MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006397	CTGAC	2	10	44157	44166	20 %	20 %	20 %	40 %	55380118
502	NC_006397	CTG	2	6	44183	44188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380118
503	NC_006397	TAG	2	6	44273	44278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380118
504	NC_006397	CGA	2	6	44304	44309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380119
505	NC_006397	TCAGT	2	10	44481	44490	20 %	40 %	20 %	20 %	55380119
506	NC_006397	GCG	2	6	44530	44535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380119
507	NC_006397	TCA	2	6	44559	44564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380119
508	NC_006397	TCG	2	6	44579	44584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380119
509	NC_006397	CGT	2	6	44619	44624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380119
510	NC_006397	TCG	2	6	44699	44704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380119
511	NC_006397	CCG	2	6	44758	44763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380119
512	NC_006397	GATCCG	2	12	44778	44789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55380119
513	NC_006397	CGA	2	6	44814	44819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380120
514	NC_006397	AGG	2	6	44828	44833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380120
515	NC_006397	CCA	2	6	44834	44839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380120
516	NC_006397	GTG	2	6	44879	44884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380120
517	NC_006397	ACG	2	6	44974	44979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380120
518	NC_006397	CGC	2	6	44990	44995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380120
519	NC_006397	GAG	2	6	45064	45069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380120
520	NC_006397	CTT	2	6	45441	45446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380121
521	NC_006397	CAG	2	6	45549	45554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380121
522	NC_006397	GTC	2	6	45601	45606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380121
523	NC_006397	CTG	2	6	45682	45687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380121
524	NC_006397	GGT	2	6	45716	45721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380121
525	NC_006397	AGT	2	6	45754	45759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380121
526	NC_006397	TTC	2	6	45778	45783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380121
527	NC_006397	GCTG	2	8	45899	45906	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
528	NC_006397	GCTG	2	8	45923	45930	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
529	NC_006397	GTA	2	6	46073	46078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380122
530	NC_006397	CAG	2	6	46114	46119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380122
531	NC_006397	TCG	2	6	46125	46130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380122
532	NC_006397	TCC	2	6	46132	46137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380122
533	NC_006397	CGT	2	6	46219	46224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380122
534	NC_006397	CAG	2	6	46229	46234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380122
535	NC_006397	CGT	2	6	46240	46245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380122
536	NC_006397	CAA	2	6	46297	46302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380122
537	NC_006397	CGC	2	6	46334	46339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380122
538	NC_006397	TCG	2	6	46350	46355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380122
539	NC_006397	GGT	2	6	46387	46392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380122
540	NC_006397	CTC	2	6	46412	46417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380122
541	NC_006397	ACGA	2	8	46418	46425	50 %	0 %	25 %	25 %	55380122
542	NC_006397	CTA	2	6	46456	46461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380122
543	NC_006397	CTC	2	6	46558	46563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380123
544	NC_006397	TCA	2	6	46577	46582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380123
545	NC_006397	TGC	2	6	46600	46605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380123
546	NC_006397	CGT	2	6	46623	46628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380123
547	NC_006397	GGA	2	6	46671	46676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380123
548	NC_006397	CAG	2	6	46701	46706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380123
549	NC_006397	GCA	2	6	46715	46720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380123
550	NC_006397	CGTT	2	8	46772	46779	0 %	50 %	25 %	25 %	55380123
551	NC_006397	CACG	2	8	46800	46807	25 %	0 %	25 %	50 %	55380123
552	NC_006397	CCA	2	6	46832	46837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380123
553	NC_006397	AC	3	6	46839	46844	50 %	0 %	0 %	50 %	55380123
554	NC_006397	GAG	2	6	46867	46872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380123
555	NC_006397	GGA	2	6	47281	47286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380124
556	NC_006397	CGCT	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	55380124
557	NC_006397	GGTC	2	8	47351	47358	0 %	25 %	50 %	25 %	55380124
558	NC_006397	TG	3	6	48048	48053	0 %	50 %	50 %	0 %	55380125
559	NC_006397	GCTC	2	8	48325	48332	0 %	25 %	25 %	50 %	55380126
560	NC_006397	TCA	2	6	48363	48368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380126
561	NC_006397	GGA	2	6	48388	48393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380126
562	NC_006397	CCG	2	6	48591	48596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380126
563	NC_006397	TCC	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380126
564	NC_006397	TCC	2	6	48693	48698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380126
565	NC_006397	TCG	2	6	48711	48716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380126
566	NC_006397	TCC	2	6	48732	48737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380126
567	NC_006397	GTTT	2	8	48738	48745	0 %	75 %	25 %	0 %	55380126
568	NC_006397	GTC	2	6	48773	48778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380126
569	NC_006397	TCC	2	6	48799	48804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380127
570	NC_006397	TCG	2	6	48850	48855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
571	NC_006397	CTTG	2	8	48875	48882	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
572	NC_006397	CG	3	6	48885	48890	0 %	0 %	50 %	50 %	55380127
573	NC_006397	ATC	2	6	48951	48956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380127
574	NC_006397	ATC	2	6	49144	49149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380127
575	NC_006397	ACG	2	6	49297	49302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380127
576	NC_006397	CCG	2	6	49305	49310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380127
577	NC_006397	TCGT	2	8	49329	49336	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
578	NC_006397	AGG	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380127
579	NC_006397	TGA	2	6	49436	49441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380127
580	NC_006397	CAT	2	6	49475	49480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380127
581	NC_006397	GTC	2	6	49495	49500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
582	NC_006397	AGC	2	6	49548	49553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380127
583	NC_006397	CGC	2	6	49595	49600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380127
584	NC_006397	GCT	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
585	NC_006397	TCG	2	6	49642	49647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
586	NC_006397	CGT	2	6	50220	50225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
587	NC_006397	AAC	2	6	50245	50250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
588	NC_006397	CG	3	6	50295	50300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380128
589	NC_006397	TCC	2	6	50494	50499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380128
590	NC_006397	AG	3	6	50522	50527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
591	NC_006397	TCG	2	6	50560	50565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
592	NC_006397	CAA	2	6	50582	50587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
593	NC_006397	TGA	2	6	50618	50623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380128
594	NC_006397	CTC	2	6	50631	50636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380128
595	NC_006397	CA	3	6	50717	50722	50 %	0 %	0 %	50 %	55380128
596	NC_006397	CAT	2	6	50771	50776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
597	NC_006397	GTTC	2	8	50840	50847	0 %	50 %	25 %	25 %	55380128
598	NC_006397	CAT	2	6	50849	50854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
599	NC_006397	TCA	3	9	51010	51018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
600	NC_006397	AAC	2	6	51088	51093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
601	NC_006397	ATC	2	6	51103	51108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
602	NC_006397	CGGT	2	8	51122	51129	0 %	25 %	50 %	25 %	55380128
603	NC_006397	CTG	2	6	51187	51192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
604	NC_006397	CGG	2	6	51333	51338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380128
605	NC_006397	CCCGT	2	10	51420	51429	0 %	20 %	20 %	60 %	55380128
606	NC_006397	GA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
607	NC_006397	CA	3	6	52466	52471	50 %	0 %	0 %	50 %	55380129
608	NC_006397	CCA	2	6	52481	52486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380129
609	NC_006397	GCA	2	6	52550	52555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
610	NC_006397	GACG	2	8	52556	52563	25 %	0 %	50 %	25 %	55380129
611	NC_006397	GC	3	6	52611	52616	0 %	0 %	50 %	50 %	55380129
612	NC_006397	CGA	2	6	52621	52626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
613	NC_006397	TCG	2	6	52641	52646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380129
614	NC_006397	ACG	2	6	52683	52688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
615	NC_006397	CCG	2	6	52731	52736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380129
616	NC_006397	ACC	2	6	52825	52830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380130
617	NC_006397	TGA	2	6	52849	52854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380130
618	NC_006397	GCT	2	6	52858	52863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380130
619	NC_006397	ATC	2	6	52886	52891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380130
620	NC_006397	CGAGCG	2	12	52951	52962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55380130
621	NC_006397	CGG	2	6	52996	53001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380130
622	NC_006397	CGA	2	6	53068	53073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380130
623	NC_006397	AAG	2	6	53177	53182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380130
624	NC_006397	GCC	2	6	53204	53209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380130
625	NC_006397	CAAG	2	8	53266	53273	50 %	0 %	25 %	25 %	55380130
626	NC_006397	CGC	2	6	53284	53289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380130
627	NC_006397	ACG	2	6	53379	53384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380130
628	NC_006397	GTCG	2	8	53425	53432	0 %	25 %	50 %	25 %	55380130
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754	NC_006397	ACG	2	6	61879	61884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380135
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