MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 3108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006394	CGG	2	6	23212	23217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376440
502	NC_006394	CATC	2	8	23245	23252	25 %	25 %	0 %	50 %	55376440
503	NC_006394	ACG	2	6	23268	23273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376440
504	NC_006394	CGA	2	6	23308	23313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376440
505	NC_006394	CTC	2	6	23437	23442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376440
506	NC_006394	ATC	2	6	23526	23531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376440
507	NC_006394	ATG	2	6	23556	23561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376440
508	NC_006394	ACA	2	6	23694	23699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376440
509	NC_006394	G	6	6	23704	23709	0 %	0 %	100 %	0 %	55376440
510	NC_006394	C	6	6	23771	23776	0 %	0 %	0 %	100 %	55376440
511	NC_006394	GTCA	2	8	23811	23818	25 %	25 %	25 %	25 %	55376441
512	NC_006394	CGT	2	6	23819	23824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376441
513	NC_006394	GAC	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376441
514	NC_006394	ATC	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376441
515	NC_006394	GATT	2	8	24026	24033	25 %	50 %	25 %	0 %	55376441
516	NC_006394	CCA	2	6	24046	24051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376441
517	NC_006394	TCG	2	6	24121	24126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376441
518	NC_006394	CGG	2	6	24134	24139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376441
519	NC_006394	TC	3	6	24173	24178	0 %	50 %	0 %	50 %	55376441
520	NC_006394	CCGT	2	8	24233	24240	0 %	25 %	25 %	50 %	55376441
521	NC_006394	CGA	2	6	24272	24277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376441
522	NC_006394	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376441
523	NC_006394	CGA	2	6	24326	24331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376441
524	NC_006394	T	6	6	24410	24415	0 %	100 %	0 %	0 %	55376441
525	NC_006394	TTG	2	6	24442	24447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376441
526	NC_006394	TGG	2	6	24464	24469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376441
527	NC_006394	GTT	2	6	24640	24645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376442
528	NC_006394	CTG	2	6	24666	24671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376442
529	NC_006394	ACC	2	6	24678	24683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376442
530	NC_006394	AGT	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376442
531	NC_006394	AGC	2	6	24774	24779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376442
532	NC_006394	CAG	2	6	24786	24791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376442
533	NC_006394	CGT	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376442
534	NC_006394	CGC	2	6	24805	24810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376442
535	NC_006394	GTCA	2	8	24813	24820	25 %	25 %	25 %	25 %	55376442
536	NC_006394	TGC	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376442
537	NC_006394	CGG	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376442
538	NC_006394	TG	3	6	25009	25014	0 %	50 %	50 %	0 %	55376442
539	NC_006394	CGA	2	6	25036	25041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376442
540	NC_006394	TCT	2	6	25048	25053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376442
541	NC_006394	GACG	2	8	25064	25071	25 %	0 %	50 %	25 %	55376442
542	NC_006394	ACGG	2	8	25081	25088	25 %	0 %	50 %	25 %	55376442
543	NC_006394	GTC	2	6	25127	25132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376442
544	NC_006394	GGA	2	6	25154	25159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376442
545	NC_006394	GTC	2	6	25173	25178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376442
546	NC_006394	CTC	2	6	25265	25270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376443
547	NC_006394	AGT	2	6	25312	25317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376443
548	NC_006394	CGT	2	6	25327	25332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376443
549	NC_006394	GCC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376443
550	NC_006394	AGT	2	6	25749	25754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376444
551	NC_006394	GTG	2	6	25800	25805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376444
552	NC_006394	CGT	2	6	25911	25916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376444
553	NC_006394	CTCGT	2	10	25978	25987	0 %	40 %	20 %	40 %	55376444
554	NC_006394	AGC	2	6	25992	25997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376444
555	NC_006394	TCCGT	2	10	26063	26072	0 %	40 %	20 %	40 %	55376444
556	NC_006394	GAT	2	6	26247	26252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376444
557	NC_006394	TGT	2	6	26303	26308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376444
558	NC_006394	C	7	7	26371	26377	0 %	0 %	0 %	100 %	55376444
559	NC_006394	GAG	2	6	26394	26399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376444
560	NC_006394	GCGAC	2	10	26426	26435	20 %	0 %	40 %	40 %	55376444
561	NC_006394	AGG	2	6	26539	26544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376444
562	NC_006394	CGCC	2	8	26550	26557	0 %	0 %	25 %	75 %	55376444
563	NC_006394	GCTC	2	8	26566	26573	0 %	25 %	25 %	50 %	55376444
564	NC_006394	TCG	2	6	26675	26680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376445
565	NC_006394	CGT	2	6	26757	26762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376445
566	NC_006394	CGA	2	6	26877	26882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376445
567	NC_006394	GGA	2	6	26988	26993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376445
568	NC_006394	GTC	2	6	26994	26999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376445
569	NC_006394	CCG	3	9	27090	27098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376446
570	NC_006394	TCG	2	6	27205	27210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376446
571	NC_006394	CGA	2	6	27238	27243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376446
572	NC_006394	TCG	2	6	27249	27254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376446
573	NC_006394	GT	3	6	27262	27267	0 %	50 %	50 %	0 %	55376446
574	NC_006394	TCGGTT	2	12	27324	27335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376446
575	NC_006394	CGT	2	6	27344	27349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376446
576	NC_006394	ACG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376446
577	NC_006394	TTG	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376446
578	NC_006394	CGG	2	6	27484	27489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376446
579	NC_006394	GTC	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376446
580	NC_006394	GTA	2	6	27520	27525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376446
581	NC_006394	CGA	2	6	27531	27536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376446
582	NC_006394	ATG	2	6	28143	28148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376447
583	NC_006394	TA	3	6	28164	28169	50 %	50 %	0 %	0 %	55376447
584	NC_006394	GCA	2	6	28232	28237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376447
585	NC_006394	GTG	2	6	28253	28258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376447
586	NC_006394	CTCG	2	8	28270	28277	0 %	25 %	25 %	50 %	55376447
587	NC_006394	CAG	2	6	28293	28298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376447
588	NC_006394	GAG	2	6	28340	28345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376447
589	NC_006394	CCA	2	6	28366	28371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376447
590	NC_006394	GA	3	6	28408	28413	50 %	0 %	50 %	0 %	55376447
591	NC_006394	CAT	2	6	28426	28431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376447
592	NC_006394	TC	3	6	28440	28445	0 %	50 %	0 %	50 %	55376447
593	NC_006394	CTA	2	6	28500	28505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376447
594	NC_006394	GGAT	2	8	28534	28541	25 %	25 %	50 %	0 %	55376447
595	NC_006394	ACG	2	6	28542	28547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376447
596	NC_006394	ATG	2	6	28593	28598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376447
597	NC_006394	GGA	2	6	28708	28713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376447
598	NC_006394	CAG	2	6	28778	28783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376447
599	NC_006394	TGAC	2	8	28806	28813	25 %	25 %	25 %	25 %	55376447
600	NC_006394	TCG	2	6	28855	28860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376447
601	NC_006394	A	6	6	28946	28951	100 %	0 %	0 %	0 %	55376447
602	NC_006394	TTC	2	6	28965	28970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376447
603	NC_006394	GTC	2	6	29276	29281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376448
604	NC_006394	CGA	2	6	29350	29355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376448
605	NC_006394	GAT	2	6	29381	29386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376448
606	NC_006394	GCCC	2	8	29387	29394	0 %	0 %	25 %	75 %	55376448
607	NC_006394	ACG	3	9	29487	29495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376448
608	NC_006394	CCG	2	6	29514	29519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376448
609	NC_006394	GAG	2	6	29573	29578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376449
610	NC_006394	CGC	2	6	29641	29646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376449
611	NC_006394	GCC	2	6	29720	29725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376449
612	NC_006394	TGA	2	6	29737	29742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376449
613	NC_006394	AGA	2	6	29746	29751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376449
614	NC_006394	CAT	2	6	29756	29761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376449
615	NC_006394	GGC	2	6	29777	29782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376449
616	NC_006394	CCG	2	6	29922	29927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376449
617	NC_006394	CCA	2	6	29987	29992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376449
618	NC_006394	CGG	2	6	29995	30000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376449
619	NC_006394	AGC	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376449
620	NC_006394	ACG	2	6	30052	30057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376449
621	NC_006394	GGAT	2	8	30082	30089	25 %	25 %	50 %	0 %	55376449
622	NC_006394	GAT	2	6	30215	30220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376450
623	NC_006394	AAG	2	6	30225	30230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376450
624	NC_006394	TG	3	6	30258	30263	0 %	50 %	50 %	0 %	55376450
625	NC_006394	TGA	2	6	30287	30292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376450
626	NC_006394	TCC	2	6	30450	30455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376451
627	NC_006394	TCG	2	6	30474	30479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376451
628	NC_006394	CAAA	2	8	30497	30504	75 %	0 %	0 %	25 %	55376451
629	NC_006394	GGA	2	6	30515	30520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376451
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746	NC_006394	GGGTC	2	10	37122	37131	0 %	20 %	60 %	20 %	55376457
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750	NC_006394	GAAGCG	2	12	37252	37263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376457
751	NC_006394	GTC	2	6	37303	37308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376457
752	NC_006394	CGTC	2	8	37311	37318	0 %	25 %	25 %	50 %	55376457
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