MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	GCGG	2	8	7114	7121	0 %	0 %	75 %	25 %	55380076
2	NC_006397	GCGA	2	8	7276	7283	25 %	0 %	50 %	25 %	55380076
3	NC_006397	TCGA	2	8	12585	12592	25 %	25 %	25 %	25 %	55380080
4	NC_006397	GAAC	2	8	13142	13149	50 %	0 %	25 %	25 %	55380080
5	NC_006397	ACGC	2	8	13184	13191	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
6	NC_006397	CACG	2	8	13205	13212	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
7	NC_006397	GTTG	2	8	13712	13719	0 %	50 %	50 %	0 %	55380081
8	NC_006397	ACGA	2	8	14598	14605	50 %	0 %	25 %	25 %	55380082
9	NC_006397	GCTG	2	8	15287	15294	0 %	25 %	50 %	25 %	55380084
10	NC_006397	GACA	2	8	15823	15830	50 %	0 %	25 %	25 %	55380084
11	NC_006397	GACG	2	8	16596	16603	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
12	NC_006397	CGGA	2	8	16708	16715	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
13	NC_006397	GACC	2	8	16833	16840	25 %	0 %	25 %	50 %	55380085
14	NC_006397	GGCC	2	8	18461	18468	0 %	0 %	50 %	50 %	55380088
15	NC_006397	CGGC	2	8	18758	18765	0 %	0 %	50 %	50 %	55380089
16	NC_006397	TCAA	2	8	18792	18799	50 %	25 %	0 %	25 %	55380089
17	NC_006397	ACAG	2	8	18807	18814	50 %	0 %	25 %	25 %	55380089
18	NC_006397	TCTG	2	8	18954	18961	0 %	50 %	25 %	25 %	55380089
19	NC_006397	CGGT	2	8	19607	19614	0 %	25 %	50 %	25 %	55380090
20	NC_006397	GGGA	2	8	22204	22211	25 %	0 %	75 %	0 %	55380093
21	NC_006397	TGAC	2	8	22247	22254	25 %	25 %	25 %	25 %	55380093
22	NC_006397	ACAT	2	8	22758	22765	50 %	25 %	0 %	25 %	55380094
23	NC_006397	GATG	2	8	24678	24685	25 %	25 %	50 %	0 %	55380096
24	NC_006397	AGCA	2	8	26048	26055	50 %	0 %	25 %	25 %	55380098
25	NC_006397	CGTG	2	8	26424	26431	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
26	NC_006397	GCGT	2	8	26445	26452	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
27	NC_006397	GTTC	2	8	26487	26494	0 %	50 %	25 %	25 %	55380099
28	NC_006397	TCGA	2	8	27044	27051	25 %	25 %	25 %	25 %	55380099
29	NC_006397	GACA	2	8	27715	27722	50 %	0 %	25 %	25 %	55380100
30	NC_006397	CTGT	2	8	29307	29314	0 %	50 %	25 %	25 %	55380101
31	NC_006397	AGCT	2	8	29389	29396	25 %	25 %	25 %	25 %	55380101
32	NC_006397	CGCT	2	8	29946	29953	0 %	25 %	25 %	50 %	55380101
33	NC_006397	CAGT	2	8	30171	30178	25 %	25 %	25 %	25 %	55380102
34	NC_006397	CGAC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	55380102
35	NC_006397	GTCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	25 %	50 %	55380103
36	NC_006397	CGAG	2	8	31405	31412	25 %	0 %	50 %	25 %	55380104
37	NC_006397	CGGT	2	8	32088	32095	0 %	25 %	50 %	25 %	55380105
38	NC_006397	ACGG	2	8	32177	32184	25 %	0 %	50 %	25 %	55380105
39	NC_006397	GCCG	2	8	32593	32600	0 %	0 %	50 %	50 %	55380105
40	NC_006397	TCGC	2	8	32789	32796	0 %	25 %	25 %	50 %	55380105
41	NC_006397	CGTC	2	8	34270	34277	0 %	25 %	25 %	50 %	55380107
42	NC_006397	TCCG	2	8	34962	34969	0 %	25 %	25 %	50 %	55380108
43	NC_006397	TGAA	2	8	36133	36140	50 %	25 %	25 %	0 %	55380109
44	NC_006397	ACCG	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	55380109
45	NC_006397	TCTG	2	8	37025	37032	0 %	50 %	25 %	25 %	55380109
46	NC_006397	ACTG	2	8	37082	37089	25 %	25 %	25 %	25 %	55380109
47	NC_006397	GCTT	2	8	37210	37217	0 %	50 %	25 %	25 %	55380109
48	NC_006397	GACC	2	8	37279	37286	25 %	0 %	25 %	50 %	55380110
49	NC_006397	CGAA	2	8	37341	37348	50 %	0 %	25 %	25 %	55380110
50	NC_006397	AGCT	2	8	37392	37399	25 %	25 %	25 %	25 %	55380110
51	NC_006397	GCAG	2	8	38138	38145	25 %	0 %	50 %	25 %	55380111
52	NC_006397	CGGC	2	8	38215	38222	0 %	0 %	50 %	50 %	55380111
53	NC_006397	AATA	2	8	40556	40563	75 %	25 %	0 %	0 %	55380113
54	NC_006397	TGGT	2	8	41470	41477	0 %	50 %	50 %	0 %	55380114
55	NC_006397	TCGC	2	8	42602	42609	0 %	25 %	25 %	50 %	55380116
56	NC_006397	GTCA	2	8	42776	42783	25 %	25 %	25 %	25 %	55380116
57	NC_006397	CGAA	2	8	42807	42814	50 %	0 %	25 %	25 %	55380116
58	NC_006397	CGTG	2	8	43532	43539	0 %	25 %	50 %	25 %	55380117
59	NC_006397	GCTG	2	8	45899	45906	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
60	NC_006397	GCTG	2	8	45923	45930	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
61	NC_006397	ACGA	2	8	46418	46425	50 %	0 %	25 %	25 %	55380122
62	NC_006397	CGTT	2	8	46772	46779	0 %	50 %	25 %	25 %	55380123
63	NC_006397	CACG	2	8	46800	46807	25 %	0 %	25 %	50 %	55380123
64	NC_006397	CGCT	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	55380124
65	NC_006397	GGTC	2	8	47351	47358	0 %	25 %	50 %	25 %	55380124
66	NC_006397	GCTC	2	8	48325	48332	0 %	25 %	25 %	50 %	55380126
67	NC_006397	GTTT	2	8	48738	48745	0 %	75 %	25 %	0 %	55380126
68	NC_006397	CTTG	2	8	48875	48882	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
69	NC_006397	TCGT	2	8	49329	49336	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
70	NC_006397	GTTC	2	8	50840	50847	0 %	50 %	25 %	25 %	55380128
71	NC_006397	CGGT	2	8	51122	51129	0 %	25 %	50 %	25 %	55380128
72	NC_006397	GACG	2	8	52556	52563	25 %	0 %	50 %	25 %	55380129
73	NC_006397	CAAG	2	8	53266	53273	50 %	0 %	25 %	25 %	55380130
74	NC_006397	GTCG	2	8	53425	53432	0 %	25 %	50 %	25 %	55380130
75	NC_006397	GATT	2	8	55823	55830	25 %	50 %	25 %	0 %	55380131
76	NC_006397	GTCT	2	8	56130	56137	0 %	50 %	25 %	25 %	55380131
77	NC_006397	CGTA	2	8	56361	56368	25 %	25 %	25 %	25 %	55380132
78	NC_006397	CGAC	2	8	56645	56652	25 %	0 %	25 %	50 %	55380132
79	NC_006397	GCCA	2	8	56814	56821	25 %	0 %	25 %	50 %	55380132
80	NC_006397	TACA	2	8	57127	57134	50 %	25 %	0 %	25 %	55380132
81	NC_006397	CGAG	2	8	57535	57542	25 %	0 %	50 %	25 %	55380133
82	NC_006397	CATC	2	8	57625	57632	25 %	25 %	0 %	50 %	55380133
83	NC_006397	TGGA	2	8	57730	57737	25 %	25 %	50 %	0 %	55380134
84	NC_006397	ATTT	2	8	58191	58198	25 %	75 %	0 %	0 %	55380134
85	NC_006397	TGCT	2	8	58674	58681	0 %	50 %	25 %	25 %	55380134
86	NC_006397	GCAG	2	8	58689	58696	25 %	0 %	50 %	25 %	55380134
87	NC_006397	GTCT	2	8	59284	59291	0 %	50 %	25 %	25 %	55380134
88	NC_006397	CGCT	2	8	61353	61360	0 %	25 %	25 %	50 %	55380135
89	NC_006397	GTTT	2	8	61923	61930	0 %	75 %	25 %	0 %	55380135
90	NC_006397	CGGA	2	8	61963	61970	25 %	0 %	50 %	25 %	55380135
91	NC_006397	AATA	2	8	62481	62488	75 %	25 %	0 %	0 %	55380137
92	NC_006397	CTGG	2	8	62829	62836	0 %	25 %	50 %	25 %	55380136
93	NC_006397	TCTG	2	8	63081	63088	0 %	50 %	25 %	25 %	55380136
94	NC_006397	TCAG	2	8	63092	63099	25 %	25 %	25 %	25 %	55380136
95	NC_006397	CCAT	2	8	63118	63125	25 %	25 %	0 %	50 %	55380136
96	NC_006397	ACAG	2	8	63158	63165	50 %	0 %	25 %	25 %	55380136
97	NC_006397	ACGC	2	8	63168	63175	25 %	0 %	25 %	50 %	55380136
98	NC_006397	ACAT	2	8	63574	63581	50 %	25 %	0 %	25 %	55380136
99	NC_006397	TTTG	2	8	64009	64016	0 %	75 %	25 %	0 %	55380136
100	NC_006397	AGCT	2	8	65622	65629	25 %	25 %	25 %	25 %	55380142
101	NC_006397	ACGG	2	8	65694	65701	25 %	0 %	50 %	25 %	55380142
102	NC_006397	GCTG	2	8	65947	65954	0 %	25 %	50 %	25 %	55380142
103	NC_006397	GACA	2	8	66016	66023	50 %	0 %	25 %	25 %	55380142
104	NC_006397	ACGG	2	8	66026	66033	25 %	0 %	50 %	25 %	55380142
105	NC_006397	TGAC	2	8	66126	66133	25 %	25 %	25 %	25 %	55380143
106	NC_006397	ACGG	2	8	66201	66208	25 %	0 %	50 %	25 %	55380143
107	NC_006397	CCGA	2	8	66575	66582	25 %	0 %	25 %	50 %	55380143
108	NC_006397	ACCG	2	8	66704	66711	25 %	0 %	25 %	50 %	55380143
109	NC_006397	TCAC	2	8	66895	66902	25 %	25 %	0 %	50 %	55380143
110	NC_006397	CGAA	2	8	67727	67734	50 %	0 %	25 %	25 %	55380145
111	NC_006397	CACT	2	8	68769	68776	25 %	25 %	0 %	50 %	55380146
112	NC_006397	AGGT	2	8	69276	69283	25 %	25 %	50 %	0 %	55380146
113	NC_006397	GGAG	2	8	69316	69323	25 %	0 %	75 %	0 %	55380146
114	NC_006397	GCCG	2	8	69446	69453	0 %	0 %	50 %	50 %	55380147
115	NC_006397	CTGA	2	8	70309	70316	25 %	25 %	25 %	25 %	55380149
116	NC_006397	CGAC	2	8	71303	71310	25 %	0 %	25 %	50 %	55380151
117	NC_006397	CCGG	2	8	72665	72672	0 %	0 %	50 %	50 %	55380152
118	NC_006397	TTTC	2	8	72892	72899	0 %	75 %	0 %	25 %	55380152
119	NC_006397	CGGT	2	8	72937	72944	0 %	25 %	50 %	25 %	55380152
120	NC_006397	GCGA	2	8	72963	72970	25 %	0 %	50 %	25 %	55380152
121	NC_006397	TCGT	2	8	73038	73045	0 %	50 %	25 %	25 %	55380152
122	NC_006397	GAAC	2	8	73171	73178	50 %	0 %	25 %	25 %	55380152
123	NC_006397	TCGT	2	8	73665	73672	0 %	50 %	25 %	25 %	55380152
124	NC_006397	GCGG	2	8	73697	73704	0 %	0 %	75 %	25 %	55380152
125	NC_006397	TTGC	2	8	76930	76937	0 %	50 %	25 %	25 %	55380155
126	NC_006397	TTCG	2	8	78855	78862	0 %	50 %	25 %	25 %	55380156
127	NC_006397	TTCG	2	8	79616	79623	0 %	50 %	25 %	25 %	55380156
128	NC_006397	AGCC	2	8	79730	79737	25 %	0 %	25 %	50 %	55380156
129	NC_006397	CCAT	2	8	83653	83660	25 %	25 %	0 %	50 %	55380161
130	NC_006397	CCGA	2	8	84228	84235	25 %	0 %	25 %	50 %	55380162
131	NC_006397	GCGG	2	8	84806	84813	0 %	0 %	75 %	25 %	55380162
132	NC_006397	TCGT	2	8	84897	84904	0 %	50 %	25 %	25 %	55380162
133	NC_006397	CGGT	2	8	85333	85340	0 %	25 %	50 %	25 %	55380163
134	NC_006397	CGGG	2	8	85375	85382	0 %	0 %	75 %	25 %	55380163
135	NC_006397	CGAC	2	8	86114	86121	25 %	0 %	25 %	50 %	55380164
136	NC_006397	GACA	2	8	87271	87278	50 %	0 %	25 %	25 %	55380165
137	NC_006397	AGAC	2	8	87468	87475	50 %	0 %	25 %	25 %	55380165
138	NC_006397	GCCG	2	8	87730	87737	0 %	0 %	50 %	50 %	55380165
139	NC_006397	TTTC	2	8	87864	87871	0 %	75 %	0 %	25 %	55380165
140	NC_006397	CTGG	2	8	88105	88112	0 %	25 %	50 %	25 %	55380165
141	NC_006397	AGCC	2	8	88208	88215	25 %	0 %	25 %	50 %	55380165
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