MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT plasmid pHS129

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006298	TCA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421263
2	NC_006298	CCG	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52421263
3	NC_006298	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	52421263
4	NC_006298	AAC	2	6	536	541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421263
5	NC_006298	TGA	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421264
6	NC_006298	AAC	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421264
7	NC_006298	ATC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
8	NC_006298	TCA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
9	NC_006298	GTT	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421264
10	NC_006298	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
11	NC_006298	TAT	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421264
12	NC_006298	TAA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
13	NC_006298	AAC	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421265
14	NC_006298	TGA	3	9	3554	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421265
15	NC_006298	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
16	NC_006298	ATT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
17	NC_006298	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421265
18	NC_006298	ATC	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421265
19	NC_006298	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52421266
20	NC_006298	TAA	2	6	4485	4490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421266
21	NC_006298	ATG	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421267
22	NC_006298	GCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52421267
23	NC_006298	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.