MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006397	CCG	2	6	141923	141928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
2002	NC_006397	GCG	2	6	141938	141943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2003	NC_006397	TC	3	6	142034	142039	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
2004	NC_006397	CGT	3	9	142083	142091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2005	NC_006397	GCC	2	6	142129	142134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
2006	NC_006397	TC	3	6	142248	142253	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
2007	NC_006397	GCGA	2	8	142256	142263	25 %	0 %	50 %	25 %	55380223
2008	NC_006397	CGA	2	6	142329	142334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2009	NC_006397	CAC	2	6	142339	142344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380223
2010	NC_006397	CTC	2	6	142354	142359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
2011	NC_006397	CGC	2	6	142388	142393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
2012	NC_006397	TCG	2	6	142394	142399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2013	NC_006397	CGT	2	6	142440	142445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2014	NC_006397	GCT	2	6	142519	142524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2015	NC_006397	TTG	2	6	142543	142548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380223
2016	NC_006397	CAG	2	6	142617	142622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2017	NC_006397	CGT	2	6	142629	142634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2018	NC_006397	CGC	2	6	142653	142658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
2019	NC_006397	CGT	3	9	142680	142688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2020	NC_006397	CGA	3	9	142689	142697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2021	NC_006397	CTC	2	6	142708	142713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
2022	NC_006397	CGA	2	6	142815	142820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2023	NC_006397	TCG	2	6	142835	142840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2024	NC_006397	CGG	2	6	142854	142859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2025	NC_006397	ACG	2	6	142865	142870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2026	NC_006397	ACCG	2	8	142885	142892	25 %	0 %	25 %	50 %	55380223
2027	NC_006397	ATC	2	6	142958	142963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380223
2028	NC_006397	CGC	2	6	142971	142976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
2029	NC_006397	TTCGA	2	10	143011	143020	20 %	40 %	20 %	20 %	55380223
2030	NC_006397	CTC	2	6	143113	143118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
2031	NC_006397	GTC	2	6	143158	143163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2032	NC_006397	GAG	2	6	143170	143175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380223
2033	NC_006397	TCG	2	6	143181	143186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2034	NC_006397	CT	3	6	143212	143217	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
2035	NC_006397	TCT	2	6	143220	143225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
2036	NC_006397	CTG	2	6	143239	143244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2037	NC_006397	TCG	2	6	143276	143281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2038	NC_006397	AG	3	6	143296	143301	50 %	0 %	50 %	0 %	55380223
2039	NC_006397	CGA	2	6	143346	143351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2041	NC_006397	GTC	2	6	143410	143415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2042	NC_006397	TCCG	2	8	143436	143443	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
2043	NC_006397	CTT	2	6	143448	143453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
2044	NC_006397	CGA	2	6	143475	143480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2045	NC_006397	CGT	2	6	143484	143489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2047	NC_006397	TCGC	2	8	143559	143566	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
2048	NC_006397	AGTTCG	2	12	143573	143584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55380223
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2050	NC_006397	CGG	3	9	143655	143663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2051	NC_006397	TCG	2	6	143750	143755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2052	NC_006397	GTC	2	6	143820	143825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2053	NC_006397	GAT	2	6	143827	143832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
2054	NC_006397	GTC	2	6	143833	143838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2055	NC_006397	CTC	2	6	143857	143862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
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2057	NC_006397	CGA	2	6	143907	143912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2058	NC_006397	GGC	2	6	143926	143931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2059	NC_006397	TGCT	2	8	143971	143978	0 %	50 %	25 %	25 %	55380223
2060	NC_006397	GCT	2	6	143982	143987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2061	NC_006397	CT	4	8	144021	144028	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
2062	NC_006397	TCG	2	6	144041	144046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2063	NC_006397	CGA	2	6	144099	144104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2065	NC_006397	TCA	2	6	144176	144181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380223
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2070	NC_006397	TCGC	2	8	144358	144365	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
2071	NC_006397	CGTCC	2	10	144375	144384	0 %	20 %	20 %	60 %	55380223
2072	NC_006397	GTGAC	2	10	144396	144405	20 %	20 %	40 %	20 %	55380223
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2086	NC_006397	GTTC	2	8	145060	145067	0 %	50 %	25 %	25 %	55380223
2087	NC_006397	CTG	2	6	145093	145098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2089	NC_006397	CCCA	2	8	145142	145149	25 %	0 %	0 %	75 %	55380223
2090	NC_006397	CGAG	2	8	145167	145174	25 %	0 %	50 %	25 %	55380223
2091	NC_006397	TCG	2	6	145241	145246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2093	NC_006397	C	6	6	145261	145266	0 %	0 %	0 %	100 %	55380223
2094	NC_006397	AGC	2	6	145388	145393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2099	NC_006397	CT	3	6	145630	145635	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
2100	NC_006397	CCGTT	2	10	145677	145686	0 %	40 %	20 %	40 %	55380223
2101	NC_006397	AG	3	6	145708	145713	50 %	0 %	50 %	0 %	55380223
2102	NC_006397	CGTCC	2	10	145729	145738	0 %	20 %	20 %	60 %	55380223
2103	NC_006397	TTC	2	6	145748	145753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
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2109	NC_006397	TCG	2	6	146051	146056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2119	NC_006397	CGG	2	6	146532	146537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2120	NC_006397	GGCC	2	8	146541	146548	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
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2122	NC_006397	CGG	2	6	146625	146630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
2123	NC_006397	GAC	2	6	146644	146649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2124	NC_006397	TGA	2	6	146667	146672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
2125	NC_006397	GGA	2	6	146751	146756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380223
2126	NC_006397	TCG	2	6	146777	146782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
2127	NC_006397	ACG	2	6	146815	146820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
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2142	NC_006397	CG	3	6	147295	147300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
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2230	NC_006397	CGA	3	9	152234	152242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380229
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2232	NC_006397	GAG	2	6	152489	152494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380230
2233	NC_006397	TTCGCC	2	12	152495	152506	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55380230
2234	NC_006397	GAC	2	6	152564	152569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380230
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2236	NC_006397	GAC	2	6	152620	152625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380230
2237	NC_006397	GCT	2	6	152687	152692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380230
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2239	NC_006397	GGCG	2	8	152728	152735	0 %	0 %	75 %	25 %	55380230
2240	NC_006397	CGG	2	6	152746	152751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380230
2241	NC_006397	CGA	2	6	152823	152828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380230
2242	NC_006397	GAT	2	6	152875	152880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380230
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2244	NC_006397	CAC	2	6	153028	153033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380230
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2367	NC_006397	CGT	2	6	161365	161370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380239
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2369	NC_006397	CTGC	2	8	161424	161431	0 %	25 %	25 %	50 %	55380239
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2489	NC_006397	GTA	2	6	168720	168725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380245
2490	NC_006397	GCC	2	6	168733	168738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
2491	NC_006397	AG	3	6	169038	169043	50 %	0 %	50 %	0 %	55380246
2492	NC_006397	TCAGC	2	10	169078	169087	20 %	20 %	20 %	40 %	55380246
2493	NC_006397	GC	3	6	169109	169114	0 %	0 %	50 %	50 %	55380246
2494	NC_006397	GAC	2	6	169151	169156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2495	NC_006397	TCT	2	6	169177	169182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380246
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2497	NC_006397	CTC	2	6	169286	169291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380246
2498	NC_006397	TC	4	8	169306	169313	0 %	50 %	0 %	50 %	55380246
2499	NC_006397	CAG	2	6	169345	169350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2500	NC_006397	GTAC	2	8	169381	169388	25 %	25 %	25 %	25 %	55380246

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