MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 65341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006396	GCG	2	6	24031	24036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
502	NC_006396	CGG	2	6	24137	24142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
503	NC_006396	CGG	2	6	24167	24172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
504	NC_006396	AGA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376964
505	NC_006396	CTG	2	6	24216	24221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
506	NC_006396	GTACC	2	10	24260	24269	20 %	20 %	20 %	40 %	55376964
507	NC_006396	TCG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
508	NC_006396	AGCGG	2	10	24323	24332	20 %	0 %	60 %	20 %	55376964
509	NC_006396	TGAG	2	8	24366	24373	25 %	25 %	50 %	0 %	55376964
510	NC_006396	GTCT	2	8	24412	24419	0 %	50 %	25 %	25 %	55376965
511	NC_006396	GTC	2	6	24460	24465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376965
512	NC_006396	GTA	2	6	24466	24471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376965
513	NC_006396	GTC	3	9	24487	24495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376965
514	NC_006396	AG	3	6	24509	24514	50 %	0 %	50 %	0 %	55376965
515	NC_006396	CTCA	2	8	24568	24575	25 %	25 %	0 %	50 %	55376965
516	NC_006396	GAC	2	6	24628	24633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376965
517	NC_006396	GAC	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376966
518	NC_006396	ATCA	2	8	24897	24904	50 %	25 %	0 %	25 %	55376966
519	NC_006396	CGG	2	6	24913	24918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376966
520	NC_006396	CT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	0 %	50 %	55376966
521	NC_006396	AAC	2	6	24994	24999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376966
522	NC_006396	TCG	2	6	25036	25041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376966
523	NC_006396	GAG	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376966
524	NC_006396	CGT	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376966
525	NC_006396	TCCA	2	8	25126	25133	25 %	25 %	0 %	50 %	55376966
526	NC_006396	CGAA	2	8	25234	25241	50 %	0 %	25 %	25 %	55376966
527	NC_006396	GATTCG	2	12	25264	25275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376966
528	NC_006396	CGA	2	6	25283	25288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376966
529	NC_006396	CGG	2	6	25304	25309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376966
530	NC_006396	CTC	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376967
531	NC_006396	TCT	2	6	25771	25776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
532	NC_006396	CGT	2	6	25789	25794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
533	NC_006396	TCG	2	6	25806	25811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
534	NC_006396	TCA	2	6	25851	25856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376967
535	NC_006396	CTT	2	6	25865	25870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
536	NC_006396	TGCTC	2	10	25930	25939	0 %	40 %	20 %	40 %	55376967
537	NC_006396	CGA	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
538	NC_006396	GCT	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
539	NC_006396	CGG	2	6	26107	26112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376967
540	NC_006396	CGT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
541	NC_006396	CGA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
542	NC_006396	GAG	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376967
543	NC_006396	GC	3	6	26305	26310	0 %	0 %	50 %	50 %	55376967
544	NC_006396	CGT	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
545	NC_006396	GGC	2	6	26336	26341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376967
546	NC_006396	GGTC	2	8	26380	26387	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
547	NC_006396	GGGT	2	8	26427	26434	0 %	25 %	75 %	0 %	55376967
548	NC_006396	TGCG	2	8	26526	26533	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
549	NC_006396	GCGTC	2	10	26566	26575	0 %	20 %	40 %	40 %	55376967
550	NC_006396	GAC	2	6	26600	26605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
551	NC_006396	TCT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
552	NC_006396	TCA	2	6	26637	26642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376967
553	NC_006396	GA	3	6	26687	26692	50 %	0 %	50 %	0 %	55376967
554	NC_006396	CGT	2	6	26719	26724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
555	NC_006396	CCG	2	6	26784	26789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376967
556	NC_006396	CGA	2	6	26837	26842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
557	NC_006396	GTC	2	6	26882	26887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
558	NC_006396	TCG	2	6	26907	26912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
559	NC_006396	CGA	2	6	26920	26925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
560	NC_006396	GCC	2	6	26979	26984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376967
561	NC_006396	GAC	2	6	26990	26995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
562	NC_006396	CCG	2	6	27014	27019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376967
563	NC_006396	TCG	2	6	27135	27140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
564	NC_006396	ACCA	2	8	27701	27708	50 %	0 %	0 %	50 %	55376968
565	NC_006396	CTC	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376968
566	NC_006396	CGG	2	6	27757	27762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376968
567	NC_006396	GA	3	6	27767	27772	50 %	0 %	50 %	0 %	55376968
568	NC_006396	CGG	2	6	27803	27808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376968
569	NC_006396	GAC	2	6	27821	27826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376968
570	NC_006396	TTCGC	2	10	27836	27845	0 %	40 %	20 %	40 %	55376968
571	NC_006396	GCC	2	6	27896	27901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376968
572	NC_006396	T	7	7	27917	27923	0 %	100 %	0 %	0 %	55376968
573	NC_006396	TGT	2	6	27952	27957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376968
574	NC_006396	ACTG	2	8	27959	27966	25 %	25 %	25 %	25 %	55376968
575	NC_006396	CGG	2	6	27980	27985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376968
576	NC_006396	GGCA	2	8	28048	28055	25 %	0 %	50 %	25 %	55376968
577	NC_006396	GGT	2	6	28067	28072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376968
578	NC_006396	CAG	2	6	28137	28142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376968
579	NC_006396	TCGT	2	8	28194	28201	0 %	50 %	25 %	25 %	55376968
580	NC_006396	CGA	2	6	28210	28215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376968
581	NC_006396	TTC	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376968
582	NC_006396	ACT	2	6	28298	28303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376968
583	NC_006396	CCGG	3	12	28304	28315	0 %	0 %	50 %	50 %	55376968
584	NC_006396	GGC	2	6	28364	28369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376968
585	NC_006396	GTC	2	6	28413	28418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376968
586	NC_006396	CCGA	2	8	28443	28450	25 %	0 %	25 %	50 %	55376968
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588	NC_006396	GGT	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376968
589	NC_006396	CGA	2	6	28636	28641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376968
590	NC_006396	CTG	2	6	28719	28724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376968
591	NC_006396	CGG	2	6	28783	28788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376969
592	NC_006396	CGA	2	6	28795	28800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376969
593	NC_006396	CTG	2	6	28844	28849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
594	NC_006396	TGA	2	6	28890	28895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376969
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596	NC_006396	CAC	2	6	28978	28983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376969
597	NC_006396	TCCG	2	8	28998	29005	0 %	25 %	25 %	50 %	55376969
598	NC_006396	GCT	2	6	29020	29025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
599	NC_006396	CGA	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376969
600	NC_006396	GCT	2	6	29056	29061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
601	NC_006396	GAC	2	6	29086	29091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376969
602	NC_006396	GTC	2	6	29120	29125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
603	NC_006396	TTA	2	6	29127	29132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376969
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607	NC_006396	TGC	2	6	29292	29297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
608	NC_006396	CGC	2	6	29314	29319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376969
609	NC_006396	GCT	2	6	29341	29346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
610	NC_006396	CGA	2	6	29374	29379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376969
611	NC_006396	GAT	2	6	29380	29385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376969
612	NC_006396	CAT	2	6	29434	29439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376969
613	NC_006396	TGT	2	6	29508	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376969
614	NC_006396	GCG	2	6	29567	29572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376969
615	NC_006396	TGG	2	6	29578	29583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376969
616	NC_006396	GTC	2	6	29585	29590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
617	NC_006396	TCG	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376969
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749	NC_006396	GC	3	6	36066	36071	0 %	0 %	50 %	50 %	55376977
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