MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008309	GTT	2	6	213275	213280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460356
4002	NC_008309	AAAT	2	8	213330	213337	75 %	25 %	0 %	0 %	113460356
4003	NC_008309	TTG	2	6	213342	213347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460356
4004	NC_008309	T	6	6	213363	213368	0 %	100 %	0 %	0 %	113460356
4005	NC_008309	A	6	6	213487	213492	100 %	0 %	0 %	0 %	113460356
4006	NC_008309	ACCTGA	2	12	213501	213512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113460356
4007	NC_008309	ACA	2	6	213526	213531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460356
4008	NC_008309	ATT	2	6	213576	213581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460356
4009	NC_008309	ATC	2	6	213613	213618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460356
4010	NC_008309	T	8	8	213655	213662	0 %	100 %	0 %	0 %	113460357
4011	NC_008309	TTG	2	6	213763	213768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460357
4012	NC_008309	GTTACT	2	12	213788	213799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113460357
4013	NC_008309	AAT	2	6	213883	213888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460357
4014	NC_008309	CGG	2	6	213890	213895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460357
4015	NC_008309	CGC	2	6	213964	213969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460357
4016	NC_008309	A	6	6	214068	214073	100 %	0 %	0 %	0 %	113460357
4017	NC_008309	AAT	2	6	214108	214113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460357
4018	NC_008309	TAAA	2	8	214134	214141	75 %	25 %	0 %	0 %	113460357
4019	NC_008309	ACTC	2	8	214171	214178	25 %	25 %	0 %	50 %	113460357
4020	NC_008309	CCG	2	6	214254	214259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460357
4021	NC_008309	A	6	6	214273	214278	100 %	0 %	0 %	0 %	113460357
4022	NC_008309	TGA	2	6	214284	214289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460357
4023	NC_008309	ATT	2	6	214336	214341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460357
4024	NC_008309	TTC	2	6	214406	214411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460358
4025	NC_008309	TCA	2	6	214440	214445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460358
4026	NC_008309	T	6	6	214523	214528	0 %	100 %	0 %	0 %	113460358
4027	NC_008309	AAT	2	6	214531	214536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460358
4028	NC_008309	TGT	2	6	214581	214586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460358
4029	NC_008309	TAA	2	6	214592	214597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460358
4030	NC_008309	TGC	2	6	214679	214684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460358
4031	NC_008309	CTA	2	6	214738	214743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460358
4032	NC_008309	GTT	2	6	214803	214808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460358
4033	NC_008309	CAA	2	6	214825	214830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460358
4034	NC_008309	T	6	6	214907	214912	0 %	100 %	0 %	0 %	113460358
4035	NC_008309	CAT	2	6	214936	214941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460358
4036	NC_008309	ACCG	2	8	215000	215007	25 %	0 %	25 %	50 %	113460358
4037	NC_008309	TGT	2	6	215020	215025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460358
4038	NC_008309	TAA	2	6	215036	215041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460358
4039	NC_008309	TG	3	6	215061	215066	0 %	50 %	50 %	0 %	113460358
4040	NC_008309	GGC	2	6	215069	215074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460358
4041	NC_008309	CAG	2	6	215086	215091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460358
4042	NC_008309	T	7	7	215107	215113	0 %	100 %	0 %	0 %	113460358
4043	NC_008309	TGT	2	6	215439	215444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460359
4044	NC_008309	ATAA	2	8	215542	215549	75 %	25 %	0 %	0 %	113460359
4045	NC_008309	AAT	2	6	215574	215579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460359
4046	NC_008309	ATTT	2	8	215606	215613	25 %	75 %	0 %	0 %	113460359
4047	NC_008309	ATT	2	6	215644	215649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460359
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4049	NC_008309	TCT	2	6	215725	215730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460359
4050	NC_008309	T	7	7	215805	215811	0 %	100 %	0 %	0 %	113460359
4051	NC_008309	ATA	2	6	215812	215817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460359
4052	NC_008309	TTTC	2	8	215833	215840	0 %	75 %	0 %	25 %	113460359
4053	NC_008309	TAA	2	6	215862	215867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460359
4054	NC_008309	ATC	2	6	215916	215921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460359
4055	NC_008309	T	7	7	215949	215955	0 %	100 %	0 %	0 %	113460359
4056	NC_008309	A	7	7	215958	215964	100 %	0 %	0 %	0 %	113460359
4057	NC_008309	AAT	2	6	216039	216044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460360
4058	NC_008309	T	6	6	216169	216174	0 %	100 %	0 %	0 %	113460360
4059	NC_008309	TGA	2	6	216183	216188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460360
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4061	NC_008309	TCA	2	6	216197	216202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460360
4062	NC_008309	ATC	2	6	216210	216215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460360
4063	NC_008309	TAA	2	6	216221	216226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460360
4064	NC_008309	CGATTC	2	12	216273	216284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113460360
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4066	NC_008309	AC	3	6	216332	216337	50 %	0 %	0 %	50 %	113460360
4067	NC_008309	TA	3	6	216359	216364	50 %	50 %	0 %	0 %	113460360
4068	NC_008309	ATA	2	6	216419	216424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460361
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4070	NC_008309	TAA	2	6	216551	216556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460361
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4073	NC_008309	AAT	2	6	216632	216637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460361
4074	NC_008309	TAT	3	9	216646	216654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460361
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4077	NC_008309	TA	4	8	216782	216789	50 %	50 %	0 %	0 %	113460361
4078	NC_008309	TATAC	2	10	216794	216803	40 %	40 %	0 %	20 %	113460361
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4081	NC_008309	TAA	2	6	217029	217034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460362
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4084	NC_008309	TA	3	6	217190	217195	50 %	50 %	0 %	0 %	113460362
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4090	NC_008309	CAT	2	6	217502	217507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460362
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4093	NC_008309	TAA	2	6	217589	217594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460362
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4096	NC_008309	TTTG	2	8	217694	217701	0 %	75 %	25 %	0 %	113460362
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4099	NC_008309	ATG	2	6	217815	217820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460362
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4103	NC_008309	ATC	2	6	217878	217883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460362
4104	NC_008309	GTA	2	6	217888	217893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460362
4105	NC_008309	CT	3	6	217915	217920	0 %	50 %	0 %	50 %	113460362
4106	NC_008309	GAG	2	6	217947	217952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460362
4107	NC_008309	ACA	2	6	217978	217983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460362
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4109	NC_008309	T	6	6	218034	218039	0 %	100 %	0 %	0 %	113460362
4110	NC_008309	T	7	7	218090	218096	0 %	100 %	0 %	0 %	113460362
4111	NC_008309	CA	3	6	218097	218102	50 %	0 %	0 %	50 %	113460362
4112	NC_008309	TGT	2	6	218114	218119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460362
4113	NC_008309	T	8	8	218192	218199	0 %	100 %	0 %	0 %	113460363
4114	NC_008309	CTTC	2	8	218289	218296	0 %	50 %	0 %	50 %	113460363
4115	NC_008309	TC	3	6	218301	218306	0 %	50 %	0 %	50 %	113460363
4116	NC_008309	CAC	2	6	218329	218334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460363
4117	NC_008309	GGCGA	2	10	218452	218461	20 %	0 %	60 %	20 %	113460363
4118	NC_008309	GTT	2	6	218475	218480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460363
4119	NC_008309	GTG	3	9	219088	219096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460364
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4121	NC_008309	GATT	2	8	219158	219165	25 %	50 %	25 %	0 %	113460364
4122	NC_008309	GAA	2	6	219171	219176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460364
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4124	NC_008309	GAA	2	6	219336	219341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460364
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4126	NC_008309	ATA	2	6	219581	219586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460365
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4133	NC_008309	TTGC	2	8	219896	219903	0 %	50 %	25 %	25 %	113460365
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4238	NC_008309	GCG	2	6	225652	225657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460371
4239	NC_008309	TTCCA	2	10	225693	225702	20 %	40 %	0 %	40 %	113460371
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4241	NC_008309	ATTA	2	8	225737	225744	50 %	50 %	0 %	0 %	113460371
4242	NC_008309	TAA	2	6	225827	225832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460372
4243	NC_008309	GAA	2	6	225849	225854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460372
4244	NC_008309	T	7	7	225977	225983	0 %	100 %	0 %	0 %	113460372
4245	NC_008309	CAT	2	6	226023	226028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460372
4246	NC_008309	ATG	2	6	226054	226059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460372
4247	NC_008309	TCA	2	6	226180	226185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460372
4248	NC_008309	TGG	2	6	226191	226196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460372
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4250	NC_008309	CAT	2	6	226281	226286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460372
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