_008358	GCG	2	6	217512	217517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797391
4508	NC_008358	GCG	2	6	217555	217560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797391
4509	NC_008358	GC	4	8	217570	217577	0 %	0 %	50 %	50 %	114797391
4510	NC_008358	GGC	2	6	217698	217703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797391
4511	NC_008358	TGA	2	6	217769	217774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797391
4512	NC_008358	T	6	6	217795	217800	0 %	100 %	0 %	0 %	114797391
4513	NC_008358	CCT	2	6	217824	217829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797391
4514	NC_008358	CGG	2	6	217844	217849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797391
4515	NC_008358	GC	3	6	217995	218000	0 %	0 %	50 %	50 %	114797391
4516	NC_008358	CAG	3	9	218044	218052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797391
4517	NC_008358	GGCC	2	8	218064	218071	0 %	0 %	50 %	50 %	114797391
4518	NC_008358	AGGCGC	2	12	218127	218138	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114797391
4519	NC_008358	CTG	2	6	218146	218151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797391
4520	NC_008358	CGGCCT	2	12	218181	218192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114797391
4521	NC_008358	GAT	2	6	218193	218198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797391
4522	NC_008358	ATG	2	6	218234	218239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797391
4523	NC_008358	TGA	3	9	218240	218248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797391
4524	NC_008358	GAAC	2	8	218256	218263	50 %	0 %	25 %	25 %	114797391
4525	NC_008358	TCA	2	6	218354	218359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797391
4526	NC_008358	TGC	2	6	218363	218368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797391
4527	NC_008358	CGA	2	6	218370	218375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797391
4528	NC_008358	CG	3	6	218416	218421	0 %	0 %	50 %	50 %	114797506
4529	NC_008358	AGC	2	6	218432	218437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797506
4530	NC_008358	CTGG	2	8	218455	218462	0 %	25 %	50 %	25 %	114797506
4531	NC_008358	CCG	2	6	218480	218485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797506
4532	NC_008358	TGG	2	6	218491	218496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797506
4533	NC_008358	TCGCC	2	10	218498	218507	0 %	20 %	20 %	60 %	114797506
4534	NC_008358	GCC	2	6	218521	218526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797506
4535	NC_008358	AAC	2	6	218536	218541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114797506
4536	NC_008358	TAGGCA	2	12	218621	218632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114797506
4537	NC_008358	CG	3	6	218654	218659	0 %	0 %	50 %	50 %	114797506
4538	NC_008358	GC	3	6	218663	218668	0 %	0 %	50 %	50 %	114797506
4539	NC_008358	CGGG	2	8	218691	218698	0 %	0 %	75 %	25 %	114797506
4540	NC_008358	TGG	2	6	218727	218732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797506
4541	NC_008358	GCC	2	6	218800	218805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797506
4542	NC_008358	CAC	2	6	218830	218835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797506
4543	NC_008358	CAGG	2	8	218904	218911	25 %	0 %	50 %	25 %	114797506
4544	NC_008358	CGA	2	6	218916	218921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797506
4545	NC_008358	GC	3	6	218924	218929	0 %	0 %	50 %	50 %	114797506
4546	NC_008358	GC	3	6	219035	219040	0 %	0 %	50 %	50 %	114797506
4547	NC_008358	CGG	2	6	219051	219056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797506
4548	NC_008358	GCGG	2	8	219138	219145	0 %	0 %	75 %	25 %	114797506
4549	NC_008358	GGC	2	6	219148	219153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797506
4550	NC_008358	CGG	2	6	219173	219178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797506
4551	NC_008358	GTC	2	6	219190	219195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797506
4552	NC_008358	AGC	2	6	219255	219260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798925
4553	NC_008358	CAG	2	6	219303	219308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798925
4554	NC_008358	GCG	3	9	219309	219317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798925
4555	NC_008358	GCTC	2	8	219323	219330	0 %	25 %	25 %	50 %	114798925
4556	NC_008358	GTA	2	6	219336	219341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798925
4557	NC_008358	CGCA	2	8	219342	219349	25 %	0 %	25 %	50 %	114798925
4558	NC_008358	CAT	2	6	219443	219448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798925
4559	NC_008358	GGAC	2	8	219458	219465	25 %	0 %	50 %	25 %	114798925
4560	NC_008358	CATT	2	8	219467	219474	25 %	50 %	0 %	25 %	114798925
4561	NC_008358	CTG	2	6	219576	219581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798925
4562	NC_008358	GGC	5	15	219596	219610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798925
4563	NC_008358	GGC	2	6	219947	219952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799855
4564	NC_008358	ATC	2	6	219954	219959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799855
4565	NC_008358	CGA	2	6	219961	219966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799855
4566	NC_008358	GCC	2	6	220001	220006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799855
4567	NC_008358	GATT	2	8	220045	220052	25 %	50 %	25 %	0 %	114799855
4568	NC_008358	GGC	2	6	220084	220089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799855
4569	NC_008358	GGT	2	6	220100	220105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799855
4570	NC_008358	GC	3	6	220130	220135	0 %	0 %	50 %	50 %	114799855
4571	NC_008358	CAT	2	6	220345	220350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799855
4572	NC_008358	CGT	2	6	220365	220370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799855
4573	NC_008358	CG	3	6	220416	220421	0 %	0 %	50 %	50 %	114799855
4574	NC_008358	AGC	2	6	220435	220440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799855
4575	NC_008358	CG	3	6	220456	220461	0 %	0 %	50 %	50 %	114799855
4576	NC_008358	CATC	2	8	220639	220646	25 %	25 %	0 %	50 %	114799855
4577	NC_008358	TTC	2	6	220673	220678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799855
4578	NC_008358	GCG	2	6	220722	220727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799855
4579	NC_008358	ACA	2	6	220744	220749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799855
4580	NC_008358	GAT	3	9	221000	221008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797706
4581	NC_008358	GCAGG	2	10	221040	221049	20 %	0 %	60 %	20 %	114797706
4582	NC_008358	CTG	2	6	221117	221122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797706
4583	NC_008358	GC	3	6	221165	221170	0 %	0 %	50 %	50 %	114797706
4584	NC_008358	TCA	2	6	221208	221213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797706
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4586	NC_008358	CTC	2	6	221236	221241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797706
4587	NC_008358	TC	3	6	221272	221277	0 %	50 %	0 %	50 %	114797706
4588	NC_008358	CCTAA	2	10	221331	221340	40 %	20 %	0 %	40 %	114797706
4589	NC_008358	GC	3	6	221361	221366	0 %	0 %	50 %	50 %	114797940
4590	NC_008358	AGC	2	6	221373	221378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797940
4591	NC_008358	GGC	3	9	221382	221390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797940
4592	NC_008358	ACA	2	6	221399	221404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114797940
4593	NC_008358	CCCA	2	8	221416	221423	25 %	0 %	0 %	75 %	114797940
4594	NC_008358	CG	3	6	221632	221637	0 %	0 %	50 %	50 %	114797940
4595	NC_008358	CGC	2	6	221651	221656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797940
4596	NC_008358	TGGA	2	8	221686	221693	25 %	25 %	50 %	0 %	114797940
4597	NC_008358	GC	3	6	221840	221845	0 %	0 %	50 %	50 %	114797940
4598	NC_008358	ATG	2	6	221854	221859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797940
4599	NC_008358	AG	3	6	221868	221873	50 %	0 %	50 %	0 %	114797940
4600	NC_008358	TGG	2	6	221951	221956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797940
4601	NC_008358	GCG	3	9	221962	221970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797940
4602	NC_008358	AAG	2	6	221979	221984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797940
4603	NC_008358	CGA	2	6	221990	221995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797940
4604	NC_008358	GCCA	2	8	222002	222009	25 %	0 %	25 %	50 %	114797940
4605	NC_008358	GT	3	6	222023	222028	0 %	50 %	50 %	0 %	114797940
4606	NC_008358	CGC	2	6	222060	222065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797940
4607	NC_008358	GCA	2	6	222107	222112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797940
4608	NC_008358	GCGCAG	2	12	222141	222152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114797940
4609	NC_008358	GCTT	2	8	222225	222232	0 %	50 %	25 %	25 %	114797940
4610	NC_008358	CGCTG	2	10	222270	222279	0 %	20 %	40 %	40 %	114797940
4611	NC_008358	CGC	2	6	222302	222307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797940
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4613	NC_008358	CAAG	2	8	222476	222483	50 %	0 %	25 %	25 %	114797940
4614	NC_008358	CGG	3	9	222497	222505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797940
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4616	NC_008358	TGCT	2	8	222695	222702	0 %	50 %	25 %	25 %	114798072
4617	NC_008358	GCC	2	6	222766	222771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798072
4618	NC_008358	GCGG	2	8	222805	222812	0 %	0 %	75 %	25 %	114798072
4619	NC_008358	GC	3	6	222827	222832	0 %	0 %	50 %	50 %	114798072
4620	NC_008358	GGC	2	6	222842	222847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798072
4621	NC_008358	CG	3	6	222860	222865	0 %	0 %	50 %	50 %	114798072
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4623	NC_008358	CGG	2	6	222999	223004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798072
4624	NC_008358	CAA	2	6	223138	223143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114798072
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4743	NC_008358	CAT	2	6	228837	228842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800356
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4745	NC_008358	GA	3	6	228923	228928	50 %	0 %	50 %	0 %	114800356
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4989	NC_008358	TCGA	2	8	240468	240475	25 %	25 %	25 %	25 %	114799551
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4992	NC_008358	CGGC	2	8	240563	240570	0 %	0 %	50 %	50 %	114799551
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