MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	GGCGAC	2	12	2585	2596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376188
2	NC_006391	CGGTCA	2	12	2961	2972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376188
3	NC_006391	TCACTG	2	12	7877	7888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376195
4	NC_006391	TCGCCA	2	12	9777	9788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376196
5	NC_006391	TGCTGG	2	12	11173	11184	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376199
6	NC_006391	CAGCCA	2	12	12715	12726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55376199
7	NC_006391	CGACGC	2	12	13042	13053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376201
8	NC_006391	CGACGG	2	12	18450	18461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376209
9	NC_006391	CCCGAT	2	12	18901	18912	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376209
10	NC_006391	TCGACG	2	12	19454	19465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376209
11	NC_006391	CTCCAT	2	12	24329	24340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55376211
12	NC_006391	CGACCT	2	12	30012	30023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376218
13	NC_006391	CGGCAA	2	12	32235	32246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376221
14	NC_006391	GTTGCT	2	12	32419	32430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376221
15	NC_006391	GAACAG	2	12	32521	32532	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55376222
16	NC_006391	GGCGAC	2	12	32572	32583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376222
17	NC_006391	GAAACT	2	12	33595	33606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55376223
18	NC_006391	GGCGAC	2	12	34247	34258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376223
19	NC_006391	GGGCTG	2	12	34535	34546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55376223
20	NC_006391	CGGGGC	2	12	37063	37074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376226
21	NC_006391	CGCGGA	2	12	37673	37684	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376226
22	NC_006391	CAAGAC	2	12	38975	38986	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.