MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 50860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008212	AGA	2	6	154182	154187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667075
2502	NC_008212	GAA	2	6	154194	154199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667075
2503	NC_008212	TGA	2	6	154257	154262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667075
2504	NC_008212	ACC	2	6	154360	154365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667075
2505	NC_008212	ACC	2	6	154378	154383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667075
2506	NC_008212	CCG	2	6	154750	154755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667076
2507	NC_008212	TAT	2	6	154819	154824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667076
2508	NC_008212	GC	3	6	154939	154944	0 %	0 %	50 %	50 %	110667076
2509	NC_008212	GAA	2	6	154977	154982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667076
2510	NC_008212	CTT	2	6	155017	155022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667076
2511	NC_008212	CCA	2	6	155050	155055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667076
2512	NC_008212	CAG	2	6	155105	155110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667076
2513	NC_008212	AC	3	6	155131	155136	50 %	0 %	0 %	50 %	110667076
2514	NC_008212	ATT	2	6	155233	155238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667076
2515	NC_008212	CGCT	2	8	155297	155304	0 %	25 %	25 %	50 %	110667076
2516	NC_008212	AAT	2	6	155407	155412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667076
2517	NC_008212	CCA	2	6	155413	155418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667076
2518	NC_008212	CAT	2	6	155490	155495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667076
2519	NC_008212	GGTG	2	8	155500	155507	0 %	25 %	75 %	0 %	110667076
2520	NC_008212	T	6	6	155518	155523	0 %	100 %	0 %	0 %	110667076
2521	NC_008212	TGG	2	6	155559	155564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667076
2522	NC_008212	TTC	2	6	155570	155575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667076
2523	NC_008212	ACT	2	6	155590	155595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667076
2524	NC_008212	CAGT	2	8	155621	155628	25 %	25 %	25 %	25 %	110667076
2525	NC_008212	TTG	2	6	155723	155728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667076
2526	NC_008212	CAC	2	6	155762	155767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667076
2527	NC_008212	TCC	2	6	155783	155788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667076
2528	NC_008212	CTTG	2	8	155826	155833	0 %	50 %	25 %	25 %	110667076
2529	NC_008212	CAGT	2	8	155852	155859	25 %	25 %	25 %	25 %	110667076
2530	NC_008212	GCGT	2	8	156220	156227	0 %	25 %	50 %	25 %	110667077
2531	NC_008212	TAT	2	6	156258	156263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667077
2532	NC_008212	TGT	2	6	156315	156320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667077
2533	NC_008212	GAT	2	6	156343	156348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667077
2534	NC_008212	TGT	2	6	156384	156389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667077
2535	NC_008212	CCG	2	6	156399	156404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667077
2536	NC_008212	TGA	2	6	156499	156504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667077
2537	NC_008212	ACCG	2	8	156505	156512	25 %	0 %	25 %	50 %	110667077
2538	NC_008212	CAT	2	6	156534	156539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667077
2539	NC_008212	TGT	2	6	156543	156548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667077
2540	NC_008212	GCT	2	6	156562	156567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2541	NC_008212	G	6	6	156581	156586	0 %	0 %	100 %	0 %	110667077
2542	NC_008212	CTG	3	9	156644	156652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2543	NC_008212	CA	3	6	156672	156677	50 %	0 %	0 %	50 %	110667077
2544	NC_008212	GATG	2	8	156712	156719	25 %	25 %	50 %	0 %	110667077
2545	NC_008212	TGT	2	6	156738	156743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667077
2546	NC_008212	TAGT	2	8	156749	156756	25 %	50 %	25 %	0 %	110667077
2547	NC_008212	TGT	2	6	156762	156767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667077
2548	NC_008212	CCA	2	6	156778	156783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667077
2549	NC_008212	AGC	2	6	156798	156803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2550	NC_008212	CA	4	8	156806	156813	50 %	0 %	0 %	50 %	110667077
2551	NC_008212	TGG	2	6	156959	156964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667077
2552	NC_008212	GTC	2	6	156982	156987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2553	NC_008212	CTG	2	6	157040	157045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2554	NC_008212	TCG	2	6	157048	157053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667077
2555	NC_008212	CCTG	2	8	157054	157061	0 %	25 %	25 %	50 %	110667077
2556	NC_008212	AT	3	6	157502	157507	50 %	50 %	0 %	0 %	110667078
2557	NC_008212	TGA	2	6	157514	157519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667078
2558	NC_008212	CAT	2	6	157532	157537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667078
2559	NC_008212	TCA	3	9	157552	157560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667078
2560	NC_008212	GT	3	6	157681	157686	0 %	50 %	50 %	0 %	110667078
2561	NC_008212	TC	3	6	157721	157726	0 %	50 %	0 %	50 %	110667078
2562	NC_008212	TGC	2	6	157730	157735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667078
2563	NC_008212	AAT	2	6	157770	157775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667078
2564	NC_008212	CGG	2	6	157796	157801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667078
2565	NC_008212	CTG	2	6	157834	157839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667078
2566	NC_008212	ACGAG	2	10	157849	157858	40 %	0 %	40 %	20 %	110667078
2567	NC_008212	GCA	2	6	157863	157868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667078
2568	NC_008212	ACA	2	6	157938	157943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667078
2569	NC_008212	CTT	2	6	157974	157979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667078
2570	NC_008212	CCA	3	9	158005	158013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667078
2571	NC_008212	CGATAT	2	12	158040	158051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110667078
2572	NC_008212	TGC	2	6	158189	158194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667078
2573	NC_008212	TGGA	2	8	158237	158244	25 %	25 %	50 %	0 %	110667078
2574	NC_008212	ATTT	2	8	158306	158313	25 %	75 %	0 %	0 %	110667078
2575	NC_008212	CTA	2	6	158332	158337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667078
2576	NC_008212	CGG	2	6	158360	158365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667078
2577	NC_008212	GCT	2	6	158406	158411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667078
2578	NC_008212	TGG	3	9	158495	158503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667078
2579	NC_008212	GTG	2	6	158524	158529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667078
2580	NC_008212	ATG	2	6	158763	158768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667079
2581	NC_008212	CGG	2	6	158772	158777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667079
2582	NC_008212	CCGA	2	8	158799	158806	25 %	0 %	25 %	50 %	110667079
2583	NC_008212	TGC	2	6	158905	158910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667079
2584	NC_008212	ATT	2	6	158914	158919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667079
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2586	NC_008212	GGT	2	6	158975	158980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667079
2587	NC_008212	ACA	2	6	159026	159031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667079
2588	NC_008212	CAT	2	6	159043	159048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667079
2589	NC_008212	CAA	2	6	159062	159067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667079
2590	NC_008212	GCT	2	6	159149	159154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667079
2591	NC_008212	TGA	2	6	159308	159313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667080
2592	NC_008212	CAG	2	6	159330	159335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667080
2593	NC_008212	GGA	2	6	159341	159346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667080
2594	NC_008212	ATA	2	6	159388	159393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667080
2595	NC_008212	CTG	2	6	159394	159399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667080
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2598	NC_008212	A	6	6	159530	159535	100 %	0 %	0 %	0 %	110667080
2599	NC_008212	CGA	2	6	159581	159586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667080
2600	NC_008212	TCG	3	9	159644	159652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667080
2601	NC_008212	CTC	2	6	159699	159704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667081
2602	NC_008212	GCA	2	6	159709	159714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667081
2603	NC_008212	CTT	2	6	159718	159723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667081
2604	NC_008212	TTA	2	6	159746	159751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667081
2605	NC_008212	GAC	2	6	159772	159777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667081
2606	NC_008212	TGC	2	6	159786	159791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667081
2607	NC_008212	AGC	2	6	159855	159860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667081
2608	NC_008212	ACG	2	6	159865	159870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667081
2609	NC_008212	CAC	2	6	160052	160057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667081
2610	NC_008212	TGA	2	6	160083	160088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667081
2611	NC_008212	ATCT	2	8	160206	160213	25 %	50 %	0 %	25 %	110667081
2612	NC_008212	ATC	2	6	160241	160246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667081
2613	NC_008212	ATG	2	6	160256	160261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667081
2614	NC_008212	ACATA	2	10	160264	160273	60 %	20 %	0 %	20 %	110667081
2615	NC_008212	GTAT	2	8	160409	160416	25 %	50 %	25 %	0 %	110667082
2616	NC_008212	C	7	7	160446	160452	0 %	0 %	0 %	100 %	110667082
2617	NC_008212	GAC	2	6	160491	160496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667082
2618	NC_008212	ATGT	2	8	160552	160559	25 %	50 %	25 %	0 %	110667082
2619	NC_008212	GAA	2	6	160582	160587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667082
2620	NC_008212	GAT	2	6	160606	160611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667082
2621	NC_008212	GTT	2	6	160666	160671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667082
2622	NC_008212	ACAA	2	8	160673	160680	75 %	0 %	0 %	25 %	110667082
2623	NC_008212	TGC	2	6	160833	160838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667082
2624	NC_008212	GACT	2	8	160859	160866	25 %	25 %	25 %	25 %	110667082
2625	NC_008212	ATG	3	9	160934	160942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667082
2626	NC_008212	ACT	2	6	161016	161021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667082
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2630	NC_008212	TGA	2	6	161163	161168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667082
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2634	NC_008212	TGG	2	6	161322	161327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667082
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2650	NC_008212	TCG	2	6	162329	162334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667083
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2730	NC_008212	TCAT	2	8	168676	168683	25 %	50 %	0 %	25 %	110667090
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2735	NC_008212	GACGT	2	10	169093	169102	20 %	20 %	40 %	20 %	110667090
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2738	NC_008212	ATC	2	6	169299	169304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667090
2739	NC_008212	TGA	2	6	169331	169336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667090
2740	NC_008212	TGA	2	6	169700	169705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667090
2741	NC_008212	TGC	2	6	169742	169747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667090
2742	NC_008212	ATG	2	6	169798	169803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667090
2743	NC_008212	TTG	2	6	169816	169821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667090
2744	NC_008212	GAG	2	6	169827	169832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667090
2745	NC_008212	ATG	2	6	169851	169856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667090
2746	NC_008212	GAC	2	6	169929	169934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667090
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2750	NC_008212	TGA	2	6	170176	170181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667091
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2752	NC_008212	TGA	2	6	170547	170552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667092
2753	NC_008212	TCG	2	6	170592	170597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667092
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2756	NC_008212	CAG	2	6	170639	170644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667092
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2759	NC_008212	ATA	2	6	170834	170839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667092
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2762	NC_008212	CTG	2	6	170945	170950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667092
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2823	NC_008212	ATCGAC	2	12	173332	173343	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110667093
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2843	NC_008212	AAAT	2	8	174075	174082	75 %	25 %	0 %	0 %	110667093
2844	NC_008212	CGA	2	6	174253	174258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667094
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2849	NC_008212	GCT	2	6	174519	174524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667094
2850	NC_008212	TGTC	2	8	174755	174762	0 %	50 %	25 %	25 %	110667094
2851	NC_008212	GTT	2	6	174789	174794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667094
2852	NC_008212	ATC	2	6	174899	174904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667094
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2854	NC_008212	T	7	7	174968	174974	0 %	100 %	0 %	0 %	110667094
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2858	NC_008212	AGT	2	6	175329	175334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667094
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2860	NC_008212	CAC	2	6	175370	175375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667094
2861	NC_008212	ATCG	2	8	175397	175404	25 %	25 %	25 %	25 %	110667094
2862	NC_008212	TCG	2	6	175421	175426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667094
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2864	NC_008212	GAC	2	6	175556	175561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667094
2865	NC_008212	CAC	2	6	175621	175626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667094
2866	NC_008212	ACG	2	6	175632	175637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667094
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2980	NC_008212	TCAT	2	8	182876	182883	25 %	50 %	0 %	25 %	110667099
2981	NC_008212	TAT	2	6	182954	182959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667099
2982	NC_008212	TAC	2	6	182994	182999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667099
2983	NC_008212	TAC	2	6	183048	183053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667099
2984	NC_008212	GGAT	2	8	183062	183069	25 %	25 %	50 %	0 %	110667099
2985	NC_008212	TAC	2	6	183089	183094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667099
2986	NC_008212	GTG	3	9	183135	183143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667099
2987	NC_008212	GGT	3	9	183146	183154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667099
2988	NC_008212	GCA	2	6	183156	183161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667099
2989	NC_008212	TTCCGG	2	12	183178	183189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667099
2990	NC_008212	CAGACC	2	12	183204	183215	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	110667099
2991	NC_008212	CA	4	8	183299	183306	50 %	0 %	0 %	50 %	110667099
2992	NC_008212	AGG	2	6	183318	183323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667099
2993	NC_008212	TCA	2	6	183337	183342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667100
2994	NC_008212	CGG	2	6	183366	183371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667100
2995	NC_008212	CGA	2	6	183385	183390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667100
2996	NC_008212	GATAT	2	10	183416	183425	40 %	40 %	20 %	0 %	110667100
2997	NC_008212	GAT	2	6	183469	183474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667100
2998	NC_008212	TGC	2	6	183555	183560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667100
2999	NC_008212	TTC	2	6	183635	183640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667100
3000	NC_008212	ATG	2	6	183668	183673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667100

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