MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 53236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002607	CGGC	2	8	217160	217167	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5002	NC_002607	CCA	2	6	217200	217205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789557
5003	NC_002607	AGCG	2	8	217210	217217	25 %	0 %	50 %	25 %	15789557
5004	NC_002607	CGT	2	6	217218	217223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5005	NC_002607	GC	3	6	217227	217232	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5006	NC_002607	GC	3	6	217304	217309	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5007	NC_002607	TCG	2	6	217346	217351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5008	NC_002607	CGT	2	6	217359	217364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5009	NC_002607	CGA	2	6	217371	217376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5010	NC_002607	CGGC	2	8	217382	217389	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5011	NC_002607	CTA	2	6	217470	217475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789557
5012	NC_002607	CGA	2	6	217500	217505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5013	NC_002607	CGG	2	6	217517	217522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789557
5014	NC_002607	ACC	2	6	217529	217534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789557
5015	NC_002607	GGC	2	6	217569	217574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789557
5016	NC_002607	CCG	2	6	217625	217630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789557
5017	NC_002607	ATC	2	6	217660	217665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789557
5018	NC_002607	GC	4	8	217672	217679	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5019	NC_002607	CGC	3	9	217677	217685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789557
5020	NC_002607	CCAC	2	8	217706	217713	25 %	0 %	0 %	75 %	15789557
5021	NC_002607	GC	3	6	217716	217721	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5022	NC_002607	CGC	2	6	217767	217772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789557
5023	NC_002607	AGG	2	6	217775	217780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789557
5024	NC_002607	GGCC	2	8	217821	217828	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5025	NC_002607	GGT	2	6	217866	217871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789557
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5027	NC_002607	CGCC	2	8	217916	217923	0 %	0 %	25 %	75 %	15789557
5028	NC_002607	CG	3	6	217941	217946	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5029	NC_002607	GC	3	6	217949	217954	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5030	NC_002607	GC	3	6	217967	217972	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
5031	NC_002607	CAC	2	6	217980	217985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789557
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5033	NC_002607	GCG	2	6	218070	218075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789557
5034	NC_002607	CGA	2	6	218428	218433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789558
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5036	NC_002607	TCG	2	6	218461	218466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
5037	NC_002607	TCG	2	6	218488	218493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
5038	NC_002607	GTGA	2	8	218508	218515	25 %	25 %	50 %	0 %	15789558
5039	NC_002607	GTCG	2	8	218532	218539	0 %	25 %	50 %	25 %	15789558
5040	NC_002607	CACGG	2	10	218553	218562	20 %	0 %	40 %	40 %	15789558
5041	NC_002607	CGC	2	6	218587	218592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
5042	NC_002607	GTC	2	6	218598	218603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
5043	NC_002607	TGC	2	6	218608	218613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
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5045	NC_002607	CGG	2	6	218653	218658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789558
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5047	NC_002607	CCG	2	6	218692	218697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
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5049	NC_002607	CGC	2	6	218717	218722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
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5052	NC_002607	GCC	2	6	218755	218760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
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5054	NC_002607	CGT	2	6	218783	218788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
5055	NC_002607	CCT	3	9	218885	218893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789558
5056	NC_002607	CGC	2	6	218906	218911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
5057	NC_002607	TCGT	2	8	218991	218998	0 %	50 %	25 %	25 %	15789558
5058	NC_002607	GTC	2	6	219021	219026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789558
5059	NC_002607	CGCT	2	8	219034	219041	0 %	25 %	25 %	50 %	15789558
5060	NC_002607	CGC	2	6	219044	219049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789558
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5065	NC_002607	GGGCG	2	10	219301	219310	0 %	0 %	80 %	20 %	15789558
5066	NC_002607	CCCG	2	8	219413	219420	0 %	0 %	25 %	75 %	15789559
5067	NC_002607	GTC	3	9	219441	219449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789559
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5073	NC_002607	CTGG	2	8	219692	219699	0 %	25 %	50 %	25 %	15789559
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5124	NC_002607	TCG	2	6	221318	221323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789561
5125	NC_002607	CGA	2	6	221352	221357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789561
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5128	NC_002607	GC	3	6	221506	221511	0 %	0 %	50 %	50 %	15789561
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5132	NC_002607	TTC	2	6	221832	221837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789562
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5234	NC_002607	CGA	2	6	225258	225263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789564
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5240	NC_002607	GCT	2	6	225396	225401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789564
5241	NC_002607	CGC	2	6	225429	225434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789564
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5243	NC_002607	GCG	2	6	225478	225483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789564
5244	NC_002607	CGA	2	6	225489	225494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789564
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5246	NC_002607	TCG	2	6	225578	225583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789564
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5248	NC_002607	GTC	2	6	225611	225616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789565
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5352	NC_002607	GC	3	6	231363	231368	0 %	0 %	50 %	50 %	15789571
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5366	NC_002607	CG	3	6	231881	231886	0 %	0 %	50 %	50 %	15789572
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5495	NC_002607	CGA	2	6	237210	237215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789579
5496	NC_002607	GTC	2	6	237250	237255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789579
5497	NC_002607	GCG	2	6	237268	237273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789579
5498	NC_002607	CGG	2	6	237313	237318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789579
5499	NC_002607	CGG	2	6	237333	237338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789579
5500	NC_002607	GTT	2	6	237367	237372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789579

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