MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 1812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GGAAC	2	10	1564	1573	40 %	0 %	40 %	20 %	55376944
2	NC_006396	CCACG	2	10	5449	5458	20 %	0 %	20 %	60 %	55376947
3	NC_006396	CATCG	2	10	6162	6171	20 %	20 %	20 %	40 %	55376948
4	NC_006396	GTTCG	2	10	10283	10292	0 %	40 %	40 %	20 %	55376952
5	NC_006396	ACGGA	2	10	12009	12018	40 %	0 %	40 %	20 %	55376954
6	NC_006396	GATCA	2	10	12599	12608	40 %	20 %	20 %	20 %	55376954
7	NC_006396	TCCAG	2	10	13128	13137	20 %	20 %	20 %	40 %	55376954
8	NC_006396	CGATT	2	10	18993	19002	20 %	40 %	20 %	20 %	55376960
9	NC_006396	GTCGT	2	10	20128	20137	0 %	40 %	40 %	20 %	55376960
10	NC_006396	GCAAC	2	10	20711	20720	40 %	0 %	20 %	40 %	55376961
11	NC_006396	TCGCG	2	10	22258	22267	0 %	20 %	40 %	40 %	55376963
12	NC_006396	CGGTG	2	10	23208	23217	0 %	20 %	60 %	20 %	55376963
13	NC_006396	GTCGT	2	10	23244	23253	0 %	40 %	40 %	20 %	55376963
14	NC_006396	GTACC	2	10	24260	24269	20 %	20 %	20 %	40 %	55376964
15	NC_006396	AGCGG	2	10	24323	24332	20 %	0 %	60 %	20 %	55376964
16	NC_006396	TGCTC	2	10	25930	25939	0 %	40 %	20 %	40 %	55376967
17	NC_006396	GCGTC	2	10	26566	26575	0 %	20 %	40 %	40 %	55376967
18	NC_006396	TTCGC	2	10	27836	27845	0 %	40 %	20 %	40 %	55376968
19	NC_006396	CCCGG	2	10	32195	32204	0 %	0 %	40 %	60 %	55376972
20	NC_006396	GGACG	2	10	34321	34330	20 %	0 %	60 %	20 %	55376976
21	NC_006396	CTCGT	2	10	35501	35510	0 %	40 %	20 %	40 %	55376977
22	NC_006396	CACCG	2	10	35740	35749	20 %	0 %	20 %	60 %	55376977
23	NC_006396	GACCG	2	10	36297	36306	20 %	0 %	40 %	40 %	55376978
24	NC_006396	GAAGG	2	10	37249	37258	40 %	0 %	60 %	0 %	55376980
25	NC_006396	TCTGC	2	10	38086	38095	0 %	40 %	20 %	40 %	55376981
26	NC_006396	GCTGT	2	10	39237	39246	0 %	40 %	40 %	20 %	55376982
27	NC_006396	GGACC	2	10	39695	39704	20 %	0 %	40 %	40 %	55376982
28	NC_006396	TCCGG	2	10	39734	39743	0 %	20 %	40 %	40 %	55376982
29	NC_006396	TCACG	2	10	44366	44375	20 %	20 %	20 %	40 %	55376989
30	NC_006396	GAGTG	2	10	48989	48998	20 %	20 %	60 %	0 %	55376995
31	NC_006396	GGTCG	2	10	49144	49153	0 %	20 %	60 %	20 %	55376995
32	NC_006396	ACCCG	2	10	50450	50459	20 %	0 %	20 %	60 %	55376997
33	NC_006396	GTGGC	2	10	51383	51392	0 %	20 %	60 %	20 %	55376999
34	NC_006396	GCCGA	2	10	55466	55475	20 %	0 %	40 %	40 %	55377006
35	NC_006396	TCGAT	2	10	56619	56628	20 %	40 %	20 %	20 %	55377009
36	NC_006396	CACGA	2	10	57277	57286	40 %	0 %	20 %	40 %	55377009
37	NC_006396	ACGAC	2	10	58762	58771	40 %	0 %	20 %	40 %	55377011
38	NC_006396	TGGGA	2	10	60699	60708	20 %	20 %	60 %	0 %	55377012
39	NC_006396	GGGGC	2	10	60799	60808	0 %	0 %	80 %	20 %	55377012
40	NC_006396	GGGCG	2	10	60969	60978	0 %	0 %	80 %	20 %	55377012
41	NC_006396	GCGAC	2	10	62041	62050	20 %	0 %	40 %	40 %	55377013
42	NC_006396	CGACG	2	10	62611	62620	20 %	0 %	40 %	40 %	55377014
43	NC_006396	CCGGA	2	10	63249	63258	20 %	0 %	40 %	40 %	55377014
44	NC_006396	ACCGA	2	10	63542	63551	40 %	0 %	20 %	40 %	55377014
45	NC_006396	ACGGA	2	10	64262	64271	40 %	0 %	40 %	20 %	55377015
46	NC_006396	CGACT	2	10	64970	64979	20 %	20 %	20 %	40 %	55377015
47	NC_006396	CGATG	2	10	70124	70133	20 %	20 %	40 %	20 %	55377019
48	NC_006396	AGCCC	2	10	72735	72744	20 %	0 %	20 %	60 %	55377020
49	NC_006396	CCTCG	2	10	74522	74531	0 %	20 %	20 %	60 %	55377022
50	NC_006396	TCGGG	2	10	74851	74860	0 %	20 %	60 %	20 %	55377022
51	NC_006396	CTGTC	2	10	75117	75126	0 %	40 %	20 %	40 %	55377023
52	NC_006396	TCGAA	2	10	76679	76688	40 %	20 %	20 %	20 %	55377025
53	NC_006396	GACCT	2	10	79390	79399	20 %	20 %	20 %	40 %	55377026
54	NC_006396	TCGCC	2	10	81012	81021	0 %	20 %	20 %	60 %	55377029
55	NC_006396	GTCGC	2	10	82049	82058	0 %	20 %	40 %	40 %	55377030
56	NC_006396	GACCG	2	10	84918	84927	20 %	0 %	40 %	40 %	55377034
57	NC_006396	GCGTC	2	10	85285	85294	0 %	20 %	40 %	40 %	55377034
58	NC_006396	CGGAC	2	10	86564	86573	20 %	0 %	40 %	40 %	55377034
59	NC_006396	CGTCT	2	10	87543	87552	0 %	40 %	20 %	40 %	55377033
60	NC_006396	TCGGC	2	10	88087	88096	0 %	20 %	40 %	40 %	55377035
61	NC_006396	GGTGA	2	10	88171	88180	20 %	20 %	60 %	0 %	55377035
62	NC_006396	GCGCC	2	10	90309	90318	0 %	0 %	40 %	60 %	55377040
63	NC_006396	TGTCG	2	10	91523	91532	0 %	40 %	40 %	20 %	55377041
64	NC_006396	GCTCG	2	10	91996	92005	0 %	20 %	40 %	40 %	55377041
65	NC_006396	GTCCG	2	10	96756	96765	0 %	20 %	40 %	40 %	55377047
66	NC_006396	CGACC	2	10	99162	99171	20 %	0 %	20 %	60 %	55377050
67	NC_006396	CCCGA	2	10	99514	99523	20 %	0 %	20 %	60 %	55377050
68	NC_006396	CGGGA	2	10	101587	101596	20 %	0 %	60 %	20 %	55377053
69	NC_006396	GGACG	2	10	101625	101634	20 %	0 %	60 %	20 %	55377053
70	NC_006396	GTACC	2	10	102453	102462	20 %	20 %	20 %	40 %	55377054
71	NC_006396	GCCCG	2	10	106023	106032	0 %	0 %	40 %	60 %	55377058
72	NC_006396	CACGA	2	10	111041	111050	40 %	0 %	20 %	40 %	55377062
73	NC_006396	CCCGG	2	10	111121	111130	0 %	0 %	40 %	60 %	55377062
74	NC_006396	TCGAA	2	10	111960	111969	40 %	20 %	20 %	20 %	55377062
75	NC_006396	CTGGG	2	10	113004	113013	0 %	20 %	60 %	20 %	55377063
76	NC_006396	CGAAC	2	10	113086	113095	40 %	0 %	20 %	40 %	55377063
77	NC_006396	CTGGT	2	10	115072	115081	0 %	40 %	40 %	20 %	55377066
78	NC_006396	GGACG	2	10	115397	115406	20 %	0 %	60 %	20 %	55377067
79	NC_006396	GGAAC	2	10	115993	116002	40 %	0 %	40 %	20 %	55377068
80	NC_006396	TCGCC	2	10	117800	117809	0 %	20 %	20 %	60 %	55377069
81	NC_006396	GCGCC	2	10	122313	122322	0 %	0 %	40 %	60 %	55377072
82	NC_006396	CCCGT	2	10	122871	122880	0 %	20 %	20 %	60 %	55377072
83	NC_006396	GGTCG	2	10	125046	125055	0 %	20 %	60 %	20 %	55377075
84	NC_006396	CGTCG	2	10	126303	126312	0 %	20 %	40 %	40 %	55377076
85	NC_006396	CGGCG	2	10	127407	127416	0 %	0 %	60 %	40 %	55377077
86	NC_006396	CGTCA	2	10	130242	130251	20 %	20 %	20 %	40 %	55377080
87	NC_006396	AAACG	2	10	131532	131541	60 %	0 %	20 %	20 %	55377081
88	NC_006396	CCGAG	2	10	132919	132928	20 %	0 %	40 %	40 %	55377082
89	NC_006396	TCGCC	2	10	133176	133185	0 %	20 %	20 %	60 %	55377082
90	NC_006396	CGCGT	2	10	133861	133870	0 %	20 %	40 %	40 %	55377083
91	NC_006396	CGGCC	2	10	137003	137012	0 %	0 %	40 %	60 %	55377087
92	NC_006396	GAGCA	2	10	141663	141672	40 %	0 %	40 %	20 %	55377091
93	NC_006396	CGGCC	2	10	142549	142558	0 %	0 %	40 %	60 %	55377091
94	NC_006396	CCGGA	2	10	143589	143598	20 %	0 %	40 %	40 %	55377091
95	NC_006396	ACGGC	2	10	145341	145350	20 %	0 %	40 %	40 %	55377091
96	NC_006396	ACTCG	2	10	145808	145817	20 %	20 %	20 %	40 %	55377091
97	NC_006396	CGGCG	2	10	146752	146761	0 %	0 %	60 %	40 %	55377092
98	NC_006396	GAAGA	2	10	146894	146903	60 %	0 %	40 %	0 %	55377092
99	NC_006396	TCGTC	2	10	148745	148754	0 %	40 %	20 %	40 %	55377094
100	NC_006396	TGAAC	2	10	151076	151085	40 %	20 %	20 %	20 %	55377095
101	NC_006396	CGTCG	2	10	151623	151632	0 %	20 %	40 %	40 %	55377095
102	NC_006396	GTCGC	2	10	155398	155407	0 %	20 %	40 %	40 %	55377098
103	NC_006396	TCCGG	2	10	159552	159561	0 %	20 %	40 %	40 %	55377101
104	NC_006396	TACGC	2	10	160256	160265	20 %	20 %	20 %	40 %	55377101
105	NC_006396	CGGGC	2	10	160531	160540	0 %	0 %	60 %	40 %	55377101
106	NC_006396	CGCGA	2	10	160581	160590	20 %	0 %	40 %	40 %	55377101
107	NC_006396	GTCGA	2	10	161442	161451	20 %	20 %	40 %	20 %	55377103
108	NC_006396	TGGTC	2	10	161906	161915	0 %	40 %	40 %	20 %	55377103
109	NC_006396	TCGTC	2	10	162734	162743	0 %	40 %	20 %	40 %	55377103
110	NC_006396	GTCGA	2	10	163705	163714	20 %	20 %	40 %	20 %	55377104
111	NC_006396	CCGTC	2	10	163849	163858	0 %	20 %	20 %	60 %	55377104
112	NC_006396	GTTGG	2	10	164429	164438	0 %	40 %	60 %	0 %	55377104
113	NC_006396	CCGTC	2	10	168373	168382	0 %	20 %	20 %	60 %	55377108
114	NC_006396	CCGCC	2	10	169594	169603	0 %	0 %	20 %	80 %	55377108
115	NC_006396	GACCG	2	10	173536	173545	20 %	0 %	40 %	40 %	55377112
116	NC_006396	GCGGG	2	10	173727	173736	0 %	0 %	80 %	20 %	55377112
117	NC_006396	TCGCC	2	10	175779	175788	0 %	20 %	20 %	60 %	55377114
118	NC_006396	CGGCG	2	10	175885	175894	0 %	0 %	60 %	40 %	55377114
119	NC_006396	ACGTG	2	10	178254	178263	20 %	20 %	40 %	20 %	55377116
120	NC_006396	TTACT	2	10	179641	179650	20 %	60 %	0 %	20 %	55377118
121	NC_006396	CGCGG	2	10	181962	181971	0 %	0 %	60 %	40 %	55377119
122	NC_006396	CCGGA	2	10	184198	184207	20 %	0 %	40 %	40 %	55377121
123	NC_006396	GGCTT	2	10	184375	184384	0 %	40 %	40 %	20 %	55377121
124	NC_006396	CTCGG	2	10	187616	187625	0 %	20 %	40 %	40 %	55377123
125	NC_006396	CCGGC	2	10	187689	187698	0 %	0 %	40 %	60 %	55377123
126	NC_006396	CTCGT	2	10	188635	188644	0 %	40 %	20 %	40 %	55377124
127	NC_006396	GCGTC	2	10	195584	195593	0 %	20 %	40 %	40 %	55377132
128	NC_006396	ATCGC	2	10	196632	196641	20 %	20 %	20 %	40 %	55377134
129	NC_006396	GGTCT	2	10	196733	196742	0 %	40 %	40 %	20 %	55377134
130	NC_006396	CATTG	2	10	200197	200206	20 %	40 %	20 %	20 %	55377139
131	NC_006396	GTCGA	2	10	203955	203964	20 %	20 %	40 %	20 %	55377142
132	NC_006396	GGAAG	2	10	208908	208917	40 %	0 %	60 %	0 %	55377147
133	NC_006396	CTGAC	2	10	209282	209291	20 %	20 %	20 %	40 %	55377147
134	NC_006396	CGACG	2	10	210422	210431	20 %	0 %	40 %	40 %	55377148
135	NC_006396	CGGGA	2	10	212539	212548	20 %	0 %	60 %	20 %	55377150
136	NC_006396	CGACG	2	10	215599	215608	20 %	0 %	40 %	40 %	55377152
137	NC_006396	GGCTG	2	10	216608	216617	0 %	20 %	60 %	20 %	55377153
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