MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 1129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002607	GCGGT	2	10	351	360	0 %	20 %	60 %	20 %	15789341
2	NC_002607	GCAGC	2	10	649	658	20 %	0 %	40 %	40 %	15789341
3	NC_002607	TGGCG	2	10	2146	2155	0 %	20 %	60 %	20 %	15789343
4	NC_002607	TCGGC	2	10	5327	5336	0 %	20 %	40 %	40 %	15789344
5	NC_002607	CGTCC	2	10	7263	7272	0 %	20 %	20 %	60 %	15789345
6	NC_002607	CGAAC	2	10	7597	7606	40 %	0 %	20 %	40 %	15789346
7	NC_002607	CCGTT	2	10	9143	9152	0 %	40 %	20 %	40 %	15789347
8	NC_002607	CCGTC	2	10	9497	9506	0 %	20 %	20 %	60 %	15789347
9	NC_002607	CCCAT	2	10	19161	19170	20 %	20 %	0 %	60 %	15789359
10	NC_002607	ACCAC	2	10	19197	19206	40 %	0 %	0 %	60 %	15789359
11	NC_002607	TGGGG	2	10	22213	22222	0 %	20 %	80 %	0 %	15789363
12	NC_002607	CGAAT	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	15789363
13	NC_002607	ACCCC	2	10	24445	24454	20 %	0 %	0 %	80 %	15789365
14	NC_002607	TTCGG	2	10	27360	27369	0 %	40 %	40 %	20 %	15789367
15	NC_002607	CGGCG	2	10	31085	31094	0 %	0 %	60 %	40 %	15789371
16	NC_002607	TCAGT	2	10	33448	33457	20 %	40 %	20 %	20 %	15789375
17	NC_002607	TGACT	2	10	35702	35711	20 %	40 %	20 %	20 %	15789377
18	NC_002607	ACCAA	2	10	36525	36534	60 %	0 %	0 %	40 %	15789378
19	NC_002607	GGTCG	2	10	37941	37950	0 %	20 %	60 %	20 %	15789379
20	NC_002607	CTAGT	2	10	42409	42418	20 %	40 %	20 %	20 %	15789383
21	NC_002607	CATAT	2	10	43253	43262	40 %	40 %	0 %	20 %	15789384
22	NC_002607	ACTCT	2	10	43379	43388	20 %	40 %	0 %	40 %	15789384
23	NC_002607	CACAA	2	10	53350	53359	60 %	0 %	0 %	40 %	15789391
24	NC_002607	CAGCG	2	10	61386	61395	20 %	0 %	40 %	40 %	15789396
25	NC_002607	GAGCG	2	10	63343	63352	20 %	0 %	60 %	20 %	15789398
26	NC_002607	GTCGA	2	10	64280	64289	20 %	20 %	40 %	20 %	15789399
27	NC_002607	CGATG	2	10	64969	64978	20 %	20 %	40 %	20 %	15789400
28	NC_002607	GTCGA	2	10	67075	67084	20 %	20 %	40 %	20 %	15789405
29	NC_002607	ACGCG	2	10	70220	70229	20 %	0 %	40 %	40 %	15789409
30	NC_002607	GCCGG	2	10	73974	73983	0 %	0 %	60 %	40 %	15789414
31	NC_002607	GCCGG	2	10	75236	75245	0 %	0 %	60 %	40 %	16554458
32	NC_002607	CCGAC	2	10	76104	76113	20 %	0 %	20 %	60 %	16554458
33	NC_002607	CGCCA	2	10	79004	79013	20 %	0 %	20 %	60 %	15789418
34	NC_002607	GCCGC	2	10	81045	81054	0 %	0 %	40 %	60 %	15789420
35	NC_002607	ACGCC	2	10	81702	81711	20 %	0 %	20 %	60 %	15789421
36	NC_002607	ACTGT	2	10	84816	84825	20 %	40 %	20 %	20 %	15789425
37	NC_002607	CACCG	2	10	86869	86878	20 %	0 %	20 %	60 %	15789428
38	NC_002607	GACGC	2	10	89172	89181	20 %	0 %	40 %	40 %	15789430
39	NC_002607	AGGCC	2	10	89642	89651	20 %	0 %	40 %	40 %	15789430
40	NC_002607	CTCTA	2	10	89655	89664	20 %	40 %	0 %	40 %	15789430
41	NC_002607	CGAAT	2	10	89876	89885	40 %	20 %	20 %	20 %	15789430
42	NC_002607	ATCGT	2	10	90415	90424	20 %	40 %	20 %	20 %	15789430
43	NC_002607	GGGCT	2	10	90723	90732	0 %	20 %	60 %	20 %	15789431
44	NC_002607	ATGGA	2	10	92103	92112	40 %	20 %	40 %	0 %	15789431
45	NC_002607	TATCC	2	10	100895	100904	20 %	40 %	0 %	40 %	15789436
46	NC_002607	CTCCC	2	10	101209	101218	0 %	20 %	0 %	80 %	15789436
47	NC_002607	ACCTC	2	10	102231	102240	20 %	20 %	0 %	60 %	15789437
48	NC_002607	GCATC	2	10	103013	103022	20 %	20 %	20 %	40 %	15789439
49	NC_002607	ATCAC	2	10	106160	106169	40 %	20 %	0 %	40 %	15789443
50	NC_002607	CCCCG	2	10	107874	107883	0 %	0 %	20 %	80 %	15789446
51	NC_002607	GGGCA	2	10	109126	109135	20 %	0 %	60 %	20 %	15789447
52	NC_002607	GTCGC	2	10	109896	109905	0 %	20 %	40 %	40 %	15789449
53	NC_002607	GTCGA	2	10	110838	110847	20 %	20 %	40 %	20 %	15789450
54	NC_002607	AGCGC	2	10	114218	114227	20 %	0 %	40 %	40 %	15789453
55	NC_002607	AGTGG	2	10	116633	116642	20 %	20 %	60 %	0 %	15789455
56	NC_002607	GGACC	2	10	117361	117370	20 %	0 %	40 %	40 %	15789457
57	NC_002607	TGCGG	2	10	121354	121363	0 %	20 %	60 %	20 %	15789464
58	NC_002607	CGCGC	3	15	126375	126389	0 %	0 %	40 %	60 %	15789469
59	NC_002607	ACGTG	2	10	127237	127246	20 %	20 %	40 %	20 %	15789469
60	NC_002607	CGTGA	2	10	127695	127704	20 %	20 %	40 %	20 %	15789470
61	NC_002607	CGTCG	2	10	132661	132670	0 %	20 %	40 %	40 %	15789473
62	NC_002607	ACGCA	2	10	133079	133088	40 %	0 %	20 %	40 %	15789474
63	NC_002607	ATCGA	2	10	135218	135227	40 %	20 %	20 %	20 %	15789474
64	NC_002607	GCCGC	2	10	137868	137877	0 %	0 %	40 %	60 %	15789476
65	NC_002607	GGCGT	2	10	141596	141605	0 %	20 %	60 %	20 %	15789478
66	NC_002607	CCGCG	2	10	144395	144404	0 %	0 %	40 %	60 %	16554459
67	NC_002607	TCACG	2	10	145947	145956	20 %	20 %	20 %	40 %	15789484
68	NC_002607	GTCGT	2	10	146630	146639	0 %	40 %	40 %	20 %	15789484
69	NC_002607	GCCGT	2	10	147569	147578	0 %	20 %	40 %	40 %	15789484
70	NC_002607	CGCTG	2	10	147591	147600	0 %	20 %	40 %	40 %	15789484
71	NC_002607	CGGCG	2	10	150019	150028	0 %	0 %	60 %	40 %	15789485
72	NC_002607	GCCGC	2	10	151274	151283	0 %	0 %	40 %	60 %	15789486
73	NC_002607	CGGCG	2	10	151934	151943	0 %	0 %	60 %	40 %	15789487
74	NC_002607	GCCGT	2	10	153626	153635	0 %	20 %	40 %	40 %	15789489
75	NC_002607	CGTCT	2	10	153736	153745	0 %	40 %	20 %	40 %	15789489
76	NC_002607	CACCG	2	10	153857	153866	20 %	0 %	20 %	60 %	15789489
77	NC_002607	TTCCG	2	10	154297	154306	0 %	40 %	20 %	40 %	15789489
78	NC_002607	TGGCG	2	10	155053	155062	0 %	20 %	60 %	20 %	15789490
79	NC_002607	TCGCG	2	10	161470	161479	0 %	20 %	40 %	40 %	15789497
80	NC_002607	TCGCC	2	10	163021	163030	0 %	20 %	20 %	60 %	15789498
81	NC_002607	TGGGT	2	10	165670	165679	0 %	40 %	60 %	0 %	15789500
82	NC_002607	GTCGC	2	10	171043	171052	0 %	20 %	40 %	40 %	15789507
83	NC_002607	TGTCG	2	10	171143	171152	0 %	40 %	40 %	20 %	15789507
84	NC_002607	ACGCG	2	10	172445	172454	20 %	0 %	40 %	40 %	15789508
85	NC_002607	GCGCG	2	10	173128	173137	0 %	0 %	60 %	40 %	15789509
86	NC_002607	AGTTC	2	10	177256	177265	20 %	40 %	20 %	20 %	15789514
87	NC_002607	TCGTC	2	10	179252	179261	0 %	40 %	20 %	40 %	15789516
88	NC_002607	GCTAT	2	10	181223	181232	20 %	40 %	20 %	20 %	15789518
89	NC_002607	CTGCC	2	10	185337	185346	0 %	20 %	20 %	60 %	15789521
90	NC_002607	GCGTC	2	10	186415	186424	0 %	20 %	40 %	40 %	15789521
91	NC_002607	CCCCA	2	10	188845	188854	20 %	0 %	0 %	80 %	15789524
92	NC_002607	GGCGT	2	10	188873	188882	0 %	20 %	60 %	20 %	15789524
93	NC_002607	TGGAC	2	10	188928	188937	20 %	20 %	40 %	20 %	15789524
94	NC_002607	GGCGT	2	10	189128	189137	0 %	20 %	60 %	20 %	15789524
95	NC_002607	CCGGG	2	10	190712	190721	0 %	0 %	60 %	40 %	15789525
96	NC_002607	CGACG	2	10	191319	191328	20 %	0 %	40 %	40 %	15789526
97	NC_002607	ACGAC	2	10	191548	191557	40 %	0 %	20 %	40 %	15789526
98	NC_002607	ACGTC	2	10	193892	193901	20 %	20 %	20 %	40 %	15789529
99	NC_002607	GCAGC	2	10	194064	194073	20 %	0 %	40 %	40 %	15789529
100	NC_002607	ACCAC	2	10	199040	199049	40 %	0 %	0 %	60 %	16554460
101	NC_002607	GTGGG	2	10	200611	200620	0 %	20 %	80 %	0 %	15789538
102	NC_002607	GTGGG	2	10	200701	200710	0 %	20 %	80 %	0 %	15789538
103	NC_002607	CCACG	2	10	201369	201378	20 %	0 %	20 %	60 %	15789539
104	NC_002607	CGGGT	2	10	202153	202162	0 %	20 %	60 %	20 %	15789540
105	NC_002607	GGCGT	2	10	202750	202759	0 %	20 %	60 %	20 %	15789541
106	NC_002607	CGTTC	2	10	207233	207242	0 %	40 %	20 %	40 %	15789544
107	NC_002607	AGAAC	2	10	208529	208538	60 %	0 %	20 %	20 %	15789546
108	NC_002607	CGACG	2	10	210183	210192	20 %	0 %	40 %	40 %	15789548
109	NC_002607	GGTCA	2	10	210942	210951	20 %	20 %	40 %	20 %	15789549
110	NC_002607	GATCA	2	10	214440	214449	40 %	20 %	20 %	20 %	15789554
111	NC_002607	GCGCC	2	10	214717	214726	0 %	0 %	40 %	60 %	15789554
112	NC_002607	GCGAC	2	10	217025	217034	20 %	0 %	40 %	40 %	15789557
113	NC_002607	CACGG	2	10	218553	218562	20 %	0 %	40 %	40 %	15789558
114	NC_002607	GGGCG	2	10	219301	219310	0 %	0 %	80 %	20 %	15789558
115	NC_002607	GGCGC	2	10	220161	220170	0 %	0 %	60 %	40 %	15789559
116	NC_002607	GGCGG	2	10	223076	223085	0 %	0 %	80 %	20 %	15789562
117	NC_002607	CGGTG	2	10	224236	224245	0 %	20 %	60 %	20 %	15789563
118	NC_002607	CGGGT	2	10	224443	224452	0 %	20 %	60 %	20 %	15789563
119	NC_002607	GTGTA	2	10	226109	226118	20 %	40 %	40 %	0 %	15789566
120	NC_002607	CGACC	2	10	229226	229235	20 %	0 %	20 %	60 %	15789568
121	NC_002607	ACTTC	2	10	230691	230700	20 %	40 %	0 %	40 %	16554462
122	NC_002607	GCGCG	2	10	233328	233337	0 %	0 %	60 %	40 %	15789574
123	NC_002607	GACGT	2	10	234293	234302	20 %	20 %	40 %	20 %	15789575
124	NC_002607	CCGAC	2	10	236159	236168	20 %	0 %	20 %	60 %	15789577
125	NC_002607	GCGTT	2	10	237428	237437	0 %	40 %	40 %	20 %	15789579
126	NC_002607	GCGCT	2	10	238911	238920	0 %	20 %	40 %	40 %	15789580
127	NC_002607	GCGCC	2	10	239087	239096	0 %	0 %	40 %	60 %	15789580
128	NC_002607	CTCGG	2	10	244777	244786	0 %	20 %	40 %	40 %	15789587
129	NC_002607	CGTCG	2	10	250746	250755	0 %	20 %	40 %	40 %	15789592
130	NC_002607	ACGCC	2	10	253553	253562	20 %	0 %	20 %	60 %	15789596
131	NC_002607	CCGTC	2	10	254603	254612	0 %	20 %	20 %	60 %	15789598
132	NC_002607	CGATC	2	10	255341	255350	20 %	20 %	20 %	40 %	15789598
133	NC_002607	TCTGT	2	10	259208	259217	0 %	60 %	20 %	20 %	15789601
134	NC_002607	GCGCT	2	10	260136	260145	0 %	20 %	40 %	40 %	15789601
135	NC_002607	GGACC	2	10	262208	262217	20 %	0 %	40 %	40 %	15789602
136	NC_002607	ACGCC	2	10	263137	263146	20 %	0 %	20 %	60 %	15789604
137	NC_002607	GCGAC	2	10	265334	265343	20 %	0 %	40 %	40 %	16554464
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