MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT plasmid pHS129

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006298	TCA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421263
2	NC_006298	CCG	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52421263
3	NC_006298	CACT	2	8	372	379	25 %	25 %	0 %	50 %	52421263
4	NC_006298	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	52421263
5	NC_006298	TTGC	2	8	492	499	0 %	50 %	25 %	25 %	52421263
6	NC_006298	AAC	2	6	536	541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421263
7	NC_006298	CGAT	2	8	606	613	25 %	25 %	25 %	25 %	52421264
8	NC_006298	TGA	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421264
9	NC_006298	T	6	6	630	635	0 %	100 %	0 %	0 %	52421264
10	NC_006298	AAC	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421264
11	NC_006298	T	7	7	849	855	0 %	100 %	0 %	0 %	52421264
12	NC_006298	T	6	6	864	869	0 %	100 %	0 %	0 %	52421264
13	NC_006298	ATC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
14	NC_006298	TCA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
15	NC_006298	GAATA	2	10	1100	1109	60 %	20 %	20 %	0 %	52421264
16	NC_006298	AAAT	2	8	1176	1183	75 %	25 %	0 %	0 %	52421264
17	NC_006298	GAAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	52421264
18	NC_006298	GTT	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421264
19	NC_006298	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
20	NC_006298	TTAAA	2	10	1358	1367	60 %	40 %	0 %	0 %	52421264
21	NC_006298	TAT	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421264
22	NC_006298	TAA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
23	NC_006298	AAC	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421265
24	NC_006298	G	6	6	3472	3477	0 %	0 %	100 %	0 %	52421265
25	NC_006298	GCAA	2	8	3513	3520	50 %	0 %	25 %	25 %	52421265
26	NC_006298	A	6	6	3548	3553	100 %	0 %	0 %	0 %	52421265
27	NC_006298	TGA	3	9	3554	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421265
28	NC_006298	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
29	NC_006298	GT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	50 %	0 %	52421265
30	NC_006298	ATT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
31	NC_006298	AAAT	2	8	3824	3831	75 %	25 %	0 %	0 %	52421265
32	NC_006298	A	6	6	3969	3974	100 %	0 %	0 %	0 %	52421265
33	NC_006298	A	7	7	3983	3989	100 %	0 %	0 %	0 %	52421265
34	NC_006298	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421265
35	NC_006298	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	52421265
36	NC_006298	ATC	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421265
37	NC_006298	ATCG	2	8	4225	4232	25 %	25 %	25 %	25 %	52421265
38	NC_006298	AG	3	6	4346	4351	50 %	0 %	50 %	0 %	52421266
39	NC_006298	ATGA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	25 %	0 %	52421266
40	NC_006298	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52421266
41	NC_006298	TAA	2	6	4485	4490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421266
42	NC_006298	AATT	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	52421266
43	NC_006298	ATG	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421267
44	NC_006298	GATA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	25 %	0 %	52421267
45	NC_006298	GCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52421267
46	NC_006298	AACG	2	8	4949	4956	50 %	0 %	25 %	25 %	52421267
47	NC_006298	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421267
48	NC_006298	A	6	6	5055	5060	100 %	0 %	0 %	0 %	52421267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.