MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 4108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	ACTC	2	8	397	404	25 %	25 %	0 %	50 %	33151283
2	NC_002940	AACC	2	8	1356	1363	50 %	0 %	0 %	50 %	33151283
3	NC_002940	TGAT	2	8	1665	1672	25 %	50 %	25 %	0 %	33151283
4	NC_002940	GCAA	2	8	2092	2099	50 %	0 %	25 %	25 %	33151283
5	NC_002940	GCAG	2	8	2322	2329	25 %	0 %	50 %	25 %	33151284
6	NC_002940	CAAG	2	8	2607	2614	50 %	0 %	25 %	25 %	33151284
7	NC_002940	TTGT	2	8	3379	3386	0 %	75 %	25 %	0 %	33151285
8	NC_002940	AACT	2	8	3594	3601	50 %	25 %	0 %	25 %	33151285
9	NC_002940	CATT	2	8	4770	4777	25 %	50 %	0 %	25 %	33151287
10	NC_002940	ATAG	2	8	5170	5177	50 %	25 %	25 %	0 %	33151288
11	NC_002940	AGAA	2	8	5241	5248	75 %	0 %	25 %	0 %	33151288
12	NC_002940	TTAC	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	33151289
13	NC_002940	CAAA	2	8	7019	7026	75 %	0 %	0 %	25 %	33151290
14	NC_002940	ACCG	2	8	7687	7694	25 %	0 %	25 %	50 %	33151291
15	NC_002940	TGAA	2	8	7739	7746	50 %	25 %	25 %	0 %	33151291
16	NC_002940	CAAG	2	8	8251	8258	50 %	0 %	25 %	25 %	33151291
17	NC_002940	ATGA	2	8	8941	8948	50 %	25 %	25 %	0 %	33151292
18	NC_002940	CAAC	2	8	9118	9125	50 %	0 %	0 %	50 %	33151292
19	NC_002940	AGTT	2	8	9476	9483	25 %	50 %	25 %	0 %	33151292
20	NC_002940	TTTA	2	8	9919	9926	25 %	75 %	0 %	0 %	33151293
21	NC_002940	ACAA	2	8	10060	10067	75 %	0 %	0 %	25 %	33151293
22	NC_002940	GATA	2	8	16950	16957	50 %	25 %	25 %	0 %	33151294
23	NC_002940	TAAT	2	8	17243	17250	50 %	50 %	0 %	0 %	33151294
24	NC_002940	GTTT	2	8	17601	17608	0 %	75 %	25 %	0 %	33151295
25	NC_002940	TGTT	2	8	17613	17620	0 %	75 %	25 %	0 %	33151295
26	NC_002940	TTGA	2	8	18045	18052	25 %	50 %	25 %	0 %	33151295
27	NC_002940	GATG	2	8	18512	18519	25 %	25 %	50 %	0 %	33151295
28	NC_002940	ACTT	2	8	18795	18802	25 %	50 %	0 %	25 %	33151296
29	NC_002940	GATT	2	8	18865	18872	25 %	50 %	25 %	0 %	33151296
30	NC_002940	ATCG	2	8	18953	18960	25 %	25 %	25 %	25 %	33151296
31	NC_002940	GCAG	2	8	19048	19055	25 %	0 %	50 %	25 %	33151296
32	NC_002940	AAAC	2	8	19103	19110	75 %	0 %	0 %	25 %	33151296
33	NC_002940	GCGG	2	8	19379	19386	0 %	0 %	75 %	25 %	33151296
34	NC_002940	CTGA	2	8	19889	19896	25 %	25 %	25 %	25 %	33151296
35	NC_002940	GTTT	2	8	19993	20000	0 %	75 %	25 %	0 %	33151296
36	NC_002940	GGTC	2	8	20107	20114	0 %	25 %	50 %	25 %	33151296
37	NC_002940	ATGG	2	8	20569	20576	25 %	25 %	50 %	0 %	33151297
38	NC_002940	TTGC	2	8	20716	20723	0 %	50 %	25 %	25 %	33151297
39	NC_002940	TGAT	2	8	20760	20767	25 %	50 %	25 %	0 %	33151297
40	NC_002940	GTTA	2	8	21010	21017	25 %	50 %	25 %	0 %	33151297
41	NC_002940	ATTG	2	8	23208	23215	25 %	50 %	25 %	0 %	33151298
42	NC_002940	AAAG	2	8	23384	23391	75 %	0 %	25 %	0 %	33151299
43	NC_002940	CTTT	2	8	23539	23546	0 %	75 %	0 %	25 %	33151299
44	NC_002940	TTGT	2	8	23633	23640	0 %	75 %	25 %	0 %	33151299
45	NC_002940	TTGT	2	8	24021	24028	0 %	75 %	25 %	0 %	33151299
46	NC_002940	AAAC	2	8	24090	24097	75 %	0 %	0 %	25 %	33151299
47	NC_002940	ATTT	2	8	24343	24350	25 %	75 %	0 %	0 %	33151299
48	NC_002940	TTTG	2	8	24466	24473	0 %	75 %	25 %	0 %	33151300
49	NC_002940	AGAT	2	8	25121	25128	50 %	25 %	25 %	0 %	33151301
50	NC_002940	TGTT	2	8	25496	25503	0 %	75 %	25 %	0 %	33151301
51	NC_002940	CAAG	2	8	25609	25616	50 %	0 %	25 %	25 %	33151301
52	NC_002940	CCAC	2	8	26098	26105	25 %	0 %	0 %	75 %	33151301
53	NC_002940	TGAT	2	8	26391	26398	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
54	NC_002940	TTAA	2	8	26612	26619	50 %	50 %	0 %	0 %	33151302
55	NC_002940	ATGT	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
56	NC_002940	AGTT	2	8	27064	27071	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
57	NC_002940	TAAA	2	8	27640	27647	75 %	25 %	0 %	0 %	33151303
58	NC_002940	CGGT	2	8	28192	28199	0 %	25 %	50 %	25 %	33151303
59	NC_002940	TAAA	2	8	30016	30023	75 %	25 %	0 %	0 %	33151304
60	NC_002940	CAGC	2	8	30303	30310	25 %	0 %	25 %	50 %	33151304
61	NC_002940	TGAT	2	8	30757	30764	25 %	50 %	25 %	0 %	33151305
62	NC_002940	AAAC	2	8	30792	30799	75 %	0 %	0 %	25 %	33151305
63	NC_002940	ACGA	2	8	31434	31441	50 %	0 %	25 %	25 %	33151306
64	NC_002940	GCTT	2	8	31494	31501	0 %	50 %	25 %	25 %	33151306
65	NC_002940	AACA	2	8	31538	31545	75 %	0 %	0 %	25 %	33151307
66	NC_002940	CGGT	2	8	32577	32584	0 %	25 %	50 %	25 %	33151309
67	NC_002940	GTCG	2	8	32605	32612	0 %	25 %	50 %	25 %	33151309
68	NC_002940	AAAT	2	8	32734	32741	75 %	25 %	0 %	0 %	33151309
69	NC_002940	CTTG	2	8	32887	32894	0 %	50 %	25 %	25 %	33151309
70	NC_002940	ATGA	2	8	33152	33159	50 %	25 %	25 %	0 %	33151309
71	NC_002940	CGGC	2	8	33167	33174	0 %	0 %	50 %	50 %	33151309
72	NC_002940	GGGA	2	8	33675	33682	25 %	0 %	75 %	0 %	33151310
73	NC_002940	ATTG	2	8	33856	33863	25 %	50 %	25 %	0 %	33151310
74	NC_002940	TTAA	2	8	33971	33978	50 %	50 %	0 %	0 %	33151310
75	NC_002940	TATT	2	8	35248	35255	25 %	75 %	0 %	0 %	33151310
76	NC_002940	AATT	2	8	35394	35401	50 %	50 %	0 %	0 %	33151310
77	NC_002940	CGCT	2	8	35699	35706	0 %	25 %	25 %	50 %	33151311
78	NC_002940	AATC	2	8	36940	36947	50 %	25 %	0 %	25 %	33151312
79	NC_002940	TAAA	2	8	36968	36975	75 %	25 %	0 %	0 %	33151312
80	NC_002940	TGAT	2	8	36993	37000	25 %	50 %	25 %	0 %	33151312
81	NC_002940	TTTC	2	8	37450	37457	0 %	75 %	0 %	25 %	33151312
82	NC_002940	CCAA	2	8	37886	37893	50 %	0 %	0 %	50 %	33151313
83	NC_002940	TTGC	2	8	38430	38437	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
84	NC_002940	GTTT	2	8	38555	38562	0 %	75 %	25 %	0 %	33151313
85	NC_002940	AATG	2	8	38625	38632	50 %	25 %	25 %	0 %	33151313
86	NC_002940	GCTT	2	8	38942	38949	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
87	NC_002940	TGCG	2	8	39080	39087	0 %	25 %	50 %	25 %	33151313
88	NC_002940	GAAA	2	8	39244	39251	75 %	0 %	25 %	0 %	33151314
89	NC_002940	GTTT	2	8	39776	39783	0 %	75 %	25 %	0 %	33151315
90	NC_002940	AATA	2	8	39880	39887	75 %	25 %	0 %	0 %	33151316
91	NC_002940	TAAT	2	8	39948	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	33151317
92	NC_002940	GCTT	2	8	40032	40039	0 %	50 %	25 %	25 %	33151317
93	NC_002940	AATG	2	8	40060	40067	50 %	25 %	25 %	0 %	33151317
94	NC_002940	TTTA	2	8	40345	40352	25 %	75 %	0 %	0 %	33151318
95	NC_002940	ATTT	2	8	40778	40785	25 %	75 %	0 %	0 %	33151318
96	NC_002940	TAAA	2	8	40921	40928	75 %	25 %	0 %	0 %	33151318
97	NC_002940	ATCA	2	8	41330	41337	50 %	25 %	0 %	25 %	33151318
98	NC_002940	GGTA	2	8	42471	42478	25 %	25 %	50 %	0 %	33151319
99	NC_002940	ATCA	2	8	42834	42841	50 %	25 %	0 %	25 %	33151319
100	NC_002940	GTCA	2	8	43289	43296	25 %	25 %	25 %	25 %	33151322
101	NC_002940	CTAT	2	8	43380	43387	25 %	50 %	0 %	25 %	33151322
102	NC_002940	TTGT	2	8	43710	43717	0 %	75 %	25 %	0 %	33151322
103	NC_002940	ATTG	2	8	43828	43835	25 %	50 %	25 %	0 %	33151322
104	NC_002940	TGGT	2	8	44259	44266	0 %	50 %	50 %	0 %	33151323
105	NC_002940	AAGC	2	8	44420	44427	50 %	0 %	25 %	25 %	33151323
106	NC_002940	AATA	2	8	44447	44454	75 %	25 %	0 %	0 %	33151323
107	NC_002940	ATTT	2	8	44841	44848	25 %	75 %	0 %	0 %	33151323
108	NC_002940	TGCC	2	8	44934	44941	0 %	25 %	25 %	50 %	33151323
109	NC_002940	TAAT	2	8	45012	45019	50 %	50 %	0 %	0 %	33151323
110	NC_002940	GATT	2	8	45043	45050	25 %	50 %	25 %	0 %	33151323
111	NC_002940	GGTT	2	8	45103	45110	0 %	50 %	50 %	0 %	33151323
112	NC_002940	TTGG	2	8	45196	45203	0 %	50 %	50 %	0 %	33151323
113	NC_002940	TAAA	2	8	46433	46440	75 %	25 %	0 %	0 %	33151325
114	NC_002940	TTTA	2	8	46604	46611	25 %	75 %	0 %	0 %	33151326
115	NC_002940	TAAT	2	8	46772	46779	50 %	50 %	0 %	0 %	33151326
116	NC_002940	GCAG	2	8	46856	46863	25 %	0 %	50 %	25 %	33151326
117	NC_002940	TAAA	2	8	47061	47068	75 %	25 %	0 %	0 %	33151326
118	NC_002940	CGAT	2	8	47654	47661	25 %	25 %	25 %	25 %	33151326
119	NC_002940	ATTG	2	8	47663	47670	25 %	50 %	25 %	0 %	33151326
120	NC_002940	ACGA	2	8	48589	48596	50 %	0 %	25 %	25 %	33151327
121	NC_002940	ATTT	2	8	48693	48700	25 %	75 %	0 %	0 %	33151327
122	NC_002940	TTTA	2	8	49759	49766	25 %	75 %	0 %	0 %	33151328
123	NC_002940	CTTT	2	8	50001	50008	0 %	75 %	0 %	25 %	33151329
124	NC_002940	TATT	2	8	50024	50031	25 %	75 %	0 %	0 %	33151329
125	NC_002940	GCAA	2	8	50273	50280	50 %	0 %	25 %	25 %	33151329
126	NC_002940	TTAA	2	8	50331	50338	50 %	50 %	0 %	0 %	33151329
127	NC_002940	GTTT	2	8	50339	50346	0 %	75 %	25 %	0 %	33151329
128	NC_002940	GTAA	2	8	50809	50816	50 %	25 %	25 %	0 %	33151329
129	NC_002940	TTTA	2	8	50916	50923	25 %	75 %	0 %	0 %	33151330
130	NC_002940	TTAA	2	8	52992	52999	50 %	50 %	0 %	0 %	33151331
131	NC_002940	GCCA	2	8	53221	53228	25 %	0 %	25 %	50 %	33151331
132	NC_002940	CGAT	2	8	53562	53569	25 %	25 %	25 %	25 %	33151332
133	NC_002940	TCAT	2	8	54038	54045	25 %	50 %	0 %	25 %	33151333
134	NC_002940	ATTG	2	8	55024	55031	25 %	50 %	25 %	0 %	33151334
135	NC_002940	ATTG	2	8	55834	55841	25 %	50 %	25 %	0 %	33151336
136	NC_002940	ATTA	2	8	55933	55940	50 %	50 %	0 %	0 %	33151336
137	NC_002940	TCTT	2	8	56074	56081	0 %	75 %	0 %	25 %	33151336
138	NC_002940	ATCA	2	8	57313	57320	50 %	25 %	0 %	25 %	33151337
139	NC_002940	ATCA	2	8	58178	58185	50 %	25 %	0 %	25 %	33151338
140	NC_002940	TGCT	2	8	58483	58490	0 %	50 %	25 %	25 %	33151338
141	NC_002940	CAAA	2	8	58857	58864	75 %	0 %	0 %	25 %	33151338
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143	NC_002940	TAAA	2	8	59594	59601	75 %	25 %	0 %	0 %	33151338
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