MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 1305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	TGTGA	2	10	378	387	20 %	40 %	40 %	0 %	113460150
2	NC_008309	AATTG	2	10	7543	7552	40 %	40 %	20 %	0 %	113460154
3	NC_008309	ACGCC	2	10	8359	8368	20 %	0 %	20 %	60 %	113460155
4	NC_008309	TTTGG	2	10	8765	8774	0 %	60 %	40 %	0 %	113460155
5	NC_008309	TTTTA	2	10	10598	10607	20 %	80 %	0 %	0 %	113460158
6	NC_008309	TTGAT	2	10	12890	12899	20 %	60 %	20 %	0 %	113460161
7	NC_008309	TATTT	2	10	14980	14989	20 %	80 %	0 %	0 %	113460163
8	NC_008309	GTGCT	2	10	17917	17926	0 %	40 %	40 %	20 %	113460166
9	NC_008309	AAAAT	2	10	19326	19335	80 %	20 %	0 %	0 %	113460167
10	NC_008309	AATCT	2	10	19452	19461	40 %	40 %	0 %	20 %	113460167
11	NC_008309	ACTCA	2	10	21056	21065	40 %	20 %	0 %	40 %	113460168
12	NC_008309	GATTA	2	10	23019	23028	40 %	40 %	20 %	0 %	113460170
13	NC_008309	AAACG	2	10	23218	23227	60 %	0 %	20 %	20 %	113460170
14	NC_008309	TAATT	2	10	23239	23248	40 %	60 %	0 %	0 %	113460170
15	NC_008309	CTTAT	2	10	24927	24936	20 %	60 %	0 %	20 %	113460172
16	NC_008309	TTATG	2	10	25087	25096	20 %	60 %	20 %	0 %	113460173
17	NC_008309	TTTAT	2	10	28265	28274	20 %	80 %	0 %	0 %	113460176
18	NC_008309	GAAAA	2	10	29517	29526	80 %	0 %	20 %	0 %	113460177
19	NC_008309	TAAAT	2	10	31943	31952	60 %	40 %	0 %	0 %	113460179
20	NC_008309	TTTAT	2	10	35264	35273	20 %	80 %	0 %	0 %	113460182
21	NC_008309	ACTCA	2	10	35391	35400	40 %	20 %	0 %	40 %	113460182
22	NC_008309	CTTTT	2	10	37523	37532	0 %	80 %	0 %	20 %	113460184
23	NC_008309	TGTTA	2	10	38293	38302	20 %	60 %	20 %	0 %	113460185
24	NC_008309	ATGAT	2	10	40751	40760	40 %	40 %	20 %	0 %	113460187
25	NC_008309	CTGTT	2	10	41251	41260	0 %	60 %	20 %	20 %	113460188
26	NC_008309	ATAAG	2	10	43540	43549	60 %	20 %	20 %	0 %	113460189
27	NC_008309	TTTAA	2	10	43610	43619	40 %	60 %	0 %	0 %	113460190
28	NC_008309	TTTTG	2	10	44928	44937	0 %	80 %	20 %	0 %	113460191
29	NC_008309	TTCTG	2	10	45282	45291	0 %	60 %	20 %	20 %	113460192
30	NC_008309	AATCT	2	10	46486	46495	40 %	40 %	0 %	20 %	113460192
31	NC_008309	TTGCA	2	10	49329	49338	20 %	40 %	20 %	20 %	113460194
32	NC_008309	ACAAA	2	10	49843	49852	80 %	0 %	0 %	20 %	113460195
33	NC_008309	TTGCC	2	10	52182	52191	0 %	40 %	20 %	40 %	113460197
34	NC_008309	AGTCC	2	10	53013	53022	20 %	20 %	20 %	40 %	113460197
35	NC_008309	GATTT	2	10	54979	54988	20 %	60 %	20 %	0 %	113460198
36	NC_008309	TTGCT	2	10	55707	55716	0 %	60 %	20 %	20 %	113460199
37	NC_008309	TTACT	2	10	58065	58074	20 %	60 %	0 %	20 %	113460201
38	NC_008309	TATCT	2	10	62212	62221	20 %	60 %	0 %	20 %	113460206
39	NC_008309	AATCC	2	10	65371	65380	40 %	20 %	0 %	40 %	113460211
40	NC_008309	ATGCC	2	10	65870	65879	20 %	20 %	20 %	40 %	113460212
41	NC_008309	TCCTT	2	10	65898	65907	0 %	60 %	0 %	40 %	113460212
42	NC_008309	GTACA	2	10	67848	67857	40 %	20 %	20 %	20 %	113460217
43	NC_008309	GTATG	2	10	68717	68726	20 %	40 %	40 %	0 %	113460218
44	NC_008309	AGTAA	2	10	69378	69387	60 %	20 %	20 %	0 %	113460218
45	NC_008309	ATTTT	2	10	70858	70867	20 %	80 %	0 %	0 %	113460218
46	NC_008309	GGTAA	2	10	71536	71545	40 %	20 %	40 %	0 %	113460220
47	NC_008309	TTTAC	2	10	75610	75619	20 %	60 %	0 %	20 %	113460229
48	NC_008309	GCAAT	2	10	76143	76152	40 %	20 %	20 %	20 %	113460229
49	NC_008309	AGCAG	2	10	78033	78042	40 %	0 %	40 %	20 %	113460232
50	NC_008309	TCTAT	2	10	79686	79695	20 %	60 %	0 %	20 %	113460235
51	NC_008309	TTTCA	2	10	81880	81889	20 %	60 %	0 %	20 %	113460237
52	NC_008309	TAAAG	2	10	83738	83747	60 %	20 %	20 %	0 %	113460239
53	NC_008309	GTTAT	2	10	85330	85339	20 %	60 %	20 %	0 %	113460241
54	NC_008309	GAAAC	2	10	86893	86902	60 %	0 %	20 %	20 %	113460243
55	NC_008309	ATTTT	2	10	90525	90534	20 %	80 %	0 %	0 %	113460245
56	NC_008309	AAATA	2	10	93588	93597	80 %	20 %	0 %	0 %	113460247
57	NC_008309	ATATT	2	10	93696	93705	40 %	60 %	0 %	0 %	113460247
58	NC_008309	GTTTG	2	10	96123	96132	0 %	60 %	40 %	0 %	113460250
59	NC_008309	AAAAT	2	10	96174	96183	80 %	20 %	0 %	0 %	113460251
60	NC_008309	TGGTG	2	10	101282	101291	0 %	40 %	60 %	0 %	113460256
61	NC_008309	TTATT	2	10	102776	102785	20 %	80 %	0 %	0 %	113460260
62	NC_008309	TTTGC	2	10	103088	103097	0 %	60 %	20 %	20 %	113460261
63	NC_008309	TTTGC	2	10	104216	104225	0 %	60 %	20 %	20 %	113460261
64	NC_008309	ATTTT	2	10	104506	104515	20 %	80 %	0 %	0 %	113460262
65	NC_008309	AATGG	2	10	107219	107228	40 %	20 %	40 %	0 %	113460266
66	NC_008309	CATTG	2	10	108514	108523	20 %	40 %	20 %	20 %	113460267
67	NC_008309	TTGGC	2	10	109480	109489	0 %	40 %	40 %	20 %	113460267
68	NC_008309	TGCAG	2	10	111859	111868	20 %	20 %	40 %	20 %	113460269
69	NC_008309	CGCAC	2	10	112689	112698	20 %	0 %	20 %	60 %	113460270
70	NC_008309	ATTTT	2	10	116246	116255	20 %	80 %	0 %	0 %	113460275
71	NC_008309	ATCGG	2	10	119683	119692	20 %	20 %	40 %	20 %	113460279
72	NC_008309	CAACC	2	10	120395	120404	40 %	0 %	0 %	60 %	113460279
73	NC_008309	ATTTA	2	10	123895	123904	40 %	60 %	0 %	0 %	113460283
74	NC_008309	ATTTT	2	10	126497	126506	20 %	80 %	0 %	0 %	113460286
75	NC_008309	AATCC	2	10	127755	127764	40 %	20 %	0 %	40 %	113460288
76	NC_008309	CTTAA	2	10	130803	130812	40 %	40 %	0 %	20 %	113460292
77	NC_008309	GCAAA	2	10	132674	132683	60 %	0 %	20 %	20 %	113460293
78	NC_008309	GTTCG	2	10	132780	132789	0 %	40 %	40 %	20 %	113460293
79	NC_008309	AAATG	2	10	134161	134170	60 %	20 %	20 %	0 %	113460295
80	NC_008309	AATCC	2	10	134903	134912	40 %	20 %	0 %	40 %	113460297
81	NC_008309	TGCCT	2	10	135085	135094	0 %	40 %	20 %	40 %	113460297
82	NC_008309	GTATG	2	10	135912	135921	20 %	40 %	40 %	0 %	113460297
83	NC_008309	AAGAA	2	10	137100	137109	80 %	0 %	20 %	0 %	113460297
84	NC_008309	AGGCG	2	10	137758	137767	20 %	0 %	60 %	20 %	113460298
85	NC_008309	ATTGT	2	10	138250	138259	20 %	60 %	20 %	0 %	113460299
86	NC_008309	TTGTG	2	10	138470	138479	0 %	60 %	40 %	0 %	113460299
87	NC_008309	GCAAT	2	10	139318	139327	40 %	20 %	20 %	20 %	113460300
88	NC_008309	TTGTA	2	10	139634	139643	20 %	60 %	20 %	0 %	113460301
89	NC_008309	TCTTT	2	10	140594	140603	0 %	80 %	0 %	20 %	113460302
90	NC_008309	TTAAA	2	10	140939	140948	60 %	40 %	0 %	0 %	113460302
91	NC_008309	TGATG	2	10	141939	141948	20 %	40 %	40 %	0 %	113460304
92	NC_008309	CAATA	2	10	143314	143323	60 %	20 %	0 %	20 %	113460305
93	NC_008309	ATTTA	2	10	144620	144629	40 %	60 %	0 %	0 %	113460307
94	NC_008309	TAAAA	2	10	144653	144662	80 %	20 %	0 %	0 %	113460307
95	NC_008309	TGTTT	2	10	144823	144832	0 %	80 %	20 %	0 %	113460307
96	NC_008309	CATTC	2	10	145131	145140	20 %	40 %	0 %	40 %	113460308
97	NC_008309	TTTAT	2	10	146978	146987	20 %	80 %	0 %	0 %	113460310
98	NC_008309	GTAAA	2	10	147527	147536	60 %	20 %	20 %	0 %	113460311
99	NC_008309	TTATT	2	10	147602	147611	20 %	80 %	0 %	0 %	113460311
100	NC_008309	ATGCA	2	10	153418	153427	40 %	20 %	20 %	20 %	113460319
101	NC_008309	GCTTA	2	10	154840	154849	20 %	40 %	20 %	20 %	113460320
102	NC_008309	GTGAT	2	10	155356	155365	20 %	40 %	40 %	0 %	113460320
103	NC_008309	TGATG	2	10	155977	155986	20 %	40 %	40 %	0 %	113460321
104	NC_008309	TGCGT	2	10	157308	157317	0 %	40 %	40 %	20 %	113460323
105	NC_008309	TATTG	2	10	157354	157363	20 %	60 %	20 %	0 %	113460323
106	NC_008309	GGGAA	2	10	158542	158551	40 %	0 %	60 %	0 %	113460324
107	NC_008309	TTTAC	2	10	158863	158872	20 %	60 %	0 %	20 %	113460324
108	NC_008309	GAATT	2	10	159206	159215	40 %	40 %	20 %	0 %	113460325
109	NC_008309	ATAAG	2	10	160495	160504	60 %	20 %	20 %	0 %	113460327
110	NC_008309	TAATT	2	10	160529	160538	40 %	60 %	0 %	0 %	113460327
111	NC_008309	GATAG	2	10	161810	161819	40 %	20 %	40 %	0 %	113460327
112	NC_008309	ACACA	2	10	163301	163310	60 %	0 %	0 %	40 %	113460328
113	NC_008309	AAAAT	2	10	166575	166584	80 %	20 %	0 %	0 %	113460331
114	NC_008309	AATAA	2	10	166607	166616	80 %	20 %	0 %	0 %	113460331
115	NC_008309	TTAAA	2	10	166686	166695	60 %	40 %	0 %	0 %	113460331
116	NC_008309	AAACC	2	10	170927	170936	60 %	0 %	0 %	40 %	113460334
117	NC_008309	AATCC	2	10	175234	175243	40 %	20 %	0 %	40 %	113460340
118	NC_008309	ATCAA	2	10	178300	178309	60 %	20 %	0 %	20 %	113460342
119	NC_008309	AATAG	2	10	178906	178915	60 %	20 %	20 %	0 %	113460343
120	NC_008309	TACCG	2	10	179101	179110	20 %	20 %	20 %	40 %	113460343
121	NC_008309	AAACC	2	10	179367	179376	60 %	0 %	0 %	40 %	113460343
122	NC_008309	CAAAT	2	10	182377	182386	60 %	20 %	0 %	20 %	113460344
123	NC_008309	TAATT	2	10	192020	192029	40 %	60 %	0 %	0 %	113460351
124	NC_008309	AAACT	2	10	193015	193024	60 %	20 %	0 %	20 %	113460351
125	NC_008309	CAAAT	2	10	193351	193360	60 %	20 %	0 %	20 %	113460351
126	NC_008309	TGAGA	2	10	194768	194777	40 %	20 %	40 %	0 %	113460352
127	NC_008309	GTTTT	2	10	196918	196927	0 %	80 %	20 %	0 %	113460354
128	NC_008309	TTCAC	2	10	197614	197623	20 %	40 %	0 %	40 %	113460355
129	NC_008309	AGCTG	2	10	198202	198211	20 %	20 %	40 %	20 %	113460355
130	NC_008309	ATTTT	2	10	209287	209296	20 %	80 %	0 %	0 %	113460355
131	NC_008309	AATTT	2	10	210259	210268	40 %	60 %	0 %	0 %	113460355
132	NC_008309	TATAC	2	10	216794	216803	40 %	40 %	0 %	20 %	113460361
133	NC_008309	GGCGA	2	10	218452	218461	20 %	0 %	60 %	20 %	113460363
134	NC_008309	GTAAT	2	10	220149	220158	40 %	40 %	20 %	0 %	113460365
135	NC_008309	ACCGC	2	10	221399	221408	20 %	0 %	20 %	60 %	113460366
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149	NC_008309	TATTT	2	10	246835	246844	20 %	80 %	0 %	0 %	113460393
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255	NC_008309	TGGCT	2	10	381248	381257	0 %	40 %	40 %	20 %	113460518
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257	NC_008309	CAGGA	2	10	381764	381773	40 %	0 %	40 %	20 %	113460518
258	NC_008309	AGCAC	2	10	382634	382643	40 %	0 %	20 %	40 %	113460519
259	NC_008309	GAAAT	2	10	382650	382659	60 %	20 %	20 %	0 %	113460519
260	NC_008309	TTAAT	2	10	383755	383764	40 %	60 %	0 %	0 %	113460521
261	NC_008309	CAAAT	2	10	383776	383785	60 %	20 %	0 %	20 %	113460521
262	NC_008309	GCAAT	2	10	384464	384473	40 %	20 %	20 %	20 %	113460522
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