MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 5123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002607	CAAC	2	8	717	724	50 %	0 %	0 %	50 %	15789341
2	NC_002607	GACA	2	8	730	737	50 %	0 %	25 %	25 %	15789341
3	NC_002607	GCAC	2	8	939	946	25 %	0 %	25 %	50 %	15789341
4	NC_002607	ACCA	2	8	969	976	50 %	0 %	0 %	50 %	15789341
5	NC_002607	GCTT	2	8	1610	1617	0 %	50 %	25 %	25 %	15789342
6	NC_002607	TCAC	2	8	2042	2049	25 %	25 %	0 %	50 %	15789342
7	NC_002607	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	15789343
8	NC_002607	CGAA	2	8	2354	2361	50 %	0 %	25 %	25 %	15789343
9	NC_002607	ACCA	2	8	2538	2545	50 %	0 %	0 %	50 %	15789343
10	NC_002607	CCGT	2	8	4103	4110	0 %	25 %	25 %	50 %	15789344
11	NC_002607	GTTC	2	8	4236	4243	0 %	50 %	25 %	25 %	15789344
12	NC_002607	CGGC	2	8	4445	4452	0 %	0 %	50 %	50 %	15789344
13	NC_002607	CACG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	15789344
14	NC_002607	TCGA	2	8	5202	5209	25 %	25 %	25 %	25 %	15789344
15	NC_002607	TCGC	2	8	5818	5825	0 %	25 %	25 %	50 %	15789345
16	NC_002607	CGGC	2	8	6037	6044	0 %	0 %	50 %	50 %	15789345
17	NC_002607	CGTC	2	8	6632	6639	0 %	25 %	25 %	50 %	15789345
18	NC_002607	CTGC	2	8	7816	7823	0 %	25 %	25 %	50 %	15789346
19	NC_002607	CGCC	2	8	8506	8513	0 %	0 %	25 %	75 %	15789346
20	NC_002607	CGTC	2	8	9290	9297	0 %	25 %	25 %	50 %	15789347
21	NC_002607	CGCC	2	8	9770	9777	0 %	0 %	25 %	75 %	15789347
22	NC_002607	CTGC	2	8	10024	10031	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
23	NC_002607	GCCT	2	8	10181	10188	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
24	NC_002607	CGCT	2	8	10269	10276	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
25	NC_002607	ACCG	2	8	10664	10671	25 %	0 %	25 %	50 %	15789348
26	NC_002607	CGGC	2	8	10857	10864	0 %	0 %	50 %	50 %	15789348
27	NC_002607	CCCG	2	8	12101	12108	0 %	0 %	25 %	75 %	15789349
28	NC_002607	TCGG	2	8	12209	12216	0 %	25 %	50 %	25 %	15789349
29	NC_002607	TCGC	2	8	13166	13173	0 %	25 %	25 %	50 %	15789350
30	NC_002607	CGAT	2	8	13551	13558	25 %	25 %	25 %	25 %	15789351
31	NC_002607	TCCA	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	15789351
32	NC_002607	TCGC	2	8	13907	13914	0 %	25 %	25 %	50 %	15789352
33	NC_002607	TCGT	2	8	14143	14150	0 %	50 %	25 %	25 %	15789352
34	NC_002607	TTTA	2	8	15977	15984	25 %	75 %	0 %	0 %	15789356
35	NC_002607	ACGA	2	8	16388	16395	50 %	0 %	25 %	25 %	15789357
36	NC_002607	GCAG	2	8	17238	17245	25 %	0 %	50 %	25 %	15789357
37	NC_002607	ACAA	2	8	17479	17486	75 %	0 %	0 %	25 %	15789357
38	NC_002607	GTTC	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	15789357
39	NC_002607	ACTG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	25 %	25 %	15789358
40	NC_002607	CCAG	2	8	18622	18629	25 %	0 %	25 %	50 %	15789358
41	NC_002607	AGTC	2	8	18780	18787	25 %	25 %	25 %	25 %	15789358
42	NC_002607	CAAG	2	8	18860	18867	50 %	0 %	25 %	25 %	15789358
43	NC_002607	TGAG	2	8	18896	18903	25 %	25 %	50 %	0 %	15789358
44	NC_002607	CCGG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	15789359
45	NC_002607	TGCC	2	8	19322	19329	0 %	25 %	25 %	50 %	15789359
46	NC_002607	GACC	2	8	19365	19372	25 %	0 %	25 %	50 %	15789359
47	NC_002607	TCGC	2	8	19441	19448	0 %	25 %	25 %	50 %	15789359
48	NC_002607	CGAT	2	8	19469	19476	25 %	25 %	25 %	25 %	15789359
49	NC_002607	AGCT	2	8	21148	21155	25 %	25 %	25 %	25 %	15789362
50	NC_002607	TTGG	2	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	15789363
51	NC_002607	CTGG	2	8	22341	22348	0 %	25 %	50 %	25 %	15789363
52	NC_002607	CACT	2	8	22566	22573	25 %	25 %	0 %	50 %	15789363
53	NC_002607	TGGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	50 %	25 %	15789363
54	NC_002607	CTTC	2	8	23555	23562	0 %	50 %	0 %	50 %	15789364
55	NC_002607	CGGC	2	8	23744	23751	0 %	0 %	50 %	50 %	15789364
56	NC_002607	GGGC	2	8	23846	23853	0 %	0 %	75 %	25 %	15789364
57	NC_002607	GCTG	2	8	23867	23874	0 %	25 %	50 %	25 %	15789364
58	NC_002607	CGAC	2	8	24171	24178	25 %	0 %	25 %	50 %	15789365
59	NC_002607	ACCC	2	8	24206	24213	25 %	0 %	0 %	75 %	15789365
60	NC_002607	CACC	2	8	24407	24414	25 %	0 %	0 %	75 %	15789365
61	NC_002607	CAAG	2	8	24458	24465	50 %	0 %	25 %	25 %	15789365
62	NC_002607	ACCA	2	8	26211	26218	50 %	0 %	0 %	50 %	15789366
63	NC_002607	ATCA	2	8	26249	26256	50 %	25 %	0 %	25 %	15789366
64	NC_002607	TGCC	2	8	26793	26800	0 %	25 %	25 %	50 %	15789367
65	NC_002607	GTCA	2	8	27252	27259	25 %	25 %	25 %	25 %	15789367
66	NC_002607	GAGT	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	15789367
67	NC_002607	TTCA	2	8	27520	27527	25 %	50 %	0 %	25 %	15789367
68	NC_002607	GGCA	2	8	28029	28036	25 %	0 %	50 %	25 %	15789367
69	NC_002607	CCGT	2	8	28672	28679	0 %	25 %	25 %	50 %	15789367
70	NC_002607	CACT	2	8	29995	30002	25 %	25 %	0 %	50 %	15789370
71	NC_002607	CTTC	2	8	30451	30458	0 %	50 %	0 %	50 %	15789371
72	NC_002607	GTTG	2	8	30490	30497	0 %	50 %	50 %	0 %	15789371
73	NC_002607	CCCG	2	8	31070	31077	0 %	0 %	25 %	75 %	15789371
74	NC_002607	CAAG	2	8	31143	31150	50 %	0 %	25 %	25 %	15789371
75	NC_002607	CGAA	2	8	31937	31944	50 %	0 %	25 %	25 %	15789372
76	NC_002607	CCGG	2	8	32120	32127	0 %	0 %	50 %	50 %	15789373
77	NC_002607	CGAA	2	8	32173	32180	50 %	0 %	25 %	25 %	15789373
78	NC_002607	TTGA	2	8	32684	32691	25 %	50 %	25 %	0 %	15789374
79	NC_002607	TCGT	2	8	32850	32857	0 %	50 %	25 %	25 %	15789374
80	NC_002607	TTGT	2	8	33341	33348	0 %	75 %	25 %	0 %	15789375
81	NC_002607	GTGG	2	8	35589	35596	0 %	25 %	75 %	0 %	15789377
82	NC_002607	ACTC	2	8	36559	36566	25 %	25 %	0 %	50 %	15789378
83	NC_002607	ACCA	2	8	36985	36992	50 %	0 %	0 %	50 %	15789379
84	NC_002607	CCGA	2	8	37231	37238	25 %	0 %	25 %	50 %	15789379
85	NC_002607	GCAA	2	8	37482	37489	50 %	0 %	25 %	25 %	15789379
86	NC_002607	TCGC	2	8	37604	37611	0 %	25 %	25 %	50 %	15789379
87	NC_002607	CCAG	2	8	38319	38326	25 %	0 %	25 %	50 %	15789380
88	NC_002607	ATCT	2	8	38461	38468	25 %	50 %	0 %	25 %	15789380
89	NC_002607	CGGA	2	8	38857	38864	25 %	0 %	50 %	25 %	15789380
90	NC_002607	CAGT	2	8	39729	39736	25 %	25 %	25 %	25 %	15789381
91	NC_002607	GTGC	2	8	39806	39813	0 %	25 %	50 %	25 %	15789381
92	NC_002607	CGCT	2	8	39951	39958	0 %	25 %	25 %	50 %	15789381
93	NC_002607	CTGG	2	8	40000	40007	0 %	25 %	50 %	25 %	15789381
94	NC_002607	CGTC	2	8	40675	40682	0 %	25 %	25 %	50 %	15789381
95	NC_002607	ACTC	2	8	40892	40899	25 %	25 %	0 %	50 %	15789381
96	NC_002607	GGCT	2	8	41688	41695	0 %	25 %	50 %	25 %	16554457
97	NC_002607	GGGA	2	8	42207	42214	25 %	0 %	75 %	0 %	15789383
98	NC_002607	ACGA	2	8	42426	42433	50 %	0 %	25 %	25 %	15789383
99	NC_002607	TTCT	2	8	42446	42453	0 %	75 %	0 %	25 %	15789383
100	NC_002607	CATG	2	8	42886	42893	25 %	25 %	25 %	25 %	15789384
101	NC_002607	GCCA	2	8	42926	42933	25 %	0 %	25 %	50 %	15789384
102	NC_002607	AATC	2	8	43024	43031	50 %	25 %	0 %	25 %	15789384
103	NC_002607	CCTC	2	8	43086	43093	0 %	25 %	0 %	75 %	15789384
104	NC_002607	TGTT	2	8	43278	43285	0 %	75 %	25 %	0 %	15789384
105	NC_002607	AGTT	2	8	43450	43457	25 %	50 %	25 %	0 %	15789384
106	NC_002607	CTTC	2	8	43576	43583	0 %	50 %	0 %	50 %	15789384
107	NC_002607	ATGA	2	8	44527	44534	50 %	25 %	25 %	0 %	15789385
108	NC_002607	ATCG	2	8	44942	44949	25 %	25 %	25 %	25 %	15789385
109	NC_002607	TCAG	2	8	47281	47288	25 %	25 %	25 %	25 %	15789386
110	NC_002607	GAAG	2	8	48902	48909	50 %	0 %	50 %	0 %	15789387
111	NC_002607	GGAA	2	8	49680	49687	50 %	0 %	50 %	0 %	15789388
112	NC_002607	CGAG	2	8	49749	49756	25 %	0 %	50 %	25 %	15789388
113	NC_002607	GAAC	2	8	50701	50708	50 %	0 %	25 %	25 %	15789390
114	NC_002607	GGTC	2	8	50956	50963	0 %	25 %	50 %	25 %	15789390
115	NC_002607	CGTC	2	8	51211	51218	0 %	25 %	25 %	50 %	15789390
116	NC_002607	CGTT	2	8	51897	51904	0 %	50 %	25 %	25 %	15789390
117	NC_002607	GTGG	2	8	53780	53787	0 %	25 %	75 %	0 %	15789391
118	NC_002607	ATCC	2	8	54955	54962	25 %	25 %	0 %	50 %	15789392
119	NC_002607	GGGT	2	8	56487	56494	0 %	25 %	75 %	0 %	15789393
120	NC_002607	GCAA	2	8	56966	56973	50 %	0 %	25 %	25 %	15789393
121	NC_002607	CGCT	2	8	57524	57531	0 %	25 %	25 %	50 %	15789393
122	NC_002607	TCGC	2	8	57883	57890	0 %	25 %	25 %	50 %	15789394
123	NC_002607	AAAT	2	8	57961	57968	75 %	25 %	0 %	0 %	15789394
124	NC_002607	TCGC	2	8	58053	58060	0 %	25 %	25 %	50 %	15789394
125	NC_002607	CCGA	2	8	58270	58277	25 %	0 %	25 %	50 %	15789394
126	NC_002607	TTGG	2	8	58365	58372	0 %	50 %	50 %	0 %	15789394
127	NC_002607	ACGA	2	8	58927	58934	50 %	0 %	25 %	25 %	15789395
128	NC_002607	TGAT	2	8	59773	59780	25 %	50 %	25 %	0 %	15789395
129	NC_002607	CCCG	2	8	60904	60911	0 %	0 %	25 %	75 %	15789396
130	NC_002607	TTCC	2	8	61079	61086	0 %	50 %	0 %	50 %	15789396
131	NC_002607	ACCG	2	8	61280	61287	25 %	0 %	25 %	50 %	15789396
132	NC_002607	TCGC	2	8	65030	65037	0 %	25 %	25 %	50 %	15789400
133	NC_002607	GCTC	2	8	65243	65250	0 %	25 %	25 %	50 %	15789401
134	NC_002607	GGCT	2	8	65395	65402	0 %	25 %	50 %	25 %	15789401
135	NC_002607	GACG	2	8	65471	65478	25 %	0 %	50 %	25 %	15789401
136	NC_002607	CGGG	2	8	68331	68338	0 %	0 %	75 %	25 %	15789407
137	NC_002607	CGAC	2	8	70343	70350	25 %	0 %	25 %	50 %	15789409
138	NC_002607	TGCT	2	8	71405	71412	0 %	50 %	25 %	25 %	15789411
139	NC_002607	CCTC	2	8	71621	71628	0 %	25 %	0 %	75 %	15789411
140	NC_002607	CGCC	2	8	71894	71901	0 %	0 %	25 %	75 %	15789412
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142	NC_002607	GTTG	2	8	72311	72318	0 %	50 %	50 %	0 %	15789412
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