MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 3108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006394	CTG	2	6	101518	101523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376522
2002	NC_006394	TGG	2	6	101648	101653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376522
2003	NC_006394	GTA	2	6	101698	101703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376522
2004	NC_006394	CGG	2	6	101718	101723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376522
2005	NC_006394	CGC	2	6	101755	101760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376522
2006	NC_006394	CGT	2	6	101782	101787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376522
2007	NC_006394	CTGG	2	8	101856	101863	0 %	25 %	50 %	25 %	55376522
2008	NC_006394	GGA	2	6	101889	101894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376522
2009	NC_006394	AAGA	2	8	101926	101933	75 %	0 %	25 %	0 %	55376522
2010	NC_006394	GTGC	2	8	102026	102033	0 %	25 %	50 %	25 %	55376523
2011	NC_006394	TGA	2	6	102035	102040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376523
2012	NC_006394	GGC	2	6	102041	102046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376523
2013	NC_006394	TCC	2	6	102049	102054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376523
2014	NC_006394	CGG	2	6	102085	102090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376523
2015	NC_006394	GCGA	2	8	102124	102131	25 %	0 %	50 %	25 %	55376523
2016	NC_006394	CGT	2	6	102158	102163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376523
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2018	NC_006394	CTC	2	6	102219	102224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376523
2019	NC_006394	CGT	2	6	102294	102299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376523
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2021	NC_006394	CGA	2	6	102335	102340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376523
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2023	NC_006394	AT	3	6	102546	102551	50 %	50 %	0 %	0 %	55376523
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2120	NC_006394	GGTG	2	8	106823	106830	0 %	25 %	75 %	0 %	55376530
2121	NC_006394	GGA	2	6	106838	106843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376530
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2126	NC_006394	CGG	2	6	106997	107002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376530
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2236	NC_006394	CTC	2	6	112536	112541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376537
2237	NC_006394	TGG	2	6	112565	112570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376537
2238	NC_006394	GTCGAA	2	12	112593	112604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376537
2239	NC_006394	GAC	2	6	112632	112637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376537
2240	NC_006394	CGGC	2	8	112638	112645	0 %	0 %	50 %	50 %	55376537
2241	NC_006394	CGA	2	6	112670	112675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376537
2242	NC_006394	CGA	2	6	112697	112702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376537
2243	NC_006394	TCC	2	6	112705	112710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376537
2244	NC_006394	ATG	2	6	112711	112716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376537
2245	NC_006394	TCG	2	6	112729	112734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376537
2246	NC_006394	TCC	2	6	112786	112791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376537
2247	NC_006394	CTCGAA	2	12	112800	112811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376537
2248	NC_006394	GTC	2	6	112821	112826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376537
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2252	NC_006394	GATC	2	8	113119	113126	25 %	25 %	25 %	25 %	55376538
2253	NC_006394	TCAG	2	8	113148	113155	25 %	25 %	25 %	25 %	55376538
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2260	NC_006394	CGA	2	6	113556	113561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376539
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2269	NC_006394	AGC	2	6	113825	113830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376539
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2273	NC_006394	CGCC	2	8	113883	113890	0 %	0 %	25 %	75 %	55376539
2274	NC_006394	CGG	2	6	113940	113945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376539
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2306	NC_006394	CCGAC	2	10	115426	115435	20 %	0 %	20 %	60 %	55376542
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2315	NC_006394	CGA	2	6	115935	115940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376543
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2319	NC_006394	GAG	2	6	116203	116208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376544
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2323	NC_006394	CGA	2	6	116406	116411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376544
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2335	NC_006394	CTT	2	6	117221	117226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376545
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2344	NC_006394	GCGA	2	8	117510	117517	25 %	0 %	50 %	25 %	55376545
2345	NC_006394	GATCGA	2	12	117542	117553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376545
2346	NC_006394	CTT	2	6	117596	117601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376545
2347	NC_006394	AGG	2	6	117610	117615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376545
2348	NC_006394	GAG	2	6	117702	117707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376545
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2350	NC_006394	CGA	2	6	117788	117793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376545
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2352	NC_006394	ACT	2	6	117946	117951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376546
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2355	NC_006394	CCCG	2	8	118163	118170	0 %	0 %	25 %	75 %	55376546
2356	NC_006394	CA	3	6	118304	118309	50 %	0 %	0 %	50 %	55376546
2357	NC_006394	AAG	2	6	118592	118597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376547
2358	NC_006394	CGAA	2	8	118610	118617	50 %	0 %	25 %	25 %	55376547
2359	NC_006394	CCT	2	6	118696	118701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376547
2360	NC_006394	TCG	2	6	118707	118712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376547
2361	NC_006394	CTC	2	6	118754	118759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376547
2362	NC_006394	GAT	2	6	118793	118798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376547
2363	NC_006394	CA	3	6	118997	119002	50 %	0 %	0 %	50 %	55376548
2364	NC_006394	CGC	2	6	119047	119052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376548
2365	NC_006394	TC	3	6	119077	119082	0 %	50 %	0 %	50 %	55376548
2366	NC_006394	CGG	2	6	119113	119118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376548
2367	NC_006394	CGTG	2	8	119121	119128	0 %	25 %	50 %	25 %	55376548
2368	NC_006394	TCGCCG	2	12	119160	119171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376548
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2370	NC_006394	GAG	2	6	119222	119227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376548
2371	NC_006394	GCC	3	9	119243	119251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376548
2372	NC_006394	CGA	2	6	119263	119268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2376	NC_006394	GTC	2	6	119375	119380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2379	NC_006394	TCG	2	6	119424	119429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376548
2380	NC_006394	GCC	2	6	119452	119457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376548
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2384	NC_006394	GAG	3	9	119678	119686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376548
2385	NC_006394	AGC	2	6	119734	119739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2387	NC_006394	TCAG	2	8	119761	119768	25 %	25 %	25 %	25 %	55376548
2388	NC_006394	TCG	2	6	119829	119834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2393	NC_006394	AGG	2	6	120003	120008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376548
2394	NC_006394	ACG	2	6	120060	120065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376548
2395	NC_006394	CAG	2	6	120072	120077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2399	NC_006394	TCG	2	6	120252	120257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376548
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2455	NC_006394	ACG	2	6	122607	122612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2456	NC_006394	AAGCG	2	10	122685	122694	40 %	0 %	40 %	20 %	55376552
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2459	NC_006394	CGG	2	6	122749	122754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376552
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2461	NC_006394	GATGG	2	10	122779	122788	20 %	20 %	60 %	0 %	55376552
2462	NC_006394	TC	3	6	122822	122827	0 %	50 %	0 %	50 %	55376552
2463	NC_006394	AAAG	2	8	122893	122900	75 %	0 %	25 %	0 %	55376552
2464	NC_006394	G	6	6	122974	122979	0 %	0 %	100 %	0 %	55376552
2465	NC_006394	CTT	2	6	123022	123027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376552
2466	NC_006394	TCA	2	6	123042	123047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376552
2467	NC_006394	CGC	2	6	123146	123151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376552
2468	NC_006394	TGA	2	6	123157	123162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376552
2469	NC_006394	GGT	2	6	123164	123169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376552
2470	NC_006394	CGA	2	6	123187	123192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2471	NC_006394	ACGGT	2	10	123246	123255	20 %	20 %	40 %	20 %	55376552
2472	NC_006394	CGA	2	6	123277	123282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2473	NC_006394	GTCG	2	8	123283	123290	0 %	25 %	50 %	25 %	55376552
2474	NC_006394	CGA	2	6	123328	123333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2475	NC_006394	CGG	2	6	123340	123345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376552
2476	NC_006394	CTC	2	6	123368	123373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376552
2477	NC_006394	GAG	2	6	123431	123436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376552
2478	NC_006394	CAT	2	6	123457	123462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376552
2479	NC_006394	GGT	2	6	123538	123543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376552
2480	NC_006394	G	6	6	123558	123563	0 %	0 %	100 %	0 %	55376552
2481	NC_006394	CGC	2	6	123645	123650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376552
2482	NC_006394	GGC	2	6	123665	123670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376552
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2484	NC_006394	CCG	2	6	123783	123788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376552
2485	NC_006394	GTC	2	6	123797	123802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2486	NC_006394	CGA	2	6	123814	123819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2487	NC_006394	CGA	2	6	123898	123903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2488	NC_006394	GAT	2	6	123929	123934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376552
2489	NC_006394	CGA	2	6	123979	123984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2490	NC_006394	CGA	2	6	124015	124020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2491	NC_006394	CGA	2	6	124045	124050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376552
2492	NC_006394	GTT	2	6	124091	124096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376552
2493	NC_006394	ATCGGT	2	12	124121	124132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376552
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