MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	AGG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
2	NC_006390	CCG	2	6	447	452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
3	NC_006390	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
4	NC_006390	CCA	2	6	557	562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376145
5	NC_006390	GTG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376145
6	NC_006390	CCG	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
7	NC_006390	GAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
8	NC_006390	CGA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
9	NC_006390	GAG	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376146
10	NC_006390	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376146
11	NC_006390	GAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376146
12	NC_006390	AGC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376146
13	NC_006390	TGT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376146
14	NC_006390	CTG	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376147
15	NC_006390	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
16	NC_006390	CGA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
17	NC_006390	AAG	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
18	NC_006390	ACA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376147
19	NC_006390	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
20	NC_006390	CTC	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376147
21	NC_006390	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
22	NC_006390	GTG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
23	NC_006390	GGT	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
24	NC_006390	CGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376147
25	NC_006390	GAG	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376147
26	NC_006390	TCC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376148
27	NC_006390	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376148
28	NC_006390	ACG	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
29	NC_006390	CTT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
30	NC_006390	TGG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376148
31	NC_006390	TCT	2	6	2665	2670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
32	NC_006390	ACG	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
33	NC_006390	GTA	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376149
34	NC_006390	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
35	NC_006390	GTT	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376149
36	NC_006390	CTG	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
37	NC_006390	TGC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
38	NC_006390	GCT	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
39	NC_006390	TGC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376150
40	NC_006390	CAC	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376150
41	NC_006390	CGA	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376150
42	NC_006390	CAA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376150
43	NC_006390	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376150
44	NC_006390	CAC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
45	NC_006390	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
46	NC_006390	CAC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
47	NC_006390	CGA	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
48	NC_006390	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
49	NC_006390	CAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
50	NC_006390	GTC	2	6	4195	4200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
51	NC_006390	TGA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376151
52	NC_006390	ACC	3	9	4243	4251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
53	NC_006390	CGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
54	NC_006390	CAC	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
55	NC_006390	GAC	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
56	NC_006390	AGG	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376151
57	NC_006390	CGT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
58	NC_006390	CGA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
59	NC_006390	CTC	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376151
60	NC_006390	GAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
61	NC_006390	TCG	3	9	4868	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
62	NC_006390	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
63	NC_006390	GAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
64	NC_006390	AGC	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
65	NC_006390	TCG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
66	NC_006390	CGA	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
67	NC_006390	GTT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376152
68	NC_006390	GAC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
69	NC_006390	GAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376152
70	NC_006390	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
71	NC_006390	CAG	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
72	NC_006390	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
73	NC_006390	TAC	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376152
74	NC_006390	CGG	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376153
75	NC_006390	GCT	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376154
76	NC_006390	TGA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
77	NC_006390	TGG	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376154
78	NC_006390	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376154
79	NC_006390	AGT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
80	NC_006390	CAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376155
81	NC_006390	TCT	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376155
82	NC_006390	TGA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376155
83	NC_006390	TCG	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
84	NC_006390	TCC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376155
85	NC_006390	CTG	2	6	6777	6782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
86	NC_006390	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376156
87	NC_006390	TCT	2	6	7367	7372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376156
88	NC_006390	TCG	2	6	7441	7446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
89	NC_006390	TCA	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376156
90	NC_006390	CTC	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376156
91	NC_006390	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376156
92	NC_006390	GTC	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
93	NC_006390	TCG	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
94	NC_006390	TCG	2	6	7633	7638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
95	NC_006390	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376157
96	NC_006390	CGT	2	6	7702	7707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
97	NC_006390	GCT	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
98	NC_006390	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376157
99	NC_006390	TGC	2	6	7821	7826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
100	NC_006390	TCG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
101	NC_006390	TGG	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376157
102	NC_006390	ATC	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376157
103	NC_006390	TCG	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
104	NC_006390	ACG	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376157
105	NC_006390	CCG	2	6	8334	8339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376157
106	NC_006390	TCG	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
107	NC_006390	GTT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376158
108	NC_006390	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
109	NC_006390	TGC	2	6	8841	8846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376158
110	NC_006390	GAT	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
111	NC_006390	AAC	2	6	8910	8915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
112	NC_006390	CAA	2	6	8925	8930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
113	NC_006390	ACA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
114	NC_006390	AGC	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376158
115	NC_006390	TGG	2	6	8976	8981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376158
116	NC_006390	AGT	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
117	NC_006390	GTT	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376159
118	NC_006390	AAC	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376159
119	NC_006390	CGG	2	6	9589	9594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376159
120	NC_006390	GTC	2	6	9599	9604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376159
121	NC_006390	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376159
122	NC_006390	TGA	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376159
123	NC_006390	ACG	2	6	9702	9707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376159
124	NC_006390	CCA	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376159
125	NC_006390	TGA	2	6	9838	9843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376159
126	NC_006390	TGT	2	6	9892	9897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376159
127	NC_006390	GAC	2	6	9980	9985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376159
128	NC_006390	GTT	2	6	10034	10039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376159
129	NC_006390	GTA	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376160
130	NC_006390	CTT	2	6	10404	10409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376160
131	NC_006390	CTT	2	6	10825	10830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376161
132	NC_006390	CTT	2	6	10879	10884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376161
133	NC_006390	CTT	2	6	10933	10938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376161
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257	NC_006390	GTC	2	6	19397	19402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376170
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381	NC_006390	CGC	2	6	30638	30643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376182
382	NC_006390	TCG	2	6	30673	30678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376182
383	NC_006390	TCA	2	6	30680	30685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376182
384	NC_006390	TAT	2	6	30814	30819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376183
385	NC_006390	AGT	2	6	30881	30886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376183
386	NC_006390	CGT	2	6	31016	31021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376184
387	NC_006390	CCG	2	6	31076	31081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376184
388	NC_006390	CCT	2	6	31133	31138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376184
389	NC_006390	CGT	2	6	31175	31180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376184
390	NC_006390	CAG	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376184
391	NC_006390	CGC	2	6	31233	31238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376184
392	NC_006390	GAC	2	6	31424	31429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376185
393	NC_006390	CAC	2	6	31484	31489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376185
394	NC_006390	TCA	2	6	31680	31685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376185
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396	NC_006390	TCG	2	6	32028	32033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
397	NC_006390	CGA	2	6	32053	32058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376186
398	NC_006390	TCG	2	6	32070	32075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
399	NC_006390	TCG	2	6	32077	32082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
400	NC_006390	GAG	2	6	32219	32224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376186
401	NC_006390	GTC	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
402	NC_006390	TCG	2	6	32493	32498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
403	NC_006390	TGC	2	6	32561	32566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
404	NC_006390	ACC	2	6	32578	32583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376186
405	NC_006390	ACG	2	6	32700	32705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376186
406	NC_006390	TCG	2	6	32787	32792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
407	NC_006390	TCG	2	6	32802	32807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
408	NC_006390	CGC	2	6	32845	32850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376186
409	NC_006390	CGT	2	6	32864	32869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
410	NC_006390	GCC	3	9	32881	32889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376186
411	NC_006390	GGC	2	6	32905	32910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376186
412	NC_006390	TCG	2	6	32928	32933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376186
413	NC_006390	CGG	2	6	32965	32970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376186
414	NC_006390	CGG	2	6	33049	33054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376186
415	NC_006390	GAT	2	6	33209	33214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376186
416	NC_006390	TCT	2	6	33232	33237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.