MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	TG	3	6	1002	1007	0 %	50 %	50 %	0 %	109644369
2	NC_008213	AT	3	6	2382	2387	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
3	NC_008213	TG	3	6	2435	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	109644370
4	NC_008213	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
5	NC_008213	CT	3	6	4151	4156	0 %	50 %	0 %	50 %	109644371
6	NC_008213	TA	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	109644371
7	NC_008213	GA	4	8	6422	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
8	NC_008213	GA	4	8	6562	6569	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
9	NC_008213	AT	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	109644374
10	NC_008213	AG	3	6	7359	7364	50 %	0 %	50 %	0 %	109644374
11	NC_008213	TC	3	6	7486	7491	0 %	50 %	0 %	50 %	109644374
12	NC_008213	AT	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	109644376
13	NC_008213	AT	3	6	9540	9545	50 %	50 %	0 %	0 %	109644377
14	NC_008213	CT	3	6	11647	11652	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
15	NC_008213	AG	3	6	12041	12046	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
16	NC_008213	AG	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
17	NC_008213	GA	3	6	12491	12496	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
18	NC_008213	AT	3	6	12543	12548	50 %	50 %	0 %	0 %	109644379
19	NC_008213	TC	3	6	13555	13560	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
20	NC_008213	CT	3	6	13934	13939	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
21	NC_008213	AT	3	6	14356	14361	50 %	50 %	0 %	0 %	109644379
22	NC_008213	TC	3	6	14638	14643	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
23	NC_008213	AG	3	6	15136	15141	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
24	NC_008213	AG	3	6	15170	15175	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
25	NC_008213	TC	3	6	16055	16060	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
26	NC_008213	TC	3	6	16065	16070	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
27	NC_008213	CT	3	6	16100	16105	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
28	NC_008213	AG	3	6	16541	16546	50 %	0 %	50 %	0 %	109644380
29	NC_008213	TA	4	8	16892	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	109644380
30	NC_008213	CT	3	6	16952	16957	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
31	NC_008213	TC	3	6	17804	17809	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
32	NC_008213	TC	3	6	18065	18070	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
33	NC_008213	CT	3	6	18545	18550	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
34	NC_008213	TG	4	8	19097	19104	0 %	50 %	50 %	0 %	109644381
35	NC_008213	GA	3	6	19207	19212	50 %	0 %	50 %	0 %	109644381
36	NC_008213	GT	3	6	20701	20706	0 %	50 %	50 %	0 %	109644383
37	NC_008213	CG	3	6	20769	20774	0 %	0 %	50 %	50 %	109644383
38	NC_008213	AG	3	6	25518	25523	50 %	0 %	50 %	0 %	109644385
39	NC_008213	CT	3	6	25813	25818	0 %	50 %	0 %	50 %	109644385
40	NC_008213	CT	3	6	27492	27497	0 %	50 %	0 %	50 %	109644386
41	NC_008213	CA	3	6	28005	28010	50 %	0 %	0 %	50 %	109644386
42	NC_008213	TG	3	6	28235	28240	0 %	50 %	50 %	0 %	109644386
43	NC_008213	CA	3	6	28751	28756	50 %	0 %	0 %	50 %	109644386
44	NC_008213	GA	3	6	31395	31400	50 %	0 %	50 %	0 %	109644387
45	NC_008213	CT	3	6	31438	31443	0 %	50 %	0 %	50 %	109644387
46	NC_008213	AT	3	6	32144	32149	50 %	50 %	0 %	0 %	109644388
47	NC_008213	GA	3	6	32332	32337	50 %	0 %	50 %	0 %	109644388
48	NC_008213	AT	3	6	32525	32530	50 %	50 %	0 %	0 %	109644388
49	NC_008213	CA	3	6	33849	33854	50 %	0 %	0 %	50 %	109644389
50	NC_008213	TG	4	8	33928	33935	0 %	50 %	50 %	0 %	109644389
51	NC_008213	AC	3	6	34068	34073	50 %	0 %	0 %	50 %	109644389
52	NC_008213	AG	3	6	34727	34732	50 %	0 %	50 %	0 %	109644390
53	NC_008213	AT	3	6	35063	35068	50 %	50 %	0 %	0 %	109644390
54	NC_008213	TC	3	6	36308	36313	0 %	50 %	0 %	50 %	109644392
55	NC_008213	CG	3	6	36428	36433	0 %	0 %	50 %	50 %	109644392
56	NC_008213	TG	3	6	38083	38088	0 %	50 %	50 %	0 %	109644394
57	NC_008213	GA	3	6	38291	38296	50 %	0 %	50 %	0 %	109644394
58	NC_008213	AC	3	6	38304	38309	50 %	0 %	0 %	50 %	109644394
59	NC_008213	CT	3	6	38894	38899	0 %	50 %	0 %	50 %	109644395
60	NC_008213	CT	3	6	39334	39339	0 %	50 %	0 %	50 %	109644395
61	NC_008213	GA	3	6	39815	39820	50 %	0 %	50 %	0 %	109644396
62	NC_008213	CT	3	6	40184	40189	0 %	50 %	0 %	50 %	109644396
63	NC_008213	TC	3	6	40424	40429	0 %	50 %	0 %	50 %	109644397
64	NC_008213	TG	3	6	40494	40499	0 %	50 %	50 %	0 %	109644397
65	NC_008213	AG	3	6	40795	40800	50 %	0 %	50 %	0 %	109644397
66	NC_008213	TC	3	6	40921	40926	0 %	50 %	0 %	50 %	109644397
67	NC_008213	AG	3	6	40942	40947	50 %	0 %	50 %	0 %	109644397
68	NC_008213	AC	3	6	41455	41460	50 %	0 %	0 %	50 %	109644398
69	NC_008213	GA	3	6	41556	41561	50 %	0 %	50 %	0 %	109644398
70	NC_008213	CT	3	6	42006	42011	0 %	50 %	0 %	50 %	109644398
71	NC_008213	GC	3	6	44681	44686	0 %	0 %	50 %	50 %	109644401
72	NC_008213	GC	3	6	45356	45361	0 %	0 %	50 %	50 %	109644402
73	NC_008213	AT	3	6	45746	45751	50 %	50 %	0 %	0 %	109644402

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.