MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	GA	3	6	6430	6435	50 %	0 %	50 %	0 %	55380075
2	NC_006397	GA	3	6	7025	7030	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
3	NC_006397	GC	3	6	7045	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	55380076
4	NC_006397	CA	3	6	7353	7358	50 %	0 %	0 %	50 %	55380076
5	NC_006397	AG	3	6	7473	7478	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
6	NC_006397	TC	3	6	10644	10649	0 %	50 %	0 %	50 %	55380078
7	NC_006397	GA	3	6	11175	11180	50 %	0 %	50 %	0 %	55380078
8	NC_006397	AT	3	6	11445	11450	50 %	50 %	0 %	0 %	55380079
9	NC_006397	TC	3	6	12403	12408	0 %	50 %	0 %	50 %	55380080
10	NC_006397	AG	4	8	13639	13646	50 %	0 %	50 %	0 %	55380081
11	NC_006397	TC	3	6	14079	14084	0 %	50 %	0 %	50 %	55380081
12	NC_006397	AC	3	6	16190	16195	50 %	0 %	0 %	50 %	55380084
13	NC_006397	CG	3	6	16281	16286	0 %	0 %	50 %	50 %	55380084
14	NC_006397	AG	3	6	16372	16377	50 %	0 %	50 %	0 %	55380084
15	NC_006397	AG	3	6	19587	19592	50 %	0 %	50 %	0 %	55380090
16	NC_006397	CG	3	6	21069	21074	0 %	0 %	50 %	50 %	55380092
17	NC_006397	AG	3	6	22030	22035	50 %	0 %	50 %	0 %	55380093
18	NC_006397	GA	3	6	22663	22668	50 %	0 %	50 %	0 %	55380094
19	NC_006397	CT	3	6	25921	25926	0 %	50 %	0 %	50 %	55380098
20	NC_006397	GA	3	6	27228	27233	50 %	0 %	50 %	0 %	55380099
21	NC_006397	TA	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	55380101
22	NC_006397	CG	3	6	30438	30443	0 %	0 %	50 %	50 %	55380102
23	NC_006397	CG	3	6	30808	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	55380103
24	NC_006397	TG	3	6	31672	31677	0 %	50 %	50 %	0 %	55380105
25	NC_006397	CT	3	6	32099	32104	0 %	50 %	0 %	50 %	55380105
26	NC_006397	GC	3	6	33520	33525	0 %	0 %	50 %	50 %	55380106
27	NC_006397	GT	3	6	34787	34792	0 %	50 %	50 %	0 %	55380108
28	NC_006397	CT	3	6	38965	38970	0 %	50 %	0 %	50 %	55380112
29	NC_006397	GT	3	6	40860	40865	0 %	50 %	50 %	0 %	55380114
30	NC_006397	CG	3	6	42641	42646	0 %	0 %	50 %	50 %	55380116
31	NC_006397	CG	3	6	42820	42825	0 %	0 %	50 %	50 %	55380116
32	NC_006397	AC	3	6	46839	46844	50 %	0 %	0 %	50 %	55380123
33	NC_006397	TG	3	6	48048	48053	0 %	50 %	50 %	0 %	55380125
34	NC_006397	CG	3	6	48885	48890	0 %	0 %	50 %	50 %	55380127
35	NC_006397	CG	3	6	50295	50300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380128
36	NC_006397	AG	3	6	50522	50527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
37	NC_006397	CA	3	6	50717	50722	50 %	0 %	0 %	50 %	55380128
38	NC_006397	GA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
39	NC_006397	CA	3	6	52466	52471	50 %	0 %	0 %	50 %	55380129
40	NC_006397	GC	3	6	52611	52616	0 %	0 %	50 %	50 %	55380129
41	NC_006397	CT	3	6	54923	54928	0 %	50 %	0 %	50 %	55380131
42	NC_006397	CT	3	6	56080	56085	0 %	50 %	0 %	50 %	55380131
43	NC_006397	CG	3	6	56491	56496	0 %	0 %	50 %	50 %	55380132
44	NC_006397	GA	3	6	56768	56773	50 %	0 %	50 %	0 %	55380132
45	NC_006397	AC	3	6	57430	57435	50 %	0 %	0 %	50 %	55380133
46	NC_006397	GT	3	6	57689	57694	0 %	50 %	50 %	0 %	55380133
47	NC_006397	CG	3	6	57852	57857	0 %	0 %	50 %	50 %	55380134
48	NC_006397	CG	3	6	58182	58187	0 %	0 %	50 %	50 %	55380134
49	NC_006397	TG	4	8	58761	58768	0 %	50 %	50 %	0 %	55380134
50	NC_006397	CT	3	6	61419	61424	0 %	50 %	0 %	50 %	55380135
51	NC_006397	CA	3	6	62143	62148	50 %	0 %	0 %	50 %	55380135
52	NC_006397	TA	3	6	62538	62543	50 %	50 %	0 %	0 %	55380137
53	NC_006397	TG	3	6	62705	62710	0 %	50 %	50 %	0 %	55380136
54	NC_006397	GC	3	6	62968	62973	0 %	0 %	50 %	50 %	55380136
55	NC_006397	GT	3	6	63830	63835	0 %	50 %	50 %	0 %	55380136
56	NC_006397	GA	4	8	64573	64580	50 %	0 %	50 %	0 %	55380140
57	NC_006397	GA	3	6	65140	65145	50 %	0 %	50 %	0 %	55380141
58	NC_006397	TC	3	6	67014	67019	0 %	50 %	0 %	50 %	55380143
59	NC_006397	AG	3	6	67139	67144	50 %	0 %	50 %	0 %	55380144
60	NC_006397	AG	3	6	69522	69527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380147
61	NC_006397	CA	3	6	70346	70351	50 %	0 %	0 %	50 %	55380149
62	NC_006397	AC	3	6	70501	70506	50 %	0 %	0 %	50 %	55380150
63	NC_006397	GA	3	6	70765	70770	50 %	0 %	50 %	0 %	55380150
64	NC_006397	GA	3	6	73401	73406	50 %	0 %	50 %	0 %	55380152
65	NC_006397	TC	3	6	74473	74478	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
66	NC_006397	CT	3	6	74576	74581	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
67	NC_006397	TC	3	6	75174	75179	0 %	50 %	0 %	50 %	55380154
68	NC_006397	AC	3	6	75210	75215	50 %	0 %	0 %	50 %	55380154
69	NC_006397	CT	3	6	75402	75407	0 %	50 %	0 %	50 %	55380154
70	NC_006397	CG	3	6	75760	75765	0 %	0 %	50 %	50 %	55380154
71	NC_006397	AC	3	6	76421	76426	50 %	0 %	0 %	50 %	55380155
72	NC_006397	CA	3	6	76850	76855	50 %	0 %	0 %	50 %	55380155
73	NC_006397	TC	3	6	77108	77113	0 %	50 %	0 %	50 %	55380155
74	NC_006397	CG	3	6	77674	77679	0 %	0 %	50 %	50 %	55380155
75	NC_006397	CG	3	6	78514	78519	0 %	0 %	50 %	50 %	55380156
76	NC_006397	CG	3	6	79603	79608	0 %	0 %	50 %	50 %	55380156
77	NC_006397	CG	3	6	82964	82969	0 %	0 %	50 %	50 %	55380161
78	NC_006397	AG	3	6	83126	83131	50 %	0 %	50 %	0 %	55380161
79	NC_006397	CG	3	6	84185	84190	0 %	0 %	50 %	50 %	55380162
80	NC_006397	TG	3	6	84334	84339	0 %	50 %	50 %	0 %	55380162
81	NC_006397	CA	3	6	84352	84357	50 %	0 %	0 %	50 %	55380162
82	NC_006397	GT	3	6	85915	85920	0 %	50 %	50 %	0 %	55380163
83	NC_006397	GC	3	6	88375	88380	0 %	0 %	50 %	50 %	55380166
84	NC_006397	CA	3	6	88442	88447	50 %	0 %	0 %	50 %	55380166
85	NC_006397	AG	3	6	88456	88461	50 %	0 %	50 %	0 %	55380166
86	NC_006397	GT	3	6	91549	91554	0 %	50 %	50 %	0 %	55380169
87	NC_006397	CA	3	6	92363	92368	50 %	0 %	0 %	50 %	55380170
88	NC_006397	GT	3	6	93494	93499	0 %	50 %	50 %	0 %	55380171
89	NC_006397	TG	3	6	94770	94775	0 %	50 %	50 %	0 %	55380172
90	NC_006397	TG	3	6	97799	97804	0 %	50 %	50 %	0 %	55380174
91	NC_006397	GT	3	6	97865	97870	0 %	50 %	50 %	0 %	55380174
92	NC_006397	CG	4	8	98426	98433	0 %	0 %	50 %	50 %	55380175
93	NC_006397	AC	3	6	98896	98901	50 %	0 %	0 %	50 %	55380175
94	NC_006397	GT	3	6	99128	99133	0 %	50 %	50 %	0 %	55380175
95	NC_006397	GC	3	6	99688	99693	0 %	0 %	50 %	50 %	55380176
96	NC_006397	GA	3	6	101913	101918	50 %	0 %	50 %	0 %	55380179
97	NC_006397	CG	3	6	102359	102364	0 %	0 %	50 %	50 %	55380180
98	NC_006397	AC	3	6	103276	103281	50 %	0 %	0 %	50 %	55380182
99	NC_006397	TC	3	6	103574	103579	0 %	50 %	0 %	50 %	55380182
100	NC_006397	TA	3	6	104169	104174	50 %	50 %	0 %	0 %	55380184
101	NC_006397	CT	3	6	105421	105426	0 %	50 %	0 %	50 %	55380186
102	NC_006397	CA	3	6	107028	107033	50 %	0 %	0 %	50 %	55380186
103	NC_006397	CA	3	6	107537	107542	50 %	0 %	0 %	50 %	55380187
104	NC_006397	CT	3	6	109785	109790	0 %	50 %	0 %	50 %	55380190
105	NC_006397	TC	3	6	113186	113191	0 %	50 %	0 %	50 %	55380195
106	NC_006397	GC	3	6	113308	113313	0 %	0 %	50 %	50 %	55380195
107	NC_006397	TG	3	6	114676	114681	0 %	50 %	50 %	0 %	55380196
108	NC_006397	AT	3	6	114786	114791	50 %	50 %	0 %	0 %	55380196
109	NC_006397	TC	3	6	114879	114884	0 %	50 %	0 %	50 %	55380196
110	NC_006397	AT	3	6	115315	115320	50 %	50 %	0 %	0 %	55380197
111	NC_006397	CA	3	6	115556	115561	50 %	0 %	0 %	50 %	55380197
112	NC_006397	TG	3	6	116684	116689	0 %	50 %	50 %	0 %	55380199
113	NC_006397	AC	3	6	119990	119995	50 %	0 %	0 %	50 %	55380202
114	NC_006397	CA	3	6	121456	121461	50 %	0 %	0 %	50 %	55380204
115	NC_006397	AC	3	6	122792	122797	50 %	0 %	0 %	50 %	55380206
116	NC_006397	CG	3	6	122859	122864	0 %	0 %	50 %	50 %	55380206
117	NC_006397	GA	3	6	122876	122881	50 %	0 %	50 %	0 %	55380206
118	NC_006397	CT	3	6	124792	124797	0 %	50 %	0 %	50 %	55380209
119	NC_006397	GC	3	6	125473	125478	0 %	0 %	50 %	50 %	55380209
120	NC_006397	TC	3	6	127002	127007	0 %	50 %	0 %	50 %	55380210
121	NC_006397	CT	3	6	127574	127579	0 %	50 %	0 %	50 %	55380211
122	NC_006397	AG	3	6	127662	127667	50 %	0 %	50 %	0 %	55380211
123	NC_006397	AG	3	6	127908	127913	50 %	0 %	50 %	0 %	55380211
124	NC_006397	GC	3	6	128136	128141	0 %	0 %	50 %	50 %	55380211
125	NC_006397	GC	3	6	128545	128550	0 %	0 %	50 %	50 %	55380211
126	NC_006397	GA	3	6	129130	129135	50 %	0 %	50 %	0 %	55380211
127	NC_006397	TC	3	6	129194	129199	0 %	50 %	0 %	50 %	55380211
128	NC_006397	TC	3	6	129398	129403	0 %	50 %	0 %	50 %	55380211
129	NC_006397	CT	3	6	130825	130830	0 %	50 %	0 %	50 %	55380211
130	NC_006397	AC	3	6	132617	132622	50 %	0 %	0 %	50 %	55380212
131	NC_006397	GT	3	6	133110	133115	0 %	50 %	50 %	0 %	55380213
132	NC_006397	TG	3	6	133537	133542	0 %	50 %	50 %	0 %	55380214
133	NC_006397	GA	3	6	134213	134218	50 %	0 %	50 %	0 %	55380215
134	NC_006397	GC	3	6	135170	135175	0 %	0 %	50 %	50 %	55380216
135	NC_006397	CT	3	6	136738	136743	0 %	50 %	0 %	50 %	55380218
136	NC_006397	GT	3	6	137053	137058	0 %	50 %	50 %	0 %	55380218
137	NC_006397	GA	3	6	138137	138142	50 %	0 %	50 %	0 %	55380219
138	NC_006397	GA	3	6	138296	138301	50 %	0 %	50 %	0 %	55380219
139	NC_006397	AT	3	6	138981	138986	50 %	50 %	0 %	0 %	55380220
140	NC_006397	CA	3	6	140320	140325	50 %	0 %	0 %	50 %	55380221
141	NC_006397	GC	3	6	141551	141556	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
142	NC_006397	TC	3	6	142034	142039	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
143	NC_006397	TC	3	6	142248	142253	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.