MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 7530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006395	TGC	2	6	282057	282062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5002	NC_006395	CGACA	2	10	282074	282083	40 %	0 %	20 %	40 %	55376825
5003	NC_006395	GTC	2	6	282092	282097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5004	NC_006395	CGG	2	6	282172	282177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376825
5005	NC_006395	CAG	2	6	282221	282226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5006	NC_006395	TTA	2	6	282366	282371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376825
5007	NC_006395	CGG	2	6	282397	282402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376825
5008	NC_006395	CTC	2	6	282422	282427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376825
5009	NC_006395	GCT	2	6	282520	282525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5010	NC_006395	AGCT	2	8	282603	282610	25 %	25 %	25 %	25 %	55376825
5011	NC_006395	TCG	2	6	282630	282635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5012	NC_006395	TCC	2	6	282651	282656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376825
5013	NC_006395	CAG	2	6	282720	282725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5014	NC_006395	GGCT	2	8	282740	282747	0 %	25 %	50 %	25 %	55376825
5015	NC_006395	CGT	2	6	282867	282872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5016	NC_006395	ACCG	2	8	282873	282880	25 %	0 %	25 %	50 %	55376825
5017	NC_006395	GAC	2	6	282893	282898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5018	NC_006395	GTC	3	9	282902	282910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376825
5019	NC_006395	ACACG	2	10	282924	282933	40 %	0 %	20 %	40 %	55376825
5020	NC_006395	ACG	2	6	283025	283030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5021	NC_006395	CGG	2	6	283034	283039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5022	NC_006395	CATC	2	8	283040	283047	25 %	25 %	0 %	50 %	55376826
5023	NC_006395	TCCC	2	8	283114	283121	0 %	25 %	0 %	75 %	55376826
5024	NC_006395	TCC	2	6	283220	283225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376826
5025	NC_006395	GGAC	2	8	283226	283233	25 %	0 %	50 %	25 %	55376826
5026	NC_006395	GGC	2	6	283242	283247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5027	NC_006395	GCG	2	6	283253	283258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5028	NC_006395	GGC	2	6	283267	283272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5029	NC_006395	GAC	2	6	283287	283292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5030	NC_006395	CTGA	2	8	283318	283325	25 %	25 %	25 %	25 %	55376826
5031	NC_006395	ACA	2	6	283334	283339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376826
5032	NC_006395	GGT	2	6	283363	283368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376826
5033	NC_006395	ACG	2	6	283429	283434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5034	NC_006395	ACG	3	9	283448	283456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5035	NC_006395	CGA	2	6	283502	283507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5036	NC_006395	GCG	2	6	283508	283513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5037	NC_006395	CGGA	2	8	283539	283546	25 %	0 %	50 %	25 %	55376826
5038	NC_006395	CCAG	2	8	283547	283554	25 %	0 %	25 %	50 %	55376826
5039	NC_006395	CGC	2	6	283649	283654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376826
5040	NC_006395	CGGC	2	8	283713	283720	0 %	0 %	50 %	50 %	55376826
5041	NC_006395	ATC	2	6	283771	283776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376826
5042	NC_006395	CGT	2	6	283800	283805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5043	NC_006395	CAC	2	6	283840	283845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376826
5044	NC_006395	CGAG	2	8	283857	283864	25 %	0 %	50 %	25 %	55376826
5045	NC_006395	CGACG	2	10	283905	283914	20 %	0 %	40 %	40 %	55376826
5046	NC_006395	TCG	2	6	283967	283972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5047	NC_006395	CGG	2	6	284042	284047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5048	NC_006395	TGT	2	6	284060	284065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376826
5049	NC_006395	GTC	2	6	284111	284116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5050	NC_006395	GGAT	2	8	284141	284148	25 %	25 %	50 %	0 %	55376826
5051	NC_006395	GACACG	2	12	284188	284199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5052	NC_006395	CGA	2	6	284217	284222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5053	NC_006395	ACT	2	6	284231	284236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376826
5054	NC_006395	GTG	2	6	284290	284295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376826
5055	NC_006395	GAG	2	6	284362	284367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376826
5056	NC_006395	GGC	2	6	284439	284444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376826
5057	NC_006395	CGA	2	6	284445	284450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376826
5058	NC_006395	TGG	2	6	284723	284728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376827
5059	NC_006395	GAC	2	6	284748	284753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5060	NC_006395	TCA	2	6	284768	284773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376827
5061	NC_006395	TCG	2	6	284774	284779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5062	NC_006395	GTT	2	6	284795	284800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376827
5063	NC_006395	CGG	2	6	284801	284806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376827
5064	NC_006395	GTC	2	6	284859	284864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5065	NC_006395	CCGG	2	8	284905	284912	0 %	0 %	50 %	50 %	55376827
5066	NC_006395	GTT	2	6	284966	284971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376827
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5068	NC_006395	ACG	2	6	285089	285094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5069	NC_006395	GAC	3	9	285115	285123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5070	NC_006395	ACG	2	6	285149	285154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
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5075	NC_006395	CGA	2	6	285321	285326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
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5080	NC_006395	ACG	2	6	285507	285512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376827
5081	NC_006395	GTC	2	6	285513	285518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376827
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5083	NC_006395	CCG	2	6	285620	285625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376827
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5087	NC_006395	TCG	2	6	286003	286008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5088	NC_006395	CGGGG	2	10	286106	286115	0 %	0 %	80 %	20 %	55376828
5089	NC_006395	CTG	2	6	286125	286130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5090	NC_006395	CAG	2	6	286145	286150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376828
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5092	NC_006395	CGGT	2	8	286180	286187	0 %	25 %	50 %	25 %	55376828
5093	NC_006395	CCTC	2	8	286288	286295	0 %	25 %	0 %	75 %	55376828
5094	NC_006395	TTC	3	9	286308	286316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376828
5095	NC_006395	CGA	2	6	286319	286324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5096	NC_006395	GAG	2	6	286386	286391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376828
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5098	NC_006395	GGCG	2	8	286439	286446	0 %	0 %	75 %	25 %	55376828
5099	NC_006395	CCT	3	9	286460	286468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376828
5100	NC_006395	GGC	2	6	286547	286552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376828
5101	NC_006395	ATC	2	6	286578	286583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376828
5102	NC_006395	TTC	2	6	286587	286592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376828
5103	NC_006395	TCG	2	6	286624	286629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5104	NC_006395	CCG	2	6	286640	286645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376828
5105	NC_006395	CTC	2	6	286647	286652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376828
5106	NC_006395	TCG	2	6	286666	286671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5107	NC_006395	CGT	2	6	286742	286747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5108	NC_006395	CGT	2	6	286754	286759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376828
5109	NC_006395	CGG	2	6	286760	286765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376828
5110	NC_006395	GCG	2	6	286787	286792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376828
5111	NC_006395	CAACTC	2	12	286828	286839	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55376829
5112	NC_006395	GCT	2	6	286868	286873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376829
5113	NC_006395	CAGTC	2	10	286880	286889	20 %	20 %	20 %	40 %	55376829
5114	NC_006395	CGA	2	6	286912	286917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376829
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5119	NC_006395	CT	3	6	287144	287149	0 %	50 %	0 %	50 %	55376829
5120	NC_006395	CGGT	2	8	287200	287207	0 %	25 %	50 %	25 %	55376829
5121	NC_006395	TTC	2	6	287222	287227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376829
5122	NC_006395	GAA	2	6	287240	287245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376829
5123	NC_006395	GCC	2	6	287252	287257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376829
5124	NC_006395	CGA	2	6	287397	287402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376829
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5126	NC_006395	AAT	2	6	287440	287445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376829
5127	NC_006395	GTC	2	6	287483	287488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376829
5128	NC_006395	GGC	2	6	287506	287511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376829
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5132	NC_006395	CG	3	6	287649	287654	0 %	0 %	50 %	50 %	55376829
5133	NC_006395	AATCC	2	10	287657	287666	40 %	20 %	0 %	40 %	55376829
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5143	NC_006395	AC	3	6	288029	288034	50 %	0 %	0 %	50 %	55376830
5144	NC_006395	CA	3	6	288123	288128	50 %	0 %	0 %	50 %	55376830
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5147	NC_006395	CTGGA	2	10	288244	288253	20 %	20 %	40 %	20 %	55376830
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5152	NC_006395	TAC	2	6	288463	288468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376830
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5248	NC_006395	ACTCGC	2	12	294549	294560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376835
5249	NC_006395	CCT	2	6	294595	294600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376835
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5349	NC_006395	GTC	2	6	299016	299021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376838
5350	NC_006395	AGG	2	6	299073	299078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376838
5351	NC_006395	GCG	2	6	299118	299123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376838
5352	NC_006395	TG	3	6	299144	299149	0 %	50 %	50 %	0 %	55376838
5353	NC_006395	GACGAT	2	12	299180	299191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376838
5354	NC_006395	ACG	2	6	299229	299234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376838
5355	NC_006395	GATATC	2	12	299253	299264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376838
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5357	NC_006395	ATA	2	6	299367	299372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376838
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5359	NC_006395	TCG	2	6	299455	299460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376838
5360	NC_006395	CCGA	2	8	299469	299476	25 %	0 %	25 %	50 %	55376838
5361	NC_006395	TCG	2	6	299515	299520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376838
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5363	NC_006395	TCG	2	6	299557	299562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376838
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5488	NC_006395	CGT	2	6	306091	306096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376843
5489	NC_006395	CCG	2	6	306114	306119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376843
5490	NC_006395	CTG	2	6	306123	306128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376843
5491	NC_006395	TTGG	2	8	306202	306209	0 %	50 %	50 %	0 %	55376843
5492	NC_006395	CTC	2	6	306243	306248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376843
5493	NC_006395	AAT	2	6	306404	306409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376844
5494	NC_006395	CGAG	2	8	306444	306451	25 %	0 %	50 %	25 %	55376844
5495	NC_006395	CGA	2	6	306620	306625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376844
5496	NC_006395	CGA	2	6	306637	306642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376844
5497	NC_006395	TC	3	6	306659	306664	0 %	50 %	0 %	50 %	55376844
5498	NC_006395	ACG	3	9	306667	306675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376844
5499	NC_006395	GAC	2	6	306683	306688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376844
5500	NC_006395	GAG	2	6	306690	306695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376844

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