MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	GC	3	6	893	898	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
2	NC_006393	CG	3	6	1013	1018	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
3	NC_006393	CT	3	6	1318	1323	0 %	50 %	0 %	50 %	55376282
4	NC_006393	GC	3	6	1522	1527	0 %	0 %	50 %	50 %	55376282
5	NC_006393	GC	3	6	2690	2695	0 %	0 %	50 %	50 %	55376283
6	NC_006393	GA	3	6	2888	2893	50 %	0 %	50 %	0 %	55376283
7	NC_006393	TG	3	6	3769	3774	0 %	50 %	50 %	0 %	55376284
8	NC_006393	CG	3	6	5709	5714	0 %	0 %	50 %	50 %	55376286
9	NC_006393	TC	3	6	7389	7394	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
10	NC_006393	CT	3	6	7814	7819	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
11	NC_006393	GA	3	6	11533	11538	50 %	0 %	50 %	0 %	55376289
12	NC_006393	AG	3	6	11881	11886	50 %	0 %	50 %	0 %	55376290
13	NC_006393	GT	3	6	11994	11999	0 %	50 %	50 %	0 %	55376290
14	NC_006393	CT	4	8	13215	13222	0 %	50 %	0 %	50 %	55376291
15	NC_006393	GC	3	6	14986	14991	0 %	0 %	50 %	50 %	55376293
16	NC_006393	CT	3	6	15630	15635	0 %	50 %	0 %	50 %	55376293
17	NC_006393	AT	4	8	15672	15679	50 %	50 %	0 %	0 %	55376293
18	NC_006393	TG	3	6	16465	16470	0 %	50 %	50 %	0 %	55376294
19	NC_006393	CG	4	8	16966	16973	0 %	0 %	50 %	50 %	55376294
20	NC_006393	GT	3	6	17272	17277	0 %	50 %	50 %	0 %	55376294
21	NC_006393	GC	3	6	18357	18362	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
22	NC_006393	CG	3	6	18386	18391	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
23	NC_006393	GA	3	6	18426	18431	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
24	NC_006393	GA	3	6	18848	18853	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
25	NC_006393	GC	3	6	19159	19164	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
26	NC_006393	AG	3	6	21326	21331	50 %	0 %	50 %	0 %	55376298
27	NC_006393	AC	3	6	21364	21369	50 %	0 %	0 %	50 %	55376298
28	NC_006393	GA	3	6	22769	22774	50 %	0 %	50 %	0 %	55376300
29	NC_006393	AC	3	6	25884	25889	50 %	0 %	0 %	50 %	55376302
30	NC_006393	AC	3	6	25920	25925	50 %	0 %	0 %	50 %	55376302
31	NC_006393	AC	3	6	26626	26631	50 %	0 %	0 %	50 %	55376304
32	NC_006393	GT	3	6	26737	26742	0 %	50 %	50 %	0 %	55376304
33	NC_006393	GA	3	6	27072	27077	50 %	0 %	50 %	0 %	55376304
34	NC_006393	GC	4	8	29427	29434	0 %	0 %	50 %	50 %	55376306
35	NC_006393	GC	3	6	29449	29454	0 %	0 %	50 %	50 %	55376306
36	NC_006393	AC	3	6	30268	30273	50 %	0 %	0 %	50 %	55376308
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40	NC_006393	GA	3	6	33029	33034	50 %	0 %	50 %	0 %	55376314
41	NC_006393	GA	3	6	34436	34441	50 %	0 %	50 %	0 %	55376315
42	NC_006393	GA	3	6	35285	35290	50 %	0 %	50 %	0 %	55376316
43	NC_006393	CT	3	6	35393	35398	0 %	50 %	0 %	50 %	55376316
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46	NC_006393	GA	3	6	36269	36274	50 %	0 %	50 %	0 %	55376317
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51	NC_006393	AG	3	6	44562	44567	50 %	0 %	50 %	0 %	55376326
52	NC_006393	AT	3	6	44793	44798	50 %	50 %	0 %	0 %	55376326
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65	NC_006393	AG	3	6	52613	52618	50 %	0 %	50 %	0 %	55376336
66	NC_006393	AG	3	6	52921	52926	50 %	0 %	50 %	0 %	55376336
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70	NC_006393	AT	3	6	59290	59295	50 %	50 %	0 %	0 %	55376340
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72	NC_006393	AG	3	6	59730	59735	50 %	0 %	50 %	0 %	55376341
73	NC_006393	AG	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	55376341
74	NC_006393	AT	3	6	63166	63171	50 %	50 %	0 %	0 %	55376342
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92	NC_006393	AT	3	6	77391	77396	50 %	50 %	0 %	0 %	55376356
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110	NC_006393	AC	4	8	89173	89180	50 %	0 %	0 %	50 %	55376366
111	NC_006393	TC	3	6	89184	89189	0 %	50 %	0 %	50 %	55376366
112	NC_006393	CT	3	6	89779	89784	0 %	50 %	0 %	50 %	55376367
113	NC_006393	AC	3	6	90585	90590	50 %	0 %	0 %	50 %	55376368
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115	NC_006393	GA	3	6	90863	90868	50 %	0 %	50 %	0 %	55376368
116	NC_006393	CG	3	6	91154	91159	0 %	0 %	50 %	50 %	55376370
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126	NC_006393	CT	3	6	97357	97362	0 %	50 %	0 %	50 %	55376377
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.