MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba plasmid pHac1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008230	ATG	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948254
2	NC_008230	TTA	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948254
3	NC_008230	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948255
4	NC_008230	CTA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109948256
5	NC_008230	CAA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948256
6	NC_008230	CTT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
7	NC_008230	CTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
8	NC_008230	CTT	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
9	NC_008230	CTT	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
10	NC_008230	AGG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948258
11	NC_008230	ATT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948259
12	NC_008230	AGA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259
13	NC_008230	CAC	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109948259
14	NC_008230	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
15	NC_008230	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109948259
16	NC_008230	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948259
17	NC_008230	CAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
18	NC_008230	CTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
19	NC_008230	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
20	NC_008230	GGA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948259
21	NC_008230	GAA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.