MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 4085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	ATGC	2	8	589	596	25 %	25 %	25 %	25 %	108562425
2	NC_008086	TTTC	2	8	881	888	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
3	NC_008086	TTCT	2	8	1094	1101	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
4	NC_008086	CAAA	2	8	1202	1209	75 %	0 %	0 %	25 %	108562425
5	NC_008086	GAGC	2	8	1546	1553	25 %	0 %	50 %	25 %	108562426
6	NC_008086	CATT	2	8	1632	1639	25 %	50 %	0 %	25 %	108562426
7	NC_008086	TTCT	2	8	1777	1784	0 %	75 %	0 %	25 %	108562426
8	NC_008086	TCTG	2	8	2328	2335	0 %	50 %	25 %	25 %	108562427
9	NC_008086	AAAT	2	8	2430	2437	75 %	25 %	0 %	0 %	108562428
10	NC_008086	GCTT	2	8	2973	2980	0 %	50 %	25 %	25 %	108562428
11	NC_008086	CCTG	2	8	3328	3335	0 %	25 %	25 %	50 %	108562429
12	NC_008086	CCAA	2	8	3352	3359	50 %	0 %	0 %	50 %	108562429
13	NC_008086	TGAA	2	8	3392	3399	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
14	NC_008086	TGAA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
15	NC_008086	TTTG	2	8	3822	3829	0 %	75 %	25 %	0 %	108562429
16	NC_008086	ATTC	2	8	3867	3874	25 %	50 %	0 %	25 %	108562429
17	NC_008086	TCTT	2	8	4076	4083	0 %	75 %	0 %	25 %	108562430
18	NC_008086	GAAA	2	8	4841	4848	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
19	NC_008086	AGAA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
20	NC_008086	CAAG	2	8	5342	5349	50 %	0 %	25 %	25 %	108562431
21	NC_008086	TAAA	2	8	6214	6221	75 %	25 %	0 %	0 %	108562433
22	NC_008086	TCGC	2	8	6734	6741	0 %	25 %	25 %	50 %	108562434
23	NC_008086	CATT	2	8	6807	6814	25 %	50 %	0 %	25 %	108562434
24	NC_008086	CTGG	2	8	8181	8188	0 %	25 %	50 %	25 %	108562434
25	NC_008086	ATCG	2	8	8356	8363	25 %	25 %	25 %	25 %	108562434
26	NC_008086	CGTT	2	8	8391	8398	0 %	50 %	25 %	25 %	108562434
27	NC_008086	TTCA	2	8	9160	9167	25 %	50 %	0 %	25 %	108562435
28	NC_008086	TCTT	2	8	9454	9461	0 %	75 %	0 %	25 %	108562435
29	NC_008086	TCAA	2	8	11367	11374	50 %	25 %	0 %	25 %	108562437
30	NC_008086	TTTG	2	8	12187	12194	0 %	75 %	25 %	0 %	108562437
31	NC_008086	GTTT	2	8	12283	12290	0 %	75 %	25 %	0 %	108562437
32	NC_008086	CTTT	2	8	12815	12822	0 %	75 %	0 %	25 %	108562437
33	NC_008086	ATTG	2	8	13162	13169	25 %	50 %	25 %	0 %	108562438
34	NC_008086	GCAA	2	8	13353	13360	50 %	0 %	25 %	25 %	108562438
35	NC_008086	TGCT	2	8	13558	13565	0 %	50 %	25 %	25 %	108562438
36	NC_008086	GGCC	2	8	13821	13828	0 %	0 %	50 %	50 %	108562438
37	NC_008086	TGCA	2	8	14036	14043	25 %	25 %	25 %	25 %	108562439
38	NC_008086	AGCA	2	8	14091	14098	50 %	0 %	25 %	25 %	108562439
39	NC_008086	GTTT	2	8	14448	14455	0 %	75 %	25 %	0 %	108562439
40	NC_008086	TCTT	2	8	14835	14842	0 %	75 %	0 %	25 %	108562439
41	NC_008086	AGCG	2	8	15305	15312	25 %	0 %	50 %	25 %	108562441
42	NC_008086	GATT	2	8	15413	15420	25 %	50 %	25 %	0 %	108562441
43	NC_008086	CAAA	2	8	15582	15589	75 %	0 %	0 %	25 %	108562442
44	NC_008086	GTTA	2	8	15727	15734	25 %	50 %	25 %	0 %	108562442
45	NC_008086	ATGC	2	8	15997	16004	25 %	25 %	25 %	25 %	108562442
46	NC_008086	TTTA	2	8	16584	16591	25 %	75 %	0 %	0 %	108562442
47	NC_008086	TTTA	2	8	17060	17067	25 %	75 %	0 %	0 %	108562442
48	NC_008086	CAGG	2	8	17742	17749	25 %	0 %	50 %	25 %	108562442
49	NC_008086	TGAT	2	8	17786	17793	25 %	50 %	25 %	0 %	108562442
50	NC_008086	AACG	2	8	18590	18597	50 %	0 %	25 %	25 %	108562443
51	NC_008086	GAGC	2	8	18706	18713	25 %	0 %	50 %	25 %	108562443
52	NC_008086	GCTT	2	8	18762	18769	0 %	50 %	25 %	25 %	108562443
53	NC_008086	ATCT	2	8	19319	19326	25 %	50 %	0 %	25 %	108562443
54	NC_008086	GTTT	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	108562443
55	NC_008086	AGCA	2	8	19671	19678	50 %	0 %	25 %	25 %	108562444
56	NC_008086	TTGA	2	8	19879	19886	25 %	50 %	25 %	0 %	108562444
57	NC_008086	AGCG	2	8	20427	20434	25 %	0 %	50 %	25 %	108562444
58	NC_008086	TAAA	2	8	21933	21940	75 %	25 %	0 %	0 %	108562446
59	NC_008086	GCGA	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	108562446
60	NC_008086	TAAA	2	8	22686	22693	75 %	25 %	0 %	0 %	108562447
61	NC_008086	CTTT	2	8	22792	22799	0 %	75 %	0 %	25 %	108562447
62	NC_008086	AAGT	2	8	23104	23111	50 %	25 %	25 %	0 %	108562447
63	NC_008086	TTTA	2	8	23691	23698	25 %	75 %	0 %	0 %	108562447
64	NC_008086	CTTT	2	8	23869	23876	0 %	75 %	0 %	25 %	108562447
65	NC_008086	GTTT	2	8	25082	25089	0 %	75 %	25 %	0 %	108562448
66	NC_008086	TTCC	2	8	25880	25887	0 %	50 %	0 %	50 %	108562448
67	NC_008086	TCCC	2	8	26222	26229	0 %	25 %	0 %	75 %	108562448
68	NC_008086	ATAA	2	8	27927	27934	75 %	25 %	0 %	0 %	108562449
69	NC_008086	AAGG	2	8	29329	29336	50 %	0 %	50 %	0 %	108562450
70	NC_008086	GCTC	2	8	29463	29470	0 %	25 %	25 %	50 %	108562450
71	NC_008086	ATGG	2	8	29911	29918	25 %	25 %	50 %	0 %	108562450
72	NC_008086	GAAT	2	8	30167	30174	50 %	25 %	25 %	0 %	108562451
73	NC_008086	GCGT	2	8	30524	30531	0 %	25 %	50 %	25 %	108562451
74	NC_008086	TTTA	2	8	30543	30550	25 %	75 %	0 %	0 %	108562451
75	NC_008086	TGGT	2	8	31061	31068	0 %	50 %	50 %	0 %	108562452
76	NC_008086	GAGT	2	8	31375	31382	25 %	25 %	50 %	0 %	108562453
77	NC_008086	TCAA	2	8	31397	31404	50 %	25 %	0 %	25 %	108562453
78	NC_008086	TGCT	2	8	31429	31436	0 %	50 %	25 %	25 %	108562453
79	NC_008086	AGCA	2	8	31546	31553	50 %	0 %	25 %	25 %	108562453
80	NC_008086	CAAT	2	8	31560	31567	50 %	25 %	0 %	25 %	108562453
81	NC_008086	TTGA	2	8	32095	32102	25 %	50 %	25 %	0 %	108562453
82	NC_008086	TAAA	2	8	32134	32141	75 %	25 %	0 %	0 %	108562453
83	NC_008086	TTTA	2	8	33169	33176	25 %	75 %	0 %	0 %	108562454
84	NC_008086	CAGA	2	8	33205	33212	50 %	0 %	25 %	25 %	108562454
85	NC_008086	TGAT	2	8	33314	33321	25 %	50 %	25 %	0 %	108562454
86	NC_008086	ATTG	2	8	33357	33364	25 %	50 %	25 %	0 %	108562454
87	NC_008086	GCGA	2	8	33367	33374	25 %	0 %	50 %	25 %	108562454
88	NC_008086	ACCC	2	8	33491	33498	25 %	0 %	0 %	75 %	108562455
89	NC_008086	CATC	2	8	33617	33624	25 %	25 %	0 %	50 %	108562455
90	NC_008086	TCAA	2	8	33759	33766	50 %	25 %	0 %	25 %	108562456
91	NC_008086	CATG	2	8	34882	34889	25 %	25 %	25 %	25 %	108562456
92	NC_008086	GAAA	2	8	34990	34997	75 %	0 %	25 %	0 %	108562456
93	NC_008086	CGCT	2	8	34998	35005	0 %	25 %	25 %	50 %	108562456
94	NC_008086	TCAT	2	8	35823	35830	25 %	50 %	0 %	25 %	108562456
95	NC_008086	GCTT	2	8	35897	35904	0 %	50 %	25 %	25 %	108562456
96	NC_008086	GAAA	2	8	35956	35963	75 %	0 %	25 %	0 %	108562456
97	NC_008086	ATGA	2	8	36237	36244	50 %	25 %	25 %	0 %	108562457
98	NC_008086	CGAG	2	8	36847	36854	25 %	0 %	50 %	25 %	108562459
99	NC_008086	TGCA	2	8	37715	37722	25 %	25 %	25 %	25 %	108562460
100	NC_008086	CTTT	2	8	37975	37982	0 %	75 %	0 %	25 %	108562460
101	NC_008086	ATGA	2	8	38536	38543	50 %	25 %	25 %	0 %	108562460
102	NC_008086	AATA	2	8	38652	38659	75 %	25 %	0 %	0 %	108562460
103	NC_008086	TAAA	2	8	38674	38681	75 %	25 %	0 %	0 %	108562460
104	NC_008086	GAAA	2	8	38804	38811	75 %	0 %	25 %	0 %	108562461
105	NC_008086	TTTG	2	8	39434	39441	0 %	75 %	25 %	0 %	108562462
106	NC_008086	CGAA	2	8	39624	39631	50 %	0 %	25 %	25 %	108562463
107	NC_008086	TGAT	2	8	39924	39931	25 %	50 %	25 %	0 %	108562463
108	NC_008086	AACC	2	8	40617	40624	50 %	0 %	0 %	50 %	108562464
109	NC_008086	CAAA	2	8	40901	40908	75 %	0 %	0 %	25 %	108562464
110	NC_008086	ATTG	2	8	41315	41322	25 %	50 %	25 %	0 %	108562464
111	NC_008086	ATCA	2	8	41490	41497	50 %	25 %	0 %	25 %	108562464
112	NC_008086	TCAA	2	8	41503	41510	50 %	25 %	0 %	25 %	108562464
113	NC_008086	TATT	2	8	41569	41576	25 %	75 %	0 %	0 %	108562464
114	NC_008086	TGAG	2	8	42007	42014	25 %	25 %	50 %	0 %	108562465
115	NC_008086	GATT	2	8	42095	42102	25 %	50 %	25 %	0 %	108562465
116	NC_008086	TGTT	2	8	42277	42284	0 %	75 %	25 %	0 %	108562465
117	NC_008086	GGCG	2	8	42290	42297	0 %	0 %	75 %	25 %	108562465
118	NC_008086	AAAT	2	8	42745	42752	75 %	25 %	0 %	0 %	108562465
119	NC_008086	CTTT	2	8	42870	42877	0 %	75 %	0 %	25 %	108562465
120	NC_008086	GAGC	2	8	42896	42903	25 %	0 %	50 %	25 %	108562465
121	NC_008086	GAAA	2	8	43159	43166	75 %	0 %	25 %	0 %	108562466
122	NC_008086	GATC	2	8	43288	43295	25 %	25 %	25 %	25 %	108562466
123	NC_008086	ATGA	2	8	44295	44302	50 %	25 %	25 %	0 %	108562466
124	NC_008086	AACG	2	8	44687	44694	50 %	0 %	25 %	25 %	108562467
125	NC_008086	CAAA	2	8	45134	45141	75 %	0 %	0 %	25 %	108562467
126	NC_008086	TTGA	2	8	45715	45722	25 %	50 %	25 %	0 %	108562468
127	NC_008086	AAAC	2	8	45729	45736	75 %	0 %	0 %	25 %	108562468
128	NC_008086	CATT	2	8	45857	45864	25 %	50 %	0 %	25 %	108562468
129	NC_008086	CGCT	2	8	45870	45877	0 %	25 %	25 %	50 %	108562468
130	NC_008086	GTTT	2	8	46492	46499	0 %	75 %	25 %	0 %	108562468
131	NC_008086	CAAA	2	8	46988	46995	75 %	0 %	0 %	25 %	108562469
132	NC_008086	AGGG	2	8	47814	47821	25 %	0 %	75 %	0 %	108562469
133	NC_008086	GCAA	2	8	48467	48474	50 %	0 %	25 %	25 %	108562469
134	NC_008086	CAAC	2	8	48599	48606	50 %	0 %	0 %	50 %	108562469
135	NC_008086	TAAA	2	8	48736	48743	75 %	25 %	0 %	0 %	108562469
136	NC_008086	AGCG	3	12	49159	49170	25 %	0 %	50 %	25 %	108562470
137	NC_008086	GTTA	2	8	49319	49326	25 %	50 %	25 %	0 %	108562470
138	NC_008086	TTCA	2	8	49779	49786	25 %	50 %	0 %	25 %	108562470
139	NC_008086	AGCT	2	8	49841	49848	25 %	25 %	25 %	25 %	108562471
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