MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	AC	3	6	1387	1392	50 %	0 %	0 %	50 %	55376109
2	NC_006389	TC	3	6	1438	1443	0 %	50 %	0 %	50 %	55376109
3	NC_006389	TG	3	6	3796	3801	0 %	50 %	50 %	0 %	55376111
4	NC_006389	AT	3	6	4284	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	55376112
5	NC_006389	TC	3	6	4679	4684	0 %	50 %	0 %	50 %	55376112
6	NC_006389	CT	3	6	5557	5562	0 %	50 %	0 %	50 %	55376113
7	NC_006389	TG	3	6	7719	7724	0 %	50 %	50 %	0 %	55376116
8	NC_006389	TC	3	6	8471	8476	0 %	50 %	0 %	50 %	55376116
9	NC_006389	CG	3	6	9299	9304	0 %	0 %	50 %	50 %	55376117
10	NC_006389	CA	3	6	10780	10785	50 %	0 %	0 %	50 %	55376118
11	NC_006389	CG	4	8	12335	12342	0 %	0 %	50 %	50 %	55376121
12	NC_006389	AC	3	6	13166	13171	50 %	0 %	0 %	50 %	55376123
13	NC_006389	CA	3	6	16375	16380	50 %	0 %	0 %	50 %	55376126
14	NC_006389	AG	3	6	18571	18576	50 %	0 %	50 %	0 %	55376128
15	NC_006389	GA	3	6	19751	19756	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
16	NC_006389	GA	3	6	19829	19834	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
17	NC_006389	GC	3	6	20031	20036	0 %	0 %	50 %	50 %	55376130
18	NC_006389	GA	3	6	20354	20359	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
19	NC_006389	CG	3	6	20454	20459	0 %	0 %	50 %	50 %	55376130
20	NC_006389	AT	3	6	20689	20694	50 %	50 %	0 %	0 %	55376130
21	NC_006389	CA	3	6	21408	21413	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
22	NC_006389	CA	3	6	21448	21453	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
23	NC_006389	GA	3	6	22433	22438	50 %	0 %	50 %	0 %	55376132
24	NC_006389	GA	3	6	24221	24226	50 %	0 %	50 %	0 %	55376133
25	NC_006389	AT	3	6	24760	24765	50 %	50 %	0 %	0 %	55376133
26	NC_006389	GC	4	8	25702	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	55376134
27	NC_006389	AC	3	6	27168	27173	50 %	0 %	0 %	50 %	55376139
28	NC_006389	CA	3	6	27408	27413	50 %	0 %	0 %	50 %	55376140
29	NC_006389	CG	3	6	27790	27795	0 %	0 %	50 %	50 %	55376141
30	NC_006389	GA	3	6	29318	29323	50 %	0 %	50 %	0 %	55376141
31	NC_006389	TC	3	6	31640	31645	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
32	NC_006389	TA	3	6	31655	31660	50 %	50 %	0 %	0 %	55376142
33	NC_006389	TC	3	6	31713	31718	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
34	NC_006389	TC	3	6	31800	31805	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
35	NC_006389	GA	3	6	32244	32249	50 %	0 %	50 %	0 %	55376142

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.