MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 1068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	TGTTC	2	10	941	950	0 %	60 %	20 %	20 %	108562425
2	NC_008086	TAAAA	2	10	3119	3128	80 %	20 %	0 %	0 %	108562428
3	NC_008086	GATTA	2	10	3766	3775	40 %	40 %	20 %	0 %	108562429
4	NC_008086	GAAAC	2	10	6175	6184	60 %	0 %	20 %	20 %	108562433
5	NC_008086	TTTCT	2	10	9696	9705	0 %	80 %	0 %	20 %	108562435
6	NC_008086	AATTT	2	10	10535	10544	40 %	60 %	0 %	0 %	108562435
7	NC_008086	TTGAA	2	10	13208	13217	40 %	40 %	20 %	0 %	108562438
8	NC_008086	TTTTG	2	10	13224	13233	0 %	80 %	20 %	0 %	108562438
9	NC_008086	TGGTG	2	10	14059	14068	0 %	40 %	60 %	0 %	108562439
10	NC_008086	CAAAA	2	10	19915	19924	80 %	0 %	0 %	20 %	108562444
11	NC_008086	CCATG	2	10	24725	24734	20 %	20 %	20 %	40 %	108562448
12	NC_008086	CAAGC	2	10	29385	29394	40 %	0 %	20 %	40 %	108562450
13	NC_008086	TGGGT	2	10	29822	29831	0 %	40 %	60 %	0 %	108562450
14	NC_008086	TTTTA	2	10	30310	30319	20 %	80 %	0 %	0 %	108562451
15	NC_008086	GTGGG	2	10	35202	35211	0 %	20 %	80 %	0 %	108562456
16	NC_008086	TGGGG	2	10	36453	36462	0 %	20 %	80 %	0 %	108562458
17	NC_008086	TTACT	2	10	44380	44389	20 %	60 %	0 %	20 %	108562467
18	NC_008086	TAAAA	2	10	46258	46267	80 %	20 %	0 %	0 %	108562468
19	NC_008086	TCCCA	2	10	47270	47279	20 %	20 %	0 %	60 %	108562469
20	NC_008086	GCTCC	2	10	47591	47600	0 %	20 %	20 %	60 %	108562469
21	NC_008086	TCGCA	2	10	48128	48137	20 %	20 %	20 %	40 %	108562469
22	NC_008086	TAGGG	2	10	48370	48379	20 %	20 %	60 %	0 %	108562469
23	NC_008086	TGCCT	2	10	50385	50394	0 %	40 %	20 %	40 %	108562471
24	NC_008086	TAAAA	2	10	52216	52225	80 %	20 %	0 %	0 %	108562473
25	NC_008086	ATTTC	2	10	52291	52300	20 %	60 %	0 %	20 %	108562473
26	NC_008086	TGAAA	2	10	54139	54148	60 %	20 %	20 %	0 %	108562477
27	NC_008086	TCAAA	2	10	54393	54402	60 %	20 %	0 %	20 %	108562477
28	NC_008086	CAACA	2	10	57801	57810	60 %	0 %	0 %	40 %	108562478
29	NC_008086	TCAAA	2	10	58148	58157	60 %	20 %	0 %	20 %	108562478
30	NC_008086	TATCC	2	10	62322	62331	20 %	40 %	0 %	40 %	108562483
31	NC_008086	TGGAT	2	10	65311	65320	20 %	40 %	40 %	0 %	108562488
32	NC_008086	GAACG	2	10	65972	65981	40 %	0 %	40 %	20 %	108562488
33	NC_008086	GGTGG	2	10	68104	68113	0 %	20 %	80 %	0 %	108562492
34	NC_008086	TCAAT	2	10	71374	71383	40 %	40 %	0 %	20 %	108562495
35	NC_008086	CTTCT	2	10	72220	72229	0 %	60 %	0 %	40 %	108562496
36	NC_008086	TGCCT	2	10	72297	72306	0 %	40 %	20 %	40 %	108562496
37	NC_008086	TCCAA	2	10	72709	72718	40 %	20 %	0 %	40 %	108562497
38	NC_008086	TTTTG	2	10	75991	76000	0 %	80 %	20 %	0 %	108562500
39	NC_008086	ACGCC	2	10	76297	76306	20 %	0 %	20 %	60 %	108562500
40	NC_008086	AAAGC	2	10	77063	77072	60 %	0 %	20 %	20 %	108562501
41	NC_008086	TCTTG	2	10	85473	85482	0 %	60 %	20 %	20 %	108562508
42	NC_008086	TGGCT	2	10	86013	86022	0 %	40 %	40 %	20 %	108562508
43	NC_008086	ATGCC	2	10	86433	86442	20 %	20 %	20 %	40 %	108562509
44	NC_008086	TTGAT	2	10	87470	87479	20 %	60 %	20 %	0 %	108562511
45	NC_008086	GGCGT	2	10	89284	89293	0 %	20 %	60 %	20 %	108562513
46	NC_008086	ATAAA	2	10	92451	92460	80 %	20 %	0 %	0 %	108562514
47	NC_008086	CTTTC	2	10	92878	92887	0 %	60 %	0 %	40 %	108562515
48	NC_008086	TTTGA	2	10	95845	95854	20 %	60 %	20 %	0 %	108562518
49	NC_008086	TCTTT	2	10	96056	96065	0 %	80 %	0 %	20 %	108562518
50	NC_008086	GGCTT	2	10	97177	97186	0 %	40 %	40 %	20 %	108562519
51	NC_008086	GAATT	2	10	103957	103966	40 %	40 %	20 %	0 %	108562525
52	NC_008086	TCGTT	2	10	105756	105765	0 %	60 %	20 %	20 %	108562526
53	NC_008086	TCACT	2	10	108466	108475	20 %	40 %	0 %	40 %	108562529
54	NC_008086	TCTTT	2	10	109056	109065	0 %	80 %	0 %	20 %	108562529
55	NC_008086	AAAGC	2	10	111858	111867	60 %	0 %	20 %	20 %	108562531
56	NC_008086	CAAAT	2	10	114380	114389	60 %	20 %	0 %	20 %	108562534
57	NC_008086	ACCCT	2	10	115809	115818	20 %	20 %	0 %	60 %	108562535
58	NC_008086	ATGCC	2	10	115941	115950	20 %	20 %	20 %	40 %	108562535
59	NC_008086	TGATT	2	10	117936	117945	20 %	60 %	20 %	0 %	108562537
60	NC_008086	CTAAA	2	10	118406	118415	60 %	20 %	0 %	20 %	108562539
61	NC_008086	AAGCC	2	10	124339	124348	40 %	0 %	20 %	40 %	108562542
62	NC_008086	TTCTG	2	10	127327	127336	0 %	60 %	20 %	20 %	108562544
63	NC_008086	CGCTG	2	10	128799	128808	0 %	20 %	40 %	40 %	108562545
64	NC_008086	TTTGA	2	10	128946	128955	20 %	60 %	20 %	0 %	108562545
65	NC_008086	CGCTC	2	10	129189	129198	0 %	20 %	20 %	60 %	108562545
66	NC_008086	GACTT	2	10	129480	129489	20 %	40 %	20 %	20 %	108562545
67	NC_008086	ATCTC	2	10	130231	130240	20 %	40 %	0 %	40 %	108562545
68	NC_008086	CGCTT	2	10	130389	130398	0 %	40 %	20 %	40 %	108562545
69	NC_008086	TTTGT	2	10	130744	130753	0 %	80 %	20 %	0 %	108562546
70	NC_008086	TGCGT	2	10	132793	132802	0 %	40 %	40 %	20 %	108562548
71	NC_008086	GAAAA	2	10	132954	132963	80 %	0 %	20 %	0 %	108562548
72	NC_008086	GAAAA	2	10	133272	133281	80 %	0 %	20 %	0 %	108562548
73	NC_008086	ATTTT	2	10	136230	136239	20 %	80 %	0 %	0 %	108562554
74	NC_008086	ATGTT	2	10	136312	136321	20 %	60 %	20 %	0 %	108562554
75	NC_008086	AAAAG	2	10	136724	136733	80 %	0 %	20 %	0 %	108562554
76	NC_008086	AAATC	2	10	138711	138720	60 %	20 %	0 %	20 %	108562555
77	NC_008086	AAAAT	2	10	140183	140192	80 %	20 %	0 %	0 %	108562556
78	NC_008086	TTTTC	2	10	142749	142758	0 %	80 %	0 %	20 %	108562559
79	NC_008086	TTCTT	2	10	144705	144714	0 %	80 %	0 %	20 %	108562561
80	NC_008086	TCTTT	2	10	145200	145209	0 %	80 %	0 %	20 %	108562562
81	NC_008086	TTTTG	2	10	146362	146371	0 %	80 %	20 %	0 %	108562563
82	NC_008086	GCGAT	2	10	147155	147164	20 %	20 %	40 %	20 %	108562563
83	NC_008086	GCTTG	2	10	147411	147420	0 %	40 %	40 %	20 %	108562563
84	NC_008086	TTTTG	2	10	148064	148073	0 %	80 %	20 %	0 %	108562564
85	NC_008086	GATTG	2	10	153035	153044	20 %	40 %	40 %	0 %	108562567
86	NC_008086	TACTT	2	10	153192	153201	20 %	60 %	0 %	20 %	108562567
87	NC_008086	ACGCC	2	10	153426	153435	20 %	0 %	20 %	60 %	108562567
88	NC_008086	GCGTT	2	10	155680	155689	0 %	40 %	40 %	20 %	108562572
89	NC_008086	ATTTG	2	10	156656	156665	20 %	60 %	20 %	0 %	108562573
90	NC_008086	GTTTT	2	10	158387	158396	0 %	80 %	20 %	0 %	108562575
91	NC_008086	AGATT	2	10	161178	161187	40 %	40 %	20 %	0 %	108562578
92	NC_008086	AAGCC	2	10	162516	162525	40 %	0 %	20 %	40 %	108562581
93	NC_008086	ATTTT	2	10	164568	164577	20 %	80 %	0 %	0 %	108562583
94	NC_008086	GGGTG	2	10	164924	164933	0 %	20 %	80 %	0 %	108562583
95	NC_008086	ATTCA	2	10	166083	166092	40 %	40 %	0 %	20 %	108562584
96	NC_008086	ATCTT	2	10	169486	169495	20 %	60 %	0 %	20 %	108562587
97	NC_008086	TGGGG	2	10	178087	178096	0 %	20 %	80 %	0 %	108562597
98	NC_008086	ATTTG	2	10	178864	178873	20 %	60 %	20 %	0 %	108562597
99	NC_008086	GGTGA	2	10	179489	179498	20 %	20 %	60 %	0 %	108562598
100	NC_008086	AAATG	2	10	180828	180837	60 %	20 %	20 %	0 %	108562600
101	NC_008086	TGTAA	2	10	181618	181627	40 %	40 %	20 %	0 %	108562601
102	NC_008086	ATAAA	2	10	183114	183123	80 %	20 %	0 %	0 %	108562602
103	NC_008086	AAAAG	2	10	184258	184267	80 %	0 %	20 %	0 %	108562603
104	NC_008086	ACCCC	2	10	184323	184332	20 %	0 %	0 %	80 %	108562603
105	NC_008086	TGAAT	2	10	184639	184648	40 %	40 %	20 %	0 %	108562604
106	NC_008086	ATTCA	2	10	190285	190294	40 %	40 %	0 %	20 %	108562609
107	NC_008086	TATTG	2	10	195566	195575	20 %	60 %	20 %	0 %	108562613
108	NC_008086	TCATT	2	10	195897	195906	20 %	60 %	0 %	20 %	108562613
109	NC_008086	CTATT	2	10	196782	196791	20 %	60 %	0 %	20 %	108562615
110	NC_008086	TTTTC	2	10	197842	197851	0 %	80 %	0 %	20 %	108562616
111	NC_008086	TATTT	2	10	201593	201602	20 %	80 %	0 %	0 %	108562621
112	NC_008086	TTTCA	2	10	202250	202259	20 %	60 %	0 %	20 %	108562622
113	NC_008086	CTTTT	2	10	203190	203199	0 %	80 %	0 %	20 %	108562623
114	NC_008086	TGAAT	2	10	205416	205425	40 %	40 %	20 %	0 %	108562625
115	NC_008086	AATTT	2	10	206816	206825	40 %	60 %	0 %	0 %	108562626
116	NC_008086	TAAAA	2	10	207118	207127	80 %	20 %	0 %	0 %	108562626
117	NC_008086	AAATT	2	10	208304	208313	60 %	40 %	0 %	0 %	108562630
118	NC_008086	ATTTA	2	10	209101	209110	40 %	60 %	0 %	0 %	108562631
119	NC_008086	AAACA	2	10	209123	209132	80 %	0 %	0 %	20 %	108562631
120	NC_008086	TGGGG	2	10	211872	211881	0 %	20 %	80 %	0 %	108562635
121	NC_008086	GATCA	2	10	213778	213787	40 %	20 %	20 %	20 %	108562636
122	NC_008086	ATTCT	2	10	214305	214314	20 %	60 %	0 %	20 %	108562636
123	NC_008086	CTAAG	2	10	217787	217796	40 %	20 %	20 %	20 %	108562639
124	NC_008086	TCGGC	2	10	218236	218245	0 %	20 %	40 %	40 %	108562639
125	NC_008086	TAAAA	2	10	219614	219623	80 %	20 %	0 %	0 %	108562640
126	NC_008086	TTAGA	2	10	220593	220602	40 %	40 %	20 %	0 %	108562640
127	NC_008086	CCACC	2	10	221139	221148	20 %	0 %	0 %	80 %	108562640
128	NC_008086	TTACA	2	10	221326	221335	40 %	40 %	0 %	20 %	108562641
129	NC_008086	GTGGG	2	10	226397	226406	0 %	20 %	80 %	0 %	108562647
130	NC_008086	TGATG	2	10	226587	226596	20 %	40 %	40 %	0 %	108562647
131	NC_008086	GGTTC	2	10	226945	226954	0 %	40 %	40 %	20 %	108562648
132	NC_008086	GATTT	2	10	227898	227907	20 %	60 %	20 %	0 %	108562648
133	NC_008086	TGGGG	2	10	228709	228718	0 %	20 %	80 %	0 %	108562650
134	NC_008086	ATTTT	2	10	231168	231177	20 %	80 %	0 %	0 %	108562652
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262	NC_008086	TTTTC	2	10	399118	399127	0 %	80 %	0 %	20 %	108562814
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