MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 30157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002940	T	6	6	35517	35522	0 %	100 %	0 %	0 %	33151311
502	NC_002940	TGG	2	6	35618	35623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151311
503	NC_002940	A	6	6	35625	35630	100 %	0 %	0 %	0 %	33151311
504	NC_002940	A	6	6	35682	35687	100 %	0 %	0 %	0 %	33151311
505	NC_002940	CGCT	2	8	35699	35706	0 %	25 %	25 %	50 %	33151311
506	NC_002940	TGA	2	6	35744	35749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151311
507	NC_002940	A	6	6	35794	35799	100 %	0 %	0 %	0 %	33151311
508	NC_002940	AGA	2	6	35807	35812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151311
509	NC_002940	AAC	2	6	35905	35910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151311
510	NC_002940	ATG	2	6	35974	35979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151311
511	NC_002940	ATC	2	6	36143	36148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151312
512	NC_002940	TTC	2	6	36200	36205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151312
513	NC_002940	AGT	2	6	36210	36215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151312
514	NC_002940	A	6	6	36224	36229	100 %	0 %	0 %	0 %	33151312
515	NC_002940	CCT	2	6	36312	36317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33151312
516	NC_002940	TAATCG	2	12	36469	36480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33151312
517	NC_002940	GGT	2	6	36489	36494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151312
518	NC_002940	TAA	2	6	36563	36568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151312
519	NC_002940	CAG	2	6	36577	36582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151312
520	NC_002940	CAA	2	6	36583	36588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151312
521	NC_002940	T	6	6	36616	36621	0 %	100 %	0 %	0 %	33151312
522	NC_002940	TCA	2	6	36627	36632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151312
523	NC_002940	AAT	2	6	36659	36664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151312
524	NC_002940	TAA	2	6	36767	36772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151312
525	NC_002940	TTGCT	2	10	36839	36848	0 %	60 %	20 %	20 %	33151312
526	NC_002940	GCT	2	6	36861	36866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151312
527	NC_002940	TGG	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151312
528	NC_002940	ATA	2	6	36876	36881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151312
529	NC_002940	A	6	6	36915	36920	100 %	0 %	0 %	0 %	33151312
530	NC_002940	TCA	2	6	36930	36935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151312
531	NC_002940	AATC	2	8	36940	36947	50 %	25 %	0 %	25 %	33151312
532	NC_002940	TAAA	2	8	36968	36975	75 %	25 %	0 %	0 %	33151312
533	NC_002940	CAA	2	6	36985	36990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151312
534	NC_002940	TGAT	2	8	36993	37000	25 %	50 %	25 %	0 %	33151312
535	NC_002940	TTG	2	6	37002	37007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151312
536	NC_002940	TGG	2	6	37057	37062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151312
537	NC_002940	GCC	2	6	37208	37213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33151312
538	NC_002940	A	6	6	37265	37270	100 %	0 %	0 %	0 %	33151312
539	NC_002940	GTG	2	6	37336	37341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151312
540	NC_002940	TTTC	2	8	37450	37457	0 %	75 %	0 %	25 %	33151312
541	NC_002940	T	6	6	37634	37639	0 %	100 %	0 %	0 %	33151313
542	NC_002940	TTG	2	6	37664	37669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151313
543	NC_002940	AAG	3	9	37728	37736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151313
544	NC_002940	TCA	2	6	37762	37767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151313
545	NC_002940	T	6	6	37807	37812	0 %	100 %	0 %	0 %	33151313
546	NC_002940	ATA	2	6	37853	37858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151313
547	NC_002940	CCAA	2	8	37886	37893	50 %	0 %	0 %	50 %	33151313
548	NC_002940	GTA	2	6	37963	37968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151313
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550	NC_002940	TA	3	6	38011	38016	50 %	50 %	0 %	0 %	33151313
551	NC_002940	TCA	2	6	38020	38025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151313
552	NC_002940	TCG	2	6	38049	38054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151313
553	NC_002940	TAC	2	6	38153	38158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151313
554	NC_002940	ATA	2	6	38196	38201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151313
555	NC_002940	TTGC	2	8	38430	38437	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
556	NC_002940	TGT	2	6	38472	38477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151313
557	NC_002940	TCATC	2	10	38527	38536	20 %	40 %	0 %	40 %	33151313
558	NC_002940	T	6	6	38546	38551	0 %	100 %	0 %	0 %	33151313
559	NC_002940	GTTT	2	8	38555	38562	0 %	75 %	25 %	0 %	33151313
560	NC_002940	AGA	3	9	38564	38572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151313
561	NC_002940	CCG	2	6	38580	38585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33151313
562	NC_002940	AATG	2	8	38625	38632	50 %	25 %	25 %	0 %	33151313
563	NC_002940	CAT	2	6	38704	38709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151313
564	NC_002940	ACA	2	6	38775	38780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151313
565	NC_002940	TAA	2	6	38912	38917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151313
566	NC_002940	GCTT	2	8	38942	38949	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
567	NC_002940	TAA	2	6	38957	38962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151313
568	NC_002940	TGCG	2	8	39080	39087	0 %	25 %	50 %	25 %	33151313
569	NC_002940	TTG	2	6	39101	39106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151313
570	NC_002940	GAAA	2	8	39244	39251	75 %	0 %	25 %	0 %	33151314
571	NC_002940	AAAAG	2	10	39258	39267	80 %	0 %	20 %	0 %	33151314
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573	NC_002940	T	6	6	39657	39662	0 %	100 %	0 %	0 %	33151315
574	NC_002940	AATTC	2	10	39710	39719	40 %	40 %	0 %	20 %	33151315
575	NC_002940	TTG	2	6	39760	39765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151315
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578	NC_002940	AATA	2	8	39880	39887	75 %	25 %	0 %	0 %	33151316
579	NC_002940	TAAT	2	8	39948	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	33151317
580	NC_002940	TTA	2	6	40006	40011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151317
581	NC_002940	GCTT	2	8	40032	40039	0 %	50 %	25 %	25 %	33151317
582	NC_002940	AATG	2	8	40060	40067	50 %	25 %	25 %	0 %	33151317
583	NC_002940	A	7	7	40272	40278	100 %	0 %	0 %	0 %	33151318
584	NC_002940	TAT	2	6	40297	40302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151318
585	NC_002940	GCA	2	6	40314	40319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151318
586	NC_002940	TGC	2	6	40322	40327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151318
587	NC_002940	TTTA	2	8	40345	40352	25 %	75 %	0 %	0 %	33151318
588	NC_002940	CA	3	6	40376	40381	50 %	0 %	0 %	50 %	33151318
589	NC_002940	TGG	2	6	40487	40492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151318
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593	NC_002940	AC	4	8	40832	40839	50 %	0 %	0 %	50 %	33151318
594	NC_002940	CTT	2	6	40846	40851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151318
595	NC_002940	TAT	2	6	40852	40857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151318
596	NC_002940	TAAA	2	8	40921	40928	75 %	25 %	0 %	0 %	33151318
597	NC_002940	TA	3	6	40939	40944	50 %	50 %	0 %	0 %	33151318
598	NC_002940	AGC	2	6	40946	40951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151318
599	NC_002940	TTCTGT	2	12	41000	41011	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	33151318
600	NC_002940	GTA	3	9	41061	41069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151318
601	NC_002940	TAT	2	6	41113	41118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151318
602	NC_002940	GTG	2	6	41248	41253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151318
603	NC_002940	CGT	2	6	41277	41282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151318
604	NC_002940	ACT	2	6	41299	41304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151318
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607	NC_002940	AAG	2	6	41464	41469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151318
608	NC_002940	A	7	7	41764	41770	100 %	0 %	0 %	0 %	33151319
609	NC_002940	TAT	2	6	41789	41794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151319
610	NC_002940	CTG	2	6	41813	41818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151319
611	NC_002940	ATA	2	6	41894	41899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151319
612	NC_002940	CTG	2	6	41921	41926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151319
613	NC_002940	AAG	2	6	41933	41938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151319
614	NC_002940	GT	3	6	41975	41980	0 %	50 %	50 %	0 %	33151319
615	NC_002940	TAT	2	6	42043	42048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151319
616	NC_002940	A	7	7	42080	42086	100 %	0 %	0 %	0 %	33151319
617	NC_002940	ATA	2	6	42134	42139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151319
618	NC_002940	GAA	2	6	42142	42147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151319
619	NC_002940	GTA	2	6	42151	42156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151319
620	NC_002940	A	6	6	42280	42285	100 %	0 %	0 %	0 %	33151319
621	NC_002940	AAT	2	6	42292	42297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151319
622	NC_002940	ATG	2	6	42326	42331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151319
623	NC_002940	GGTA	2	8	42471	42478	25 %	25 %	50 %	0 %	33151319
624	NC_002940	CTG	2	6	42506	42511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151319
625	NC_002940	GC	3	6	42536	42541	0 %	0 %	50 %	50 %	33151319
626	NC_002940	ATG	3	9	42544	42552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151319
627	NC_002940	TAT	2	6	42617	42622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151319
628	NC_002940	AAG	2	6	42650	42655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151319
629	NC_002940	AGA	2	6	42753	42758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151319
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631	NC_002940	ATCA	2	8	42834	42841	50 %	25 %	0 %	25 %	33151319
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