MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 1455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	ACC	2	6	381	386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376281
2	NC_006393	AGC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
3	NC_006393	TGA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376281
4	NC_006393	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
5	NC_006393	GCT	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
6	NC_006393	GAG	2	6	778	783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376281
7	NC_006393	CTT	2	6	794	799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376281
8	NC_006393	CCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376281
9	NC_006393	GCT	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
10	NC_006393	GGC	2	6	978	983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376281
11	NC_006393	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
12	NC_006393	CGA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
13	NC_006393	CGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
14	NC_006393	TCG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
15	NC_006393	GCG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376282
16	NC_006393	TCG	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
17	NC_006393	TCG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
18	NC_006393	TGA	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376282
19	NC_006393	GCT	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
20	NC_006393	TCG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
21	NC_006393	CAG	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
22	NC_006393	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
23	NC_006393	CAG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
24	NC_006393	CAG	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
25	NC_006393	CCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376282
26	NC_006393	CAC	2	6	2000	2005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376283
27	NC_006393	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
28	NC_006393	ACG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
29	NC_006393	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
30	NC_006393	CTG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
31	NC_006393	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
32	NC_006393	CGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
33	NC_006393	AGT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376283
34	NC_006393	CGT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
35	NC_006393	CGG	2	6	2471	2476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
36	NC_006393	CTT	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376283
37	NC_006393	ACG	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
38	NC_006393	GCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
39	NC_006393	GTC	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
40	NC_006393	CGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
41	NC_006393	GTC	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
42	NC_006393	ACG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
43	NC_006393	CGT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
44	NC_006393	CTG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
45	NC_006393	GCA	3	9	4842	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
46	NC_006393	CGC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
47	NC_006393	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376285
48	NC_006393	CCG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
49	NC_006393	TCA	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
50	NC_006393	TAC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
51	NC_006393	GAC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
52	NC_006393	GTC	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
53	NC_006393	GAC	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
54	NC_006393	CTG	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
55	NC_006393	CCG	2	6	5823	5828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376286
56	NC_006393	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
57	NC_006393	GAA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
58	NC_006393	TCG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376286
59	NC_006393	GGC	2	6	5935	5940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376286
60	NC_006393	GAC	2	6	5945	5950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376286
61	NC_006393	TTC	2	6	6041	6046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376286
62	NC_006393	ACC	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376286
63	NC_006393	ATT	2	6	6117	6122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376286
64	NC_006393	GAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
65	NC_006393	CAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
66	NC_006393	GAA	2	6	7319	7324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376287
67	NC_006393	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
68	NC_006393	AAC	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
69	NC_006393	CTC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376287
70	NC_006393	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
71	NC_006393	TTG	2	6	7728	7733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
72	NC_006393	GGC	2	6	7780	7785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376287
73	NC_006393	GCA	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
74	NC_006393	GTG	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
75	NC_006393	ACC	2	6	7913	7918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376287
76	NC_006393	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
77	NC_006393	GGT	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
78	NC_006393	CGA	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
79	NC_006393	ACA	2	6	8232	8237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
80	NC_006393	GAC	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
81	NC_006393	GCA	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
82	NC_006393	CCA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376288
83	NC_006393	CAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
84	NC_006393	AGC	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
85	NC_006393	CAA	2	6	8666	8671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
86	NC_006393	TTG	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376288
87	NC_006393	CGG	2	6	8695	8700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376288
88	NC_006393	TCA	2	6	8744	8749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
89	NC_006393	TAG	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
90	NC_006393	ATC	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
91	NC_006393	TCG	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
92	NC_006393	ACT	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
93	NC_006393	TGC	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
94	NC_006393	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
95	NC_006393	GGA	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376288
96	NC_006393	ACT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
97	NC_006393	AGC	2	6	9331	9336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
98	NC_006393	GAT	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
99	NC_006393	GAA	2	6	9440	9445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376288
100	NC_006393	AAC	2	6	9508	9513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
101	NC_006393	ACA	3	9	9554	9562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
102	NC_006393	GAT	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
103	NC_006393	TGA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
104	NC_006393	TAT	2	6	9676	9681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376288
105	NC_006393	GAT	2	6	9767	9772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
106	NC_006393	ATG	2	6	9789	9794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
107	NC_006393	CGA	2	6	9841	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
108	NC_006393	GGC	2	6	9959	9964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376288
109	NC_006393	CTT	2	6	10088	10093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376288
110	NC_006393	CCT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376288
111	NC_006393	AGA	2	6	10252	10257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376288
112	NC_006393	TGG	2	6	10312	10317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376288
113	NC_006393	AAC	2	6	10339	10344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
114	NC_006393	ATT	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376288
115	NC_006393	AAC	2	6	10520	10525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
116	NC_006393	TGA	2	6	10640	10645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376289
117	NC_006393	CGA	2	6	10688	10693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376289
118	NC_006393	GCG	2	6	10809	10814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376289
119	NC_006393	GTC	2	6	10908	10913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376289
120	NC_006393	CAG	2	6	10959	10964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376289
121	NC_006393	TCT	2	6	11062	11067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376289
122	NC_006393	AGT	2	6	11147	11152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376289
123	NC_006393	GGC	2	6	11259	11264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376289
124	NC_006393	CGA	2	6	11270	11275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376289
125	NC_006393	GGT	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376289
126	NC_006393	TCG	2	6	11290	11295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376289
127	NC_006393	ACG	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376289
128	NC_006393	CGG	2	6	11343	11348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376289
129	NC_006393	CAG	2	6	11399	11404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376289
130	NC_006393	GGA	2	6	11438	11443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376289
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249	NC_006393	GAG	2	6	20671	20676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376296
250	NC_006393	CGA	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376297
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252	NC_006393	ACT	2	6	20980	20985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376297
253	NC_006393	GGT	2	6	20990	20995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376297
254	NC_006393	CGA	2	6	21200	21205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376298
255	NC_006393	CCA	2	6	21215	21220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376298
256	NC_006393	CGA	2	6	21305	21310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376298
257	NC_006393	GCT	2	6	21320	21325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376298
258	NC_006393	ACG	2	6	21385	21390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376298
259	NC_006393	GAC	2	6	21393	21398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376298
260	NC_006393	CGA	2	6	21476	21481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376298
261	NC_006393	TAC	3	9	21489	21497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376298
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263	NC_006393	CCG	2	6	21927	21932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376299
264	NC_006393	AAG	2	6	21990	21995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376299
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269	NC_006393	GGC	2	6	22143	22148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376299
270	NC_006393	ACG	2	6	22301	22306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376299
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272	NC_006393	GCG	2	6	22591	22596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376300
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275	NC_006393	TCC	2	6	22714	22719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376300
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284	NC_006393	CTG	2	6	23178	23183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376301
285	NC_006393	GAG	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376301
286	NC_006393	GTG	2	6	23312	23317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376301
287	NC_006393	TCT	2	6	23414	23419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376301
288	NC_006393	CGA	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376301
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323	NC_006393	AAG	2	6	27119	27124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376304
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372	NC_006393	CGT	3	9	31622	31630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376310
373	NC_006393	GCC	2	6	31925	31930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376311
374	NC_006393	ACT	2	6	31967	31972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376311
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