MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248552
2	NC_007146	CAACCG	2	12	2344	2355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248553
3	NC_007146	TTTCCT	2	12	4615	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248556
4	NC_007146	GTTCTG	2	12	6511	6522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	68248557
5	NC_007146	AAATAA	2	12	7376	7387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248557
6	NC_007146	AACTGG	2	12	8094	8105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248557
7	NC_007146	CACAAC	2	12	8425	8436	50 %	0 %	0 %	50 %	68248557
8	NC_007146	TCTAGC	2	12	9570	9581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248558
9	NC_007146	TGGCAA	2	12	14513	14524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248565
10	NC_007146	AAACCA	2	12	16866	16877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248567
11	NC_007146	CACGCT	2	12	17728	17739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	68248567
12	NC_007146	AAGATG	2	12	25478	25489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248573
13	NC_007146	AAGCGA	2	12	26206	26217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248574
14	NC_007146	ACCAAA	2	12	34113	34124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248583
15	NC_007146	TTTACT	2	12	41527	41538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248589
16	NC_007146	TACTTT	2	12	42054	42065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248589
17	NC_007146	CTTGTA	2	12	42427	42438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248590
18	NC_007146	AAAGCA	2	12	45950	45961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248594
19	NC_007146	TGCATT	2	12	49470	49481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248599
20	NC_007146	GCTTTT	2	12	51027	51038	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248600
21	NC_007146	ACAATT	2	12	52214	52225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248601
22	NC_007146	CAATAT	2	12	52407	52418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248601
23	NC_007146	TTTAAA	2	12	56561	56572	50 %	50 %	0 %	0 %	68248605
24	NC_007146	GTAAAA	2	12	56868	56879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68248605
25	NC_007146	TGGAAT	2	12	62676	62687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248610
26	NC_007146	TCTAAA	2	12	63548	63559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248611
27	NC_007146	TGCCAA	2	12	65028	65039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248612
28	NC_007146	TTAGAT	2	12	69533	69544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248615
29	NC_007146	CGATTG	2	12	70366	70377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248617
30	NC_007146	ATCAAG	2	12	75232	75243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248620
31	NC_007146	TGCGCC	2	12	76798	76809	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	68248620
32	NC_007146	AGAACA	2	12	80246	80257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248623
33	NC_007146	CAAATT	2	12	81471	81482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248625
34	NC_007146	TTTGGT	2	12	82793	82804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248626
35	NC_007146	ATTAAA	2	12	86683	86694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248629
36	NC_007146	TGGGCT	2	12	87924	87935	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	68248631
37	NC_007146	TGATAC	2	12	92468	92479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248637
38	NC_007146	TAAAAA	2	12	94540	94551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248639
39	NC_007146	GCCACA	2	12	95536	95547	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248639
40	NC_007146	TTAATT	2	12	96694	96705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248640
41	NC_007146	CTCTAT	2	12	98598	98609	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248642
42	NC_007146	GTTCTC	2	12	100542	100553	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	68248645
43	NC_007146	TAATTA	2	12	110938	110949	50 %	50 %	0 %	0 %	68248658
44	NC_007146	GAAGAT	2	12	113311	113322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248659
45	NC_007146	AGAGCA	2	12	114613	114624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248661
46	NC_007146	GGGATT	2	12	116501	116512	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	68248664
47	NC_007146	ATTGAT	2	12	118785	118796	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248666
48	NC_007146	AATCCA	2	12	120096	120107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248668
49	NC_007146	ATGAAG	2	12	121168	121179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248668
50	NC_007146	TGGTTA	2	12	121746	121757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248668
51	NC_007146	CCTAAT	2	12	122158	122169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248668
52	NC_007146	TTTTAT	2	12	122654	122665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	68248670
53	NC_007146	GCAAAA	2	12	122839	122850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248670
54	NC_007146	CCAGCG	2	12	127081	127092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	68248673
55	NC_007146	ATATTG	2	12	131043	131054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248678
56	NC_007146	CATTAT	2	12	135063	135074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68248683
57	NC_007146	TGAACC	2	12	137201	137212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248686
58	NC_007146	ATAAAG	2	12	146247	146258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68248696
59	NC_007146	CTTCAA	2	12	151634	151645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248700
60	NC_007146	AGTTCA	2	12	151654	151665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248700
61	NC_007146	TTCGCC	2	12	168100	168111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	68248714
62	NC_007146	ACACGC	2	12	168383	168394	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248714
63	NC_007146	GCAAAG	2	12	171158	171169	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248716
64	NC_007146	CCCAAT	2	12	176040	176051	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	68248719
65	NC_007146	ATTGCG	2	12	177183	177194	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248719
66	NC_007146	TACTTC	2	12	177515	177526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248719
67	NC_007146	ATTGGA	2	12	177701	177712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248719
68	NC_007146	CACCCA	2	12	179113	179124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248720
69	NC_007146	GTAATC	2	12	198640	198651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248730
70	NC_007146	CAAATT	2	12	199478	199489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248731
71	NC_007146	CACAAA	2	12	200330	200341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248732
72	NC_007146	ACGACC	2	12	200355	200366	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248732
73	NC_007146	CTAAAA	2	12	201062	201073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	68248733
74	NC_007146	ATATCA	2	12	203939	203950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248735
75	NC_007146	TGCATC	2	12	208848	208859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248740
76	NC_007146	AAAAAC	2	12	210467	210478	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68248742
77	NC_007146	CTTATA	2	12	211908	211919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68248743
78	NC_007146	GGCGCA	2	12	212264	212275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	68248743
79	NC_007146	ACGTTT	2	12	212528	212539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248744
80	NC_007146	CAATAA	2	12	213841	213852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	68248744
81	NC_007146	CTAGAA	2	12	217261	217272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248747
82	NC_007146	GAAAAA	2	12	217302	217313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	68248747
83	NC_007146	CTTTTG	2	12	219999	220010	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248750
84	NC_007146	GTGCTG	2	12	227424	227435	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	68248756
85	NC_007146	GGCTGA	2	12	229479	229490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	68248759
86	NC_007146	TTCGTT	2	12	232014	232025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248761
87	NC_007146	TAAAAA	2	12	232853	232864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248761
88	NC_007146	AATATC	2	12	234062	234073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248763
89	NC_007146	ACCTTT	2	12	234143	234154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248763
90	NC_007146	CAACTG	2	12	239154	239165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248769
91	NC_007146	CAACCT	2	12	243884	243895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	68248772
92	NC_007146	TTGGCA	2	12	243942	243953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248772
93	NC_007146	TTAGTG	2	12	246229	246240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248776
94	NC_007146	GCGGTG	2	12	246392	246403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	68248776
95	NC_007146	TTGTGA	2	12	248728	248739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248778
96	NC_007146	TAAACG	3	18	251199	251216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248781
97	NC_007146	ATCTTT	2	12	254878	254889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248785
98	NC_007146	TTCAGT	2	12	255643	255654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248785
99	NC_007146	ACGACC	2	12	256015	256026	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248785
100	NC_007146	AAATCT	2	12	256689	256700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248786
101	NC_007146	CATAAT	2	12	256838	256849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248786
102	NC_007146	TAAAGT	2	12	257138	257149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	68248786
103	NC_007146	TGTACT	2	12	259998	260009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248788
104	NC_007146	AAAGAG	2	12	263592	263603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248791
105	NC_007146	TTGCTT	2	12	264553	264564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248793
106	NC_007146	GCAAGT	2	12	265532	265543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248794
107	NC_007146	TCTGGT	2	12	266028	266039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	68248794
108	NC_007146	CAAAAC	2	12	269171	269182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248798
109	NC_007146	TTTAAA	2	12	272235	272246	50 %	50 %	0 %	0 %	68248800
110	NC_007146	ATTCGT	2	12	273603	273614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248800
111	NC_007146	GTGTTG	2	12	273730	273741	0 %	50 %	50 %	0 %	68248800
112	NC_007146	TTGGTA	2	12	278546	278557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248805
113	NC_007146	TTGTTC	2	12	279475	279486	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248806
114	NC_007146	ATCTGC	2	12	290476	290487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248818
115	NC_007146	TATGTC	2	12	291710	291721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248820
116	NC_007146	AAAAAC	2	12	292729	292740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68248820
117	NC_007146	ATCCCC	2	12	296037	296048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	68248822
118	NC_007146	AGTTCC	2	12	296621	296632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248822
119	NC_007146	AAAAGC	2	12	298930	298941	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248824
120	NC_007146	ATTTAA	2	12	302035	302046	50 %	50 %	0 %	0 %	68248825
121	NC_007146	CAACAT	2	12	303671	303682	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248827
122	NC_007146	AATCCT	2	12	314270	314281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248831
123	NC_007146	CCCTGG	2	12	315449	315460	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	68248831
124	NC_007146	AACAAA	2	12	321913	321924	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68248838
125	NC_007146	TGAAGA	2	12	322256	322267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248838
126	NC_007146	ATTGAT	2	12	323166	323177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248838
127	NC_007146	TATTGA	2	12	325606	325617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248840
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130	NC_007146	GTTGCC	2	12	332609	332620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248848
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149	NC_007146	TGAAAA	2	12	366597	366608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68248876
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151	NC_007146	TTAGCT	2	12	372511	372522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248881
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230	NC_007146	CAAAAG	2	12	618934	618945	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68249125
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233	NC_007146	TTGAGG	2	12	620170	620181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	68249127
234	NC_007146	CGATGA	2	12	625070	625081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249130
235	NC_007146	TAATTG	2	12	626025	626036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68249131
236	NC_007146	TTTGAT	2	12	638465	638476	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	68249146
237	NC_007146	ATCAAC	2	12	639338	639349	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68249147
238	NC_007146	GATTTG	2	12	641962	641973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68249150
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240	NC_007146	TCAATA	2	12	648882	648893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249157
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242	NC_007146	ATTGTA	2	12	654874	654885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68249165
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247	NC_007146	CAGAAA	2	12	662192	662203	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68249170
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351	NC_007146	TACACG	2	12	908962	908973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68249382
352	NC_007146	TGGGTG	2	12	911206	911217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	68249386
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455	NC_007146	AAGATA	2	12	1153173	1153184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68249610
456	NC_007146	GGCAAT	2	12	1154301	1154312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249613
457	NC_007146	CCACTT	2	12	1154357	1154368	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	68249613
458	NC_007146	GCCGTT	2	12	1155058	1155069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68249613
459	NC_007146	AAACTT	2	12	1155580	1155591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249613
460	NC_007146	GGTTTT	2	12	1159015	1159026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68249617
461	NC_007146	TATCGC	2	12	1159170	1159181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68249617
462	NC_007146	CGGGAA	2	12	1167842	1167853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	68249623
463	NC_007146	ATTGAA	2	12	1167895	1167906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	68249623
464	NC_007146	TAACGC	2	12	1170636	1170647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68249626
465	NC_007146	TCAATA	2	12	1170866	1170877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249627
466	NC_007146	GCAATG	2	12	1173788	1173799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161761270
467	NC_007146	TTTTGT	2	12	1175500	1175511	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	161761270
468	NC_007146	TTAATG	2	12	1177658	1177669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68249631
469	NC_007146	ACTAAT	2	12	1178395	1178406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249631
470	NC_007146	AGATTT	2	12	1181111	1181122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68249633
471	NC_007146	CGTCAT	2	12	1182300	1182311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68249633
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489	NC_007146	TTTTAA	2	12	1221168	1221179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68249671
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492	NC_007146	GTTTTA	2	12	1230742	1230753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	68249679
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